MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002662	G	6	6	543744	543749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_002662	C	6	6	543825	543830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12503	NC_002662	TATT	2	8	543906	543913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_002662	ATGA	2	8	543921	543928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_002662	GAA	2	6	543994	543999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_002662	GTT	2	6	544031	544036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672534
12507	NC_002662	TCCT	2	8	544147	544154	0 %	50 %	0 %	50 %	15672534
12508	NC_002662	TGA	2	6	544306	544311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672534
12509	NC_002662	AGA	2	6	544315	544320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672534
12510	NC_002662	A	7	7	544320	544326	100 %	0 %	0 %	0 %	15672534
12511	NC_002662	GCT	2	6	544364	544369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672534
12512	NC_002662	GAG	2	6	544430	544435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672534
12513	NC_002662	TGA	2	6	544447	544452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672534
12514	NC_002662	GAA	2	6	544487	544492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672534
12515	NC_002662	ATTTT	2	10	544497	544506	20 %	80 %	0 %	0 %	15672534
12516	NC_002662	TGA	2	6	544528	544533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672534
12517	NC_002662	ATTTC	2	10	544558	544567	20 %	60 %	0 %	20 %	15672534
12518	NC_002662	ATA	2	6	544572	544577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672534
12519	NC_002662	CGAAT	2	10	544596	544605	40 %	20 %	20 %	20 %	15672534
12520	NC_002662	ATG	2	6	544671	544676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672534
12521	NC_002662	AT	3	6	544690	544695	50 %	50 %	0 %	0 %	15672534
12522	NC_002662	CAA	2	6	544707	544712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672534
12523	NC_002662	CAA	2	6	544761	544766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672534
12524	NC_002662	AGC	2	6	544773	544778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672534
12525	NC_002662	AATA	2	8	544834	544841	75 %	25 %	0 %	0 %	15672534
12526	NC_002662	TGT	2	6	544843	544848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672534
12527	NC_002662	CGT	2	6	544886	544891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672534
12528	NC_002662	A	7	7	544906	544912	100 %	0 %	0 %	0 %	15672534
12529	NC_002662	ATG	2	6	544926	544931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672534
12530	NC_002662	CTG	2	6	544938	544943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672534
12531	NC_002662	TTGAT	2	10	544968	544977	20 %	60 %	20 %	0 %	15672534
12532	NC_002662	CTG	2	6	544986	544991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672534
12533	NC_002662	ATT	2	6	545112	545117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672534
12534	NC_002662	TA	3	6	545219	545224	50 %	50 %	0 %	0 %	15672534
12535	NC_002662	ATT	2	6	545373	545378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672534
12536	NC_002662	GAG	2	6	545411	545416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672534
12537	NC_002662	TTA	2	6	545419	545424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672534
12538	NC_002662	AAT	2	6	545429	545434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672534
12539	NC_002662	CAA	2	6	545444	545449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672534
12540	NC_002662	AGA	2	6	545456	545461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672534
12541	NC_002662	GTT	2	6	545477	545482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672534
12542	NC_002662	GAA	2	6	545528	545533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672534
12543	NC_002662	TCAT	2	8	545557	545564	25 %	50 %	0 %	25 %	15672534
12544	NC_002662	A	6	6	545573	545578	100 %	0 %	0 %	0 %	15672534
12545	NC_002662	ATTT	2	8	545625	545632	25 %	75 %	0 %	0 %	15672534
12546	NC_002662	CTTG	2	8	545641	545648	0 %	50 %	25 %	25 %	15672534
12547	NC_002662	TGA	2	6	545671	545676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672534
12548	NC_002662	GAA	2	6	545705	545710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672534
12549	NC_002662	T	6	6	545790	545795	0 %	100 %	0 %	0 %	15672534
12550	NC_002662	GAA	2	6	545822	545827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672534
12551	NC_002662	CTG	2	6	545847	545852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672534
12552	NC_002662	ATT	2	6	545897	545902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672534
12553	NC_002662	A	6	6	545912	545917	100 %	0 %	0 %	0 %	15672534
12554	NC_002662	T	6	6	545927	545932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_002662	AGT	2	6	545971	545976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_002662	AGG	2	6	545988	545993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_002662	GCA	2	6	546003	546008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672535
12558	NC_002662	A	7	7	546012	546018	100 %	0 %	0 %	0 %	15672535
12559	NC_002662	GAA	2	6	546129	546134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672535
12560	NC_002662	CGT	2	6	546135	546140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672535
12561	NC_002662	CTT	2	6	546141	546146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672535
12562	NC_002662	TGT	3	9	546167	546175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672535
12563	NC_002662	TGA	2	6	546308	546313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672535
12564	NC_002662	TTG	2	6	546349	546354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672535
12565	NC_002662	ATG	2	6	546355	546360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672535
12566	NC_002662	TGA	2	6	546449	546454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672535
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12569	NC_002662	TGA	2	6	546572	546577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672535
12570	NC_002662	ATT	2	6	546600	546605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672535
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12582	NC_002662	GAA	2	6	547170	547175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672535
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12589	NC_002662	T	7	7	547376	547382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_002662	T	7	7	547386	547392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_002662	GTAT	2	8	547400	547407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_002662	TAT	2	6	547422	547427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_002662	ATT	2	6	547433	547438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_002662	T	6	6	547437	547442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_002662	ATT	2	6	547495	547500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672536
12596	NC_002662	AGA	2	6	547502	547507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672536
12597	NC_002662	AAT	2	6	547520	547525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672536
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12602	NC_002662	TTA	2	6	547719	547724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672536
12603	NC_002662	GCT	2	6	547736	547741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672536
12604	NC_002662	AG	3	6	547742	547747	50 %	0 %	50 %	0 %	15672536
12605	NC_002662	GTT	2	6	547764	547769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672536
12606	NC_002662	ATT	2	6	547800	547805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672536
12607	NC_002662	GA	3	6	547844	547849	50 %	0 %	50 %	0 %	15672536
12608	NC_002662	ATA	2	6	547891	547896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672536
12609	NC_002662	A	6	6	548006	548011	100 %	0 %	0 %	0 %	15672536
12610	NC_002662	TTTGCT	2	12	548063	548074	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15672536
12611	NC_002662	TTG	2	6	548107	548112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672536
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12613	NC_002662	AATT	2	8	548137	548144	50 %	50 %	0 %	0 %	15672536
12614	NC_002662	TGTAA	2	10	548225	548234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_002662	T	7	7	548261	548267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_002662	AAAT	2	8	548275	548282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_002662	ATTT	2	8	548308	548315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_002662	TAAT	2	8	548333	548340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_002662	TCA	2	6	548341	548346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_002662	A	6	6	548403	548408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_002662	TTA	2	6	548488	548493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672537
12622	NC_002662	TAT	2	6	548494	548499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672537
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12624	NC_002662	TC	3	6	548575	548580	0 %	50 %	0 %	50 %	15672537
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12739	NC_002662	T	8	8	552950	552957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12752	NC_002662	A	6	6	553592	553597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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