MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 44408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014471	TCT	2	6	20016	20021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662468
502	NC_014471	CTT	2	6	20040	20045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662468
503	NC_014471	TCA	2	6	20049	20054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662468
504	NC_014471	AAG	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662468
505	NC_014471	CT	3	6	20131	20136	0 %	50 %	0 %	50 %	305662468
506	NC_014471	TCC	2	6	20198	20203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662468
507	NC_014471	CTA	2	6	20326	20331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662468
508	NC_014471	CCT	2	6	20353	20358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662468
509	NC_014471	TA	3	6	20372	20377	50 %	50 %	0 %	0 %	305662468
510	NC_014471	AT	3	6	20416	20421	50 %	50 %	0 %	0 %	305662468
511	NC_014471	ATG	2	6	20569	20574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662468
512	NC_014471	TA	3	6	20585	20590	50 %	50 %	0 %	0 %	305662468
513	NC_014471	AT	3	6	20608	20613	50 %	50 %	0 %	0 %	305662468
514	NC_014471	TTG	2	6	20656	20661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662468
515	NC_014471	ATC	2	6	20687	20692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662468
516	NC_014471	TAA	2	6	20717	20722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662468
517	NC_014471	TGTA	2	8	20777	20784	25 %	50 %	25 %	0 %	305662468
518	NC_014471	CTCATC	2	12	20798	20809	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	305662468
519	NC_014471	CAA	2	6	20843	20848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662468
520	NC_014471	TCT	2	6	20849	20854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662468
521	NC_014471	TGA	2	6	20927	20932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662468
522	NC_014471	TCT	2	6	20934	20939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662468
523	NC_014471	GTA	2	6	20949	20954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662468
524	NC_014471	TAGA	2	8	20956	20963	50 %	25 %	25 %	0 %	305662468
525	NC_014471	AC	3	6	21001	21006	50 %	0 %	0 %	50 %	305662468
526	NC_014471	CT	3	6	21078	21083	0 %	50 %	0 %	50 %	305662468
527	NC_014471	TCA	2	6	21151	21156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662468
528	NC_014471	AT	3	6	21189	21194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014471	AACTTC	2	12	21223	21234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_014471	ATG	2	6	21238	21243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014471	AAT	2	6	21249	21254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014471	ATA	2	6	21285	21290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014471	TTA	2	6	21311	21316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662469
534	NC_014471	AAG	2	6	21354	21359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662469
535	NC_014471	AGA	2	6	21418	21423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662469
536	NC_014471	AGT	2	6	21471	21476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662469
537	NC_014471	CCA	2	6	21478	21483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662469
538	NC_014471	CAATA	2	10	21521	21530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_014471	ATG	2	6	21536	21541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014471	ATA	2	6	21568	21573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014471	AAT	2	6	21596	21601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014471	TTC	2	6	21670	21675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014471	TA	5	10	21711	21720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014471	AAG	2	6	21810	21815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014471	TC	3	6	21887	21892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_014471	TCA	2	6	21992	21997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662470
547	NC_014471	CTT	2	6	22009	22014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662470
548	NC_014471	T	6	6	22021	22026	0 %	100 %	0 %	0 %	305662470
549	NC_014471	GAT	2	6	22050	22055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
550	NC_014471	TAAA	2	8	22063	22070	75 %	25 %	0 %	0 %	305662470
551	NC_014471	AAG	2	6	22103	22108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662470
552	NC_014471	GCA	2	6	22134	22139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662470
553	NC_014471	CAGAGA	2	12	22149	22160	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	305662470
554	NC_014471	TA	3	6	22170	22175	50 %	50 %	0 %	0 %	305662470
555	NC_014471	TTG	2	6	22198	22203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662470
556	NC_014471	TAGCTA	2	12	22246	22257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	305662470
557	NC_014471	TTG	2	6	22318	22323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662470
558	NC_014471	TAT	2	6	22361	22366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662470
559	NC_014471	TGA	2	6	22388	22393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
560	NC_014471	TGC	2	6	22436	22441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662470
561	NC_014471	TAGA	2	8	22483	22490	50 %	25 %	25 %	0 %	305662470
562	NC_014471	AT	3	6	22636	22641	50 %	50 %	0 %	0 %	305662470
563	NC_014471	GAG	2	6	22721	22726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662470
564	NC_014471	TTG	2	6	22729	22734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662470
565	NC_014471	ATT	2	6	22736	22741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662470
