MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014962	GGA	2	6	98910	98915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101623
2003	NC_014962	GAGC	2	8	98937	98944	25 %	0 %	50 %	25 %	320101623
2004	NC_014962	CGGTCG	2	12	98951	98962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320101623
2005	NC_014962	GCG	2	6	98963	98968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101623
2006	NC_014962	ACC	2	6	98990	98995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101623
2007	NC_014962	CCG	2	6	99006	99011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101623
2008	NC_014962	GCG	2	6	99046	99051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101623
2009	NC_014962	CCG	2	6	99085	99090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101623
2010	NC_014962	CGG	2	6	99144	99149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101623
2011	NC_014962	TGG	2	6	99224	99229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101623
2012	NC_014962	G	6	6	99234	99239	0 %	0 %	100 %	0 %	320101623
2013	NC_014962	GGT	2	6	99286	99291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101623
2014	NC_014962	GGT	2	6	99299	99304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101623
2015	NC_014962	ACG	2	6	99413	99418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101623
2016	NC_014962	GAC	2	6	99450	99455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101623
2017	NC_014962	CG	3	6	99491	99496	0 %	0 %	50 %	50 %	320101623
2018	NC_014962	CAG	2	6	99502	99507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101623
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2021	NC_014962	CTG	2	6	99762	99767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101623
2022	NC_014962	TGGG	2	8	99773	99780	0 %	25 %	75 %	0 %	320101623
2023	NC_014962	GGGT	2	8	99803	99810	0 %	25 %	75 %	0 %	320101623
2024	NC_014962	GTA	2	6	99886	99891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101623
2025	NC_014962	GTG	2	6	99940	99945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101623
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2031	NC_014962	CGA	2	6	100165	100170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101623
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2034	NC_014962	GTC	2	6	100225	100230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101623
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2042	NC_014962	G	6	6	100378	100383	0 %	0 %	100 %	0 %	320101623
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2058	NC_014962	GGCG	2	8	101154	101161	0 %	0 %	75 %	25 %	320101624
2059	NC_014962	CG	3	6	101182	101187	0 %	0 %	50 %	50 %	320101624
2060	NC_014962	CGTGA	2	10	101359	101368	20 %	20 %	40 %	20 %	320101624
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2121	NC_014962	CCAA	2	8	105092	105099	50 %	0 %	0 %	50 %	320101627
2122	NC_014962	ACGGC	2	10	105119	105128	20 %	0 %	40 %	40 %	320101627
2123	NC_014962	GGT	2	6	105162	105167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101627
2124	NC_014962	AGA	2	6	105212	105217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101627
2125	NC_014962	GGC	2	6	105225	105230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101627
2126	NC_014962	CTG	2	6	105247	105252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101627
2127	NC_014962	TTG	2	6	105266	105271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101627
2128	NC_014962	TGATCG	2	12	105317	105328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320101627
2129	NC_014962	CA	3	6	105478	105483	50 %	0 %	0 %	50 %	320101627
2130	NC_014962	GTC	2	6	105526	105531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101627
2131	NC_014962	GACT	2	8	105553	105560	25 %	25 %	25 %	25 %	320101627
2132	NC_014962	GGC	2	6	105817	105822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101628
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2134	NC_014962	TGC	2	6	105891	105896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101628
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2136	NC_014962	GCC	2	6	105940	105945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101628
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2140	NC_014962	CGC	2	6	106047	106052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101628
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2142	NC_014962	CGCCC	2	10	106126	106135	0 %	0 %	20 %	80 %	320101628
2143	NC_014962	GGC	2	6	106141	106146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101628
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2147	NC_014962	CTCAGC	2	12	106218	106229	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320101628
2148	NC_014962	CGG	3	9	106260	106268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101628
