MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Intrasporangium calvum DSM 43043 chromosome

Total Repeats: 100388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014830	CCG	2	6	47378	47383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123220
1002	NC_014830	GCC	2	6	47412	47417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123220
1003	NC_014830	GAG	2	6	47423	47428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123220
1004	NC_014830	GCA	2	6	47436	47441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1005	NC_014830	TGC	2	6	47442	47447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1006	NC_014830	GC	3	6	47514	47519	0 %	0 %	50 %	50 %	317123220
1007	NC_014830	CGA	2	6	47545	47550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1008	NC_014830	GTCT	2	8	47651	47658	0 %	50 %	25 %	25 %	317123220
1009	NC_014830	GC	3	6	47659	47664	0 %	0 %	50 %	50 %	317123220
1010	NC_014830	CGG	2	6	47713	47718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123220
1011	NC_014830	CTG	2	6	47798	47803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1012	NC_014830	AAG	2	6	47828	47833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123220
1013	NC_014830	GGC	2	6	47869	47874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123220
1014	NC_014830	GCT	2	6	47875	47880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1015	NC_014830	TCGC	2	8	47902	47909	0 %	25 %	25 %	50 %	317123220
1016	NC_014830	CTT	2	6	47923	47928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317123220
1017	NC_014830	CGCCTT	2	12	47932	47943	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	317123220
1018	NC_014830	CTG	3	9	47990	47998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1019	NC_014830	ACG	2	6	48030	48035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123220
1020	NC_014830	GCTA	2	8	48038	48045	25 %	25 %	25 %	25 %	317123220
1021	NC_014830	GGCGCC	2	12	48241	48252	0 %	0 %	50 %	50 %	317123220
1022	NC_014830	CG	3	6	48324	48329	0 %	0 %	50 %	50 %	317123220
1023	NC_014830	CGA	2	6	48716	48721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1024	NC_014830	AGC	2	6	48723	48728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1025	NC_014830	CGT	2	6	48794	48799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1026	NC_014830	TCG	2	6	48804	48809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1027	NC_014830	GCG	2	6	48837	48842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123221
1028	NC_014830	CGA	2	6	48859	48864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1029	NC_014830	TCG	2	6	48900	48905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1030	NC_014830	GAGGC	2	10	48934	48943	20 %	0 %	60 %	20 %	317123221
1031	NC_014830	CGC	2	6	48968	48973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123221
1032	NC_014830	TGG	2	6	48985	48990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123221
1033	NC_014830	GTC	2	6	48993	48998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1034	NC_014830	TCG	2	6	49012	49017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1035	NC_014830	TCG	3	9	49030	49038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1036	NC_014830	CGG	2	6	49045	49050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123221
1037	NC_014830	CGC	2	6	49141	49146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123221
1038	NC_014830	GACGAG	2	12	49172	49183	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	317123221
1039	NC_014830	GTG	2	6	49227	49232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123221
1040	NC_014830	CCATCG	2	12	49234	49245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317123221
1041	NC_014830	CTC	2	6	49316	49321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123221
1042	NC_014830	GTC	2	6	49355	49360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1043	NC_014830	GCG	2	6	49371	49376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123221
1044	NC_014830	GCG	2	6	49380	49385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123221
1045	NC_014830	ACCCCG	2	12	49386	49397	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	317123221
1046	NC_014830	ACG	3	9	49416	49424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1047	NC_014830	CG	3	6	49587	49592	0 %	0 %	50 %	50 %	317123221
1048	NC_014830	GCT	2	6	49593	49598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1049	NC_014830	CGA	2	6	49624	49629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1050	NC_014830	CAG	2	6	49658	49663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1051	NC_014830	TCA	2	6	49666	49671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317123221
1052	NC_014830	TGCG	2	8	49699	49706	0 %	25 %	50 %	25 %	317123221
1053	NC_014830	CGG	2	6	49762	49767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123221
1054	NC_014830	GCC	2	6	49778	49783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123221
1055	NC_014830	C	6	6	49782	49787	0 %	0 %	0 %	100 %	317123221
1056	NC_014830	GCC	2	6	49838	49843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123221
1057	NC_014830	TCC	2	6	49860	49865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123221
1058	NC_014830	ACG	2	6	49875	49880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1059	NC_014830	GC	3	6	49894	49899	0 %	0 %	50 %	50 %	317123221
1060	NC_014830	ACG	2	6	49905	49910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1061	NC_014830	GCG	2	6	49926	49931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123221
1062	NC_014830	CCGT	2	8	49971	49978	0 %	25 %	25 %	50 %	317123221
1063	NC_014830	CTG	2	6	49991	49996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123221
1064	NC_014830	GGGCT	2	10	50037	50046	0 %	20 %	60 %	20 %	317123221
1065	NC_014830	TCC	2	6	50124	50129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123221
1066	NC_014830	CT	3	6	50323	50328	0 %	50 %	0 %	50 %	317123222
1067	NC_014830	GCC	2	6	50342	50347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123222
