MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_002662	TGT	2	6	43108	43113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672020
1003	NC_002662	ACT	2	6	43140	43145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672020
1004	NC_002662	ATTTTT	2	12	43155	43166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15672020
1005	NC_002662	GAT	2	6	43167	43172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672020
1006	NC_002662	TAG	2	6	43232	43237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30023970
1007	NC_002662	TAC	2	6	43255	43260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30023970
1008	NC_002662	CTT	2	6	43284	43289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30023970
1009	NC_002662	TCTT	2	8	43355	43362	0 %	75 %	0 %	25 %	30023970
1010	NC_002662	TCG	2	6	43387	43392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30023970
1011	NC_002662	T	6	6	43399	43404	0 %	100 %	0 %	0 %	30023970
1012	NC_002662	TAG	2	6	43417	43422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002662	CTT	2	6	43436	43441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002662	T	8	8	43444	43451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002662	CTT	2	6	43458	43463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002662	TAT	2	6	43485	43490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002662	CTG	2	6	43545	43550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_002662	AAG	2	6	43564	43569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002662	T	6	6	43577	43582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002662	TAACT	2	10	43589	43598	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_002662	ATA	2	6	43621	43626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_002662	AAT	2	6	43657	43662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002662	A	7	7	43793	43799	100 %	0 %	0 %	0 %	15672021
1024	NC_002662	ACT	2	6	43837	43842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672021
1025	NC_002662	TGA	3	9	43928	43936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672021
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1030	NC_002662	GATA	2	8	44180	44187	50 %	25 %	25 %	0 %	15672022
1031	NC_002662	TAC	2	6	44262	44267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672022
1032	NC_002662	GAT	2	6	44271	44276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672022
1033	NC_002662	A	6	6	44314	44319	100 %	0 %	0 %	0 %	15672022
1034	NC_002662	CAA	2	6	44324	44329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672022
1035	NC_002662	TGA	2	6	44381	44386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672022
1036	NC_002662	CG	3	6	44524	44529	0 %	0 %	50 %	50 %	15672022
1037	NC_002662	AT	3	6	44539	44544	50 %	50 %	0 %	0 %	15672022
1038	NC_002662	CTT	2	6	44549	44554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672022
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1041	NC_002662	TGG	2	6	44629	44634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672022
1042	NC_002662	GAA	2	6	44648	44653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002662	A	6	6	44652	44657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002662	A	6	6	44659	44664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002662	TGT	2	6	44679	44684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002662	A	7	7	44773	44779	100 %	0 %	0 %	0 %	15672023
1047	NC_002662	A	6	6	44784	44789	100 %	0 %	0 %	0 %	15672023
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1049	NC_002662	TA	3	6	44853	44858	50 %	50 %	0 %	0 %	15672023
1050	NC_002662	TAA	2	6	44908	44913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672023
1051	NC_002662	TA	3	6	44931	44936	50 %	50 %	0 %	0 %	15672023
1052	NC_002662	TAT	2	6	44949	44954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672023
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1055	NC_002662	TTG	2	6	44999	45004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_002662	AAG	2	6	45208	45213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672024
1061	NC_002662	ATGAA	2	10	45222	45231	60 %	20 %	20 %	0 %	15672024
1062	NC_002662	A	6	6	45230	45235	100 %	0 %	0 %	0 %	15672024
1063	NC_002662	TA	3	6	45269	45274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002662	T	6	6	45291	45296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_002662	ATA	2	6	45403	45408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672025
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1076	NC_002662	AT	4	8	45677	45684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_002662	TCTT	2	8	46566	46573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_002662	ATG	2	6	46577	46582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_002662	AAT	2	6	46906	46911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_002662	AAAAT	2	10	46951	46960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_002662	A	7	7	46978	46984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_002662	TAA	2	6	46990	46995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002662	A	7	7	47065	47071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_002662	AATA	2	8	47130	47137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002662	ACA	2	6	47144	47149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1117	NC_002662	CCG	2	6	47353	47358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_002662	TAC	2	6	47423	47428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672027
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1122	NC_002662	T	6	6	47606	47611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_002662	ATC	2	6	47619	47624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1129	NC_002662	ATT	2	6	47915	47920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_002662	T	6	6	48026	48031	0 %	100 %	0 %	0 %	15672028
1133	NC_002662	AGA	3	9	48071	48079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672028
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1268	NC_002662	A	6	6	54298	54303	100 %	0 %	0 %	0 %	15672035
1269	NC_002662	CTT	2	6	54334	54339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672035
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1272	NC_002662	TGT	2	6	54442	54447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672035
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1329	NC_002662	AGTAA	2	10	56500	56509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1395	NC_002662	T	6	6	60048	60053	0 %	100 %	0 %	0 %	15672041
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