MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 plasmid1

Total Repeats: 1446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007801	ATC	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
2	NC_007801	TCA	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
3	NC_007801	CGG	2	6	278	283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
4	NC_007801	ACG	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
5	NC_007801	GGT	2	6	314	319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057700
6	NC_007801	CCAT	2	8	382	389	25 %	25 %	0 %	50 %	89057700
7	NC_007801	ATC	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
8	NC_007801	CG	3	6	459	464	0 %	0 %	50 %	50 %	89057700
9	NC_007801	CGA	2	6	473	478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
10	NC_007801	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057700
11	NC_007801	TCCA	2	8	549	556	25 %	25 %	0 %	50 %	89057700
12	NC_007801	CCA	2	6	566	571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057700
13	NC_007801	GCATC	2	10	575	584	20 %	20 %	20 %	40 %	89057700
14	NC_007801	ATC	3	9	582	590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
15	NC_007801	CG	4	8	659	666	0 %	0 %	50 %	50 %	89057700
16	NC_007801	GGCAC	2	10	721	730	20 %	0 %	40 %	40 %	89057700
17	NC_007801	GGC	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
18	NC_007801	GGCCTC	2	12	792	803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89057700
19	NC_007801	GAA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057700
20	NC_007801	GCC	2	6	831	836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
21	NC_007801	GCC	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
22	NC_007801	GCA	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
23	NC_007801	TGA	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057700
24	NC_007801	GGAACA	2	12	911	922	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	89057700
25	NC_007801	AGGT	2	8	937	944	25 %	25 %	50 %	0 %	89057700
26	NC_007801	GCGG	2	8	963	970	0 %	0 %	75 %	25 %	89057700
27	NC_007801	GGC	2	6	972	977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
28	NC_007801	ATAGCC	2	12	1044	1055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89057700
29	NC_007801	CGG	2	6	1106	1111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
30	NC_007801	ACGG	2	8	1112	1119	25 %	0 %	50 %	25 %	89057700
31	NC_007801	CGA	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
32	NC_007801	TCA	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057700
33	NC_007801	CAG	3	9	1212	1220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057700
34	NC_007801	CCG	2	6	1334	1339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
35	NC_007801	GCG	2	6	1354	1359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
36	NC_007801	GCG	2	6	1418	1423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057700
37	NC_007801	CGC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057700
38	NC_007801	GAT	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057700
39	NC_007801	TG	3	6	1871	1876	0 %	50 %	50 %	0 %	89057701
40	NC_007801	GCC	3	9	1974	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057701
41	NC_007801	CGA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057701
42	NC_007801	GT	3	6	2061	2066	0 %	50 %	50 %	0 %	89057701
43	NC_007801	CG	3	6	2085	2090	0 %	0 %	50 %	50 %	89057701
44	NC_007801	GGA	2	6	2149	2154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057701
45	NC_007801	CAT	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057701
46	NC_007801	CG	3	6	2227	2232	0 %	0 %	50 %	50 %	89057701
47	NC_007801	ATCT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	89057701
48	NC_007801	CGC	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057701
49	NC_007801	GC	3	6	2471	2476	0 %	0 %	50 %	50 %	89057701
50	NC_007801	CGGCAT	2	12	2488	2499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89057701
51	NC_007801	CTGA	2	8	2826	2833	25 %	25 %	25 %	25 %	89057702
52	NC_007801	GCA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057702
53	NC_007801	GCG	2	6	3037	3042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
54	NC_007801	GAT	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057702
55	NC_007801	GCC	2	6	3144	3149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057702
56	NC_007801	ATG	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057702
57	NC_007801	CGCC	2	8	3157	3164	0 %	0 %	25 %	75 %	89057702
58	NC_007801	C	6	6	3187	3192	0 %	0 %	0 %	100 %	89057702
59	NC_007801	TCGG	2	8	3297	3304	0 %	25 %	50 %	25 %	89057702
60	NC_007801	CTG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057702
61	NC_007801	GGC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
62	NC_007801	TCC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89057702
63	NC_007801	GGC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
64	NC_007801	GGC	3	9	3612	3620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
65	NC_007801	GATCG	2	10	3641	3650	20 %	20 %	40 %	20 %	89057702
66	NC_007801	GC	3	6	3689	3694	0 %	0 %	50 %	50 %	89057702
67	NC_007801	TGA	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057702
68	NC_007801	CG	3	6	3869	3874	0 %	0 %	50 %	50 %	89057702
69	NC_007801	CGG	2	6	3883	3888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057702
70	NC_007801	TGC	3	9	3967	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057702
71	NC_007801	ACC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057702
72	NC_007801	CTG	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057702
73	NC_007801	CAA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89057702
74	NC_007801	GC	3	6	4213	4218	0 %	0 %	50 %	50 %	89057703
75	NC_007801	GCG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057703
76	NC_007801	GGC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057703
77	NC_007801	AGGC	2	8	4443	4450	25 %	0 %	50 %	25 %	89057703
78	NC_007801	CAG	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057703
79	NC_007801	ATC	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057703
80	NC_007801	GCCC	2	8	4575	4582	0 %	0 %	25 %	75 %	89057703
81	NC_007801	CG	3	6	4619	4624	0 %	0 %	50 %	50 %	89057703
82	NC_007801	GCCC	2	8	4644	4651	0 %	0 %	25 %	75 %	89057703
