MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 6187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014471	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014471	ATC	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014471	AAT	2	6	137	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014471	CCT	2	6	191	196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014471	AGT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014471	GAT	2	6	240	245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014471	GAT	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014471	GAT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014471	GAG	2	6	294	299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014471	TA	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014471	TAA	2	6	338	343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014471	AAT	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014471	GAG	2	6	409	414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014471	TA	4	8	459	466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014471	AATAC	2	10	489	498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014471	TTAG	2	8	520	527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014471	TTA	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014471	TGG	2	6	548	553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014471	CCGG	2	8	555	562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014471	T	6	6	668	673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014471	TTTC	2	8	700	707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014471	AG	3	6	722	727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014471	ACTA	2	8	3787	3794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014471	A	6	6	3814	3819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014471	TAG	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014471	ATT	3	9	4868	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014471	AT	3	6	7772	7777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014471	ATT	2	6	7781	7786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014471	ATT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014471	AAG	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014471	AAT	2	6	7850	7855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014471	TAAGA	2	10	7865	7874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014471	CATAT	2	10	7960	7969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014471	ATG	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014471	TATT	2	8	8013	8020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014471	ATC	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014471	ATC	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014471	TTC	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014471	TA	3	6	8281	8286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014471	AAGG	2	8	8339	8346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014471	AT	3	6	10054	10059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014471	ATT	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014471	ATT	2	6	10110	10115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014471	TAG	2	6	12251	12256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014471	AATT	2	8	12259	12266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014471	TA	3	6	12302	12307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014471	AGT	2	6	12326	12331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014471	GTT	2	6	12372	12377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014471	TCT	2	6	12416	12421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014471	ATAG	2	8	12454	12461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014471	TGA	2	6	12480	12485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014471	AAT	2	6	12547	12552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014471	ATA	2	6	12564	12569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014471	ACATA	2	10	13480	13489	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014471	TC	3	6	13490	13495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014471	AGTT	2	8	14240	14247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014471	TAT	2	6	14311	14316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014471	TTAC	2	8	14322	14329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014471	TAA	2	6	14341	14346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014471	ATG	2	6	14387	14392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014471	TAA	2	6	14434	14439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014471	TTA	2	6	14440	14445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014471	GTAT	2	8	14447	14454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014471	TA	4	8	15663	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014471	ACA	2	6	15676	15681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014471	TTA	2	6	15689	15694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014471	ACTAT	2	10	15707	15716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014471	AGG	2	6	16183	16188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014471	AT	3	6	16191	16196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014471	ATT	2	6	19042	19047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014471	TAA	2	6	19053	19058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014471	CAC	3	9	19880	19888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014471	TAA	2	6	19907	19912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014471	AT	3	6	21189	21194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014471	AACTTC	2	12	21223	21234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014471	ATG	2	6	21238	21243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014471	AAT	2	6	21249	21254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014471	ATA	2	6	21285	21290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014471	CAATA	2	10	21521	21530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014471	ATG	2	6	21536	21541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014471	ATA	2	6	21568	21573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014471	AAT	2	6	21596	21601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014471	TTC	2	6	21670	21675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014471	TA	5	10	21711	21720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014471	AAG	2	6	21810	21815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014471	TC	3	6	21887	21892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014471	ATT	2	6	25689	25694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014471	GTG	2	6	25741	25746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014471	TGT	2	6	26911	26916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014471	TAT	2	6	27431	27436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014471	TA	3	6	27448	27453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014471	ATG	2	6	29521	29526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014471	AG	3	6	29527	29532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014471	TCT	2	6	29534	29539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014471	ATG	3	9	29545	29553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014471	AT	3	6	29568	29573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014471	CT	3	6	29589	29594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014471	TAT	2	6	29619	29624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014471	TA	3	6	29682	29687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014471	GGT	2	6	29709	29714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014471	T	6	6	30364	30369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014471	TC	3	6	30390	30395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014471	AG	3	6	30407	30412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014471	GAT	2	6	30419	30424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014471	AAC	2	6	30445	30450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014471	ATA	2	6	30700	30705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014471	TAT	2	6	30709	30714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014471	TC	3	6	30734	30739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014471	TCA	2	6	30748	30753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014471	T	6	6	30911	30916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014471	TA	3	6	31492	31497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014471	G	6	6	31509	31514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014471	ACC	2	6	31524	31529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014471	GAA	2	6	31661	31666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014471	CT	3	6	31709	31714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014471	TA	4	8	34496	34503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014471	CT	3	6	34505	34510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014471	ATT	2	6	34515	34520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014471	ATC	2	6	34601	34606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014471	TGT	2	6	34674	34679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014471	GCTCTA	2	12	34697	34708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014471	CTAT	2	8	34768	34775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014471	TTA	2	6	34989	34994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014471	AAG	2	6	35056	35061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014471	AAT	2	6	35097	35102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014471	TGT	2	6	35103	35108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014471	ATG	2	6	35186	35191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014471	TGT	2	6	35201	35206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014471	CTATAG	2	12	35225	35236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014471	TA	3	6	35323	35328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014471	ATA	2	6	35399	35404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014471	ATTA	2	8	40166	40173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014471	AAAT	2	8	40174	40181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014471	AT	3	6	40190	40195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014471	T	6	6	40195	40200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014471	TTC	2	6	40206	40211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014471	ATT	2	6	40220	40225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014471	GAT	2	6	41098	41103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014471	TGA	2	6	41126	41131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014471	AT	3	6	42254	42259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014471	AAC	2	6	42316	42321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014471	TA	3	6	42354	42359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014471	ATC	2	6	45701	45706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014471	TAA	2	6	45713	45718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014471	TAA	2	6	45739	45744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014471	GCG	2	6	45800	45805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014471	CCA	2	6	45808	45813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_014471	TA	3	6	45855	45860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_014471	CT	3	6	110414	110419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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454	NC_014471	CAT	2	6	114964	114969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_014471	TTA	2	6	115668	115673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014471	TA	3	6	120693	120698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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