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2150	NC_014962	CTA	2	6	106303	106308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101628
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2155	NC_014962	GGGA	2	8	106462	106469	25 %	0 %	75 %	0 %	320101628
2156	NC_014962	GGC	2	6	106497	106502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101628
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2159	NC_014962	GCTGG	2	10	106591	106600	0 %	20 %	60 %	20 %	320101628
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2163	NC_014962	CGG	2	6	106735	106740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101628
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2188	NC_014962	TTGA	2	8	108560	108567	25 %	50 %	25 %	0 %	320101630
2189	NC_014962	GCAG	2	8	108573	108580	25 %	0 %	50 %	25 %	320101630
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2202	NC_014962	CGCC	2	8	109101	109108	0 %	0 %	25 %	75 %	320101631
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2228	NC_014962	TCGC	2	8	110070	110077	0 %	25 %	25 %	50 %	320101631
2229	NC_014962	CGCT	2	8	110120	110127	0 %	25 %	25 %	50 %	320101631
2230	NC_014962	ACC	2	6	110201	110206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101631
2231	NC_014962	ACGA	2	8	110216	110223	50 %	0 %	25 %	25 %	320101631
2232	NC_014962	CCG	2	6	110252	110257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101631
2233	NC_014962	TGT	2	6	110288	110293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101631
2234	NC_014962	CGA	2	6	110352	110357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101631
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2236	NC_014962	T	6	6	110494	110499	0 %	100 %	0 %	0 %	320101631
2237	NC_014962	GTG	2	6	110506	110511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101631
2238	NC_014962	GGA	2	6	110512	110517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101631
2239	NC_014962	CGG	2	6	110532	110537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101631
2240	NC_014962	CGTG	2	8	110682	110689	0 %	25 %	50 %	25 %	320101632
2241	NC_014962	ATCGGA	2	12	110715	110726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320101632
2242	NC_014962	CGG	2	6	110775	110780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101632
2243	NC_014962	ATCCAC	2	12	110908	110919	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	320101632
2244	NC_014962	ACC	2	6	110947	110952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101632
2245	NC_014962	TGAC	2	8	110974	110981	25 %	25 %	25 %	25 %	320101632
2246	NC_014962	CAG	2	6	110988	110993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101632
2247	NC_014962	ACGCCA	2	12	110996	111007	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320101632
2248	NC_014962	CCA	2	6	111012	111017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101632
2249	NC_014962	CGG	2	6	111095	111100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101632
2250	NC_014962	CCA	2	6	111110	111115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101632
2251	NC_014962	GGC	2	6	111184	111189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101632
2252	NC_014962	CGT	2	6	111193	111198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101632
2253	NC_014962	GCT	2	6	111287	111292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101632
2254	NC_014962	ACC	2	6	111296	111301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101632
2255	NC_014962	GCCAGC	2	12	111316	111327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320101632
2256	NC_014962	ACC	2	6	111343	111348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101632
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2258	NC_014962	GTGCT	2	10	111937	111946	0 %	40 %	40 %	20 %	320101633
2259	NC_014962	TCG	2	6	111955	111960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2260	NC_014962	CGG	2	6	111968	111973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101633
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2262	NC_014962	CGA	2	6	112062	112067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2263	NC_014962	GTC	2	6	112136	112141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2264	NC_014962	GAC	2	6	112177	112182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2265	NC_014962	GTG	2	6	112243	112248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101633
2266	NC_014962	GC	3	6	112249	112254	0 %	0 %	50 %	50 %	320101633
2267	NC_014962	CG	3	6	112309	112314	0 %	0 %	50 %	50 %	320101633
2268	NC_014962	GCC	2	6	112317	112322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101633
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2271	NC_014962	CGC	2	6	112498	112503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101633
2272	NC_014962	GCG	2	6	112557	112562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101633