1068	NC_014830	TGG	2	6	50364	50369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123222
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1070	NC_014830	CGC	2	6	50485	50490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123222
1071	NC_014830	ACC	2	6	50549	50554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123222
1072	NC_014830	TCC	2	6	50565	50570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123222
1073	NC_014830	TCA	2	6	50625	50630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317123222
1074	NC_014830	TCG	2	6	50649	50654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123222
1075	NC_014830	TCC	2	6	50673	50678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123222
1076	NC_014830	CGC	2	6	50683	50688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123222
1077	NC_014830	CGCCC	2	10	50727	50736	0 %	0 %	20 %	80 %	317123222
1078	NC_014830	GC	4	8	50761	50768	0 %	0 %	50 %	50 %	317123222
1079	NC_014830	ACGC	2	8	50779	50786	25 %	0 %	25 %	50 %	317123222
1080	NC_014830	CG	3	6	50992	50997	0 %	0 %	50 %	50 %	317123223
1081	NC_014830	CG	3	6	51084	51089	0 %	0 %	50 %	50 %	317123223
1082	NC_014830	C	6	6	51092	51097	0 %	0 %	0 %	100 %	317123223
1083	NC_014830	TGG	2	6	51109	51114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123223
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1085	NC_014830	CAC	2	6	51147	51152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123223
1086	NC_014830	TCGACC	2	12	51191	51202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317123223
1087	NC_014830	GAC	2	6	51225	51230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123223
1088	NC_014830	GCA	2	6	51248	51253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123223
1089	NC_014830	CTC	2	6	51304	51309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123223
1090	NC_014830	GGC	2	6	51310	51315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123223
1091	NC_014830	GCCGGT	2	12	51339	51350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317123223
1092	NC_014830	CGA	2	6	51375	51380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123223
1093	NC_014830	CAC	2	6	51391	51396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123223
1094	NC_014830	CGA	2	6	51530	51535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123223
1095	NC_014830	G	6	6	51570	51575	0 %	0 %	100 %	0 %	317123223
1096	NC_014830	CAG	2	6	51627	51632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123223
1097	NC_014830	TCT	2	6	51668	51673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317123223
1098	NC_014830	C	6	6	51715	51720	0 %	0 %	0 %	100 %	317123223
1099	NC_014830	CCGG	2	8	51724	51731	0 %	0 %	50 %	50 %	317123223
1100	NC_014830	CG	3	6	51732	51737	0 %	0 %	50 %	50 %	317123223
1101	NC_014830	GAC	2	6	51742	51747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123223
1102	NC_014830	CTC	2	6	51811	51816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123223
1103	NC_014830	CGG	3	9	51839	51847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123223
1104	NC_014830	ACC	2	6	51850	51855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123223
1105	NC_014830	CG	3	6	51868	51873	0 %	0 %	50 %	50 %	317123223
1106	NC_014830	CCCG	2	8	51901	51908	0 %	0 %	25 %	75 %	317123223
1107	NC_014830	ACC	3	9	52016	52024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123224
1108	NC_014830	CGA	2	6	52036	52041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1109	NC_014830	AGC	2	6	52042	52047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1110	NC_014830	CGC	2	6	52048	52053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123224
1111	NC_014830	CAC	2	6	52067	52072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123224
1112	NC_014830	TCG	2	6	52080	52085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1113	NC_014830	TCG	2	6	52101	52106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1114	NC_014830	GC	3	6	52196	52201	0 %	0 %	50 %	50 %	317123224
1115	NC_014830	TCG	2	6	52203	52208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1116	NC_014830	GAG	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123224
1117	NC_014830	ACG	2	6	52253	52258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1118	NC_014830	GGCC	2	8	52285	52292	0 %	0 %	50 %	50 %	317123224
1119	NC_014830	CCT	2	6	52294	52299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123224
1120	NC_014830	CGC	2	6	52303	52308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123224
1121	NC_014830	TCG	2	6	52341	52346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1122	NC_014830	GCCG	2	8	52369	52376	0 %	0 %	50 %	50 %	317123224
1123	NC_014830	CGG	2	6	52377	52382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123224
1124	NC_014830	GCT	2	6	52399	52404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123224
1125	NC_014830	TCC	2	6	52446	52451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123224
1126	NC_014830	CTC	2	6	52454	52459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123224
1127	NC_014830	CTC	2	6	52490	52495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123224
1128	NC_014830	GAG	2	6	52496	52501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123224
1129	NC_014830	CAC	2	6	52505	52510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123224
1130	NC_014830	CTC	2	6	52569	52574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123225
1131	NC_014830	CTC	2	6	52597	52602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123225
1132	NC_014830	CCGGG	2	10	52603	52612	0 %	0 %	60 %	40 %	317123225
1133	NC_014830	CGA	2	6	52683	52688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123225
1134	NC_014830	TCC	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123225
1135	NC_014830	TCG	3	9	52763	52771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123225
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1142	NC_014830	CCGG	2	8	53118	53125	0 %	0 %	50 %	50 %	317123225