83	NC_007801	CG	3	6	4678	4683	0 %	0 %	50 %	50 %	89057703
84	NC_007801	CGT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057703
85	NC_007801	CCG	2	6	4772	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
86	NC_007801	GCC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
87	NC_007801	GAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057703
88	NC_007801	CCG	2	6	4858	4863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
89	NC_007801	CCG	2	6	4881	4886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
90	NC_007801	CAG	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057703
91	NC_007801	CGCC	2	8	4974	4981	0 %	0 %	25 %	75 %	89057703
92	NC_007801	GCA	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057703
93	NC_007801	CCG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057703
94	NC_007801	AT	3	6	5042	5047	50 %	50 %	0 %	0 %	89057703
95	NC_007801	AT	3	6	5051	5056	50 %	50 %	0 %	0 %	89057703
96	NC_007801	GAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057704
97	NC_007801	TG	3	6	5404	5409	0 %	50 %	50 %	0 %	89057704
98	NC_007801	GCA	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057704
99	NC_007801	TGT	2	6	5703	5708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057704
100	NC_007801	CGT	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057704
101	NC_007801	GCC	2	6	5958	5963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057704
102	NC_007801	GAG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057704
103	NC_007801	CG	3	6	6290	6295	0 %	0 %	50 %	50 %	89057704
104	NC_007801	AT	3	6	6305	6310	50 %	50 %	0 %	0 %	89057704
105	NC_007801	CTG	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057704
106	NC_007801	GAT	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057704
107	NC_007801	CAC	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057704
108	NC_007801	GCCGAT	2	12	6500	6511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89057704
109	NC_007801	TCA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057704
110	NC_007801	CGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057704
111	NC_007801	CCA	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057704
112	NC_007801	GCG	2	6	6624	6629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057704
113	NC_007801	CGG	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057704
114	NC_007801	GGA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057704
115	NC_007801	ATC	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057704
116	NC_007801	CACC	2	8	6802	6809	25 %	0 %	0 %	75 %	89057704
117	NC_007801	AGCA	2	8	6833	6840	50 %	0 %	25 %	25 %	89057704
118	NC_007801	TCT	2	6	7298	7303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057705
119	NC_007801	CGA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057705
120	NC_007801	ACC	2	6	7375	7380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057705
121	NC_007801	CAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057705
122	NC_007801	TGG	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057705
123	NC_007801	TTC	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057706
124	NC_007801	GACAGC	2	12	7649	7660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057706
125	NC_007801	GCT	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057706
126	NC_007801	GCGG	2	8	7752	7759	0 %	0 %	75 %	25 %	89057706
127	NC_007801	AGC	2	6	7795	7800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057706
128	NC_007801	CGA	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057706
129	NC_007801	CAT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057706
130	NC_007801	GCGCC	2	10	7900	7909	0 %	0 %	40 %	60 %	89057706
131	NC_007801	CGGCA	2	10	7978	7987	20 %	0 %	40 %	40 %	89057706
132	NC_007801	AGAT	2	8	8034	8041	50 %	25 %	25 %	0 %	89057706
133	NC_007801	CAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057706
134	NC_007801	TGA	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057706
135	NC_007801	ATG	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057706
136	NC_007801	AG	3	6	8269	8274	50 %	0 %	50 %	0 %	89057706
137	NC_007801	CTG	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057706
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141	NC_007801	ATC	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057706
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144	NC_007801	ACCA	2	8	8820	8827	50 %	0 %	0 %	50 %	89057707
145	NC_007801	GCA	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057707
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171	NC_007801	GC	3	6	10637	10642	0 %	0 %	50 %	50 %	89057712
172	NC_007801	CG	3	6	10662	10667	0 %	0 %	50 %	50 %	89057712
173	NC_007801	GCG	2	6	10767	10772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057712
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253	NC_007801	CA	4	8	15745	15752	50 %	0 %	0 %	50 %	89057716
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262	NC_007801	ATT	2	6	16378	16383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89057717
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267	NC_007801	GTC	2	6	16661	16666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057717
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397	NC_007801	CTC	2	6	24447	24452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89057722
398	NC_007801	AGC	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057722
399	NC_007801	TCCCG	2	10	24663	24672	0 %	20 %	20 %	60 %	89057723
400	NC_007801	CG	3	6	24671	24676	0 %	0 %	50 %	50 %	89057723
401	NC_007801	ATA	2	6	24828	24833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89057723
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410	NC_007801	CGC	2	6	25276	25281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057723
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412	NC_007801	CGA	2	6	25986	25991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057724
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422	NC_007801	CG	3	6	26430	26435	0 %	0 %	50 %	50 %	89057724
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431	NC_007801	ACCA	2	8	26765	26772	50 %	0 %	0 %	50 %	89057724
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