MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014962	GC	3	6	655510	655515	0 %	0 %	50 %	50 %	320102014
13002	NC_014962	GGC	2	6	655526	655531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102014
13003	NC_014962	CGT	2	6	655541	655546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102014
13004	NC_014962	GTG	2	6	655649	655654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102014
13005	NC_014962	GAG	2	6	655700	655705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102014
13006	NC_014962	CGC	2	6	655783	655788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102014
13007	NC_014962	CCT	2	6	655862	655867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320102014
13008	NC_014962	GACCAC	2	12	655936	655947	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320102014
13009	NC_014962	CGC	2	6	656008	656013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102014
13010	NC_014962	TGA	2	6	656166	656171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102014
13011	NC_014962	TCT	2	6	656188	656193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320102014
13012	NC_014962	CGG	2	6	656206	656211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102014
13013	NC_014962	AC	3	6	656228	656233	50 %	0 %	0 %	50 %	320102014
13014	NC_014962	GCC	2	6	656267	656272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102014
13015	NC_014962	CG	3	6	656313	656318	0 %	0 %	50 %	50 %	320102014
13016	NC_014962	TCT	2	6	656445	656450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320102014
13017	NC_014962	TTTC	2	8	656456	656463	0 %	75 %	0 %	25 %	320102014
13018	NC_014962	CCG	2	6	656601	656606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102014
13019	NC_014962	CGA	2	6	656665	656670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102014
13020	NC_014962	C	7	7	656672	656678	0 %	0 %	0 %	100 %	320102014
13021	NC_014962	CAA	2	6	656708	656713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320102014
13022	NC_014962	CGGT	2	8	656738	656745	0 %	25 %	50 %	25 %	320102014
13023	NC_014962	CCA	2	6	656800	656805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320102014
13024	NC_014962	CGAAT	2	10	656812	656821	40 %	20 %	20 %	20 %	320102014
13025	NC_014962	GAGG	2	8	656860	656867	25 %	0 %	75 %	0 %	320102014
13026	NC_014962	GGTT	2	8	656869	656876	0 %	50 %	50 %	0 %	320102014
13027	NC_014962	TCG	2	6	657238	657243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13028	NC_014962	GGCCG	2	10	657258	657267	0 %	0 %	60 %	40 %	320102015
13029	NC_014962	TGA	2	6	657302	657307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102015
13030	NC_014962	AGC	2	6	657321	657326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13031	NC_014962	CAG	2	6	657345	657350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13032	NC_014962	CAA	2	6	657362	657367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320102015
13033	NC_014962	GTC	2	6	657386	657391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13034	NC_014962	TGT	2	6	657437	657442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320102015
13035	NC_014962	G	6	6	657488	657493	0 %	0 %	100 %	0 %	320102015
13036	NC_014962	GGC	2	6	657563	657568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102015
13037	NC_014962	TGG	2	6	657571	657576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102015
13038	NC_014962	TTCGTA	2	12	657594	657605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	320102015
13039	NC_014962	AGC	2	6	657677	657682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13040	NC_014962	G	6	6	657687	657692	0 %	0 %	100 %	0 %	320102015
13041	NC_014962	GTA	2	6	657771	657776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102015
13042	NC_014962	GGT	2	6	657861	657866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102015
13043	NC_014962	CGA	2	6	657875	657880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13044	NC_014962	CGT	2	6	657896	657901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13045	NC_014962	GTA	2	6	657933	657938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102015
13046	NC_014962	CGA	2	6	657956	657961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13047	NC_014962	CGA	2	6	658043	658048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13048	NC_014962	CGG	2	6	658067	658072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102015
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13050	NC_014962	GGC	2	6	658140	658145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102015
13051	NC_014962	GCG	2	6	658170	658175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102015
13052	NC_014962	GCG	2	6	658222	658227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102015
13053	NC_014962	CGA	2	6	658230	658235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
13054	NC_014962	CCG	2	6	658307	658312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102015
13055	NC_014962	CCG	2	6	658327	658332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102015
13056	NC_014962	GTCC	2	8	658359	658366	0 %	25 %	25 %	50 %	320102015
13057	NC_014962	CG	3	6	658428	658433	0 %	0 %	50 %	50 %	320102015
13058	NC_014962	GCA	2	6	658453	658458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102015
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13060	NC_014962	GAGGG	2	10	658904	658913	20 %	0 %	80 %	0 %	320102016
13061	NC_014962	TGA	2	6	658977	658982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102016
