MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 2708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	TGT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973417
2	NC_009649	GGC	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973417
3	NC_009649	T	6	6	635	640	0 %	100 %	0 %	0 %	152973418
4	NC_009649	CCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973418
5	NC_009649	TTC	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973418
6	NC_009649	TCA	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973418
7	NC_009649	CAG	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973418
8	NC_009649	CGT	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973418
9	NC_009649	TCA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973418
10	NC_009649	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973418
11	NC_009649	CAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973418
12	NC_009649	TTC	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973418
13	NC_009649	CTGA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	152973418
14	NC_009649	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973419
15	NC_009649	TGG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
16	NC_009649	TGG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
17	NC_009649	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
18	NC_009649	CAA	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973419
19	NC_009649	TTC	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973419
20	NC_009649	ATC	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973419
21	NC_009649	TAA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973419
22	NC_009649	TAC	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973419
23	NC_009649	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	152973419
24	NC_009649	CAG	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
25	NC_009649	CCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973419
26	NC_009649	CTG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
27	NC_009649	CTG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
28	NC_009649	GCT	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
29	NC_009649	TAA	2	6	2043	2048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973419
30	NC_009649	CTG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
31	NC_009649	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973419
32	NC_009649	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	152973419
33	NC_009649	GCA	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
34	NC_009649	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973419
35	NC_009649	ATG	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973419
36	NC_009649	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
37	NC_009649	TGC	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
38	NC_009649	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973419
39	NC_009649	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
40	NC_009649	AGG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973419
41	NC_009649	AGC	3	9	2523	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
42	NC_009649	CGC	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973419
43	NC_009649	A	8	8	2546	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	152973419
44	NC_009649	GCA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
45	NC_009649	GAG	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973419
46	NC_009649	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973419
47	NC_009649	TGC	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
48	NC_009649	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973419
49	NC_009649	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
50	NC_009649	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973419
51	NC_009649	AGC	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
52	NC_009649	ATGA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	152973419
53	NC_009649	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973419
54	NC_009649	G	8	8	3450	3457	0 %	0 %	100 %	0 %	152973419
55	NC_009649	TTCC	2	8	3482	3489	0 %	50 %	0 %	50 %	152973419
56	NC_009649	TTC	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973419
57	NC_009649	AAGC	2	8	3582	3589	50 %	0 %	25 %	25 %	152973419
58	NC_009649	AGG	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973419
59	NC_009649	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973419
60	NC_009649	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973420
61	NC_009649	GAA	3	9	3818	3826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973420
62	NC_009649	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973420
63	NC_009649	GAT	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973420
64	NC_009649	TATT	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	152973420
65	NC_009649	CTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973420
66	NC_009649	TTC	2	6	3967	3972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973420
67	NC_009649	GCT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973420
68	NC_009649	TGA	2	6	4064	4069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973420
69	NC_009649	A	7	7	4329	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	152973421
70	NC_009649	TGT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973421
71	NC_009649	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973421
72	NC_009649	GCC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973421
73	NC_009649	GGAA	2	8	4442	4449	50 %	0 %	50 %	0 %	152973421
74	NC_009649	GCA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973421
75	NC_009649	GCG	2	6	4559	4564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973421
76	NC_009649	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973421
77	NC_009649	GCAA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	152973421
78	NC_009649	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973421
79	NC_009649	TCT	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973421
80	NC_009649	TCA	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973421
81	NC_009649	CGC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973421
82	NC_009649	GAT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973421
83	NC_009649	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973421
84	NC_009649	TTA	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973421
85	NC_009649	CAG	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973422
86	NC_009649	TGC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973422
87	NC_009649	AAG	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973422
88	NC_009649	TGA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973422
89	NC_009649	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973422
