MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_002662	TACCA	2	10	2160221	2160230	40 %	20 %	0 %	40 %	15674062
50002	NC_002662	CTT	2	6	2160247	2160252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674062
50003	NC_002662	TAC	2	6	2160254	2160259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674062
50004	NC_002662	TAATTT	2	12	2160343	2160354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674062
50005	NC_002662	T	6	6	2160361	2160366	0 %	100 %	0 %	0 %	15674062
50006	NC_002662	CCT	2	6	2160367	2160372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674063
50007	NC_002662	GCA	2	6	2160406	2160411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674063
50008	NC_002662	CTT	2	6	2160413	2160418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674063
50009	NC_002662	AAC	2	6	2160459	2160464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674063
50010	NC_002662	GT	3	6	2160473	2160478	0 %	50 %	50 %	0 %	15674063
50011	NC_002662	CAC	2	6	2160542	2160547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674063
50012	NC_002662	AGG	2	6	2160583	2160588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15674063
50013	NC_002662	ACC	3	9	2160594	2160602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674063
50014	NC_002662	GTA	2	6	2160631	2160636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674063
50015	NC_002662	TAA	2	6	2160653	2160658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674063
50016	NC_002662	GCT	2	6	2160670	2160675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674063
50017	NC_002662	CTT	2	6	2160704	2160709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674063
50018	NC_002662	CAA	4	12	2160752	2160763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674063
50019	NC_002662	TGC	2	6	2160765	2160770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674063
50020	NC_002662	GAC	2	6	2160779	2160784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674063
50021	NC_002662	AAC	2	6	2160795	2160800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674063
50022	NC_002662	TTC	2	6	2160831	2160836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674063
50023	NC_002662	TCT	2	6	2160861	2160866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674063
50024	NC_002662	GCT	2	6	2160922	2160927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674064
50025	NC_002662	TGC	2	6	2160936	2160941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674064
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50027	NC_002662	CTT	2	6	2160983	2160988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674064
50028	NC_002662	TGA	2	6	2161071	2161076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674064
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50030	NC_002662	TGTTTG	2	12	2161127	2161138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674064
50031	NC_002662	GT	3	6	2161196	2161201	0 %	50 %	50 %	0 %	15674064
50032	NC_002662	GTTT	2	8	2161217	2161224	0 %	75 %	25 %	0 %	15674064
50033	NC_002662	TA	3	6	2161256	2161261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50034	NC_002662	TGTC	2	8	2161342	2161349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50035	NC_002662	ACC	2	6	2161395	2161400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50036	NC_002662	T	6	6	2161415	2161420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50037	NC_002662	TAAA	2	8	2161423	2161430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50038	NC_002662	ATT	2	6	2161444	2161449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50039	NC_002662	ATT	2	6	2161459	2161464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674065
50040	NC_002662	CTT	2	6	2161477	2161482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674065
50041	NC_002662	ACG	2	6	2161484	2161489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674065
50042	NC_002662	CCTTTA	2	12	2161515	2161526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15674065
50043	NC_002662	ACG	2	6	2161541	2161546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674065
50044	NC_002662	GCT	2	6	2161560	2161565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674065
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50050	NC_002662	TGAA	2	8	2161885	2161892	50 %	25 %	25 %	0 %	15674065
50051	NC_002662	TGACAG	2	12	2161918	2161929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674065
50052	NC_002662	T	7	7	2161996	2162002	0 %	100 %	0 %	0 %	15674065
50053	NC_002662	TTTTA	2	10	2162075	2162084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50054	NC_002662	ATC	2	6	2162151	2162156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50055	NC_002662	TC	3	6	2162199	2162204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50056	NC_002662	CAC	2	6	2162236	2162241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674066
50057	NC_002662	TAC	2	6	2162273	2162278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674066
50058	NC_002662	GAT	2	6	2162294	2162299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674066
50059	NC_002662	ATC	2	6	2162333	2162338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674066
50060	NC_002662	TTGT	2	8	2162441	2162448	0 %	75 %	25 %	0 %	15674066
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50071	NC_002662	TAG	2	6	2163123	2163128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674067