13062	NC_014962	GGCG	2	8	659076	659083	0 %	0 %	75 %	25 %	320102016
13063	NC_014962	GGTC	2	8	659094	659101	0 %	25 %	50 %	25 %	320102016
13064	NC_014962	GTC	2	6	659133	659138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102016
13065	NC_014962	CGA	2	6	659160	659165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102016
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13068	NC_014962	AGG	2	6	659255	659260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102016
13069	NC_014962	CGA	2	6	659283	659288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102016
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13071	NC_014962	TGA	2	6	659309	659314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102016
13072	NC_014962	GC	3	6	659319	659324	0 %	0 %	50 %	50 %	320102016
13073	NC_014962	GGTCGG	2	12	659451	659462	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320102016
13074	NC_014962	CGT	2	6	659549	659554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102016
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13076	NC_014962	GGCG	2	8	659577	659584	0 %	0 %	75 %	25 %	320102016
13077	NC_014962	CAGG	2	8	659610	659617	25 %	0 %	50 %	25 %	320102016
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13079	NC_014962	CGGG	2	8	659685	659692	0 %	0 %	75 %	25 %	320102016
13080	NC_014962	GGTG	2	8	659734	659741	0 %	25 %	75 %	0 %	320102017
13081	NC_014962	TCG	2	6	659761	659766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102017
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13084	NC_014962	AGCC	2	8	659952	659959	25 %	0 %	25 %	50 %	320102017
13085	NC_014962	G	6	6	659975	659980	0 %	0 %	100 %	0 %	320102017
13086	NC_014962	AGG	2	6	659981	659986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102017
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13088	NC_014962	CGC	2	6	660030	660035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102017
13089	NC_014962	CGC	2	6	660048	660053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102017
13090	NC_014962	GCG	3	9	660061	660069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102017
13091	NC_014962	CCCGA	2	10	660087	660096	20 %	0 %	20 %	60 %	320102017
13092	NC_014962	CCAC	2	8	660101	660108	25 %	0 %	0 %	75 %	320102017
13093	NC_014962	TGG	2	6	660145	660150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102017
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13098	NC_014962	CAGC	2	8	660360	660367	25 %	0 %	25 %	50 %	320102017
13099	NC_014962	CAT	2	6	660387	660392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320102017
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13101	NC_014962	TCA	2	6	660725	660730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320102018
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13103	NC_014962	GC	3	6	660768	660773	0 %	0 %	50 %	50 %	320102018
13104	NC_014962	GTT	2	6	660774	660779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320102018
13105	NC_014962	GGA	2	6	660786	660791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102018
13106	NC_014962	CGT	2	6	660812	660817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102018
13107	NC_014962	TGGT	2	8	660826	660833	0 %	50 %	50 %	0 %	320102018
13108	NC_014962	TGG	2	6	660914	660919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
13109	NC_014962	TGG	2	6	660995	661000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
13110	NC_014962	TTGGC	2	10	661015	661024	0 %	40 %	40 %	20 %	320102018
13111	NC_014962	TGG	2	6	661037	661042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
13112	NC_014962	GTTG	2	8	661043	661050	0 %	50 %	50 %	0 %	320102018
13113	NC_014962	CGG	2	6	661076	661081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102018
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13115	NC_014962	CG	3	6	661147	661152	0 %	0 %	50 %	50 %	320102018
13116	NC_014962	TGG	2	6	661183	661188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
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13118	NC_014962	GGT	2	6	661392	661397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
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13120	NC_014962	TTC	2	6	661621	661626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320102018
13121	NC_014962	CGC	2	6	661677	661682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102018
13122	NC_014962	GTG	2	6	661714	661719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
13123	NC_014962	CCG	2	6	661734	661739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102018
13124	NC_014962	GGA	2	6	661761	661766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102018
13125	NC_014962	GGT	2	6	661782	661787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102018
13126	NC_014962	CGG	2	6	661797	661802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102018
13127	NC_014962	CGG	2	6	661809	661814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102018
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13129	NC_014962	TGGG	2	8	661859	661866	0 %	25 %	75 %	0 %	320102018
13130	NC_014962	CG	3	6	661947	661952	0 %	0 %	50 %	50 %	320102018
13131	NC_014962	GCG	2	6	661975	661980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102018
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13134	NC_014962	GGC	2	6	662157	662162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102018
