MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Jannaschia sp. CCS1 plasmid1

Total Repeats: 1446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007801	TGAG	2	8	30552	30559	25 %	25 %	50 %	0 %	89057728
502	NC_007801	CGA	2	6	30589	30594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057728
503	NC_007801	TGG	2	6	30627	30632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057728
504	NC_007801	GCC	2	6	30650	30655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057728
505	NC_007801	GAA	2	6	30738	30743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057728
506	NC_007801	CAC	2	6	30746	30751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057728
507	NC_007801	CAA	2	6	30752	30757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89057728
508	NC_007801	ATA	2	6	30776	30781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89057728
509	NC_007801	GA	4	8	30857	30864	50 %	0 %	50 %	0 %	89057728
510	NC_007801	CGC	2	6	30935	30940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057728
511	NC_007801	GCCA	2	8	30953	30960	25 %	0 %	25 %	50 %	89057728
512	NC_007801	ATA	2	6	31061	31066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89057728
513	NC_007801	TCT	2	6	31080	31085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057728
514	NC_007801	CAT	2	6	31100	31105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057728
515	NC_007801	AC	3	6	31345	31350	50 %	0 %	0 %	50 %	89057729
516	NC_007801	C	6	6	31369	31374	0 %	0 %	0 %	100 %	89057729
517	NC_007801	ATC	2	6	31513	31518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057729
518	NC_007801	ACC	2	6	31608	31613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057729
519	NC_007801	T	6	6	31644	31649	0 %	100 %	0 %	0 %	89057729
520	NC_007801	CG	4	8	31660	31667	0 %	0 %	50 %	50 %	89057729
521	NC_007801	TGCGTT	2	12	31709	31720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	89057729
522	NC_007801	GTC	2	6	31737	31742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057729
523	NC_007801	CCCTG	2	10	31754	31763	0 %	20 %	20 %	60 %	89057729
524	NC_007801	GCC	2	6	31827	31832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057729
525	NC_007801	GCC	2	6	31851	31856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057729
526	NC_007801	T	6	6	31881	31886	0 %	100 %	0 %	0 %	89057729
527	NC_007801	CGT	2	6	31889	31894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057729
528	NC_007801	TGT	2	6	31897	31902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057729
529	NC_007801	TGA	2	6	31912	31917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057729
530	NC_007801	ACGG	2	8	31936	31943	25 %	0 %	50 %	25 %	89057729
531	NC_007801	TGG	2	6	31976	31981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057729
532	NC_007801	TGGC	2	8	32001	32008	0 %	25 %	50 %	25 %	89057729
533	NC_007801	TA	3	6	32147	32152	50 %	50 %	0 %	0 %	89057729
534	NC_007801	TGGC	2	8	32316	32323	0 %	25 %	50 %	25 %	89057729
535	NC_007801	GTT	2	6	32382	32387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057729
536	NC_007801	T	6	6	32528	32533	0 %	100 %	0 %	0 %	89057729
537	NC_007801	TTG	2	6	32544	32549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89057729
538	NC_007801	CT	3	6	32640	32645	0 %	50 %	0 %	50 %	89057729
539	NC_007801	GTG	2	6	32658	32663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057729
540	NC_007801	TCTG	2	8	32702	32709	0 %	50 %	25 %	25 %	89057729
541	NC_007801	TCG	2	6	32737	32742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057729
542	NC_007801	GGCG	2	8	32773	32780	0 %	0 %	75 %	25 %	89057729
543	NC_007801	CGCCT	2	10	32822	32831	0 %	20 %	20 %	60 %	89057729
544	NC_007801	CGG	2	6	32900	32905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057730
545	NC_007801	ACC	2	6	33019	33024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057730
546	NC_007801	TCT	2	6	33042	33047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057730
547	NC_007801	GAT	2	6	33048	33053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057730
548	NC_007801	T	7	7	33153	33159	0 %	100 %	0 %	0 %	89057730
549	NC_007801	CT	3	6	33161	33166	0 %	50 %	0 %	50 %	89057730
550	NC_007801	TGG	2	6	33178	33183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057730
551	NC_007801	GCC	2	6	33249	33254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057730
552	NC_007801	CG	3	6	33261	33266	0 %	0 %	50 %	50 %	89057730
553	NC_007801	CGC	2	6	33268	33273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057730
554	NC_007801	CCG	2	6	33304	33309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057730
555	NC_007801	GCC	2	6	33369	33374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057730
556	NC_007801	CG	3	6	33413	33418	0 %	0 %	50 %	50 %	89057730
557	NC_007801	TCA	2	6	33427	33432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057730
558	NC_007801	CGC	3	9	33537	33545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057730
559	NC_007801	GTC	2	6	33578	33583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057730
560	NC_007801	GAA	2	6	33599	33604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89057730
561	NC_007801	TG	3	6	33630	33635	0 %	50 %	50 %	0 %	89057730
562	NC_007801	GC	3	6	33704	33709	0 %	0 %	50 %	50 %	89057730
563	NC_007801	GGA	2	6	33731	33736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057730
564	NC_007801	ATG	2	6	33838	33843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057730
565	NC_007801	TGCC	2	8	33889	33896	0 %	25 %	25 %	50 %	89057730
