MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 chromosome

Total Repeats: 83715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007802	GC	3	6	51919	51924	0 %	0 %	50 %	50 %	89052547
1002	NC_007802	CGGG	2	8	51951	51958	0 %	0 %	75 %	25 %	89052547
1003	NC_007802	TGG	2	6	52089	52094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052547
1004	NC_007802	CCA	2	6	52098	52103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052547
1005	NC_007802	GGA	2	6	52117	52122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052547
1006	NC_007802	G	6	6	52195	52200	0 %	0 %	100 %	0 %	89052547
1007	NC_007802	GGA	2	6	52234	52239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052547
1008	NC_007802	GCG	2	6	52257	52262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052547
1009	NC_007802	GTTCGA	2	12	52264	52275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89052547
1010	NC_007802	CAGC	2	8	52281	52288	25 %	0 %	25 %	50 %	89052547
1011	NC_007802	CCG	2	6	52376	52381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052548
1012	NC_007802	ATG	2	6	52419	52424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052548
1013	NC_007802	CCAT	2	8	52449	52456	25 %	25 %	0 %	50 %	89052548
1014	NC_007802	GTT	2	6	52521	52526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052548
1015	NC_007802	CGA	2	6	52530	52535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052548
1016	NC_007802	GCA	2	6	52594	52599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052548
1017	NC_007802	ACTG	2	8	52652	52659	25 %	25 %	25 %	25 %	89052548
1018	NC_007802	TGG	2	6	52706	52711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052548
1019	NC_007802	CGT	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052548
1020	NC_007802	GTCA	2	8	52866	52873	25 %	25 %	25 %	25 %	89052548
1021	NC_007802	A	6	6	52921	52926	100 %	0 %	0 %	0 %	89052548
1022	NC_007802	AC	3	6	53004	53009	50 %	0 %	0 %	50 %	89052548
1023	NC_007802	CG	3	6	53022	53027	0 %	0 %	50 %	50 %	89052548
1024	NC_007802	CATC	2	8	53081	53088	25 %	25 %	0 %	50 %	89052549
1025	NC_007802	GT	3	6	53105	53110	0 %	50 %	50 %	0 %	89052549
1026	NC_007802	TCGA	2	8	53116	53123	25 %	25 %	25 %	25 %	89052549
1027	NC_007802	GCC	2	6	53172	53177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052549
1028	NC_007802	GCC	2	6	53190	53195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052549
1029	NC_007802	GCC	2	6	53262	53267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052549
1030	NC_007802	AGG	2	6	53309	53314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052549
1031	NC_007802	CAG	2	6	53479	53484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052549
1032	NC_007802	GGC	2	6	53514	53519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052549
1033	NC_007802	CGTT	2	8	53654	53661	0 %	50 %	25 %	25 %	89052550
1034	NC_007802	TC	3	6	53669	53674	0 %	50 %	0 %	50 %	89052550
1035	NC_007802	TCAG	2	8	53734	53741	25 %	25 %	25 %	25 %	89052550
1036	NC_007802	AGGT	2	8	53926	53933	25 %	25 %	50 %	0 %	89052550
1037	NC_007802	CGC	2	6	53961	53966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052550
1038	NC_007802	GCGG	2	8	53973	53980	0 %	0 %	75 %	25 %	89052550
1039	NC_007802	GCC	2	6	53994	53999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052550
1040	NC_007802	CACCCA	2	12	54104	54115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052550
1041	NC_007802	GGC	2	6	54126	54131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052550
1042	NC_007802	GAGG	2	8	54171	54178	25 %	0 %	75 %	0 %	89052550
1043	NC_007802	CCGCTC	2	12	54222	54233	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	89052550
1044	NC_007802	TGC	2	6	54250	54255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052550
1045	NC_007802	GGC	2	6	54285	54290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052550
1046	NC_007802	CTG	2	6	54321	54326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052550
1047	NC_007802	ACG	3	9	54334	54342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052550
1048	NC_007802	TGA	2	6	54356	54361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052550
1049	NC_007802	TC	3	6	54371	54376	0 %	50 %	0 %	50 %	89052550
1050	NC_007802	CTG	2	6	54408	54413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052550
1051	NC_007802	TGA	2	6	54434	54439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052550
1052	NC_007802	GCC	2	6	54483	54488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052550
1053	NC_007802	CAAG	2	8	54500	54507	50 %	0 %	25 %	25 %	89052550
1054	NC_007802	GGCA	2	8	54516	54523	25 %	0 %	50 %	25 %	89052550
1055	NC_007802	AGC	2	6	54543	54548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052550
1056	NC_007802	GGT	2	6	54552	54557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052550
1057	NC_007802	GATCG	2	10	54573	54582	20 %	20 %	40 %	20 %	89052550
1058	NC_007802	TCA	2	6	54631	54636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052550
1059	NC_007802	GCG	2	6	54683	54688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052550
1060	NC_007802	GCGT	2	8	54697	54704	0 %	25 %	50 %	25 %	89052550
1061	NC_007802	CG	3	6	54729	54734	0 %	0 %	50 %	50 %	89052550
1062	NC_007802	GAT	2	6	54855	54860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052550
1063	NC_007802	CAT	2	6	54876	54881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89052550
1064	NC_007802	GC	3	6	54882	54887	0 %	0 %	50 %	50 %	89052550
1065	NC_007802	GTGATC	2	12	55133	55144	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89052551
1066	NC_007802	CAG	2	6	55198	55203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052551
1067	NC_007802	GC	3	6	55211	55216	0 %	0 %	50 %	50 %	89052551
1068	NC_007802	AGG	2	6	55326	55331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89052551
1069	NC_007802	ACG	2	6	55364	55369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052551
1070	NC_007802	GTG	2	6	55412	55417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052551
1071	NC_007802	CG	3	6	55457	55462	0 %	0 %	50 %	50 %	89052551