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50074	NC_002662	TCCT	2	8	2163202	2163209	0 %	50 %	0 %	50 %	15674067
50075	NC_002662	GAA	2	6	2163215	2163220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674067
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50079	NC_002662	TAT	2	6	2163270	2163275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674067
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50083	NC_002662	AAT	2	6	2163463	2163468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50084	NC_002662	TAA	2	6	2163480	2163485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50085	NC_002662	A	8	8	2163500	2163507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50093	NC_002662	TTTG	2	8	2163946	2163953	0 %	75 %	25 %	0 %	15674069
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50099	NC_002662	ATT	2	6	2164309	2164314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50100	NC_002662	T	6	6	2164349	2164354	0 %	100 %	0 %	0 %	15674070
50101	NC_002662	T	6	6	2164367	2164372	0 %	100 %	0 %	0 %	15674070
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50105	NC_002662	TTTA	2	8	2164538	2164545	25 %	75 %	0 %	0 %	15674070
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50108	NC_002662	A	6	6	2164726	2164731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50118	NC_002662	ATA	2	6	2165162	2165167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674072
50119	NC_002662	CTT	2	6	2165172	2165177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674072
50120	NC_002662	ACGA	2	8	2165236	2165243	50 %	0 %	25 %	25 %	15674072
50121	NC_002662	GTT	2	6	2165263	2165268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674072
50122	NC_002662	TCG	2	6	2165270	2165275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674072
50123	NC_002662	T	6	6	2165287	2165292	0 %	100 %	0 %	0 %	15674072
50124	NC_002662	GGT	2	6	2165322	2165327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674072
50125	NC_002662	GTT	2	6	2165403	2165408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674072
50126	NC_002662	TAT	2	6	2165437	2165442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674073
50127	NC_002662	TCA	2	6	2165494	2165499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674073
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50129	NC_002662	CAG	3	9	2165525	2165533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674073
50130	NC_002662	TTCT	2	8	2165556	2165563	0 %	75 %	0 %	25 %	15674073
50131	NC_002662	TTC	2	6	2165589	2165594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674073
50132	NC_002662	GC	3	6	2165605	2165610	0 %	0 %	50 %	50 %	15674073
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50135	NC_002662	TCA	2	6	2165730	2165735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674074
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50163	NC_002662	GTC	2	6	2167112	2167117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674077
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50224	NC_002662	T	7	7	2170258	2170264	0 %	100 %	0 %	0 %	15674082
50225	NC_002662	T	6	6	2170273	2170278	0 %	100 %	0 %	0 %	15674082
50226	NC_002662	CTC	2	6	2170279	2170284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50227	NC_002662	GT	3	6	2170353	2170358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50228	NC_002662	TCG	2	6	2170373	2170378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50229	NC_002662	TCTAT	2	10	2170405	2170414	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50230	NC_002662	T	7	7	2170450	2170456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50231	NC_002662	TTCT	2	8	2170459	2170466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50232	NC_002662	TTTG	2	8	2170546	2170553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50233	NC_002662	TAT	2	6	2170568	2170573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50234	NC_002662	AGG	2	6	2170576	2170581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50235	NC_002662	ATC	2	6	2170649	2170654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674083
50236	NC_002662	TGTT	2	8	2170719	2170726	0 %	75 %	25 %	0 %	15674083
50237	NC_002662	ATG	2	6	2170797	2170802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674083
50238	NC_002662	TCA	2	6	2170812	2170817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674083
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50240	NC_002662	A	6	6	2170871	2170876	100 %	0 %	0 %	0 %	15674083
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50482	NC_002662	GAA	2	6	2182027	2182032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674094
50483	NC_002662	ATC	2	6	2182066	2182071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674094
50484	NC_002662	AG	3	6	2182109	2182114	50 %	0 %	50 %	0 %	15674094
50485	NC_002662	ATG	2	6	2182116	2182121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674094
50486	NC_002662	ATT	3	9	2182137	2182145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674094
50487	NC_002662	AAAAT	2	10	2182159	2182168	80 %	20 %	0 %	0 %	15674094
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50490	NC_002662	T	6	6	2182237	2182242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50491	NC_002662	CTT	2	6	2182247	2182252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50493	NC_002662	AATC	2	8	2182274	2182281	50 %	25 %	0 %	25 %	15674095
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