MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 44408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014471	TTC	2	6	1857462	1857467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664355
44002	NC_014471	GAG	2	6	1857476	1857481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664355
44003	NC_014471	GGA	2	6	1857500	1857505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664355
44004	NC_014471	AAG	2	6	1857573	1857578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664355
44005	NC_014471	GGC	2	6	1857588	1857593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44006	NC_014471	GGTA	2	8	1857602	1857609	25 %	25 %	50 %	0 %	305664356
44007	NC_014471	GAA	2	6	1857639	1857644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664356
44008	NC_014471	GGA	2	6	1857691	1857696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664356
44009	NC_014471	AAG	2	6	1857834	1857839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664356
44010	NC_014471	GAG	2	6	1857874	1857879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664356
44011	NC_014471	AAG	2	6	1857992	1857997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664356
44012	NC_014471	AG	3	6	1857996	1858001	50 %	0 %	50 %	0 %	305664356
44013	NC_014471	GCC	2	6	1858012	1858017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	305664356
44014	NC_014471	AAC	2	6	1858146	1858151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305664357
44015	NC_014471	AAGTC	2	10	1858178	1858187	40 %	20 %	20 %	20 %	305664357
44016	NC_014471	TGT	2	6	1858199	1858204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664357
44017	NC_014471	AG	3	6	1858231	1858236	50 %	0 %	50 %	0 %	305664357
44018	NC_014471	TG	3	6	1858308	1858313	0 %	50 %	50 %	0 %	305664357
44019	NC_014471	AGA	2	6	1858324	1858329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664357
44020	NC_014471	AG	3	6	1858415	1858420	50 %	0 %	50 %	0 %	305664357
44021	NC_014471	CTT	2	6	1858482	1858487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664357
44022	NC_014471	TGC	2	6	1858565	1858570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44023	NC_014471	ATA	2	6	1858646	1858651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305664357
44024	NC_014471	TGG	2	6	1858706	1858711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664357
44025	NC_014471	GAC	2	6	1858728	1858733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44026	NC_014471	TCG	2	6	1858781	1858786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44027	NC_014471	AGGA	2	8	1858796	1858803	50 %	0 %	50 %	0 %	305664357
44028	NC_014471	AC	3	6	1858823	1858828	50 %	0 %	0 %	50 %	305664357
44029	NC_014471	CTT	2	6	1858851	1858856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664357
44030	NC_014471	ATT	2	6	1858877	1858882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664357
44031	NC_014471	AGG	2	6	1858934	1858939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664357
44032	NC_014471	AAG	2	6	1858974	1858979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664357
44033	NC_014471	CGC	2	6	1858981	1858986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	305664357
44034	NC_014471	TCC	2	6	1858997	1859002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664357
44035	NC_014471	ACC	2	6	1859003	1859008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305664357
44036	NC_014471	ACG	2	6	1859069	1859074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44037	NC_014471	GATAGG	2	12	1859185	1859196	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	305664357
44038	NC_014471	CGA	2	6	1859226	1859231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44039	NC_014471	GAG	2	6	1859236	1859241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664357
44040	NC_014471	CGA	2	6	1859253	1859258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44041	NC_014471	AGTA	2	8	1859335	1859342	50 %	25 %	25 %	0 %	305664357
44042	NC_014471	CGA	2	6	1859343	1859348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664357
44043	NC_014471	AT	3	6	1859369	1859374	50 %	50 %	0 %	0 %	305664357
44044	NC_014471	CATA	2	8	1859382	1859389	50 %	25 %	0 %	25 %	305664357
44045	NC_014471	TA	3	6	1859401	1859406	50 %	50 %	0 %	0 %	305664357
44046	NC_014471	GT	3	6	1859441	1859446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44047	NC_014471	GAT	2	6	1859474	1859479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44048	NC_014471	AT	3	6	1859506	1859511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44049	NC_014471	TAT	2	6	1859524	1859529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44050	NC_014471	TA	5	10	1859531	1859540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44051	NC_014471	AT	3	6	1859547	1859552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44052	NC_014471	AT	3	6	1859647	1859652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44053	NC_014471	AG	3	6	1859658	1859663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44054	NC_014471	TG	3	6	1859678	1859683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44055	NC_014471	T	7	7	1859711	1859717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44056	NC_014471	GA	3	6	1859718	1859723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_014471	AGA	2	6	1859744	1859749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664358
