MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 83715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007802	GCGCGG	2	12	153943	153954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052652
3002	NC_007802	G	6	6	153953	153958	0 %	0 %	100 %	0 %	89052652
3003	NC_007802	CGG	2	6	153959	153964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052652
3004	NC_007802	GTC	2	6	153981	153986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052652
3005	NC_007802	AACGGG	2	12	154045	154056	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	89052652
3006	NC_007802	GC	3	6	154070	154075	0 %	0 %	50 %	50 %	89052652
3007	NC_007802	CGG	2	6	154078	154083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052652
3008	NC_007802	CCG	2	6	154160	154165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052652
3009	NC_007802	GGA	2	6	154178	154183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052652
3010	NC_007802	CAG	2	6	154212	154217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052652
3011	NC_007802	GC	3	6	154250	154255	0 %	0 %	50 %	50 %	89052652
3012	NC_007802	CGT	2	6	154281	154286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052652
3013	NC_007802	AGGC	2	8	154312	154319	25 %	0 %	50 %	25 %	89052652
3014	NC_007802	GTC	2	6	154339	154344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052652
3015	NC_007802	G	6	6	154382	154387	0 %	0 %	100 %	0 %	89052652
3016	NC_007802	TGAG	2	8	154396	154403	25 %	25 %	50 %	0 %	89052652
3017	NC_007802	CGG	2	6	154409	154414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052652
3018	NC_007802	AGA	2	6	154495	154500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052652
3019	NC_007802	TTC	2	6	154521	154526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052652
3020	NC_007802	ATC	2	6	154597	154602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052652
3021	NC_007802	GCG	2	6	154609	154614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052652
3022	NC_007802	AGG	2	6	154621	154626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052652
3023	NC_007802	GAA	2	6	154656	154661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052652
3024	NC_007802	GAT	2	6	154689	154694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052652
3025	NC_007802	GT	3	6	154745	154750	0 %	50 %	50 %	0 %	89052652
3026	NC_007802	TGA	2	6	154843	154848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052653
3027	NC_007802	GCC	2	6	154863	154868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052653
3028	NC_007802	AGC	2	6	154908	154913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052653
3029	NC_007802	AGGA	2	8	154947	154954	50 %	0 %	50 %	0 %	89052653
3030	NC_007802	AGA	2	6	154969	154974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052653
3031	NC_007802	ATG	2	6	155034	155039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052653
3032	NC_007802	TGA	2	6	155062	155067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052653
3033	NC_007802	CGC	2	6	155078	155083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052653
3034	NC_007802	AGGC	2	8	155233	155240	25 %	0 %	50 %	25 %	89052653
3035	NC_007802	GTCG	2	8	155255	155262	0 %	25 %	50 %	25 %	89052653
3036	NC_007802	ACCG	2	8	155740	155747	25 %	0 %	25 %	50 %	89052654
3037	NC_007802	TGA	2	6	155751	155756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052654
3038	NC_007802	TG	3	6	155759	155764	0 %	50 %	50 %	0 %	89052654
3039	NC_007802	CATC	2	8	155805	155812	25 %	25 %	0 %	50 %	89052654
3040	NC_007802	TGGA	2	8	155822	155829	25 %	25 %	50 %	0 %	89052654
3041	NC_007802	ATC	2	6	155845	155850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052654
3042	NC_007802	CGC	2	6	155871	155876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052654
3043	NC_007802	AGG	2	6	155948	155953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052654
3044	NC_007802	GCAA	2	8	155992	155999	50 %	0 %	25 %	25 %	89052654
3045	NC_007802	CATA	2	8	156000	156007	50 %	25 %	0 %	25 %	89052654
3046	NC_007802	ACG	2	6	156131	156136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052654
3047	NC_007802	TGC	2	6	156171	156176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052654
3048	NC_007802	TGG	2	6	156254	156259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052654
3049	NC_007802	TTG	2	6	156313	156318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052654
3050	NC_007802	GAA	2	6	156336	156341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052654
3051	NC_007802	CG	3	6	156497	156502	0 %	0 %	50 %	50 %	89052655
3052	NC_007802	TCG	2	6	156526	156531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052655
3053	NC_007802	GGC	2	6	156604	156609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052655
3054	NC_007802	GTC	2	6	156622	156627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052655
3055	NC_007802	TCCGA	2	10	156810	156819	20 %	20 %	20 %	40 %	89052655
3056	NC_007802	CAT	2	6	156849	156854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052655
3057	NC_007802	GCA	2	6	156894	156899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052655
3058	NC_007802	GCG	2	6	156985	156990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052655
3059	NC_007802	CG	3	6	156989	156994	0 %	0 %	50 %	50 %	89052655