2273	NC_014962	ACG	2	6	112634	112639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101633
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2275	NC_014962	CCA	2	6	112679	112684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101633
2276	NC_014962	CGT	2	6	112699	112704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2277	NC_014962	CTCAAC	2	12	112717	112728	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	320101633
2278	NC_014962	GAC	2	6	112729	112734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2279	NC_014962	CTTCG	2	10	112750	112759	0 %	40 %	20 %	40 %	320101633
2280	NC_014962	GGT	2	6	112803	112808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101633
2281	NC_014962	GCT	2	6	112821	112826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101633
2282	NC_014962	TTCC	2	8	112867	112874	0 %	50 %	0 %	50 %	320101633
2283	NC_014962	ACG	3	9	112883	112891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101633
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2285	NC_014962	GCATCG	2	12	113142	113153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320101634
2286	NC_014962	GCC	2	6	113189	113194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101634
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2288	NC_014962	AAG	2	6	113243	113248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101634
2289	NC_014962	GGC	2	6	113294	113299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101634
2290	NC_014962	ATG	2	6	113300	113305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101634
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2292	NC_014962	CCTG	2	8	113403	113410	0 %	25 %	25 %	50 %	320101634
2293	NC_014962	GACGCC	2	12	113477	113488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320101634
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2298	NC_014962	C	8	8	113734	113741	0 %	0 %	0 %	100 %	320101634
2299	NC_014962	GGT	2	6	113776	113781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101634
2300	NC_014962	CGGC	3	12	113856	113867	0 %	0 %	50 %	50 %	320101634
2301	NC_014962	C	6	6	113952	113957	0 %	0 %	0 %	100 %	320101634
2302	NC_014962	GGA	2	6	114040	114045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101634
2303	NC_014962	GGGC	2	8	114050	114057	0 %	0 %	75 %	25 %	320101634
2304	NC_014962	TGGC	2	8	114060	114067	0 %	25 %	50 %	25 %	320101634
2305	NC_014962	CGCGT	2	10	114091	114100	0 %	20 %	40 %	40 %	320101634
2306	NC_014962	GTTGG	2	10	114228	114237	0 %	40 %	60 %	0 %	320101635
2307	NC_014962	CGGGC	2	10	114247	114256	0 %	0 %	60 %	40 %	320101635
2308	NC_014962	GTC	2	6	114261	114266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101635
2309	NC_014962	TGT	2	6	114292	114297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101635
2310	NC_014962	TCG	2	6	114298	114303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101635
2311	NC_014962	GGC	2	6	114318	114323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101635
2312	NC_014962	C	6	6	114362	114367	0 %	0 %	0 %	100 %	320101635
2313	NC_014962	GAT	2	6	114443	114448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101635
2314	NC_014962	GAC	2	6	114493	114498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101635
2315	NC_014962	ATC	2	6	114535	114540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101635
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2318	NC_014962	GAT	2	6	114725	114730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101635
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2320	NC_014962	CGGTC	2	10	114883	114892	0 %	20 %	40 %	40 %	320101635
2321	NC_014962	CAA	2	6	115008	115013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101635
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2323	NC_014962	GTC	2	6	115071	115076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101635
2324	NC_014962	GGT	2	6	115131	115136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101635
2325	NC_014962	TCA	2	6	115157	115162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101635
2326	NC_014962	TCG	2	6	115763	115768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101636
2327	NC_014962	GCG	2	6	115776	115781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101636
2328	NC_014962	TCG	2	6	115785	115790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101636
2329	NC_014962	CG	3	6	115830	115835	0 %	0 %	50 %	50 %	320101636
2330	NC_014962	CGG	2	6	115839	115844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101636
2331	NC_014962	CGGA	2	8	115848	115855	25 %	0 %	50 %	25 %	320101636
2332	NC_014962	CGG	2	6	115902	115907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101636
2333	NC_014962	CG	3	6	115919	115924	0 %	0 %	50 %	50 %	320101636
2334	NC_014962	TGG	2	6	115947	115952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101636
