MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 9731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015588	CTCG	2	8	38	45	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015588	CAG	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015588	CCCT	2	8	165	172	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015588	GCG	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015588	CCG	2	6	1648	1653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015588	CG	3	6	1678	1683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015588	CG	3	6	1686	1691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015588	GTCC	2	8	1747	1754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015588	AC	3	6	1769	1774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015588	CCAC	2	8	1868	1875	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015588	GCC	2	6	1899	1904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015588	GTCC	2	8	1909	1916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015588	CCG	2	6	1920	1925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015588	CGA	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015588	GAC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015588	TCA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015588	GAC	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015588	CGAC	2	8	2125	2132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015588	CG	4	8	2148	2155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015588	CGT	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015588	CGCCGT	2	12	3360	3371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015588	CA	3	6	3395	3400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015588	GGA	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015588	GAC	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015588	CG	4	8	5693	5700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015588	GCC	2	6	5701	5706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015588	CGGT	2	8	5710	5717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015588	GC	3	6	7114	7119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015588	CGC	2	6	7165	7170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015588	CGG	2	6	7254	7259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015588	CGG	2	6	7308	7313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015588	TTC	2	6	7356	7361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015588	CG	4	8	7447	7454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015588	GAC	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015588	GTCG	2	8	7476	7483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015588	GGT	2	6	7501	7506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015588	CGA	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015588	TGC	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015588	GAG	2	6	7612	7617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015588	GAG	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015588	GGC	2	6	9733	9738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015588	GGAA	2	8	9742	9749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015588	CCGT	2	8	13255	13262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015588	CGG	2	6	13325	13330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015588	TGC	2	6	13346	13351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015588	TCC	2	6	13435	13440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015588	CGC	2	6	13474	13479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015588	GAG	2	6	13492	13497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015588	CTCC	2	8	13625	13632	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_015588	CACG	2	8	13726	13733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015588	GC	3	6	14736	14741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015588	CGC	2	6	14753	14758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015588	CTT	2	6	15345	15350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015588	GTC	2	6	15385	15390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015588	CCCG	2	8	15393	15400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_015588	GGA	2	6	15412	15417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015588	CG	3	6	16306	16311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015588	CGT	2	6	16313	16318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015588	GGT	2	6	16657	16662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015588	GCG	2	6	16663	16668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015588	GGT	2	6	16745	16750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015588	GC	3	6	19363	19368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015588	GTC	3	9	19385	19393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015588	CGA	2	6	19405	19410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015588	CGC	2	6	19487	19492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015588	CGG	2	6	19527	19532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015588	CGA	2	6	19569	19574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015588	CGC	2	6	19587	19592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015588	CGGC	2	8	19607	19614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015588	CCT	2	6	28724	28729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015588	GCA	2	6	28783	28788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015588	CGG	2	6	28853	28858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015588	ACG	2	6	28863	28868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015588	GCGT	2	8	28883	28890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015588	CCCGC	2	10	28896	28905	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
76	NC_015588	TCT	2	6	28936	28941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015588	CG	3	6	28948	28953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015588	C	6	6	29020	29025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_015588	TCG	2	6	29070	29075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015588	TC	4	8	29088	29095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015588	ACG	2	6	29137	29142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015588	ACG	2	6	29157	29162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015588	GC	3	6	29166	29171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015588	CG	3	6	29195	29200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015588	CGAC	2	8	29273	29280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015588	CG	3	6	29297	29302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015588	CGC	2	6	29310	29315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015588	CAC	2	6	29329	29334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015588	GCA	2	6	29336	29341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015588	ACG	2	6	29362	29367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015588	TCG	2	6	30983	30988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015588	CG	3	6	31003	31008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015588	CTC	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015588	GTC	2	6	31806	31811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015588	CCG	2	6	31829	31834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015588	GC	3	6	31861	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015588	GC	3	6	31882	31887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015588	CGA	2	6	31896	31901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015588	CGCACC	2	12	31909	31920	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015588	CTG	2	6	32663	32668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015588	GGCAC	2	10	32683	32692	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015588	GGT	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015588	CG	3	6	32732	32737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015588	CG	3	6	32763	32768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015588	GC	3	6	32774	32779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015588	ACC	2	6	32781	32786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015588	ACG	2	6	32840	32845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015588	CG	3	6	32857	32862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015588	C	6	