3060	NC_007802	TCG	2	6	157031	157036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052655
3061	NC_007802	GC	3	6	157052	157057	0 %	0 %	50 %	50 %	89052655
3062	NC_007802	GCC	2	6	157093	157098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052655
3063	NC_007802	TGA	2	6	157164	157169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052655
3064	NC_007802	CGC	2	6	157242	157247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052655
3065	NC_007802	GGCA	2	8	157281	157288	25 %	0 %	50 %	25 %	89052655
3066	NC_007802	CAT	2	6	157380	157385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052655
3067	NC_007802	ATG	2	6	157397	157402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052655
3068	NC_007802	CG	3	6	157472	157477	0 %	0 %	50 %	50 %	89052655
3069	NC_007802	CAA	2	6	157518	157523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052655
3070	NC_007802	GCG	2	6	157607	157612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052655
3071	NC_007802	CAC	2	6	157614	157619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052655
3072	NC_007802	TCG	2	6	157631	157636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052655
3073	NC_007802	GAC	2	6	157702	157707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052655
3074	NC_007802	CCA	2	6	157766	157771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052655
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3077	NC_007802	ACA	2	6	157820	157825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052655
3078	NC_007802	GCG	2	6	157837	157842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052655
3079	NC_007802	GAA	2	6	157905	157910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052655
3080	NC_007802	CGAC	2	8	158000	158007	25 %	0 %	25 %	50 %	89052656
3081	NC_007802	CA	3	6	158010	158015	50 %	0 %	0 %	50 %	89052656
3082	NC_007802	GCG	2	6	158108	158113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052656
3083	NC_007802	CCG	2	6	158120	158125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052656
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3085	NC_007802	GGC	2	6	158205	158210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052656
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3087	NC_007802	CGC	3	9	158385	158393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052656
3088	NC_007802	TGG	2	6	158437	158442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052656
3089	NC_007802	TCTG	2	8	158502	158509	0 %	50 %	25 %	25 %	89052656
3090	NC_007802	GC	3	6	158513	158518	0 %	0 %	50 %	50 %	89052656
3091	NC_007802	CTT	2	6	158545	158550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052656
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3093	NC_007802	CG	3	6	158656	158661	0 %	0 %	50 %	50 %	89052656
3094	NC_007802	CGT	2	6	158676	158681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052656
3095	NC_007802	CTG	2	6	158794	158799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052656
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3098	NC_007802	CG	3	6	158921	158926	0 %	0 %	50 %	50 %	89052657
3099	NC_007802	CGC	2	6	158960	158965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052657
3100	NC_007802	TGG	2	6	159037	159042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052657
3101	NC_007802	TTG	3	9	159133	159141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052657
3102	NC_007802	TGG	2	6	159154	159159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052657
3103	NC_007802	ATC	2	6	159216	159221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052657
3104	NC_007802	CCG	3	9	159286	159294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052657
3105	NC_007802	GCC	3	9	159312	159320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052657
3106	NC_007802	CATC	2	8	159361	159368	25 %	25 %	0 %	50 %	89052657
3107	NC_007802	GCT	2	6	159446	159451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052657
3108	NC_007802	GC	3	6	159533	159538	0 %	0 %	50 %	50 %	89052657
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3110	NC_007802	TGAG	2	8	159607	159614	25 %	25 %	50 %	0 %	89052657
3111	NC_007802	CCA	2	6	159667	159672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052657
3112	NC_007802	TTG	2	6	159703	159708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052657
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3114	NC_007802	CAT	2	6	159779	159784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052657
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3119	NC_007802	GCG	2	6	159921	159926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052657
3120	NC_007802	GCC	2	6	159966	159971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052657
3121	NC_007802	CG	3	6	160010	160015	0 %	0 %	50 %	50 %	89052657
3122	NC_007802	GCC	2	6	160080	160085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052657
3123	NC_007802	TCG	2	6	160090	160095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052657
3124	NC_007802	CTT	2	6	160104	160109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052657
3125	NC_007802	ACG	2	6	160161	160166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052658