44058	NC_014471	GAA	2	6	1859806	1859811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664358
44059	NC_014471	CAC	2	6	1859855	1859860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305664358
44060	NC_014471	GTA	2	6	1859972	1859977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664358
44061	NC_014471	GAC	2	6	1860155	1860160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664358
44062	NC_014471	CAC	2	6	1860173	1860178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305664358
44063	NC_014471	TCT	2	6	1860196	1860201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664358
44064	NC_014471	AAG	2	6	1860253	1860258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664358
44065	NC_014471	GAT	2	6	1860288	1860293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44066	NC_014471	GAAG	2	8	1860299	1860306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44067	NC_014471	AGAA	2	8	1860324	1860331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_014471	CGC	2	6	1860515	1860520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	305664359
44069	NC_014471	GCG	2	6	1860526	1860531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	305664359
44070	NC_014471	TGA	2	6	1860539	1860544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664359
44071	NC_014471	GAA	2	6	1860567	1860572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664359
44072	NC_014471	TAT	2	6	1860695	1860700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664359
44073	NC_014471	GAA	2	6	1860776	1860781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664359
44074	NC_014471	TGT	2	6	1860791	1860796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664359
44075	NC_014471	GAC	2	6	1860842	1860847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664359
44076	NC_014471	GAT	2	6	1860978	1860983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664359
44077	NC_014471	GA	3	6	1861022	1861027	50 %	0 %	50 %	0 %	305664359
44078	NC_014471	GA	3	6	1861081	1861086	50 %	0 %	50 %	0 %	305664359
44079	NC_014471	GTAT	2	8	1861133	1861140	25 %	50 %	25 %	0 %	305664359
44080	NC_014471	TAT	2	6	1861172	1861177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664359
44081	NC_014471	TCT	2	6	1861279	1861284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44082	NC_014471	GTT	2	6	1861298	1861303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44083	NC_014471	AT	3	6	1861333	1861338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44084	NC_014471	GTTCTA	2	12	1861391	1861402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44085	NC_014471	TA	3	6	1861407	1861412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44086	NC_014471	AT	3	6	1861424	1861429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44087	NC_014471	CACGCC	2	12	1861437	1861448	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44088	NC_014471	GCC	2	6	1861496	1861501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44089	NC_014471	TG	3	6	1861513	1861518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44090	NC_014471	TGTTTT	2	12	1861526	1861537	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44091	NC_014471	TA	3	6	1861554	1861559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44092	NC_014471	TAT	2	6	1861569	1861574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44093	NC_014471	GAA	2	6	1861595	1861600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664360
44094	NC_014471	AAG	2	6	1861602	1861607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664360
44095	NC_014471	TGG	2	6	1861636	1861641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664360
44096	NC_014471	AGTTT	2	10	1861674	1861683	20 %	60 %	20 %	0 %	305664360
44097	NC_014471	TA	3	6	1861690	1861695	50 %	50 %	0 %	0 %	305664360
44098	NC_014471	TGG	2	6	1861854	1861859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664360
44099	NC_014471	GAAG	2	8	1861889	1861896	50 %	0 %	50 %	0 %	305664360
44100	NC_014471	GAA	2	6	1861916	1861921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664360
44101	NC_014471	AGAT	2	8	1861988	1861995	50 %	25 %	25 %	0 %	305664361
44102	NC_014471	GAA	2	6	1862022	1862027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664361
44103	NC_014471	AGTAT	2	10	1862039	1862048	40 %	40 %	20 %	0 %	305664361
44104	NC_014471	TGT	2	6	1862060	1862065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664361
44105	NC_014471	TATC	2	8	1862070	1862077	25 %	50 %	0 %	25 %	305664361
44106	NC_014471	TA	3	6	1862114	1862119	50 %	50 %	0 %	0 %	305664361
44107	NC_014471	AAC	2	6	1862131	1862136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305664361
44108	NC_014471	TGT	2	6	1862139	1862144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664361
44109	NC_014471	AGC	2	6	1862165	1862170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664361
44110	NC_014471	AGA	2	6	1862200	1862205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664361
44111	NC_014471	TTG	2	6	1862228	1862233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664361
44112	NC_014471	GCT	2	6	1862293	1862298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305664361
