MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014962	ACC	2	6	508354	508359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101906
10002	NC_014962	CG	3	6	508377	508382	0 %	0 %	50 %	50 %	320101906
10003	NC_014962	GATCA	2	10	508552	508561	40 %	20 %	20 %	20 %	320101907
10004	NC_014962	GAG	2	6	508592	508597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10005	NC_014962	G	6	6	508621	508626	0 %	0 %	100 %	0 %	320101907
10006	NC_014962	ATC	2	6	508661	508666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101907
10007	NC_014962	GTT	2	6	508696	508701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101907
10008	NC_014962	ACA	2	6	508705	508710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101907
10009	NC_014962	GAT	2	6	508715	508720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101907
10010	NC_014962	CGCC	2	8	508744	508751	0 %	0 %	25 %	75 %	320101907
10011	NC_014962	TGA	2	6	508759	508764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101907
10012	NC_014962	GGC	2	6	508945	508950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10013	NC_014962	ACA	2	6	509020	509025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101907
10014	NC_014962	CGC	2	6	509053	509058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10015	NC_014962	CGTT	2	8	509064	509071	0 %	50 %	25 %	25 %	320101907
10016	NC_014962	CG	3	6	509172	509177	0 %	0 %	50 %	50 %	320101907
10017	NC_014962	CAC	2	6	509234	509239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101907
10018	NC_014962	CCG	2	6	509267	509272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10019	NC_014962	GCG	2	6	509290	509295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10020	NC_014962	CG	3	6	509334	509339	0 %	0 %	50 %	50 %	320101907
10021	NC_014962	CGA	2	6	509473	509478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10022	NC_014962	TCA	2	6	509485	509490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101907
10023	NC_014962	GCC	2	6	509585	509590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10024	NC_014962	GCGG	2	8	509639	509646	0 %	0 %	75 %	25 %	320101907
10025	NC_014962	GGT	2	6	509667	509672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101907
10026	NC_014962	CCCAA	2	10	509680	509689	40 %	0 %	0 %	60 %	320101907
10027	NC_014962	CG	3	6	509996	510001	0 %	0 %	50 %	50 %	320101907
10028	NC_014962	CCG	2	6	510063	510068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10029	NC_014962	GAAC	2	8	510083	510090	50 %	0 %	25 %	25 %	320101907
10030	NC_014962	C	6	6	510145	510150	0 %	0 %	0 %	100 %	320101907
10031	NC_014962	CCA	2	6	510196	510201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101907
10032	NC_014962	ACC	2	6	510205	510210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101907
10033	NC_014962	GAG	2	6	510214	510219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10034	NC_014962	GGA	2	6	510224	510229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10035	NC_014962	GCG	2	6	510237	510242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10036	NC_014962	GGC	2	6	510258	510263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10037	NC_014962	CGG	2	6	510301	510306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10038	NC_014962	CG	3	6	510354	510359	0 %	0 %	50 %	50 %	320101907
10039	NC_014962	TCG	2	6	510382	510387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10040	NC_014962	ACGCC	2	10	510431	510440	20 %	0 %	20 %	60 %	320101907
10041	NC_014962	GC	3	6	510473	510478	0 %	0 %	50 %	50 %	320101907
10042	NC_014962	GTG	2	6	510504	510509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101907
10043	NC_014962	GGA	2	6	510516	510521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10044	NC_014962	GCG	2	6	510569	510574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10045	NC_014962	GGC	2	6	510575	510580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10046	NC_014962	GCC	2	6	510600	510605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10047	NC_014962	GCC	2	6	510759	510764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10048	NC_014962	AGG	2	6	510799	510804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10049	NC_014962	CGGA	2	8	510850	510857	25 %	0 %	50 %	25 %	320101907
10050	NC_014962	GGA	2	6	510933	510938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10051	NC_014962	GGC	2	6	511026	511031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10052	NC_014962	GTTGGT	2	12	511064	511075	0 %	50 %	50 %	0 %	320101907
10053	NC_014962	GTT	2	6	511094	511099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101907
10054	NC_014962	ATG	2	6	511124	511129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101907
10055	NC_014962	GGTTG	2	10	511138	511147	0 %	40 %	60 %	0 %	320101907
10056	NC_014962	GTC	2	6	511154	511159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10057	NC_014962	CGT	2	6	511177	511182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10058	NC_014962	AGG	2	6	511191	511196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10059	NC_014962	CGT	2	6	511198	511203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10060	NC_014962	ATC	2	6	511241	511246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101907
10061	NC_014962	GACCC	2	10	511343	511352	20 %	0 %	20 %	60 %	320101907
10062	NC_014962	GGA	2	6	511459	511464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10063	NC_014962	GTC	2	6	511628	511633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10064	NC_014962	CAG	2	6	511637	511642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10065	NC_014962	CGC	2	6	511657	511662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10066	NC_014962	GTC	2	6	511666	511671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10067	NC_014962	GCC	2	6	511862	511867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10068	NC_014962	CGC	2	6	511889	511894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10069	NC_014962	CGC	2	6	511963	511968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101907