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13144	NC_014962	CGCC	2	8	662999	663006	0 %	0 %	25 %	75 %	320102019
13145	NC_014962	CGA	2	6	663071	663076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102019
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13150	NC_014962	GGGGT	2	10	663283	663292	0 %	20 %	80 %	0 %	320102019
13151	NC_014962	CGG	2	6	663317	663322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102019
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13192	NC_014962	GGAG	2	8	665441	665448	25 %	0 %	75 %	0 %	320102020
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13226	NC_014962	G	6	6	667496	667501	0 %	0 %	100 %	0 %	320102022
13227	NC_014962	TGG	2	6	667512	667517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102022
13228	NC_014962	GCGTG	2	10	667518	667527	0 %	20 %	60 %	20 %	320102022
13229	NC_014962	GTGG	2	8	667528	667535	0 %	25 %	75 %	0 %	320102022
13230	NC_014962	TTG	2	6	667536	667541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320102022
13231	NC_014962	CG	3	6	667549	667554	0 %	0 %	50 %	50 %	320102022
13232	NC_014962	TCGG	2	8	667586	667593	0 %	25 %	50 %	25 %	320102022
13233	NC_014962	CGC	2	6	667620	667625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102022
13234	NC_014962	GGC	2	6	667648	667653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102022
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13236	NC_014962	GTC	2	6	667738	667743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102022
13237	NC_014962	ACGC	2	8	667859	667866	25 %	0 %	25 %	50 %	320102022
13238	NC_014962	GAGCG	2	10	667918	667927	20 %	0 %	60 %	20 %	320102022
13239	NC_014962	CGC	2	6	667977	667982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102022
13240	NC_014962	TCG	2	6	668012	668017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102022
13241	NC_014962	TCG	2	6	668039	668044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102022
13242	NC_014962	GAA	2	6	668059	668064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320102022
13243	NC_014962	CG	3	6	668075	668080	0 %	0 %	50 %	50 %	320102022
13244	NC_014962	GCA	2	6	668115	668120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102022
13245	NC_014962	CAC	2	6	668125	668130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320102022
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13247	NC_014962	CAC	2	6	668173	668178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320102022
13248	NC_014962	ATC	2	6	668189	668194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320102022
13249	NC_014962	TCGTT	2	10	668432	668441	0 %	60 %	20 %	20 %	320102023
13250	NC_014962	CGG	2	6	668444	668449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102023
13251	NC_014962	GGTT	2	8	668468	668475	0 %	50 %	50 %	0 %	320102023
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13253	NC_014962	TGGC	2	8	668524	668531	0 %	25 %	50 %	25 %	320102023
13254	NC_014962	TCGATC	2	12	668557	668568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320102023
13255	NC_014962	CGT	2	6	668582	668587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102023
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13264	NC_014962	TCG	2	6	669719	669724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102024
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13270	NC_014962	TCG	3	9	669948	669956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102024
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13272	NC_014962	CGC	2	6	669998	670003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102024
13273	NC_014962	GAA	2	6	670006	670011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320102024
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13293	NC_014962	GTC	2	6	670908	670913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102025
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13326	NC_014962	AACC	2	8	672230	672237	50 %	0 %	0 %	50 %	320102025
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13331	NC_014962	GCCCC	2	10	672357	672366	0 %	0 %	20 %	80 %	320102025
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13352	NC_014962	TCC	2	6	673157	673162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320102026
13353	NC_014962	CTG	2	6	673199	673204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102026
13354	NC_014962	GAC	2	6	673214	673219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102026
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13356	NC_014962	GTG	2	6	673289	673294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102026
13357	NC_014962	GGC	2	6	673295	673300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102026
13358	NC_014962	GACGCC	2	12	673319	673330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320102026
13359	NC_014962	CGC	2	6	673339	673344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102026
13360	NC_014962	GGC	2	6	673351	673356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102026
13361	NC_014962	CGA	2	6	673393	673398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102026
13362	NC_014962	CGC	2	6	673435	673440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102026
13363	NC_014962	GTC	2	6	673448	673453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102026
13364	NC_014962	CCCA	2	8	673505	673512	25 %	0 %	0 %	75 %	320102026
13365	NC_014962	CG	3	6	673556	673561	0 %	0 %	50 %	50 %	320102026
