MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002662	AGC	2	6	21238	21243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15671996
502	NC_002662	ATA	2	6	21277	21282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671996
503	NC_002662	A	7	7	21282	21288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002662	TAA	2	6	21313	21318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_002662	ATG	2	6	21332	21337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_002662	TTA	3	9	21343	21351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15671997
507	NC_002662	CAAA	2	8	21368	21375	75 %	0 %	0 %	25 %	15671997
508	NC_002662	CGT	2	6	21441	21446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15671997
509	NC_002662	AAG	2	6	21457	21462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671997
510	NC_002662	TTG	2	6	21562	21567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15671997
511	NC_002662	AGA	2	6	21605	21610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671997
512	NC_002662	AGA	2	6	21653	21658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671997
513	NC_002662	ATC	2	6	21671	21676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_002662	ATA	2	6	21722	21727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671998
515	NC_002662	A	9	9	21743	21751	100 %	0 %	0 %	0 %	15671998
516	NC_002662	TTTAG	2	10	21817	21826	20 %	60 %	20 %	0 %	15671998
517	NC_002662	AAG	2	6	21917	21922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671998
518	NC_002662	A	6	6	21931	21936	100 %	0 %	0 %	0 %	15671998
519	NC_002662	GAA	2	6	21937	21942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15671998
520	NC_002662	TGA	2	6	22014	22019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15671998
521	NC_002662	TAC	2	6	22029	22034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15671998
522	NC_002662	AAT	2	6	22067	22072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671998
523	NC_002662	A	6	6	22303	22308	100 %	0 %	0 %	0 %	15671999
524	NC_002662	A	7	7	22372	22378	100 %	0 %	0 %	0 %	15671999
525	NC_002662	AAT	2	6	22394	22399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15671999
526	NC_002662	A	6	6	22407	22412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_002662	TAT	2	6	22413	22418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002662	T	6	6	22423	22428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_002662	CTATT	2	10	22435	22444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
530	NC_002662	ACA	2	6	22501	22506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002662	ATT	2	6	22510	22515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002662	ATGGA	2	10	22518	22527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002662	T	6	6	22622	22627	0 %	100 %	0 %	0 %	15672000
534	NC_002662	A	6	6	22675	22680	100 %	0 %	0 %	0 %	15672000
535	NC_002662	TTG	2	6	22683	22688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672000
536	NC_002662	AAAGAA	2	12	22709	22720	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15672000
537	NC_002662	AAC	2	6	22771	22776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672000
538	NC_002662	A	6	6	22898	22903	100 %	0 %	0 %	0 %	15672000
539	NC_002662	AG	3	6	22931	22936	50 %	0 %	50 %	0 %	15672000
540	NC_002662	AATA	2	8	22939	22946	75 %	25 %	0 %	0 %	15672000
541	NC_002662	CAA	2	6	22947	22952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672000
542	NC_002662	TA	3	6	22953	22958	50 %	50 %	0 %	0 %	15672000
543	NC_002662	AAT	2	6	23011	23016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672000
544	NC_002662	CTG	2	6	23046	23051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672000
545	NC_002662	TAC	2	6	23081	23086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672000
546	NC_002662	GGGTT	2	10	23113	23122	0 %	40 %	60 %	0 %	15672000
547	NC_002662	ATT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672000
548	NC_002662	TGA	2	6	23344	23349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672000
549	NC_002662	CAG	2	6	23427	23432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672000
550	NC_002662	ATA	2	6	23433	23438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672000
551	NC_002662	TAT	2	6	23513	23518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672000
552	NC_002662	AAAT	2	8	23553	23560	75 %	25 %	0 %	0 %	15672000
553	NC_002662	GGTA	2	8	23614	23621	25 %	25 %	50 %	0 %	15672000
554	NC_002662	AGG	2	6	23647	23652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15672000
555	NC_002662	TGA	2	6	23686	23691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672000
556	NC_002662	AT	3	6	23721	23726	50 %	50 %	0 %	0 %	15672000
557	NC_002662	TGG	2	6	23743	23748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672000
558	NC_002662	CAGATA	2	12	23751	23762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15672000
559	NC_002662	ATG	2	6	23766	23771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672000
560	NC_002662	GAT	2	6	23831	23836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672000
561	NC_002662	ATT	2	6	23949	23954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
562	NC_002662	GGT	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672001
563	NC_002662	AAG	2	6	24011	24016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
564	NC_002662	GAA	2	6	24079	24084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
565	NC_002662	CAA	2	6	24104	24109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
566	NC_002662	A	7	7	24158	24164	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
567	NC_002662	T	6	6	24187	24192	0 %	100 %	0 %	0 %	15672001
568	NC_002662	TCA	3	9	24237	24245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672001
569	NC_002662	TTG	2	6	24254	24259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672001
570	NC_002662	ATT	2	6	24357	24362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
571	NC_002662	AGA	2	6	24375	24380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
