MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 1134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	GAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041923
2	NC_014957	TCGGT	2	10	367	376	0 %	40 %	40 %	20 %	320041923
3	NC_014957	TGC	2	6	466	471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
4	NC_014957	GCG	3	9	523	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
5	NC_014957	C	7	7	546	552	0 %	0 %	0 %	100 %	320041923
6	NC_014957	CCG	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
7	NC_014957	CCCGGC	2	12	714	725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
8	NC_014957	GAG	2	6	744	749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041923
9	NC_014957	GC	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
10	NC_014957	CGA	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
11	NC_014957	GCCG	2	8	837	844	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
12	NC_014957	CTG	3	9	888	896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
13	NC_014957	CGCC	2	8	920	927	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
14	NC_014957	CGCCC	2	10	1031	1040	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
15	NC_014957	AG	3	6	1060	1065	50 %	0 %	50 %	0 %	320041923
16	NC_014957	GACG	2	8	1089	1096	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
17	NC_014957	CGG	2	6	1097	1102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
18	NC_014957	GTG	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041923
19	NC_014957	CCG	3	9	1149	1157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
20	NC_014957	GTG	3	9	1298	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041923
21	NC_014957	GGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
22	NC_014957	CGC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
23	NC_014957	CCGC	2	8	1417	1424	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
24	NC_014957	TCT	3	9	1429	1437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320041923
25	NC_014957	CCG	3	9	1438	1446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
26	NC_014957	AGC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
27	NC_014957	GAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041923
28	NC_014957	GGTGAT	2	12	1586	1597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	320041923
29	NC_014957	GCCA	2	8	1611	1618	25 %	0 %	25 %	50 %	320041923
30	NC_014957	CGT	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
31	NC_014957	AAC	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320041923
32	NC_014957	GCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
33	NC_014957	TGC	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
34	NC_014957	CTGC	2	8	1919	1926	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
35	NC_014957	CCG	2	6	2016	2021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
36	NC_014957	GC	3	6	2040	2045	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
37	NC_014957	AGG	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041923
38	NC_014957	CGC	2	6	2163	2168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
39	NC_014957	CG	3	6	2187	2192	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
40	NC_014957	TCC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041923
41	NC_014957	GTT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041923
42	NC_014957	GCC	2	6	2286	2291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
43	NC_014957	CAC	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041923
44	NC_014957	CCG	4	12	2368	2379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
45	NC_014957	GCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
46	NC_014957	GCC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
47	NC_014957	CCG	2	6	2543	2548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
48	NC_014957	CGA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
49	NC_014957	CG	3	6	2579	2584	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
50	NC_014957	CGCT	2	8	2601	2608	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
51	NC_014957	GA	3	6	2636	2641	50 %	0 %	50 %	0 %	320041923
52	NC_014957	AGG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041923
53	NC_014957	CGA	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
54	NC_014957	CGCC	2	8	2762	2769	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
55	NC_014957	C	6	6	2783	2788	0 %	0 %	0 %	100 %	320041923
56	NC_014957	GCC	2	6	2808	2813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
57	NC_014957	CTG	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
58	NC_014957	TCC	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041923
59	NC_014957	GGC	2	6	2990	2995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
60	NC_014957	ACGG	2	8	3007	3014	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
61	NC_014957	CGCC	2	8	3020	3027	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
62	NC_014957	ACGCC	2	10	3041	3050	20 %	0 %	20 %	60 %	320041923
63	NC_014957	GCC	4	12	3048	3059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
64	NC_014957	ACC	2	6	3061	3066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041923
65	NC_014957	CCCGG	2	10	3098	3107	0 %	0 %	40 %	60 %	320041923
66	NC_014957	CCGC	2	8	3112	3119	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
67	NC_014957	GGTC	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	320041923
68	NC_014957	GAC	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
69	NC_014957	CGA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
70	NC_014957	CCA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041923
71	NC_014957	GCTCCG	2	12	3290	3301	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320041923
72	NC_014957	CGCCCT	2	12	3302	3313	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041923
73	NC_014957	CGCCC	2	10	3324	3333	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
74	NC_014957	CCGC	2	8	3343	3350	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
75	NC_014957	C	8	8	3370	3377	0 %	0 %	0 %	100 %	320041923
76	NC_014957	CCCTCC	2	12	3418	3429	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320041923
77	NC_014957	CTC	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041924
78	NC_014957	ATGCG	2	10	3730	3739	20 %	20 %	40 %	20 %	320041924