44113	NC_014471	AGA	2	6	1862321	1862326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664361
44114	NC_014471	CAAG	2	8	1862361	1862368	50 %	0 %	25 %	25 %	305664361
44115	NC_014471	AGC	2	6	1862376	1862381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664361
44116	NC_014471	CTA	2	6	1862440	1862445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664361
44117	NC_014471	TAC	2	6	1862497	1862502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664361
44118	NC_014471	TGC	2	6	1862517	1862522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305664361
44119	NC_014471	GAT	2	6	1862728	1862733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664361
44120	NC_014471	ATA	2	6	1862762	1862767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305664361
44121	NC_014471	TGT	2	6	1862874	1862879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664361
44122	NC_014471	GGCA	2	8	1862893	1862900	25 %	0 %	50 %	25 %	305664361
44123	NC_014471	GTT	2	6	1862992	1862997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44124	NC_014471	A	6	6	1863044	1863049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44125	NC_014471	TA	4	8	1863072	1863079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44126	NC_014471	GTGC	2	8	1863095	1863102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44127	NC_014471	CGA	2	6	1863122	1863127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44128	NC_014471	GT	3	6	1863196	1863201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44129	NC_014471	GAC	2	6	1863216	1863221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44130	NC_014471	TGA	2	6	1863323	1863328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44131	NC_014471	CTTT	2	8	1863358	1863365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44132	NC_014471	A	6	6	1863458	1863463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44133	NC_014471	TATAT	2	10	1863475	1863484	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44134	NC_014471	TCA	2	6	1863588	1863593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44135	NC_014471	TGGT	2	8	1863639	1863646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44136	NC_014471	TCA	2	6	1863750	1863755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44137	NC_014471	CTC	2	6	1863859	1863864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44138	NC_014471	GAA	2	6	1863870	1863875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44139	NC_014471	ATTCT	2	10	1863913	1863922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44140	NC_014471	TAG	2	6	1863985	1863990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44141	NC_014471	TA	3	6	1863992	1863997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44142	NC_014471	TA	3	6	1864034	1864039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44143	NC_014471	ACT	2	6	1864097	1864102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44146	NC_014471	GAATG	2	10	1864304	1864313	40 %	20 %	40 %	0 %	305664362
44147	NC_014471	AT	4	8	1864339	1864346	50 %	50 %	0 %	0 %	305664362
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44150	NC_014471	TGCC	2	8	1864426	1864433	0 %	25 %	25 %	50 %	305664363
44151	NC_014471	GA	3	6	1864502	1864507	50 %	0 %	50 %	0 %	305664363
44152	NC_014471	GGTAA	2	10	1864512	1864521	40 %	20 %	40 %	0 %	305664363
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44162	NC_014471	GGA	2	6	1864975	1864980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664364
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44170	NC_014471	GTTT	2	8	1865390	1865397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44200	NC_014471	TC	3	6	1866923	1866928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44201	NC_014471	GAT	2	6	1867027	1867032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44229	NC_014471	AT	3	6	1868070	1868075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44230	NC_014471	CTA	2	6	1868099	1868104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44231	NC_014471	TATAT	2	10	1868117	1868126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44232	NC_014471	AG	3	6	1868127	1868132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44233	NC_014471	TCTA	2	8	1868144	1868151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44234	NC_014471	GGA	2	6	1868235	1868240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664367
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44236	NC_014471	TA	3	6	1868323	1868328	50 %	50 %	0 %	0 %	305664367
44237	NC_014471	GGA	2	6	1868415	1868420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664367
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44239	NC_014471	GAG	2	6	1868442	1868447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664367
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44242	NC_014471	GAT	2	6	1868564	1868569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664367
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44349	NC_014471	ATT	2	6	1873360	1873365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44353	NC_014471	GAA	2	6	1873488	1873493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44357	NC_014471	GAT	2	6	1873616	1873621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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