13366	NC_014962	GCT	2	6	673564	673569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102026
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13372	NC_014962	ACG	2	6	673761	673766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102027
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13374	NC_014962	GAT	2	6	673874	673879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102027
13375	NC_014962	TGA	2	6	673894	673899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102027
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13383	NC_014962	GGT	2	6	674200	674205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102027
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13395	NC_014962	AACG	2	8	675316	675323	50 %	0 %	25 %	25 %	320102028
13396	NC_014962	GCC	2	6	675324	675329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102028
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13399	NC_014962	CAAG	2	8	675468	675475	50 %	0 %	25 %	25 %	320102028
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13414	NC_014962	TCG	2	6	676800	676805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102030
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13416	NC_014962	TCG	2	6	676866	676871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102030
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13424	NC_014962	GGGC	2	8	677428	677435	0 %	0 %	75 %	25 %	320102031
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13429	NC_014962	GCG	2	6	677645	677650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102031
13430	NC_014962	GTCATC	2	12	677699	677710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320102031
13431	NC_014962	GAA	2	6	677728	677733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320102031
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13433	NC_014962	ATC	2	6	677947	677952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320102031
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13443	NC_014962	GTC	2	6	678467	678472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102032
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13451	NC_014962	CG	3	6	678798	678803	0 %	0 %	50 %	50 %	320102032
13452	NC_014962	CGA	2	6	678825	678830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102032
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13460	NC_014962	ATG	2	6	679218	679223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102032
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13462	NC_014962	GGTT	2	8	679405	679412	0 %	50 %	50 %	0 %	320102033
13463	NC_014962	CGG	2	6	679413	679418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102033
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13469	NC_014962	GACC	2	8	679631	679638	25 %	0 %	25 %	50 %	320102033
13470	NC_014962	GAG	2	6	679652	679657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102033
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13473	NC_014962	TTG	2	6	679794	679799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320102033
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13475	NC_014962	ACG	2	6	679912	679917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102033
13476	NC_014962	AGCG	2	8	679935	679942	25 %	0 %	50 %	25 %	320102033
13477	NC_014962	GATC	2	8	680056	680063	25 %	25 %	25 %	25 %	320102033
13478	NC_014962	TG	3	6	680073	680078	0 %	50 %	50 %	0 %	320102033
13479	NC_014962	TGA	2	6	680194	680199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320102033
13480	NC_014962	CAT	2	6	680203	680208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320102033
13481	NC_014962	TTGG	2	8	680259	680266	0 %	50 %	50 %	0 %	320102033
13482	NC_014962	AG	3	6	680277	680282	50 %	0 %	50 %	0 %	320102033
13483	NC_014962	G	7	7	680286	680292	0 %	0 %	100 %	0 %	320102033
13484	NC_014962	ACA	2	6	680337	680342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320102033
13485	NC_014962	CGG	2	6	680351	680356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102033
13486	NC_014962	AAGGCG	2	12	680376	680387	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	320102033
13487	NC_014962	GGA	2	6	680489	680494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320102033
13488	NC_014962	CG	3	6	680637	680642	0 %	0 %	50 %	50 %	320102033
13489	NC_014962	CAT	2	6	680738	680743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320102033
13490	NC_014962	ACG	2	6	681589	681594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102034
13491	NC_014962	CCG	2	6	681598	681603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320102034
13492	NC_014962	GGT	2	6	681612	681617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320102034
13493	NC_014962	TGC	2	6	681670	681675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102034
13494	NC_014962	CT	3	6	681753	681758	0 %	50 %	0 %	50 %	320102034
13495	NC_014962	GTC	3	9	681778	681786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320102034
13496	NC_014962	GCG	2	6	681826	681831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320102034
13497	NC_014962	GGGC	2	8	681838	681845	0 %	0 %	75 %	25 %	320102034
13498	NC_014962	GGTC	2	8	681874	681881	0 %	25 %	50 %	25 %	320102034
13499	NC_014962	ACG	2	6	681889	681894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320102034
13500	NC_014962	TGAT	2	8	681925	681932	25 %	50 %	25 %	0 %	320102034

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