10070	NC_014962	AAG	2	6	512006	512011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101907
10071	NC_014962	GTC	2	6	512042	512047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10072	NC_014962	GAG	2	6	512059	512064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101907
10073	NC_014962	GGGA	2	8	512097	512104	25 %	0 %	75 %	0 %	320101907
10074	NC_014962	TGA	2	6	512146	512151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101907
10075	NC_014962	CGTT	2	8	512178	512185	0 %	50 %	25 %	25 %	320101907
10076	NC_014962	CGG	2	6	512312	512317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101907
10077	NC_014962	TCG	2	6	512385	512390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101907
10078	NC_014962	GGT	2	6	512399	512404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101907
10079	NC_014962	CGGC	2	8	512442	512449	0 %	0 %	50 %	50 %	320101907
10080	NC_014962	C	6	6	512458	512463	0 %	0 %	0 %	100 %	320101907
10081	NC_014962	CGA	2	6	512494	512499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101907
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10084	NC_014962	CGA	2	6	512662	512667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101907
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10086	NC_014962	CCA	2	6	512683	512688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101907
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10091	NC_014962	CGTGGG	2	12	512782	512793	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320101907
10092	NC_014962	GTC	2	6	512879	512884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101908
10093	NC_014962	CGG	2	6	512910	512915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101908
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10101	NC_014962	TCT	2	6	513170	513175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101908
10102	NC_014962	GGTGGA	2	12	513187	513198	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320101908
10103	NC_014962	CAG	2	6	513235	513240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101908
10104	NC_014962	CG	3	6	513255	513260	0 %	0 %	50 %	50 %	320101908
10105	NC_014962	GAGC	2	8	513266	513273	25 %	0 %	50 %	25 %	320101908
10106	NC_014962	GCC	2	6	513307	513312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101908
10107	NC_014962	GGC	2	6	513345	513350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101908
10108	NC_014962	GCC	2	6	513358	513363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101908
10109	NC_014962	GCAC	2	8	513437	513444	25 %	0 %	25 %	50 %	320101908
10110	NC_014962	ACC	3	9	513560	513568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101908
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10112	NC_014962	CGA	2	6	513755	513760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101908
10113	NC_014962	TGG	2	6	514134	514139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101909
10114	NC_014962	CGC	2	6	514174	514179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101909
10115	NC_014962	AAAATC	2	12	514204	514215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	320101909
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10118	NC_014962	TCT	2	6	514322	514327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101909
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10120	NC_014962	G	8	8	514485	514492	0 %	0 %	100 %	0 %	320101909
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10240	NC_014962	CGA	2	6	520084	520089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101914
10241	NC_014962	ACCC	2	8	520149	520156	25 %	0 %	0 %	75 %	320101914
10242	NC_014962	GCCC	2	8	520232	520239	0 %	0 %	25 %	75 %	320101914
10243	NC_014962	GCC	2	6	520240	520245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101914
10244	NC_014962	AAG	2	6	520251	520256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101914
10245	NC_014962	CGC	2	6	520269	520274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101914
10246	NC_014962	CCCG	2	8	520288	520295	0 %	0 %	25 %	75 %	320101914
10247	NC_014962	CG	3	6	520294	520299	0 %	0 %	50 %	50 %	320101914
10248	NC_014962	ACCC	2	8	520317	520324	25 %	0 %	0 %	75 %	320101914
10249	NC_014962	ACC	2	6	520330	520335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101914
10250	NC_014962	GT	3	6	520413	520418	0 %	50 %	50 %	0 %	320101914
10251	NC_014962	GCA	2	6	520427	520432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101914
10252	NC_014962	CAG	2	6	520476	520481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101914
10253	NC_014962	CGC	2	6	520485	520490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101914
10254	NC_014962	ATC	2	6	520492	520497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101914
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10257	NC_014962	CGG	2	6	520674	520679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101914
10258	NC_014962	TCG	2	6	520690	520695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101914
10259	NC_014962	CGA	2	6	521278	521283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101915
10260	NC_014962	CGT	2	6	521305	521310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101915
10261	NC_014962	CT	3	6	521319	521324	0 %	50 %	0 %	50 %	320101915
10262	NC_014962	GTT	2	6	521382	521387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101915
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10266	NC_014962	GGC	2	6	521642	521647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101915
10267	NC_014962	GCG	2	6	521651	521656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101915
10268	NC_014962	GCG	3	9	521658	521666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101915
10269	NC_014962	CGT	2	6	521725	521730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101915