79	NC_014957	GGTC	2	8	3752	3759	0 %	25 %	50 %	25 %	320041924
80	NC_014957	CA	4	8	3793	3800	50 %	0 %	0 %	50 %	320041924
81	NC_014957	ACATG	2	10	3801	3810	40 %	20 %	20 %	20 %	320041924
82	NC_014957	GAA	2	6	3859	3864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041924
83	NC_014957	CATC	2	8	3905	3912	25 %	25 %	0 %	50 %	320041924
84	NC_014957	TGG	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041925
85	NC_014957	TTGTGT	2	12	4003	4014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041925
86	NC_014957	TCGC	2	8	4031	4038	0 %	25 %	25 %	50 %	320041925
87	NC_014957	CCG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041925
88	NC_014957	TGA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041925
89	NC_014957	CTGAT	2	10	4116	4125	20 %	40 %	20 %	20 %	320041925
90	NC_014957	GGT	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
91	NC_014957	CCCG	2	8	6029	6036	0 %	0 %	25 %	75 %	320041926
92	NC_014957	TGG	2	6	6176	6181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
93	NC_014957	A	6	6	6207	6212	100 %	0 %	0 %	0 %	320041926
94	NC_014957	CCTT	2	8	6213	6220	0 %	50 %	0 %	50 %	320041926
95	NC_014957	GTG	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
96	NC_014957	ACC	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
97	NC_014957	A	6	6	6548	6553	100 %	0 %	0 %	0 %	320041926
98	NC_014957	TGA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041926
99	NC_014957	ACC	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
100	NC_014957	CGA	3	9	6715	6723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041926
101	NC_014957	CT	3	6	6788	6793	0 %	50 %	0 %	50 %	320041926
102	NC_014957	GTG	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
103	NC_014957	ACG	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041926
104	NC_014957	ACG	3	9	6885	6893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041926
105	NC_014957	CG	3	6	6914	6919	0 %	0 %	50 %	50 %	320041926
106	NC_014957	ACC	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
107	NC_014957	TGC	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041926
108	NC_014957	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
109	NC_014957	GGC	2	6	7144	7149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041926
110	NC_014957	CTG	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041926
111	NC_014957	GGC	3	9	7247	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041926
112	NC_014957	CCA	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
113	NC_014957	CAT	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320041926
114	NC_014957	CCCA	2	8	7337	7344	25 %	0 %	0 %	75 %	320041926
115	NC_014957	GAG	2	6	7397	7402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041926
116	NC_014957	CGC	2	6	7415	7420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041926
117	NC_014957	CGC	2	6	7435	7440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041926
118	NC_014957	GCC	2	6	7451	7456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041926
119	NC_014957	ACC	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
120	NC_014957	CCA	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
121	NC_014957	CG	3	6	7523	7528	0 %	0 %	50 %	50 %	320041926
122	NC_014957	CTCGTC	2	12	7931	7942	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320041927
123	NC_014957	C	6	6	7972	7977	0 %	0 %	0 %	100 %	320041927
124	NC_014957	GCAG	2	8	8005	8012	25 %	0 %	50 %	25 %	320041927
125	NC_014957	AGC	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041927
126	NC_014957	TGC	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041927
127	NC_014957	GACC	2	8	8081	8088	25 %	0 %	25 %	50 %	320041927
128	NC_014957	CGA	2	6	8120	8125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041927
129	NC_014957	G	6	6	8127	8132	0 %	0 %	100 %	0 %	320041927
130	NC_014957	CCG	2	6	8173	8178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
131	NC_014957	TGG	2	6	8185	8190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041927
132	NC_014957	GCC	2	6	8246	8251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
133	NC_014957	GTG	2	6	8300	8305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041927
134	NC_014957	TAG	2	6	8392	8397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041927
135	NC_014957	CGG	2	6	8398	8403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041927
136	NC_014957	GAG	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041927
137	NC_014957	CAGCGG	2	12	8418	8429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320041927
138	NC_014957	AGG	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041927
139	NC_014957	G	6	6	8437	8442	0 %	0 %	100 %	0 %	320041927
140	NC_014957	C	6	6	8445	8450	0 %	0 %	0 %	100 %	320041927
141	NC_014957	CGC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
142	NC_014957	CGG	3	9	8515	8523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041927
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148	NC_014957	CACCT	2	10	8818	8827	20 %	20 %	0 %	60 %	320041927
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150	NC_014957	GGC	2	6	8846	8851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041927
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152	NC_014957	GGT	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041927
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157	NC_014957	TGCA	2	8	9108	9115	25 %	25 %	25 %	25 %	320041927
158	NC_014957	CGCGG	2	10	9149	9158	0 %	0 %	60 %	40 %	320041927
159	NC_014957	GAA	2	6	9182	9187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041927
160	NC_014957	GCG	2	6	9207	9212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041927
161	NC_014957	GCG	2	6	9216	9221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041927
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163	NC_014957	G	8	8	9276	9283	0 %	0 %	100 %	0 %	320041927
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166	NC_014957	CTCCAG	2	12	9365	9376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320041927
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245	NC_014957	CGA	2	6	12215	12220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041927
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247	NC_014957	GACC	2	8	12281	12288	25 %	0 %	25 %	50 %	320041927
