MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 48605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006512	GCT	2	6	28315	28320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459137
502	NC_006512	CCG	2	6	28441	28446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459137
503	NC_006512	TGA	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
504	NC_006512	TGA	2	6	28554	28559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
505	NC_006512	AAC	2	6	28627	28632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459137
506	NC_006512	TGGT	2	8	28659	28666	0 %	50 %	50 %	0 %	56459137
507	NC_006512	GT	3	6	28665	28670	0 %	50 %	50 %	0 %	56459137
508	NC_006512	TA	3	6	28700	28705	50 %	50 %	0 %	0 %	56459137
509	NC_006512	CCT	2	6	28890	28895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56459137
510	NC_006512	TTAC	2	8	29067	29074	25 %	50 %	0 %	25 %	56459137
511	NC_006512	A	7	7	29259	29265	100 %	0 %	0 %	0 %	56459137
512	NC_006512	GAG	2	6	29285	29290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56459137
513	NC_006512	TTC	2	6	29327	29332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459137
514	NC_006512	GAA	2	6	29356	29361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459137
515	NC_006512	GC	3	6	29373	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	56459137
516	NC_006512	GCA	2	6	29443	29448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459137
517	NC_006512	GAT	2	6	29497	29502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
518	NC_006512	AC	3	6	29524	29529	50 %	0 %	0 %	50 %	56459137
519	NC_006512	CCG	2	6	29607	29612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459137
520	NC_006512	TGA	2	6	29797	29802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
521	NC_006512	CGT	2	6	30020	30025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459137
522	NC_006512	TAA	2	6	30166	30171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459137
523	NC_006512	GAT	2	6	30179	30184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
524	NC_006512	TAA	2	6	30328	30333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459137
525	NC_006512	GCCA	2	8	30495	30502	25 %	0 %	25 %	50 %	56459138
526	NC_006512	TAGG	2	8	30627	30634	25 %	25 %	50 %	0 %	56459138
527	NC_006512	TAC	2	6	30669	30674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459138
528	NC_006512	CGG	2	6	30698	30703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459138
529	NC_006512	CAGAA	2	10	30723	30732	60 %	0 %	20 %	20 %	56459138
530	NC_006512	GCT	2	6	30755	30760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459138
531	NC_006512	TAA	2	6	30770	30775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459138
532	NC_006512	TTG	2	6	30800	30805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459138
533	NC_006512	TGA	2	6	30875	30880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459138
534	NC_006512	GC	3	6	31023	31028	0 %	0 %	50 %	50 %	56459138
535	NC_006512	TGA	2	6	31033	31038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459138
536	NC_006512	CGC	2	6	31100	31105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459138
537	NC_006512	CGG	2	6	31213	31218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459138
538	NC_006512	CTG	2	6	31244	31249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459138
539	NC_006512	T	7	7	31299	31305	0 %	100 %	0 %	0 %	56459138
540	NC_006512	A	6	6	31312	31317	100 %	0 %	0 %	0 %	56459138
541	NC_006512	TCG	2	6	31382	31387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459139
542	NC_006512	GCTT	2	8	31499	31506	0 %	50 %	25 %	25 %	56459139
543	NC_006512	GC	4	8	31528	31535	0 %	0 %	50 %	50 %	56459139
544	NC_006512	TAA	2	6	31561	31566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459139
545	NC_006512	AATT	2	8	31603	31610	50 %	50 %	0 %	0 %	56459139
546	NC_006512	TTAA	2	8	31796	31803	50 %	50 %	0 %	0 %	56459139
547	NC_006512	GTCC	2	8	31808	31815	0 %	25 %	25 %	50 %	56459139
548	NC_006512	CGGC	2	8	31892	31899	0 %	0 %	50 %	50 %	56459139
549	NC_006512	CGG	2	6	31924	31929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459139
550	NC_006512	A	6	6	32197	32202	100 %	0 %	0 %	0 %	56459140
551	NC_006512	TTC	2	6	32224	32229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459140
552	NC_006512	CCG	2	6	32234	32239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459140
553	NC_006512	GCG	2	6	32258	32263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459140
554	NC_006512	CCGA	2	8	32329	32336	25 %	0 %	25 %	50 %	56459140
555	NC_006512	AGC	2	6	32381	32386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459140
556	NC_006512	GGC	2	6	32416	32421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459140
557	NC_006512	GAA	2	6	32422	32427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459140
558	NC_006512	TAA	2	6	32433	32438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459140
559	NC_006512	ATG	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459140
560	NC_006512	CCT	2	6	32462	32467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56459140
561	NC_006512	AGA	2	6	32472	32477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459140
562	NC_006512	TGC	2	6	32493	32498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459140
563	NC_006512	CAT	2	6	32544	32549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459140
564	NC_006512	CCG	2	6	32571	32576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459140
565	NC_006512	GCT	2	6	32647	32652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459140
566	NC_006512	CGC	2	6	32676	32681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459140
567	NC_006512	GCG	2	6	32714	32719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459140
568	NC_006512	AATGA	2	10	32737	32746	60 %	20 %	20 %	0 %	56459140
569	NC_006512	GA	3	6	33488	33493	50 %	0 %	50 %	0 %	56459141
570	NC_006512	A	6	6	33528	33533	100 %	0 %	0 %	0 %	56459141
571	NC_006512	CAA	2	6	33582	33587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459141
572	NC_006512	CAAAA	2	10	33590	33599	80 %	0 %	0 %	20 %	56459141