3126	NC_007802	TTG	3	9	160167	160175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052658
3127	NC_007802	GCG	2	6	160179	160184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052658
3128	NC_007802	CCG	3	9	160200	160208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052658
3129	NC_007802	GCG	2	6	160272	160277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052658
3130	NC_007802	CGC	2	6	160287	160292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052658
3131	NC_007802	ACC	2	6	160343	160348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052658
3132	NC_007802	GAT	2	6	160354	160359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052658
3133	NC_007802	CCA	2	6	160365	160370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052658
3134	NC_007802	GCG	2	6	160548	160553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052658
3135	NC_007802	GC	3	6	160596	160601	0 %	0 %	50 %	50 %	89052658
3136	NC_007802	CGC	2	6	160612	160617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052658
3137	NC_007802	GCG	2	6	160632	160637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052658
3138	NC_007802	ATC	2	6	160670	160675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052658
3139	NC_007802	GCA	2	6	160800	160805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052658
3140	NC_007802	GC	3	6	160893	160898	0 %	0 %	50 %	50 %	89052658
3141	NC_007802	GACGT	2	10	160935	160944	20 %	20 %	40 %	20 %	89052658
3142	NC_007802	GCG	2	6	160961	160966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052658
3143	NC_007802	AT	3	6	160997	161002	50 %	50 %	0 %	0 %	89052658
3144	NC_007802	TGGT	2	8	161010	161017	0 %	50 %	50 %	0 %	89052658
3145	NC_007802	GCC	2	6	161027	161032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052658
3146	NC_007802	GCC	2	6	161042	161047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052658
3147	NC_007802	CTA	2	6	161149	161154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052658
3148	NC_007802	GC	3	6	161255	161260	0 %	0 %	50 %	50 %	89052658
3149	NC_007802	TGC	2	6	161453	161458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052659
3150	NC_007802	GCG	2	6	161463	161468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052659
3151	NC_007802	CG	3	6	161467	161472	0 %	0 %	50 %	50 %	89052659
3152	NC_007802	TGC	2	6	161512	161517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052659
3153	NC_007802	GGCG	2	8	161538	161545	0 %	0 %	75 %	25 %	89052659
3154	NC_007802	TGA	2	6	161568	161573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052659
3155	NC_007802	GCG	2	6	161639	161644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052659
3156	NC_007802	TGA	2	6	161708	161713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052659
3157	NC_007802	CGC	2	6	161744	161749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052659
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3159	NC_007802	CGC	2	6	161972	161977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052660
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3162	NC_007802	ACA	2	6	162034	162039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052660
3163	NC_007802	GCA	2	6	162077	162082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052660
3164	NC_007802	ATC	2	6	162285	162290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052660
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3166	NC_007802	CGG	2	6	162377	162382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052661
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3181	NC_007802	CG	3	6	162963	162968	0 %	0 %	50 %	50 %	89052661
3182	NC_007802	CAT	2	6	163007	163012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052661
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3196	NC_007802	CGGG	2	8	163667	163674	0 %	0 %	75 %	25 %	89052661
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3199	NC_007802	ACTCAG	2	12	163889	163900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89052661
3200	NC_007802	GATCC	2	10	163947	163956	20 %	20 %	20 %	40 %	89052661
3201	NC_007802	TGG	2	6	163990	163995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052661
3202	NC_007802	ATGG	2	8	164040	164047	25 %	25 %	50 %	0 %	89052661
3203	NC_007802	GAT	2	6	164074	164079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052661
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3207	NC_007802	CTT	2	6	164372	164377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052662
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3214	NC_007802	ATG	3	9	164680	164688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052662
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3216	NC_007802	CG	3	6	164739	164744	0 %	0 %	50 %	50 %	89052662
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3218	NC_007802	CTG	2	6	164820	164825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052662
3219	NC_007802	GCT	3	9	164843	164851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052662
3220	NC_007802	TGT	2	6	164885	164890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052662
3221	NC_007802	CGT	2	6	164897	164902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052662
3222	NC_007802	CG	3	6	164967	164972	0 %	0 %	50 %	50 %	89052662
