MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014962	C	6	6	25968	25973	0 %	0 %	0 %	100 %	320101576
502	NC_014962	CG	3	6	26038	26043	0 %	0 %	50 %	50 %	320101576
503	NC_014962	CTT	2	6	26061	26066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101576
504	NC_014962	CA	3	6	26087	26092	50 %	0 %	0 %	50 %	320101576
505	NC_014962	CGG	2	6	26442	26447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101577
506	NC_014962	CTT	2	6	26458	26463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101577
507	NC_014962	GAC	2	6	26503	26508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101577
508	NC_014962	CCTG	2	8	26561	26568	0 %	25 %	25 %	50 %	320101577
509	NC_014962	CAG	2	6	26584	26589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101577
510	NC_014962	CAG	2	6	26611	26616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101577
511	NC_014962	TTC	2	6	26617	26622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101577
512	NC_014962	GTT	2	6	26623	26628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101577
513	NC_014962	CGGTGG	2	12	26639	26650	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320101577
514	NC_014962	GAC	2	6	26659	26664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101577
515	NC_014962	CCA	2	6	26676	26681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101577
516	NC_014962	GTC	2	6	26782	26787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101577
517	NC_014962	TCG	2	6	26813	26818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101577
518	NC_014962	TTC	2	6	26821	26826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101577
519	NC_014962	GCA	2	6	26916	26921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101577
520	NC_014962	CCA	2	6	27039	27044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101577
521	NC_014962	TCGT	2	8	27049	27056	0 %	50 %	25 %	25 %	320101577
522	NC_014962	CTCGA	2	10	27090	27099	20 %	20 %	20 %	40 %	320101578
523	NC_014962	ACGG	2	8	27110	27117	25 %	0 %	50 %	25 %	320101578
524	NC_014962	GCG	2	6	27132	27137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101578
525	NC_014962	GTCG	2	8	27162	27169	0 %	25 %	50 %	25 %	320101578
526	NC_014962	GAC	2	6	27178	27183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101578
527	NC_014962	TCTT	2	8	27193	27200	0 %	75 %	0 %	25 %	320101578
528	NC_014962	CAT	2	6	27207	27212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101578
529	NC_014962	ATG	2	6	27223	27228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101578
530	NC_014962	G	6	6	27391	27396	0 %	0 %	100 %	0 %	320101579
531	NC_014962	CGG	2	6	27418	27423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101579
532	NC_014962	CGA	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101579
533	NC_014962	CGT	2	6	27466	27471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101579
534	NC_014962	AGGC	2	8	27480	27487	25 %	0 %	50 %	25 %	320101579
535	NC_014962	CAG	2	6	27632	27637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101579
536	NC_014962	CAGA	2	8	27668	27675	50 %	0 %	25 %	25 %	320101579
537	NC_014962	GGCG	2	8	27745	27752	0 %	0 %	75 %	25 %	320101579
538	NC_014962	GGGTTG	2	12	27848	27859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101579
539	NC_014962	TCG	2	6	27878	27883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101579
540	NC_014962	TGG	2	6	27904	27909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101579
541	NC_014962	G	6	6	27961	27966	0 %	0 %	100 %	0 %	320101579
542	NC_014962	GCA	2	6	27994	27999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101579
543	NC_014962	CAC	2	6	28076	28081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101579
544	NC_014962	CCGT	2	8	28088	28095	0 %	25 %	25 %	50 %	320101579
545	NC_014962	GGT	2	6	28115	28120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101579
546	NC_014962	CGA	2	6	28127	28132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101579
547	NC_014962	CGGG	2	8	28174	28181	0 %	0 %	75 %	25 %	320101579
548	NC_014962	CGA	2	6	28202	28207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101579
549	NC_014962	GGC	2	6	28208	28213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101579
550	NC_014962	AGG	2	6	28231	28236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101579
551	NC_014962	GGT	2	6	28658	28663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101580
552	NC_014962	GAT	2	6	28742	28747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101580
553	NC_014962	CGA	2	6	28766	28771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101580
554	NC_014962	CG	3	6	28800	28805	0 %	0 %	50 %	50 %	320101580
555	NC_014962	GTG	2	6	28818	28823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101580
556	NC_014962	G	6	6	28846	28851	0 %	0 %	100 %	0 %	320101580
557	NC_014962	CGC	2	6	28877	28882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101580
558	NC_014962	TC	3	6	28919	28924	0 %	50 %	0 %	50 %	320101580
559	NC_014962	CGA	2	6	28925	28930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101580
560	NC_014962	GGT	2	6	29007	29012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101580
561	NC_014962	GCT	2	6	29042	29047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101580
562	NC_014962	CCA	2	6	29104	29109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101580
563	NC_014962	CGC	2	6	29129	29134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101580
564	NC_014962	GGC	2	6	29214	29219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101580
565	NC_014962	GGT	2	6	29222	29227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101580
566	NC_014962	CCCA	2	8	29235	29242	25 %	0 %	0 %	75 %	320101580
567	NC_014962	GAC	2	6	29347	29352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101580
568	NC_014962	TGA	2	6	29593	29598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101581
569	NC_014962	TCG	2	6	29697	29702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101581
570	NC_014962	CGG	2	6	29722	29727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101581
571	NC_014962	CCCGC	2	10	29730	29739	0 %	0 %	20 %	80 %	320101581
572	NC_014962	ACC	2	6	29757	29762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101581
573	NC_014962	CCGC	2	8	29766	29773	0 %	0 %	25 %	75 %	320101581
574	NC_014962	GCC	4	12	29777	29788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101581
575	NC_014962	CAGG	2	8	29792	29799	25 %	0 %	50 %	25 %	320101581
576	NC_014962	ACC	2	6	29825	29830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101581
577	NC_014962	GTC	2	6	29883	29888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101581
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579	NC_014962	AAC	2	6	29919	29924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101581
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581	NC_014962	ACC	2	6	29999	30004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101581