566	NC_007801	TGGT	2	8	33910	33917	0 %	50 %	50 %	0 %	89057730
567	NC_007801	TCT	2	6	33950	33955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89057730
568	NC_007801	GAT	2	6	34026	34031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057730
569	NC_007801	GGT	2	6	34172	34177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057731
570	NC_007801	GCA	3	9	34237	34245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057731
571	NC_007801	ATGT	2	8	34247	34254	25 %	50 %	25 %	0 %	89057731
572	NC_007801	CGC	2	6	34263	34268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057731
573	NC_007801	ACC	2	6	34280	34285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057731
574	NC_007801	ACCAT	2	10	34335	34344	40 %	20 %	0 %	40 %	89057731
575	NC_007801	TCG	2	6	34439	34444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057731
576	NC_007801	GC	3	6	34503	34508	0 %	0 %	50 %	50 %	89057731
577	NC_007801	GGC	2	6	34560	34565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057731
578	NC_007801	CGG	2	6	34578	34583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057731
579	NC_007801	GGC	2	6	34589	34594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057731
580	NC_007801	ATC	2	6	34685	34690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89057731
581	NC_007801	GGC	2	6	34817	34822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057731
582	NC_007801	GGA	2	6	34834	34839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89057731
583	NC_007801	CGCT	2	8	34877	34884	0 %	25 %	25 %	50 %	89057731
584	NC_007801	CG	3	6	34930	34935	0 %	0 %	50 %	50 %	89057731
585	NC_007801	GCGG	2	8	34970	34977	0 %	0 %	75 %	25 %	89057731
586	NC_007801	CTTC	2	8	34984	34991	0 %	50 %	0 %	50 %	89057731
587	NC_007801	CCCG	2	8	35002	35009	0 %	0 %	25 %	75 %	89057731
588	NC_007801	GCC	2	6	35040	35045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057731
589	NC_007801	CG	3	6	35046	35051	0 %	0 %	50 %	50 %	89057731
590	NC_007801	CGGG	2	8	35152	35159	0 %	0 %	75 %	25 %	89057732
591	NC_007801	CCG	2	6	35182	35187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057732
592	NC_007801	GCT	2	6	35192	35197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057732
593	NC_007801	G	9	9	35251	35259	0 %	0 %	100 %	0 %	89057732
594	NC_007801	GGCC	2	8	35263	35270	0 %	0 %	50 %	50 %	89057732
595	NC_007801	CGA	2	6	35312	35317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89057732
596	NC_007801	GCC	2	6	35367	35372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057732
597	NC_007801	GA	3	6	35455	35460	50 %	0 %	50 %	0 %	89057732
598	NC_007801	GCG	2	6	35576	35581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057732
599	NC_007801	GT	3	6	35584	35589	0 %	50 %	50 %	0 %	89057732
600	NC_007801	CCCGGC	2	12	35601	35612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057732
601	NC_007801	CGC	2	6	35702	35707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057732
602	NC_007801	GC	4	8	35840	35847	0 %	0 %	50 %	50 %	89057732
603	NC_007801	GC	3	6	35866	35871	0 %	0 %	50 %	50 %	89057732
604	NC_007801	GCG	2	6	35965	35970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057732
605	NC_007801	AC	3	6	36070	36075	50 %	0 %	0 %	50 %	89057732
606	NC_007801	TGGC	2	8	36113	36120	0 %	25 %	50 %	25 %	89057732
607	NC_007801	TGGA	2	8	36165	36172	25 %	25 %	50 %	0 %	89057732
608	NC_007801	CGC	2	6	36176	36181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057732
609	NC_007801	CCCG	2	8	36182	36189	0 %	0 %	25 %	75 %	89057732
610	NC_007801	A	6	6	36211	36216	100 %	0 %	0 %	0 %	89057732
611	NC_007801	GAT	2	6	36561	36566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057733
612	NC_007801	GTG	2	6	36579	36584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057733
613	NC_007801	TGG	2	6	36625	36630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057733
614	NC_007801	CGATGA	2	12	36655	36666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89057733
615	NC_007801	CA	3	6	36675	36680	50 %	0 %	0 %	50 %	89057733
616	NC_007801	TGA	3	9	36713	36721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89057733
617	NC_007801	CG	4	8	36722	36729	0 %	0 %	50 %	50 %	89057733
618	NC_007801	AGGCCG	2	12	36940	36951	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89057733
619	NC_007801	GCC	2	6	36989	36994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057734
620	NC_007801	CAC	2	6	37031	37036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89057734
621	NC_007801	GTG	2	6	37115	37120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057734
622	NC_007801	ACCA	2	8	37127	37134	50 %	0 %	0 %	50 %	89057734
623	NC_007801	GC	3	6	37218	37223	0 %	0 %	50 %	50 %	89057734
624	NC_007801	CG	3	6	37272	37277	0 %	0 %	50 %	50 %	89057734
625	NC_007801	TCG	2	6	37278	37283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89057734
626	NC_007801	CCGGGC	2	12	37301	37312	0 %	0 %	50 %	50 %	89057734
627	NC_007801	GC	3	6	37321	37326	0 %	0 %	50 %	50 %	89057734
628	NC_007801	ATT	2	6	37514	37519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89057734
629	NC_007801	CGG	2	6	37569	37574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89057735
630	NC_007801	G	7	7	37663	37669	0 %	0 %	100 %	0 %	89057735
631	NC_007801	GTG	2	6	37690	37695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89057735
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633	NC_007801	CGC	3	9	37767	37775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89057735
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