3223	NC_007802	GTT	2	6	165033	165038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052662
3224	NC_007802	TCA	2	6	165175	165180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052662
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3226	NC_007802	CGCC	2	8	165323	165330	0 %	0 %	25 %	75 %	89052662
3227	NC_007802	CATG	2	8	165425	165432	25 %	25 %	25 %	25 %	89052662
3228	NC_007802	CGC	2	6	165515	165520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052662
3229	NC_007802	GTC	2	6	165567	165572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052662
3230	NC_007802	CTC	2	6	165609	165614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89052663
3231	NC_007802	CGC	2	6	165626	165631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052663
3232	NC_007802	ACG	2	6	165727	165732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052663
3233	NC_007802	GATGCC	2	12	165747	165758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89052663
3234	NC_007802	ACC	2	6	165785	165790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052663
3235	NC_007802	GCTC	2	8	165856	165863	0 %	25 %	25 %	50 %	89052663
3236	NC_007802	CGC	2	6	165905	165910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052663
3237	NC_007802	TCG	2	6	165932	165937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052663
3238	NC_007802	AAC	2	6	165952	165957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052663
3239	NC_007802	GTA	2	6	166005	166010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052663
3240	NC_007802	GTC	2	6	166039	166044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052663
3241	NC_007802	ACC	2	6	166208	166213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052663
3242	NC_007802	CAG	2	6	166230	166235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052663
3243	NC_007802	GAA	2	6	166236	166241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052663
3244	NC_007802	GAT	2	6	166248	166253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052663
3245	NC_007802	ACC	2	6	166256	166261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052663
3246	NC_007802	GCG	2	6	166274	166279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052663
3247	NC_007802	GGC	2	6	166306	166311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052663
3248	NC_007802	ATC	2	6	166530	166535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052663
3249	NC_007802	ACCTGG	2	12	166561	166572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89052663
3250	NC_007802	ATT	2	6	166603	166608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89052663
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3267	NC_007802	CGG	2	6	167303	167308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052664
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3368	NC_007802	CAT	2	6	172284	172289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052670
3369	NC_007802	GCC	2	6	172326	172331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052670
3370	NC_007802	GAT	2	6	172347	172352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052670
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3372	NC_007802	TCG	2	6	172408	172413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052670
3373	NC_007802	CGT	2	6	172424	172429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052670
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3464	NC_007802	GCATG	2	10	177013	177022	20 %	20 %	40 %	20 %	89052674
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3475	NC_007802	CG	3	6	177673	177678	0 %	0 %	50 %	50 %	89052675
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3481	NC_007802	GCCGC	2	10	178056	178065	0 %	0 %	40 %	60 %	89052675
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3483	NC_007802	GGCAC	2	10	178166	178175	20 %	0 %	40 %	40 %	89052676
3484	NC_007802	ATC	2	6	178180	178185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052676
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3486	NC_007802	AGTC	2	8	178230	178237	25 %	25 %	25 %	25 %	89052676
3487	NC_007802	GCG	2	6	178275	178280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052676
3488	NC_007802	ATG	2	6	178298	178303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052676
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3490	NC_007802	ATC	2	6	178492	178497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052676
3491	NC_007802	GCG	2	6	178537	178542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052676
3492	NC_007802	ATCGG	2	10	178543	178552	20 %	20 %	40 %	20 %	89052676
3493	NC_007802	CG	4	8	178575	178582	0 %	0 %	50 %	50 %	89052676
3494	NC_007802	ATG	2	6	178585	178590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052676
3495	NC_007802	GC	3	6	178721	178726	0 %	0 %	50 %	50 %	89052677
3496	NC_007802	TGA	2	6	178744	178749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052677
3497	NC_007802	GCAG	2	8	178757	178764	25 %	0 %	50 %	25 %	89052677
3498	NC_007802	CCTC	2	8	178765	178772	0 %	25 %	0 %	75 %	89052677
3499	NC_007802	GAA	2	6	178785	178790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052677
3500	NC_007802	GC	3	6	178802	178807	0 %	0 %	50 %	50 %	89052677

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