248	NC_014957	CGC	2	6	12333	12338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
249	NC_014957	GAG	2	6	12532	12537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041928
250	NC_014957	AGC	2	6	12577	12582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041928
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252	NC_014957	GGCA	2	8	12797	12804	25 %	0 %	50 %	25 %	320041928
253	NC_014957	AAC	2	6	12829	12834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320041928
254	NC_014957	GAT	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041928
255	NC_014957	C	6	6	12877	12882	0 %	0 %	0 %	100 %	320041928
256	NC_014957	CGT	2	6	12905	12910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041928
257	NC_014957	ACC	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041928
258	NC_014957	CAG	2	6	13044	13049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041928
259	NC_014957	TCC	2	6	13306	13311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041928
260	NC_014957	CCT	2	6	13430	13435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041928
261	NC_014957	CAA	2	6	13455	13460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320041928
262	NC_014957	C	7	7	13461	13467	0 %	0 %	0 %	100 %	320041928
263	NC_014957	TGG	2	6	13514	13519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041928
264	NC_014957	GGA	2	6	13550	13555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041928
265	NC_014957	CCA	2	6	13661	13666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041928
266	NC_014957	CGG	2	6	13690	13695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041928
267	NC_014957	CG	3	6	13719	13724	0 %	0 %	50 %	50 %	320041928
268	NC_014957	TGGT	2	8	13756	13763	0 %	50 %	50 %	0 %	320041928
269	NC_014957	CGC	2	6	13767	13772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041928
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390	NC_014957	GCC	2	6	20551	20556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041934
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392	NC_014957	CGGA	2	8	20592	20599	25 %	0 %	50 %	25 %	320041934
393	NC_014957	CGC	2	6	20602	20607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041934
394	NC_014957	CGT	2	6	20642	20647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041934
395	NC_014957	CCA	2	6	20726	20731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041934
396	NC_014957	GCCGAC	2	12	20743	20754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320041934
397	NC_014957	CCG	2	6	20759	20764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041934
398	NC_014957	GCCGAT	2	12	20767	20778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320041934
399	NC_014957	ACG	2	6	20797	20802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041934
400	NC_014957	CGC	2	6	20812	20817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041934
401	NC_014957	CGCGC	2	10	20825	20834	0 %	0 %	40 %	60 %	320041934
402	NC_014957	CG	3	6	20968	20973	0 %	0 %	50 %	50 %	320041934
403	NC_014957	GGT	2	6	21547	21552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041935
404	NC_014957	GCCA	2	8	21569	21576	25 %	0 %	25 %	50 %	320041935
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411	NC_014957	CGG	2	6	21799	21804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041935
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413	NC_014957	CG	3	6	21832	21837	0 %	0 %	50 %	50 %	320041935
414	NC_014957	CCG	2	6	21870	21875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041935
415	NC_014957	GGT	2	6	21904	21909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041935
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417	NC_014957	CGG	2	6	21967	21972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041935
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421	NC_014957	CG	3	6	22117	22122	0 %	0 %	50 %	50 %	320041935
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425	NC_014957	CCG	2	6	22584	22589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041936
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429	NC_014957	CGCAG	2	10	22722	22731	20 %	0 %	40 %	40 %	320041936
430	NC_014957	CGG	2	6	22732	22737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041936
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452	NC_014957	GTC	2	6	23423	23428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041936
453	NC_014957	CCA	2	6	23445	23450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041936
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455	NC_014957	CCCG	2	8	23493	23500	0 %	0 %	25 %	75 %	320041936
456	NC_014957	CG	3	6	23520	23525	0 %	0 %	50 %	50 %	320041936
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470	NC_014957	GCG	2	6	24573	24578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041937
471	NC_014957	CG	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	320041937
472	NC_014957	CGG	3	9	24647	24655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041937
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481	NC_014957	C	8	8	25071	25078	0 %	0 %	0 %	100 %	320041937
482	NC_014957	GCC	2	6	25087	25092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041937
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489	NC_014957	C	6	6	25259	25264	0 %	0 %	0 %	100 %	320041937
490	NC_014957	CCA	2	6	25294	25299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041937
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492	NC_014957	CGCCTC	2	12	25320	25331	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041937
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495	NC_014957	GTG	2	6	25635	25640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041938
496	NC_014957	CGC	2	6	25643	25648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041938
497	NC_014957	GCC	2	6	25650	25655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041938
498	NC_014957	CG	4	8	25688	25695	0 %	0 %	50 %	50 %	320041938
499	NC_014957	GCC	3	9	25746	25754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041938
500	NC_014957	GTC	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041938

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