582	NC_014962	CGAAC	2	10	30019	30028	40 %	0 %	20 %	40 %	320101581
583	NC_014962	ACAG	2	8	30055	30062	50 %	0 %	25 %	25 %	320101581
584	NC_014962	GTG	2	6	30078	30083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101581
585	NC_014962	CGAA	2	8	30146	30153	50 %	0 %	25 %	25 %	320101581
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590	NC_014962	G	6	6	30388	30393	0 %	0 %	100 %	0 %	320101581
591	NC_014962	G	6	6	30413	30418	0 %	0 %	100 %	0 %	320101581
592	NC_014962	ATC	2	6	30422	30427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101581
593	NC_014962	ACC	2	6	30450	30455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101581
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597	NC_014962	CGC	2	6	30649	30654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101581
598	NC_014962	CGC	2	6	30709	30714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101581
599	NC_014962	TGGT	2	8	31092	31099	0 %	50 %	50 %	0 %	320101582
600	NC_014962	GCG	3	9	31185	31193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101582
601	NC_014962	ACC	2	6	31245	31250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101582
602	NC_014962	GAC	2	6	31321	31326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101582
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604	NC_014962	GTT	2	6	31444	31449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101582
605	NC_014962	GCC	2	6	31527	31532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101582
606	NC_014962	TTG	2	6	31566	31571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101582
607	NC_014962	TTC	2	6	31575	31580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101582
608	NC_014962	ACC	2	6	31625	31630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101582
609	NC_014962	AGCC	2	8	31650	31657	25 %	0 %	25 %	50 %	320101582
610	NC_014962	CGA	2	6	31662	31667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101582
611	NC_014962	CAG	2	6	31679	31684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101582
612	NC_014962	GTC	2	6	31691	31696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101582
613	NC_014962	CTTG	2	8	31891	31898	0 %	50 %	25 %	25 %	320101582
614	NC_014962	CGGC	2	8	31918	31925	0 %	0 %	50 %	50 %	320101582
615	NC_014962	GGC	2	6	31927	31932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101582
616	NC_014962	CG	3	6	31940	31945	0 %	0 %	50 %	50 %	320101582
617	NC_014962	TGG	2	6	31972	31977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101582
618	NC_014962	GCT	2	6	32051	32056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101582
619	NC_014962	CAG	2	6	32081	32086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101582
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621	NC_014962	TCG	2	6	32265	32270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101582
622	NC_014962	CAG	2	6	32276	32281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101582
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624	NC_014962	TCC	2	6	32367	32372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101582
625	NC_014962	GCA	2	6	32395	32400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101582
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627	NC_014962	TTG	2	6	32427	32432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101582
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753	NC_014962	C	6	6	38244	38249	0 %	0 %	0 %	100 %	320101586
754	NC_014962	GTA	2	6	38417	38422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101586
755	NC_014962	GCT	2	6	38518	38523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101586
756	NC_014962	ACC	2	6	38602	38607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101586
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758	NC_014962	GTTGG	2	10	38647	38656	0 %	40 %	60 %	0 %	320101586
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760	NC_014962	GA	3	6	38770	38775	50 %	0 %	50 %	0 %	320101587
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762	NC_014962	ATC	2	6	38822	38827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101587
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783	NC_014962	C	6	6	40211	40216	0 %	0 %	0 %	100 %	320101590
784	NC_014962	CGA	2	6	40246	40251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101590
785	NC_014962	CCG	2	6	40256	40261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101590
786	NC_014962	CTG	2	6	40337	40342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101590
787	NC_014962	CCG	2	6	40353	40358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101590
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832	NC_014962	CCA	2	6	42857	42862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101591
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855	NC_014962	ACC	2	6	43972	43977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101592
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860	NC_014962	ACCG	2	8	44135	44142	25 %	0 %	25 %	50 %	320101592
861	NC_014962	CGGGTC	2	12	44146	44157	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320101592
862	NC_014962	GAT	2	6	44166	44171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101592
863	NC_014962	CGC	2	6	44231	44236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101592
864	NC_014962	ATCTCG	2	12	44242	44253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320101592
865	NC_014962	GGC	2	6	44307	44312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
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867	NC_014962	GC	3	6	44350	44355	0 %	0 %	50 %	50 %	320101592
868	NC_014962	CGCC	2	8	44356	44363	0 %	0 %	25 %	75 %	320101592
869	NC_014962	GCGG	2	8	44383	44390	0 %	0 %	75 %	25 %	320101592
870	NC_014962	CTG	2	6	44462	44467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101592
871	NC_014962	ACC	2	6	44479	44484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101592
872	NC_014962	GCG	2	6	44491	44496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
873	NC_014962	TGG	2	6	44576	44581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101592
874	NC_014962	CGA	2	6	44594	44599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101592
875	NC_014962	ACC	2	6	44689	44694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101592
876	NC_014962	CGG	2	6	44712	44717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
877	NC_014962	CGA	2	6	44745	44750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101592
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879	NC_014962	CGG	2	6	44977	44982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101593
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1000	NC_014962	CGG	2	6	50764	50769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101597

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