6	33814	33819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_015588	GC	3	6	33833	33838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015588	CCG	2	6	33847	33852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015588	GGC	2	6	33871	33876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015588	CG	4	8	36070	36077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015588	CCT	2	6	36649	36654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015588	GTG	3	9	36675	36683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015588	CCCT	2	8	38284	38291	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_015588	CTGT	2	8	41668	41675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015588	ATG	2	6	41703	41708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015588	CCG	2	6	42898	42903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015588	GA	3	6	43033	43038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015588	GA	3	6	43053	43058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015588	GC	3	6	43078	43083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015588	GA	3	6	43093	43098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015588	CGG	2	6	43847	43852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015588	CGG	2	6	43900	43905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015588	GGA	2	6	44048	44053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015588	ACC	2	6	44949	44954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015588	CG	4	8	45879	45886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015588	GCC	2	6	45909	45914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015588	CGA	2	6	45922	45927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015588	CTT	2	6	52133	52138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015588	CCGG	2	8	52145	52152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015588	GTCC	2	8	52174	52181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015588	CG	4	8	52214	52221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015588	CGCGGG	2	12	52227	52238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015588	GC	3	6	52255	52260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015588	ACG	2	6	52789	52794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015588	CGCGG	2	10	52801	52810	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015588	CGGG	2	8	52822	52829	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015588	GCG	2	6	52831	52836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015588	CCT	2	6	53161	53166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015588	GCA	2	6	53168	53173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015588	GTG	2	6	53178	53183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015588	CG	4	8	53191	53198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015588	G	6	6	53207	53212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015588	CCGG	2	8	53252	53259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015588	CCAG	2	8	53316	53323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015588	CGTC	3	12	54248	54259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015588	GCC	2	6	54310	54315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_015588	GCG	2	6	54322	54327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015588	TCGA	2	8	54334	54341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015588	GGA	2	6	54343	54348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015588	CG	3	6	54734	54739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015588	CCG	2	6	56198	56203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_015588	CCG	2	6	56218	56223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_015588	CGA	2	6	56239	56244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015588	CGC	2	6	56279	56284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_015588	CCG	2	6	61837	61842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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292	NC_015588	CGG	2	6	94085	94090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_015588	CGC	2	6	94093	94098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_015588	CG	3	6	94112	94117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
295	NC_015588	GCT	2	6	94166	94171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_015588	CGG	2	6	94175	94180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_015588	GC	3	6	94189	94194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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301	NC_015588	CG	3	6	94307	94312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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420	NC_015588	CGAGC	2	10	123354	123363	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
421	NC_015588	CCG	2	6	123365	123370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_015588	CGC	2	6	123383	123388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_015588	CG	3	6	123402	123407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
424	NC_015588	CG	4	8	123413	123420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
425	NC_015588	CGAGCT	2	12	123428	123439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_015588	CGTCGC	2	12	123440	123451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
427	NC_015588	CG	3	6	123466	123471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
428	NC_015588	GCG	2	6	123473	123478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_015588	CCGG	2	8	123500	123507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
430	NC_015588	CGA	3	9	123539	123547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_015588	GC	4	8	123557	123564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
432	NC_015588	CGC	2	6	123575	123580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_015588	CGC	2	6	123594	123599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_015588	CGC	2	6	123630	123635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_015588	GC	3	6	123634	123639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
436	NC_015588	CG	3	6	123646	123651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
437	NC_015588	CGC	2	6	123681	123686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_015588	CGGC	2	8	123693	123700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
439	NC_015588	GAC	2	6	123735	123740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_015588	CCG	2	6	123755	123760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_015588	CGC	3	9	123833	123841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_015588	CGA	2	6	123846	123851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_015588	CG	3	6	123876	123881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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448	NC_015588	GCGG	2	8	123922	123929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_015588	CGC	2	6	124007	124012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_015588	GGCC	2	8	124019	124026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_015588	CG	3	6	124049	124054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
454	NC_015588	GCG	2	6	124058	124063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_015588	AGC	2	6	124195	124200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_015588	GCC	2	6	124278	124283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_015588	CGT	3	9	124323	124331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_015588	CGA	2	6	124451	124456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_015588	CGT	2	6	124463	124468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_015588	CGCACG	2	12	124480	124491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_015588	CG	3	6	125379	125384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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483	NC_015588	GC	3	6	125441	125446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_015588	CAG	2	6	125466	125471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_015588	GCCGC	2	10	128130	128139	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
489	NC_015588	CAC	3	9	128165	128173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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492	NC_015588	GCCT	2	8	129611	129618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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