90	NC_009649	CTC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973422
91	NC_009649	CGC	2	6	5830	5835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973423
92	NC_009649	GTCA	2	8	6107	6114	25 %	25 %	25 %	25 %	152973423
93	NC_009649	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973423
94	NC_009649	CCGA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	152973423
95	NC_009649	TGG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973423
96	NC_009649	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
97	NC_009649	CGG	2	6	6438	6443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973423
98	NC_009649	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
99	NC_009649	AAG	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973423
100	NC_009649	TGC	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973423
101	NC_009649	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
102	NC_009649	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973423
103	NC_009649	AAG	2	6	8145	8150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973424
104	NC_009649	ACA	2	6	8234	8239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973424
105	NC_009649	TTTC	2	8	8243	8250	0 %	75 %	0 %	25 %	152973424
106	NC_009649	TAA	2	6	8405	8410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973424
107	NC_009649	TAC	2	6	8444	8449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973424
108	NC_009649	GGC	2	6	8472	8477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973424
109	NC_009649	CAT	2	6	8564	8569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973424
110	NC_009649	TGG	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973424
111	NC_009649	T	6	6	8637	8642	0 %	100 %	0 %	0 %	152973424
112	NC_009649	GCC	2	6	8672	8677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973424
113	NC_009649	GAT	2	6	8685	8690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973424
114	NC_009649	CAA	2	6	8828	8833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973424
115	NC_009649	CGC	2	6	8840	8845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973424
116	NC_009649	TGAG	2	8	8854	8861	25 %	25 %	50 %	0 %	152973424
117	NC_009649	AGC	2	6	9007	9012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973424
118	NC_009649	ATC	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973424
119	NC_009649	TGT	2	6	9306	9311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973424
120	NC_009649	TGG	2	6	9376	9381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973424
121	NC_009649	ATTC	2	8	9389	9396	25 %	50 %	0 %	25 %	152973424
122	NC_009649	CA	3	6	9413	9418	50 %	0 %	0 %	50 %	152973424
123	NC_009649	TTC	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973424
124	NC_009649	CAACG	2	10	9696	9705	40 %	0 %	20 %	40 %	152973424
125	NC_009649	AGC	2	6	9763	9768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973424
126	NC_009649	TCA	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973424
127	NC_009649	GAA	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973424
128	NC_009649	AGCC	2	8	9847	9854	25 %	0 %	25 %	50 %	152973424
129	NC_009649	CAG	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973424
130	NC_009649	CTT	3	9	9927	9935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973424
131	NC_009649	GAC	2	6	10004	10009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973424
132	NC_009649	CAGG	2	8	10090	10097	25 %	0 %	50 %	25 %	152973424
133	NC_009649	AAGA	2	8	10098	10105	75 %	0 %	25 %	0 %	152973424
134	NC_009649	GCT	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973424
135	NC_009649	ACC	2	6	10208	10213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973424
136	NC_009649	CGT	3	9	10291	10299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973425
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138	NC_009649	GTG	2	6	10317	10322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973425
139	NC_009649	G	6	6	10444	10449	0 %	0 %	100 %	0 %	152973425
140	NC_009649	TAC	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973425
141	NC_009649	CAGT	2	8	10498	10505	25 %	25 %	25 %	25 %	152973425
142	NC_009649	AGT	2	6	10624	10629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973425
143	NC_009649	GCAG	2	8	10771	10778	25 %	0 %	50 %	25 %	152973425
144	NC_009649	CTTG	2	8	10818	10825	0 %	50 %	25 %	25 %	152973425
145	NC_009649	TAT	2	6	10828	10833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973425
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147	NC_009649	GCCT	2	8	10886	10893	0 %	25 %	25 %	50 %	152973425
148	NC_009649	TCA	2	6	10909	10914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973425
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151	NC_009649	TAG	2	6	10987	10992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973425
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155	NC_009649	CTTC	2	8	11167	11174	0 %	50 %	0 %	50 %	152973425
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159	NC_009649	CTT	2	6	11339	11344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973425
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242	NC_009649	GCCA	2	8	15968	15975	25 %	0 %	25 %	50 %	152973428
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250	NC_009649	CG	4	8	16425	16432	0 %	0 %	50 %	50 %	152973428
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252	NC_009649	ACC	2	6	16523	16528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973428
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255	NC_009649	TAA	2	6	16615	16620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973428
256	NC_009649	CAG	2	6	16625	16630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973428
257	NC_009649	AAT	2	6	16680	16685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973428
258	NC_009649	ATA	2	6	16713	16718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973428
259	NC_009649	A	6	6	16793	16798	100 %	0 %	0 %	0 %	152973428
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388	NC_009649	TTG	2	6	23882	23887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973432
389	NC_009649	GTT	2	6	23959	23964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973432
390	NC_009649	GTC	2	6	23984	23989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973432
391	NC_009649	GCTG	2	8	24421	24428	0 %	25 %	50 %	25 %	152973433
392	NC_009649	TC	3	6	24634	24639	0 %	50 %	0 %	50 %	152973433
393	NC_009649	CGT	2	6	24644	24649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973433
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499	NC_009649	GAA	2	6	30582	30587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973441
500	NC_009649	CAT	2	6	30608	30613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973441

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