MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 44408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_014471	GCAATA	2	12	1625800	1625811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	305664136
38502	NC_014471	TAA	2	6	1625825	1625830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305664136
38503	NC_014471	TA	3	6	1625836	1625841	50 %	50 %	0 %	0 %	305664136
38504	NC_014471	CAT	2	6	1625855	1625860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664136
38505	NC_014471	TAC	2	6	1625880	1625885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664136
38506	NC_014471	CTA	2	6	1625927	1625932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664136
38507	NC_014471	A	6	6	1625942	1625947	100 %	0 %	0 %	0 %	305664136
38508	NC_014471	GGT	2	6	1625983	1625988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664136
38509	NC_014471	AAG	2	6	1626068	1626073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664136
38510	NC_014471	ATG	2	6	1626092	1626097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664136
38511	NC_014471	TTG	2	6	1626146	1626151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664136
38512	NC_014471	CAG	2	6	1626158	1626163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664136
38513	NC_014471	CAG	2	6	1626172	1626177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664136
38514	NC_014471	GTT	2	6	1626220	1626225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664136
38515	NC_014471	AGT	2	6	1626241	1626246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664136
38516	NC_014471	CCAA	2	8	1626278	1626285	50 %	0 %	0 %	50 %	305664136
38517	NC_014471	TGT	2	6	1626420	1626425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664136
38518	NC_014471	GGAGA	2	10	1626434	1626443	40 %	0 %	60 %	0 %	305664136
38519	NC_014471	AGAT	2	8	1626609	1626616	50 %	25 %	25 %	0 %	305664136
38520	NC_014471	GAA	2	6	1626655	1626660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664136
38521	NC_014471	ACA	2	6	1626742	1626747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305664136
38522	NC_014471	ATG	2	6	1626905	1626910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664136
38523	NC_014471	ATG	2	6	1626953	1626958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664136
38524	NC_014471	AGC	2	6	1626960	1626965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664136
38525	NC_014471	CAG	2	6	1627130	1627135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664136
38526	NC_014471	T	6	6	1627176	1627181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38527	NC_014471	ATG	3	9	1627245	1627253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664137
38528	NC_014471	A	6	6	1627267	1627272	100 %	0 %	0 %	0 %	305664137
38529	NC_014471	TGG	2	6	1627288	1627293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664137
38530	NC_014471	GAA	2	6	1627327	1627332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664137
38531	NC_014471	TG	3	6	1627390	1627395	0 %	50 %	50 %	0 %	305664137
38532	NC_014471	TCC	2	6	1627459	1627464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664137
38533	NC_014471	TA	3	6	1627473	1627478	50 %	50 %	0 %	0 %	305664137
38534	NC_014471	AGG	2	6	1627592	1627597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664137
38535	NC_014471	GAAT	2	8	1627612	1627619	50 %	25 %	25 %	0 %	305664137
38536	NC_014471	TTG	2	6	1627656	1627661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664137
38537	NC_014471	GATA	2	8	1627667	1627674	50 %	25 %	25 %	0 %	305664137
38538	NC_014471	GCA	2	6	1627742	1627747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305664137
38539	NC_014471	TGG	2	6	1627780	1627785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664137
38540	NC_014471	CCT	2	6	1627794	1627799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664137
38541	NC_014471	AGG	2	6	1627826	1627831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305664137
38542	NC_014471	TTTCT	2	10	1627851	1627860	0 %	80 %	0 %	20 %	305664137
38543	NC_014471	ATAGA	2	10	1627872	1627881	60 %	20 %	20 %	0 %	305664137
38544	NC_014471	TATGTA	2	12	1627904	1627915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	305664137
38545	NC_014471	GAA	2	6	1627963	1627968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664137
38546	NC_014471	TGA	2	6	1628082	1628087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664138
38547	NC_014471	CTC	2	6	1628137	1628142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664138
38548	NC_014471	AT	4	8	1628165	1628172	50 %	50 %	0 %	0 %	305664138
38549	NC_014471	AT	3	6	1628220	1628225	50 %	50 %	0 %	0 %	305664138
38550	NC_014471	CAAA	2	8	1628257	1628264	75 %	0 %	0 %	25 %	305664138
38551	NC_014471	TCT	2	6	1628270	1628275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664138
38552	NC_014471	AGA	2	6	1628328	1628333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664138
38553	NC_014471	GAA	2	6	1628350	1628355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664138
38554	NC_014471	TTTC	2	8	1628364	1628371	0 %	75 %	0 %	25 %	305664138
38555	NC_014471	AGA	2	6	1628425	1628430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664138
38556	NC_014471	TTG	2	6	1628473	1628478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664138
38557	NC_014471	AAC	2	6	1628490	1628495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305664138
