MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014962	GGC	2	6	299797	299802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101758
6002	NC_014962	CGG	2	6	299817	299822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101758
6003	NC_014962	ACC	2	6	299839	299844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101758
6004	NC_014962	CGG	2	6	299982	299987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101758
6005	NC_014962	CCG	2	6	300005	300010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101758
6006	NC_014962	CGA	2	6	300043	300048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6007	NC_014962	TCG	2	6	300110	300115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6008	NC_014962	TGA	2	6	300119	300124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101758
6009	NC_014962	CAG	2	6	300184	300189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6010	NC_014962	CGG	2	6	300198	300203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101758
6011	NC_014962	CTCC	2	8	300230	300237	0 %	25 %	0 %	75 %	320101758
6012	NC_014962	CGC	2	6	300324	300329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101758
6013	NC_014962	ACC	2	6	300437	300442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101758
6014	NC_014962	TGT	2	6	300450	300455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101758
6015	NC_014962	CCG	2	6	300461	300466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101758
6016	NC_014962	GGGA	2	8	300506	300513	25 %	0 %	75 %	0 %	320101758
6017	NC_014962	GC	3	6	300515	300520	0 %	0 %	50 %	50 %	320101758
6018	NC_014962	TCG	2	6	300551	300556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6019	NC_014962	GAG	3	9	300598	300606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101758
6020	NC_014962	GAT	2	6	300708	300713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101758
6021	NC_014962	ACG	2	6	300758	300763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6022	NC_014962	CGC	2	6	300769	300774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101758
6023	NC_014962	GCC	2	6	300787	300792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101758
6024	NC_014962	AGG	2	6	300800	300805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101758
6025	NC_014962	GCCCG	2	10	301030	301039	0 %	0 %	40 %	60 %	320101758
6026	NC_014962	TGGCC	2	10	301212	301221	0 %	20 %	40 %	40 %	320101758
6027	NC_014962	GTC	2	6	301339	301344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6028	NC_014962	CTT	2	6	301348	301353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101758
6029	NC_014962	GAC	2	6	301354	301359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6030	NC_014962	TCG	2	6	301490	301495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6031	NC_014962	GTG	2	6	301540	301545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101758
6032	NC_014962	GCCC	2	8	301609	301616	0 %	0 %	25 %	75 %	320101758
6033	NC_014962	ACG	2	6	301667	301672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6034	NC_014962	ACG	2	6	301715	301720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
6035	NC_014962	CTG	2	6	301905	301910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101759
6036	NC_014962	GCC	2	6	301938	301943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101759
6037	NC_014962	CCG	2	6	301950	301955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101759
6038	NC_014962	CGG	2	6	301969	301974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101759
6039	NC_014962	AGG	2	6	302005	302010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101759
6040	NC_014962	TCGTTG	2	12	302034	302045	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	320101759
6041	NC_014962	CCAA	2	8	302101	302108	50 %	0 %	0 %	50 %	320101759
6042	NC_014962	GCG	2	6	302134	302139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101759
6043	NC_014962	GGT	2	6	302171	302176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101759
6044	NC_014962	GGC	2	6	302177	302182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101759
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6046	NC_014962	ACGCC	2	10	302307	302316	20 %	0 %	20 %	60 %	320101759
6047	NC_014962	CGC	3	9	302457	302465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101760
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6049	NC_014962	GTC	2	6	302511	302516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101760
6050	NC_014962	TCT	2	6	302744	302749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101761
6051	NC_014962	GCA	2	6	302787	302792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101761
6052	NC_014962	CGAT	2	8	303014	303021	25 %	25 %	25 %	25 %	320101761
6053	NC_014962	CGA	2	6	303174	303179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101761
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6055	NC_014962	GAG	3	9	303205	303213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101761
6056	NC_014962	CGGTT	2	10	303234	303243	0 %	40 %	40 %	20 %	320101761
6057	NC_014962	ATGGG	2	10	303248	303257	20 %	20 %	60 %	0 %	320101761
6058	NC_014962	TGG	3	9	303371	303379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101761
6059	NC_014962	CGA	2	6	303396	303401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101761