1072	NC_007802	CG	3	6	55507	55512	0 %	0 %	50 %	50 %	89052551
1073	NC_007802	GAT	2	6	55525	55530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052551
1074	NC_007802	GCG	3	9	55583	55591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052551
1075	NC_007802	GGC	2	6	55660	55665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052551
1076	NC_007802	TCT	2	6	55686	55691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89052551
1077	NC_007802	GGTC	2	8	55710	55717	0 %	25 %	50 %	25 %	89052551
1078	NC_007802	CG	3	6	55779	55784	0 %	0 %	50 %	50 %	89052551
1079	NC_007802	GCG	2	6	55903	55908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052551
1080	NC_007802	CGT	2	6	56076	56081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052552
1081	NC_007802	TTG	2	6	56200	56205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89052552
1082	NC_007802	GGC	2	6	56223	56228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052552
1083	NC_007802	CCG	2	6	56258	56263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052552
1084	NC_007802	GGC	2	6	56286	56291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052552
1085	NC_007802	GCA	2	6	56360	56365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052552
1086	NC_007802	GAAGC	2	10	56383	56392	40 %	0 %	40 %	20 %	89052552
1087	NC_007802	GC	3	6	56391	56396	0 %	0 %	50 %	50 %	89052552
1088	NC_007802	TGC	2	6	56404	56409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052552
1089	NC_007802	CAG	2	6	56427	56432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052552
1090	NC_007802	CTC	2	6	56433	56438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89052552
1091	NC_007802	CAA	2	6	56462	56467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89052552
1092	NC_007802	GCA	2	6	56534	56539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052552
1093	NC_007802	CCA	2	6	56657	56662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052552
1094	NC_007802	CCA	2	6	56729	56734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052552
1095	NC_007802	CGG	2	6	56759	56764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052552
1096	NC_007802	GCC	2	6	56784	56789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052552
1097	NC_007802	GCGG	2	8	56871	56878	0 %	0 %	75 %	25 %	89052552
1098	NC_007802	GC	4	8	57154	57161	0 %	0 %	50 %	50 %	89052553
1099	NC_007802	TCG	2	6	57219	57224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052553
1100	NC_007802	CTG	2	6	57235	57240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052553
1101	NC_007802	CAC	2	6	57334	57339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052553
1102	NC_007802	TCACCG	2	12	57342	57353	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89052553
1103	NC_007802	CG	3	6	57399	57404	0 %	0 %	50 %	50 %	89052553
1104	NC_007802	ATG	3	9	57497	57505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052553
1105	NC_007802	CCGT	2	8	57527	57534	0 %	25 %	25 %	50 %	89052553
1106	NC_007802	GGC	2	6	57545	57550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052553
1107	NC_007802	CCG	2	6	57591	57596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052553
1108	NC_007802	TGACC	2	10	57610	57619	20 %	20 %	20 %	40 %	89052553
1109	NC_007802	GCC	2	6	57674	57679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052553
1110	NC_007802	TGCC	2	8	57700	57707	0 %	25 %	25 %	50 %	89052553
1111	NC_007802	TG	3	6	57755	57760	0 %	50 %	50 %	0 %	89052553
1112	NC_007802	CTC	2	6	57790	57795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89052553
1113	NC_007802	GGAA	2	8	57822	57829	50 %	0 %	50 %	0 %	89052553
1114	NC_007802	CG	3	6	57848	57853	0 %	0 %	50 %	50 %	89052553
1115	NC_007802	TGA	2	6	57855	57860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052553
1116	NC_007802	CGT	2	6	57892	57897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052553
1117	NC_007802	CCA	2	6	57951	57956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89052553
1118	NC_007802	TCG	2	6	58050	58055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052553
1119	NC_007802	CGG	2	6	58066	58071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052553
1120	NC_007802	GCG	2	6	58104	58109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052553
1121	NC_007802	TGA	2	6	58119	58124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89052553
1122	NC_007802	CGG	2	6	58264	58269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052553
1123	NC_007802	CG	4	8	58360	58367	0 %	0 %	50 %	50 %	89052553
1124	NC_007802	GAA	2	6	58379	58384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052553
1125	NC_007802	GCC	2	6	58394	58399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89052553
1126	NC_007802	GC	3	6	58406	58411	0 %	0 %	50 %	50 %	89052553
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1128	NC_007802	CGA	2	6	58488	58493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052553
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1132	NC_007802	CTG	2	6	58625	58630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052553
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1246	NC_007802	GC	3	6	64167	64172	0 %	0 %	50 %	50 %	89052560
1247	NC_007802	TGC	2	6	64195	64200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89052560
1248	NC_007802	CCCGC	2	10	64208	64217	0 %	0 %	20 %	80 %	89052560
1249	NC_007802	GGT	2	6	64358	64363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89052560
1250	NC_007802	GT	4	8	64362	64369	0 %	50 %	50 %	0 %	89052560
1251	NC_007802	CCT	2	6	64502	64507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89052560
1252	NC_007802	GAC	2	6	64515	64520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89052560
1253	NC_007802	AAG	2	6	64545	64550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89052560
1254	NC_007802	GGTTT	2	10	64642	64651	0 %	60 %	40 %	0 %	89052560
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1256	NC_007802	GCG	3	9	64740	64748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89052561
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