566	NC_014471	GAT	2	6	22742	22747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
567	NC_014471	TAG	2	6	22775	22780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
568	NC_014471	AG	3	6	22779	22784	50 %	0 %	50 %	0 %	305662470
569	NC_014471	TTA	2	6	22846	22851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662470
570	NC_014471	GTG	2	6	22867	22872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662470
571	NC_014471	TGA	2	6	23006	23011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
572	NC_014471	ATT	2	6	23094	23099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662470
573	NC_014471	TGA	2	6	23102	23107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
574	NC_014471	GAA	2	6	23111	23116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662470
575	NC_014471	GGT	2	6	23135	23140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662470
576	NC_014471	TGC	2	6	23150	23155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662470
577	NC_014471	TAT	2	6	23162	23167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662470
578	NC_014471	GAT	2	6	23199	23204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
579	NC_014471	GTA	2	6	23206	23211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
580	NC_014471	AGC	2	6	23237	23242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662470
581	NC_014471	TCC	2	6	23267	23272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662470
582	NC_014471	GAG	2	6	23286	23291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662470
583	NC_014471	AAG	2	6	23307	23312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662470
584	NC_014471	TCC	2	6	23318	23323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662470
585	NC_014471	GAA	2	6	23331	23336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662470
586	NC_014471	TGT	2	6	23426	23431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662470
587	NC_014471	TA	3	6	23541	23546	50 %	50 %	0 %	0 %	305662470
588	NC_014471	ATTG	2	8	23555	23562	25 %	50 %	25 %	0 %	305662470
589	NC_014471	AGG	2	6	23664	23669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662470
590	NC_014471	TGA	2	6	23678	23683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
591	NC_014471	TTG	2	6	23707	23712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662470
592	NC_014471	TGA	2	6	23723	23728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662470
593	NC_014471	AG	3	6	23737	23742	50 %	0 %	50 %	0 %	305662470
594	NC_014471	GGTAA	2	10	23769	23778	40 %	20 %	40 %	0 %	305662470
595	NC_014471	AGG	2	6	23830	23835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662470
596	NC_014471	AGA	2	6	23927	23932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662471
597	NC_014471	AGA	2	6	23948	23953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662471
598	NC_014471	TTG	2	6	23955	23960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662471
599	NC_014471	TAGA	2	8	23982	23989	50 %	25 %	25 %	0 %	305662471
600	NC_014471	ATT	2	6	23993	23998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662471
601	NC_014471	GAA	2	6	24022	24027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662471
602	NC_014471	AGT	2	6	24137	24142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662471
603	NC_014471	AAT	2	6	24148	24153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662471
604	NC_014471	ATT	2	6	24296	24301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662471
605	NC_014471	TAT	3	9	24319	24327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662471
606	NC_014471	GTG	2	6	24339	24344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662471
607	NC_014471	CAT	2	6	24351	24356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662471
608	NC_014471	AT	3	6	24483	24488	50 %	50 %	0 %	0 %	305662471
609	NC_014471	AT	3	6	24531	24536	50 %	50 %	0 %	0 %	305662472
610	NC_014471	T	6	6	24617	24622	0 %	100 %	0 %	0 %	305662472
611	NC_014471	TACGGG	2	12	24628	24639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	305662472
612	NC_014471	GTA	2	6	24677	24682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662472
613	NC_014471	TAG	2	6	24694	24699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662472
614	NC_014471	TGT	2	6	24727	24732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662472
615	NC_014471	GAG	2	6	24740	24745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662472
616	NC_014471	AGG	2	6	24811	24816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662472
617	NC_014471	AGTGG	2	10	24820	24829	20 %	20 %	60 %	0 %	305662472
618	NC_014471	TAT	2	6	24955	24960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662472
619	NC_014471	GTAG	2	8	24977	24984	25 %	25 %	50 %	0 %	305662472
620	NC_014471	TAG	2	6	24988	24993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662472
621	NC_014471	TAG	2	6	24999	25004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662472
622	NC_014471	AGG	2	6	25032	25037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662472
623	NC_014471	AG	3	6	25064	25069	50 %	0 %	50 %	0 %	305662472
624	NC_014471	GAA	2	6	25082	25087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662472
625	NC_014471	GTT	2	6	25097	25102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662472
626	NC_014471	GA	3	6	25126	25131	50 %	0 %	50 %	0 %	305662472
627	NC_014471	TCA	2	6	25295	25300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662472
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629	NC_014471	TGC	2	6	25381	25386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662472
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