38558	NC_014471	AAG	2	6	1628592	1628597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305664138
38559	NC_014471	TTA	2	6	1628671	1628676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664138
38560	NC_014471	TA	3	6	1628747	1628752	50 %	50 %	0 %	0 %	305664139
38561	NC_014471	ATC	2	6	1628767	1628772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664139
38562	NC_014471	TCA	2	6	1628773	1628778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664139
38563	NC_014471	TCTCT	2	10	1628786	1628795	0 %	60 %	0 %	40 %	305664139
38564	NC_014471	TATAT	2	10	1628860	1628869	40 %	60 %	0 %	0 %	305664139
38565	NC_014471	TTA	2	6	1629020	1629025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664139
38566	NC_014471	CTA	2	6	1629041	1629046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664139
38567	NC_014471	TAT	2	6	1629084	1629089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664139
38568	NC_014471	CT	3	6	1629091	1629096	0 %	50 %	0 %	50 %	305664139
38569	NC_014471	CTC	2	6	1629123	1629128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664139
38570	NC_014471	TATC	2	8	1629184	1629191	25 %	50 %	0 %	25 %	305664139
38571	NC_014471	TCC	2	6	1629261	1629266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664139
38572	NC_014471	AC	3	6	1629276	1629281	50 %	0 %	0 %	50 %	305664139
38573	NC_014471	CAA	3	9	1629311	1629319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305664139
38574	NC_014471	TAT	2	6	1629323	1629328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664139
38575	NC_014471	CTA	2	6	1629394	1629399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664139
38576	NC_014471	CTC	2	6	1629405	1629410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664139
38577	NC_014471	AG	3	6	1629469	1629474	50 %	0 %	50 %	0 %	305664139
38578	NC_014471	CTA	2	6	1629491	1629496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664139
38579	NC_014471	CTC	2	6	1629518	1629523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664139
38580	NC_014471	GATATA	2	12	1629595	1629606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	305664139
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38582	NC_014471	TTC	2	6	1629685	1629690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664139
38583	NC_014471	AT	3	6	1629740	1629745	50 %	50 %	0 %	0 %	305664139
38584	NC_014471	CTA	2	6	1629761	1629766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664140
38585	NC_014471	TGG	2	6	1629835	1629840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305664140
38586	NC_014471	TGT	2	6	1629856	1629861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305664140
38587	NC_014471	TAA	2	6	1629903	1629908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305664140
38588	NC_014471	CTC	2	6	1629954	1629959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664140
38589	NC_014471	TC	3	6	1629963	1629968	0 %	50 %	0 %	50 %	305664140
38590	NC_014471	TTA	2	6	1630056	1630061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305664140
38591	NC_014471	CCA	2	6	1630106	1630111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305664140
38592	NC_014471	TCC	2	6	1630186	1630191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664140
38593	NC_014471	CTGT	2	8	1630275	1630282	0 %	50 %	25 %	25 %	305664140
38594	NC_014471	TCC	2	6	1630323	1630328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305664140
38595	NC_014471	TCCC	2	8	1630365	1630372	0 %	25 %	0 %	75 %	305664140
38596	NC_014471	CTG	3	9	1630398	1630406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305664140
38597	NC_014471	TCA	2	6	1630412	1630417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664140
38598	NC_014471	CAT	2	6	1630456	1630461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664140
38599	NC_014471	GTA	2	6	1630470	1630475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305664140
38600	NC_014471	TTC	2	6	1630533	1630538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664140
38601	NC_014471	ATGAA	2	10	1630540	1630549	60 %	20 %	20 %	0 %	305664140
38602	NC_014471	AT	3	6	1630558	1630563	50 %	50 %	0 %	0 %	305664140
38603	NC_014471	TCT	2	6	1630566	1630571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664140
38604	NC_014471	ATCT	2	8	1630653	1630660	25 %	50 %	0 %	25 %	305664140
38605	NC_014471	TAC	2	6	1630663	1630668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664140
38606	NC_014471	CT	3	6	1630693	1630698	0 %	50 %	0 %	50 %	305664140
38607	NC_014471	TCA	2	6	1630728	1630733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305664140
38608	NC_014471	TG	3	6	1630807	1630812	0 %	50 %	50 %	0 %	305664140
38609	NC_014471	TTC	2	6	1630827	1630832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305664140
38610	NC_014471	CATA	2	8	1630844	1630851	50 %	25 %	0 %	25 %	305664140
38611	NC_014471	CT	3	6	1630856	1630861	0 %	50 %	0 %	50 %	305664140
38612	NC_014471	CTCTAT	2	12	1630867	1630878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	305664140
38613	NC_014471	CAC	2	6	1631069	1631074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305664141
38614	NC_014471	AAT	2	6	1631076	1631081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305664141
38615	NC_014471	CTAT	2	8	1631116	1631123	25 %	50 %	0 %	25 %	305664141
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38617	NC_014471	TA	4	8	1631183	1631190	50 %	50 %	0 %	0 %	305664141
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