573	NC_006512	GTC	2	6	33628	33633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459141
574	NC_006512	TGA	2	6	33649	33654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459141
575	NC_006512	CAG	2	6	33739	33744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
576	NC_006512	AGC	2	6	33784	33789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
577	NC_006512	CGA	2	6	33815	33820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
578	NC_006512	GAC	2	6	33828	33833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
579	NC_006512	GAG	2	6	33834	33839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56459141
580	NC_006512	ATT	2	6	33890	33895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459142
581	NC_006512	TGA	2	6	33991	33996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459142
582	NC_006512	ATT	2	6	34001	34006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459142
583	NC_006512	GCA	2	6	34024	34029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459142
584	NC_006512	ATC	2	6	34080	34085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459142
585	NC_006512	CGATTA	2	12	34099	34110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56459142
586	NC_006512	AAG	2	6	34181	34186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459142
587	NC_006512	AAG	2	6	34193	34198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459142
588	NC_006512	GAC	2	6	34214	34219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459142
589	NC_006512	ATT	2	6	34253	34258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459142
590	NC_006512	CGG	2	6	34293	34298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459142
591	NC_006512	GAG	2	6	34302	34307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56459142
592	NC_006512	T	6	6	34319	34324	0 %	100 %	0 %	0 %	56459143
593	NC_006512	AGA	2	6	34336	34341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459143
594	NC_006512	GC	3	6	34373	34378	0 %	0 %	50 %	50 %	56459143
595	NC_006512	GTC	2	6	34542	34547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459143
596	NC_006512	TGG	2	6	34636	34641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459143
597	NC_006512	TGT	3	9	34762	34770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459143
598	NC_006512	AAC	2	6	34789	34794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459143
599	NC_006512	TAA	2	6	34999	35004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459143
600	NC_006512	GAC	2	6	35048	35053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459143
601	NC_006512	GAA	2	6	35066	35071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459143
602	NC_006512	CGC	2	6	35080	35085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459143
603	NC_006512	ACG	2	6	35089	35094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459143
604	NC_006512	TCAA	2	8	35159	35166	50 %	25 %	0 %	25 %	56459144
605	NC_006512	CTG	2	6	35230	35235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459144
606	NC_006512	GCCAC	2	10	35288	35297	20 %	0 %	20 %	60 %	56459144
607	NC_006512	TTC	2	6	35302	35307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459144
608	NC_006512	GAAC	2	8	35525	35532	50 %	0 %	25 %	25 %	56459144
609	NC_006512	TCA	2	6	35534	35539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459144
610	NC_006512	TGC	2	6	35578	35583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459144
611	NC_006512	GGTT	2	8	35610	35617	0 %	50 %	50 %	0 %	56459144
612	NC_006512	TTC	2	6	35680	35685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459144
613	NC_006512	CCT	2	6	35826	35831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56459144
614	NC_006512	TCAT	2	8	35849	35856	25 %	50 %	0 %	25 %	56459144
615	NC_006512	GCT	2	6	35879	35884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459144
616	NC_006512	ATC	2	6	35932	35937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459144
617	NC_006512	CCG	2	6	35954	35959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459144
618	NC_006512	TCAC	2	8	36005	36012	25 %	25 %	0 %	50 %	56459144
619	NC_006512	AACT	2	8	36067	36074	50 %	25 %	0 %	25 %	56459144
620	NC_006512	TAA	2	6	36103	36108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459144
621	NC_006512	GCA	2	6	36114	36119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459144
622	NC_006512	CGA	2	6	36237	36242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459144
623	NC_006512	T	7	7	36336	36342	0 %	100 %	0 %	0 %	56459144
624	NC_006512	CGGA	2	8	36365	36372	25 %	0 %	50 %	25 %	56459144
625	NC_006512	AAT	2	6	36429	36434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459144
626	NC_006512	CGC	2	6	36516	36521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459144
627	NC_006512	TTTCC	2	10	36675	36684	0 %	60 %	0 %	40 %	56459144
628	NC_006512	GAAA	2	8	36930	36937	75 %	0 %	25 %	0 %	56459145
629	NC_006512	AGT	3	9	37068	37076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459145
630	NC_006512	TGC	2	6	37332	37337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459146
631	NC_006512	TGA	2	6	37349	37354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459146
632	NC_006512	GAA	2	6	37478	37483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459146
633	NC_006512	CA	3	6	37484	37489	50 %	0 %	0 %	50 %	56459146
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638	NC_006512	GGC	2	6	37599	37604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459146
639	NC_006512	TCT	2	6	37615	37620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459146
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652	NC_006512	GGC	2	6	38375	38380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459147
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756	NC_006512	TATT	2	8	45292	45299	25 %	75 %	0 %	0 %	56459153
757	NC_006512	GAA	2	6	45313	45318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459153
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764	NC_006512	GGT	2	6	45642	45647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459153
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