1143	NC_014830	CGG	2	6	53169	53174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123225
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1145	NC_014830	CGA	2	6	53274	53279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123225
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1151	NC_014830	GCA	2	6	53550	53555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123225
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1155	NC_014830	GCC	2	6	53679	53684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123225
1156	NC_014830	GCG	2	6	53685	53690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123225
1157	NC_014830	CGAC	2	8	53812	53819	25 %	0 %	25 %	50 %	317123225
1158	NC_014830	CGA	2	6	53826	53831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123225
1159	NC_014830	ACGGCC	2	12	53834	53845	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317123225
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1161	NC_014830	CGA	2	6	53913	53918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123225
1162	NC_014830	GTC	2	6	53920	53925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123225
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1198	NC_014830	GCCG	2	8	54817	54824	0 %	0 %	50 %	50 %	317123226
1199	NC_014830	CG	3	6	54851	54856	0 %	0 %	50 %	50 %	317123226
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1201	NC_014830	GGACG	2	10	54927	54936	20 %	0 %	60 %	20 %	317123226
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1211	NC_014830	G	6	6	55344	55349	0 %	0 %	100 %	0 %	317123226
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1218	NC_014830	GGGTC	2	10	55512	55521	0 %	20 %	60 %	20 %	317123226
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1220	NC_014830	GC	3	6	55550	55555	0 %	0 %	50 %	50 %	317123226
1221	NC_014830	CG	3	6	55572	55577	0 %	0 %	50 %	50 %	317123226
1222	NC_014830	GCAG	2	8	55623	55630	25 %	0 %	50 %	25 %	317123226
1223	NC_014830	CGC	2	6	55648	55653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123226
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1227	NC_014830	CGT	2	6	55901	55906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123227
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1229	NC_014830	GGCGGG	2	12	56021	56032	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	317123227
1230	NC_014830	AGC	2	6	56090	56095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1231	NC_014830	GC	3	6	56097	56102	0 %	0 %	50 %	50 %	317123227
1232	NC_014830	GAG	2	6	56106	56111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123227
1233	NC_014830	ACG	2	6	56192	56197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1234	NC_014830	TCTCC	2	10	56207	56216	0 %	40 %	0 %	60 %	317123227
1235	NC_014830	CGT	2	6	56219	56224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1236	NC_014830	AGC	2	6	56233	56238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1237	NC_014830	GAT	2	6	56343	56348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317123227
1238	NC_014830	CGGC	2	8	56362	56369	0 %	0 %	50 %	50 %	317123227
1239	NC_014830	GGT	2	6	56378	56383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123227
1240	NC_014830	AGGCC	2	10	56390	56399	20 %	0 %	40 %	40 %	317123227
1241	NC_014830	TCGCCG	2	12	56405	56416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317123227
1242	NC_014830	GCA	2	6	56423	56428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1243	NC_014830	AGC	2	6	56479	56484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1244	NC_014830	GCC	2	6	56519	56524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123227
1245	NC_014830	GAC	2	6	56556	56561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1246	NC_014830	GCC	2	6	56613	56618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123227
1247	NC_014830	CGGGT	2	10	56667	56676	0 %	20 %	60 %	20 %	317123227
1248	NC_014830	AGC	2	6	56683	56688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
1249	NC_014830	GGC	2	6	56694	56699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123227
1250	NC_014830	CGC	2	6	56700	56705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123227
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1253	NC_014830	AGC	2	6	56749	56754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123227
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1361	NC_014830	GCTC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	317123230
1362	NC_014830	CCT	2	6	61294	61299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123230
1363	NC_014830	GGC	2	6	61304	61309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123230
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1366	NC_014830	CCCGGC	2	12	61615	61626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123230
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1368	NC_014830	CCGGC	2	10	61669	61678	0 %	0 %	40 %	60 %	317123230
1369	NC_014830	CGC	2	6	61708	61713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123230
1370	NC_014830	AGC	2	6	61717	61722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123230
1371	NC_014830	TGC	2	6	61741	61746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123230
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1373	NC_014830	CCGG	2	8	61813	61820	0 %	0 %	50 %	50 %	317123230
1374	NC_014830	GCG	2	6	61830	61835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123230
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1496	NC_014830	GCA	2	6	66816	66821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123237
1497	NC_014830	CGG	2	6	66825	66830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123237
1498	NC_014830	GACC	2	8	66832	66839	25 %	0 %	25 %	50 %	317123237
1499	NC_014830	CGA	2	6	66924	66929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123237
1500	NC_014830	TCA	2	6	66959	66964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317123237

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