572	NC_002662	TAT	2	6	24397	24402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
573	NC_002662	CAA	2	6	24410	24415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
574	NC_002662	ATT	2	6	24428	24433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
575	NC_002662	A	7	7	24471	24477	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
576	NC_002662	CAAT	2	8	24496	24503	50 %	25 %	0 %	25 %	15672001
577	NC_002662	TAAT	2	8	24542	24549	50 %	50 %	0 %	0 %	15672001
578	NC_002662	A	6	6	24551	24556	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
579	NC_002662	TTG	2	6	24572	24577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672001
580	NC_002662	A	6	6	24581	24586	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
581	NC_002662	ATC	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672001
582	NC_002662	A	6	6	24595	24600	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
583	NC_002662	CAAA	2	8	24610	24617	75 %	0 %	0 %	25 %	15672001
584	NC_002662	ACA	2	6	24624	24629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
585	NC_002662	T	6	6	24646	24651	0 %	100 %	0 %	0 %	15672001
586	NC_002662	AAGT	2	8	24671	24678	50 %	25 %	25 %	0 %	15672001
587	NC_002662	A	6	6	24682	24687	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
588	NC_002662	CAA	2	6	24721	24726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
589	NC_002662	ATTTT	2	10	24750	24759	20 %	80 %	0 %	0 %	15672001
590	NC_002662	A	6	6	24788	24793	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
591	NC_002662	GAAATT	2	12	24883	24894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15672001
592	NC_002662	TCA	2	6	24933	24938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672001
593	NC_002662	A	6	6	24940	24945	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
594	NC_002662	T	6	6	24955	24960	0 %	100 %	0 %	0 %	15672001
595	NC_002662	GA	3	6	24989	24994	50 %	0 %	50 %	0 %	15672001
596	NC_002662	A	6	6	25015	25020	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
597	NC_002662	AGA	2	6	25084	25089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
598	NC_002662	A	7	7	25137	25143	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
599	NC_002662	AGA	3	9	25177	25185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672002
600	NC_002662	A	6	6	25240	25245	100 %	0 %	0 %	0 %	15672002
601	NC_002662	TTC	2	6	25263	25268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672002
602	NC_002662	ATTG	2	8	25307	25314	25 %	50 %	25 %	0 %	15672002
603	NC_002662	CGG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672002
604	NC_002662	CAG	2	6	25404	25409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672002
605	NC_002662	TTG	2	6	25431	25436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672002
606	NC_002662	CTT	2	6	25520	25525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672002
607	NC_002662	TTG	2	6	25545	25550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672002
608	NC_002662	ATT	2	6	25563	25568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672002
609	NC_002662	TGT	2	6	25594	25599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672002
610	NC_002662	TTTGG	2	10	25604	25613	0 %	60 %	40 %	0 %	15672002
611	NC_002662	GAA	2	6	25619	25624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672002
612	NC_002662	AAT	2	6	25677	25682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672002
613	NC_002662	A	6	6	25727	25732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002662	TACT	2	8	25744	25751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_002662	TTA	2	6	25816	25821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_002662	AAG	2	6	25833	25838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_002662	TAA	3	9	25856	25864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_002662	AAC	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672003
619	NC_002662	AAC	2	6	25900	25905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672003
620	NC_002662	A	6	6	25925	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	15672003
621	NC_002662	TTG	4	12	25957	25968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
622	NC_002662	TCT	2	6	25981	25986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672003
623	NC_002662	AGT	2	6	25989	25994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
624	NC_002662	AATC	2	8	25995	26002	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
625	NC_002662	TGA	2	6	26032	26037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
626	NC_002662	GTAAAA	2	12	26124	26135	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15672003
627	NC_002662	AAT	2	6	26142	26147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672003
628	NC_002662	TAG	2	6	26168	26173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
629	NC_002662	TAT	2	6	26198	26203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672003
630	NC_002662	ATG	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
631	NC_002662	GTT	2	6	26268	26273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
632	NC_002662	TCA	2	6	26280	26285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672003
633	NC_002662	TC	3	6	26306	26311	0 %	50 %	0 %	50 %	15672003
634	NC_002662	CAT	2	6	26315	26320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672003
635	NC_002662	TTG	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
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642	NC_002662	CAG	2	6	26563	26568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672003
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659	NC_002662	TGC	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672003
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663	NC_002662	TTG	2	6	27271	27276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
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764	NC_002662	A	6	6	31505	31510	100 %	0 %	0 %	0 %	15672004
765	NC_002662	TGAC	2	8	31511	31518	25 %	25 %	25 %	25 %	15672004
766	NC_002662	T	6	6	31541	31546	0 %	100 %	0 %	0 %	15672004
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