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2338	NC_014962	TGT	2	6	116087	116092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101636
2339	NC_014962	CGA	2	6	116143	116148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101636
2340	NC_014962	CGG	2	6	116248	116253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101636
2341	NC_014962	GAGCGG	2	12	116267	116278	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320101636
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2344	NC_014962	CG	3	6	116413	116418	0 %	0 %	50 %	50 %	320101636
2345	NC_014962	CGATC	2	10	116474	116483	20 %	20 %	20 %	40 %	320101636
2346	NC_014962	CGCC	2	8	116751	116758	0 %	0 %	25 %	75 %	320101637
2347	NC_014962	TCG	2	6	116852	116857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2348	NC_014962	CGT	2	6	116862	116867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2349	NC_014962	GCT	2	6	116869	116874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2350	NC_014962	AAC	2	6	116912	116917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101637
2351	NC_014962	CAG	2	6	116963	116968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2352	NC_014962	C	8	8	117048	117055	0 %	0 %	0 %	100 %	320101637
2353	NC_014962	GAT	2	6	117110	117115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101637
2354	NC_014962	GCA	2	6	117139	117144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2355	NC_014962	CCG	2	6	117203	117208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101637
2356	NC_014962	TGC	3	9	117237	117245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2357	NC_014962	ATG	2	6	117278	117283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101637
2358	NC_014962	CGG	2	6	117284	117289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101637
2359	NC_014962	GC	3	6	117290	117295	0 %	0 %	50 %	50 %	320101637
2360	NC_014962	AGC	2	6	117363	117368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2361	NC_014962	CAC	2	6	117370	117375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101637
2362	NC_014962	CGA	2	6	117379	117384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2363	NC_014962	CGG	2	6	117466	117471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101637
2364	NC_014962	TGC	2	6	117489	117494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2365	NC_014962	TGGT	2	8	117495	117502	0 %	50 %	50 %	0 %	320101637
2366	NC_014962	C	6	6	117503	117508	0 %	0 %	0 %	100 %	320101637
2367	NC_014962	CG	3	6	117533	117538	0 %	0 %	50 %	50 %	320101637
2368	NC_014962	GGCG	2	8	117541	117548	0 %	0 %	75 %	25 %	320101637
2369	NC_014962	ATTC	2	8	117586	117593	25 %	50 %	0 %	25 %	320101637
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2374	NC_014962	GCT	2	6	117844	117849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101637
2375	NC_014962	CGGT	2	8	117856	117863	0 %	25 %	50 %	25 %	320101637
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2471	NC_014962	GCC	2	6	121928	121933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101640
2472	NC_014962	GC	3	6	121938	121943	0 %	0 %	50 %	50 %	320101640
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2483	NC_014962	G	7	7	123631	123637	0 %	0 %	100 %	0 %	320101641
2484	NC_014962	CGG	2	6	123667	123672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101641
2485	NC_014962	ACG	2	6	123747	123752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101641
2486	NC_014962	ACG	2	6	123771	123776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101641
2487	NC_014962	GTG	2	6	123881	123886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101641
2488	NC_014962	TGA	2	6	123939	123944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101641
2489	NC_014962	TGC	3	9	123993	124001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101641
2490	NC_014962	GCA	2	6	124002	124007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101641
2491	NC_014962	CGGG	2	8	124057	124064	0 %	0 %	75 %	25 %	320101641
2492	NC_014962	GGA	2	6	124114	124119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101641
2493	NC_014962	GCT	2	6	124149	124154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101641
2494	NC_014962	TCGCTA	2	12	124278	124289	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320101641
2495	NC_014962	CGGG	2	8	124385	124392	0 %	0 %	75 %	25 %	320101641
2496	NC_014962	TGTT	2	8	124409	124416	0 %	75 %	25 %	0 %	320101641
2497	NC_014962	GGC	2	6	124435	124440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101641
2498	NC_014962	CAA	2	6	124447	124452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101641
2499	NC_014962	CGC	2	6	124471	124476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101641
2500	NC_014962	TCA	2	6	124482	124487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101641

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