10270	NC_014962	GCTC	2	8	521733	521740	0 %	25 %	25 %	50 %	320101915
10271	NC_014962	GTG	2	6	521751	521756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101915
10272	NC_014962	CGG	2	6	521766	521771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101915
10273	NC_014962	GCT	2	6	521787	521792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101915
10274	NC_014962	CCG	2	6	521793	521798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101915
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10276	NC_014962	CCCA	2	8	521934	521941	25 %	0 %	0 %	75 %	320101915
10277	NC_014962	CGG	2	6	521988	521993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101915
10278	NC_014962	GCC	2	6	522020	522025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101915
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10280	NC_014962	CCG	2	6	522071	522076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101915
10281	NC_014962	CCCGAC	2	12	522083	522094	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320101915
10282	NC_014962	CGC	2	6	522109	522114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101915
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10300	NC_014962	GCCG	2	8	522903	522910	0 %	0 %	50 %	50 %	320101916
10301	NC_014962	TGG	2	6	522950	522955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101916
10302	NC_014962	GCT	2	6	522971	522976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101916
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10304	NC_014962	CAG	2	6	523107	523112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101916
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10322	NC_014962	GCT	2	6	523900	523905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101916
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10329	NC_014962	GCTC	2	8	524121	524128	0 %	25 %	25 %	50 %	320101916
10330	NC_014962	CGG	2	6	524223	524228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101916
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10332	NC_014962	CGT	2	6	524453	524458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101917
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10339	NC_014962	CCGC	2	8	524716	524723	0 %	0 %	25 %	75 %	320101917
10340	NC_014962	GGCGA	2	10	524787	524796	20 %	0 %	60 %	20 %	320101917
10341	NC_014962	CGC	2	6	524804	524809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101917
10342	NC_014962	GTC	2	6	524820	524825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101917
10343	NC_014962	GGT	2	6	524853	524858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101917
10344	NC_014962	CCT	2	6	524870	524875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101917
10345	NC_014962	CGT	2	6	524886	524891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101917
10346	NC_014962	CCGGC	2	10	524930	524939	0 %	0 %	40 %	60 %	320101917
10347	NC_014962	TGG	2	6	524960	524965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101917
10348	NC_014962	CGG	2	6	525051	525056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101917
10349	NC_014962	GGTGC	2	10	525075	525084	0 %	20 %	60 %	20 %	320101917
10350	NC_014962	GGAC	2	8	525107	525114	25 %	0 %	50 %	25 %	320101917
10351	NC_014962	TTG	2	6	525169	525174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101918
10352	NC_014962	CTG	2	6	525195	525200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101918
10353	NC_014962	ACG	2	6	525239	525244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101918
10354	NC_014962	GCG	2	6	525372	525377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101918
10355	NC_014962	GCC	2	6	525421	525426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101918
10356	NC_014962	GC	3	6	525443	525448	0 %	0 %	50 %	50 %	320101918
10357	NC_014962	CGC	2	6	525554	525559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101918
10358	NC_014962	GCC	2	6	525568	525573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101918
10359	NC_014962	CCA	2	6	525578	525583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101918
10360	NC_014962	GC	3	6	525668	525673	0 %	0 %	50 %	50 %	320101918
10361	NC_014962	CGCCAC	2	12	525690	525701	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320101918
10362	NC_014962	TGG	2	6	525726	525731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101918
10363	NC_014962	ACGCC	2	10	525743	525752	20 %	0 %	20 %	60 %	320101918
10364	NC_014962	CGT	2	6	525801	525806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101918
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10366	NC_014962	GCCA	2	8	525963	525970	25 %	0 %	25 %	50 %	320101918
10367	NC_014962	CGT	2	6	525996	526001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101918
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10369	NC_014962	CCT	2	6	526127	526132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101918
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10382	NC_014962	AGCGGC	2	12	526603	526614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320101918
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10393	NC_014962	GGC	2	6	526986	526991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101919
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10398	NC_014962	GCCC	2	8	527171	527178	0 %	0 %	25 %	75 %	320101919
10399	NC_014962	GACC	2	8	527182	527189	25 %	0 %	25 %	50 %	320101919
10400	NC_014962	CAG	2	6	527279	527284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101919
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10475	NC_014962	TCC	2	6	530498	530503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101922
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10478	NC_014962	CGT	2	6	530590	530595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101922
10479	NC_014962	GCA	2	6	530721	530726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101922
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