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6061	NC_014962	GGT	2	6	303420	303425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101761
6062	NC_014962	GTG	2	6	303511	303516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101761
6063	NC_014962	AGG	2	6	303518	303523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101761
6064	NC_014962	GTTC	2	8	303526	303533	0 %	50 %	25 %	25 %	320101761
6065	NC_014962	GT	3	6	303598	303603	0 %	50 %	50 %	0 %	320101761
6066	NC_014962	GTG	2	6	303622	303627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101761
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6070	NC_014962	GAT	2	6	303816	303821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101761
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6072	NC_014962	GGT	2	6	303888	303893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101761
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6075	NC_014962	CGC	2	6	303933	303938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101761
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6080	NC_014962	CG	3	6	304143	304148	0 %	0 %	50 %	50 %	320101761
6081	NC_014962	TGG	2	6	304149	304154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101761
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6104	NC_014962	CT	3	6	305491	305496	0 %	50 %	0 %	50 %	320101763
6105	NC_014962	CCAGA	2	10	305574	305583	40 %	0 %	20 %	40 %	320101763
6106	NC_014962	CGG	3	9	305854	305862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101764
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6109	NC_014962	CGT	2	6	305920	305925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101764
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6112	NC_014962	CGG	2	6	306133	306138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101764
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6121	NC_014962	AACC	2	8	306744	306751	50 %	0 %	0 %	50 %	320101764
6122	NC_014962	CGG	2	6	306799	306804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101764
6123	NC_014962	CGG	2	6	306814	306819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101764
6124	NC_014962	CGT	2	6	306844	306849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101764
6125	NC_014962	CGG	2	6	306910	306915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101764
6126	NC_014962	GGT	2	6	306919	306924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101764
6127	NC_014962	GGCCG	2	10	306971	306980	0 %	0 %	60 %	40 %	320101764
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6134	NC_014962	CGA	2	6	307522	307527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101765
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6136	NC_014962	GCGGGA	2	12	307574	307585	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320101765
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6141	NC_014962	CGT	2	6	307699	307704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101765
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6143	NC_014962	GCTC	2	8	307785	307792	0 %	25 %	25 %	50 %	320101766
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6149	NC_014962	ACCG	2	8	307921	307928	25 %	0 %	25 %	50 %	320101766
6150	NC_014962	GCG	2	6	308006	308011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101766
6151	NC_014962	GTA	2	6	308068	308073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101766
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6159	NC_014962	CG	3	6	308398	308403	0 %	0 %	50 %	50 %	320101766
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6237	NC_014962	GCAGGG	2	12	311660	311671	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320101767
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6241	NC_014962	GTC	2	6	312108	312113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101768
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6352	NC_014962	G	6	6	317421	317426	0 %	0 %	100 %	0 %	320101772
6353	NC_014962	GGACGG	2	12	317475	317486	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320101772
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6356	NC_014962	CTC	2	6	317850	317855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101773
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6362	NC_014962	C	6	6	318142	318147	0 %	0 %	0 %	100 %	320101773
6363	NC_014962	CGA	2	6	318159	318164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101773
6364	NC_014962	CCG	2	6	318170	318175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101773
6365	NC_014962	CTG	2	6	318244	318249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101773
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6383	NC_014962	TCG	2	6	319273	319278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101774
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6394	NC_014962	TCG	2	6	319672	319677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101774
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6483	NC_014962	GAG	2	6	323693	323698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101775
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6485	NC_014962	CG	3	6	323746	323751	0 %	0 %	50 %	50 %	320101775
6486	NC_014962	GC	3	6	323770	323775	0 %	0 %	50 %	50 %	320101775
6487	NC_014962	GTC	2	6	323781	323786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101775
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