MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae KR494

Total Repeats: 5806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022356	GCT	2	6	183861	183866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022356	CTT	2	6	183886	183891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022356	CTT	2	6	183970	183975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_022356	C	6	6	184005	184010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
505	NC_022356	CTG	2	6	184029	184034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_022356	CCA	2	6	184128	184133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_022356	TC	3	6	184193	184198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_022356	CGT	2	6	184228	184233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022356	TCC	2	6	184305	184310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_022356	GCC	2	6	184342	184347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_022356	TTCAA	2	10	184377	184386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
512	NC_022356	ACT	2	6	184404	184409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_022356	TAAA	2	8	184416	184423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022356	ACT	2	6	184426	184431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_022356	A	6	6	184433	184438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022356	A	6	6	184484	184489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022356	TCAA	2	8	184505	184512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_022356	CA	3	6	184521	184526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_022356	AT	3	6	184536	184541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022356	A	6	6	184553	184558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022356	ACG	2	6	184561	184566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_022356	CGT	2	6	184598	184603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022356	TG	3	6	184604	184609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022356	A	7	7	184665	184671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022356	AAT	2	6	184725	184730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022356	TGA	2	6	186868	186873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022356	A	6	6	186933	186938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022356	ATT	2	6	187206	187211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022356	AT	3	6	187242	187247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022356	GTT	2	6	187287	187292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022356	CATTA	2	10	187300	187309	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_022356	TA	3	6	188724	188729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022356	AAAG	2	8	188730	188737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022356	ATG	2	6	188745	188750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022356	ATA	2	6	191195	191200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022356	ATC	2	6	191289	191294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_022356	A	6	6	191377	191382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022356	GAAT	2	8	192085	192092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022356	GAT	2	6	192157	192162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022356	TGC	2	6	192166	192171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_022356	A	7	7	193061	193067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022356	GAG	2	6	193071	193076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022356	AT	3	6	193112	193117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022356	T	6	6	193181	193186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022356	AAAG	2	8	193191	193198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022356	ATT	2	6	193201	193206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022356	ATA	2	6	193210	193215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022356	A	7	7	193215	193221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022356	CGG	2	6	193230	193235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022356	TCT	2	6	193249	193254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_022356	TTTA	2	8	193767	193774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022356	CCA	2	6	193821	193826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_022356	ATG	2	6	193843	193848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022356	A	6	6	193853	193858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022356	ACG	2	6	194117	194122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022356	TTG	2	6	194149	194154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022356	ATTA	2	8	194164	194171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022356	CAAA	2	8	194234	194241	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_022356	GCT	2	6	194270	194275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_022356	TTA	2	6	194302	194307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_022356	ATT	2	6	194323	194328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022356	ATTAAT	2	12	194364	194375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022356	CTA	2	6	194473	194478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022356	CACC	2	8	194498	194505	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
565	NC_022356	ACTT	2	8	194530	194537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_022356	AAT	2	6	194568	194573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022356	TAT	2	6	194582	194587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022356	AGT	2	6	194593	194598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022356	TTA	2	6	194635	194640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022356	TA	3	6	194659	194664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022356	TGA	2	6	194665	194670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022356	A	7	7	194675	194681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022356	CCA	2	6	196160	196165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_022356	T	7	7	196224	196230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022356	A	6	6	196264	196269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022356	AT	4	8	196278	196285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022356	AAT	2	6	196542	196547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022356	TAAAA	2	10	196627	196636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022356	GAAAA	2	10	196639	196648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022356	A	7	7	196645	196651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022356	TAA	2	6	198633	198638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022356	TTA	2	6	198650	198655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022356	ATA	2	6	199532	199537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022356	TAAA	2	8	200445	200452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022356	T	6	6	200469	200474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022356	CTA	2	6	200480	200485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022356	CAA	2	6	200502	200507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_022356	TTA	2	6	202030	202035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022356	TAA	2	6	202083	202088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022356	TATT	2	8	203643	203650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022356	AAG	2	6	203660	203665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022356	CTT	2	6	203692	203697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_022356	TAT	2	6	204763	204768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022356	ATT	2	6	206303	206308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022356	AAT	2	6	206336	206341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022356	A	7	7	206356	206362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022356	AGA	2	6	207626	207631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022356	AAAT	2	8	207644	207651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022356	A	7	7	209667	209673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022356	T	7	7	209716	209722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022356	T	8	8	209771	209778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022356	TAA	2	6	209783	209788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022356	TAA	2	6	209814	209819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022356	TCC	2	6	210757	210762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_022356	T	6	6	210779	210784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022356	ATA	2	6	210798	210803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022356	AAGAA	2	10	210811	210820	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022356	TAAA	2	8	210823	210830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022356	ATT	2	6	210848	210853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022356	AAT	2	6	210859	210864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022356	CTC	2	6	210879	210884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_022356	A	6	6	210888	210893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022356	TTA	2	6	211945	211950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022356	TTA	2	6	212666	212671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022356	A	6	6	213407	213412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022356	AAT	2	6	213433	213438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022356	GAA	2	6	213448	213453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022356	TAAA	2	8	215941	215948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022356	A	6	6	215968	215973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022356	GAAAG	2	10	215999	216008	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022356	A	7	7	216013	216019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022356	AAT	2	6	216025	216030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022356	CTT	2	6	218367	218372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022356	A	7	7	218379	218385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022356	A	6	6	218431	218436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022356	CTTT	2	8	218437	218444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_022356	AGA	2	6	218935	218940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022356	AAG	2	6	220623	220628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022356	AGC	2	6	220672	220677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022356	TGT	2	6	220685	220690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022356	TA	3	6	220737	220742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022356	TTACA	2	10	220825	220834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
633	NC_022356	A	8	8	221080	221087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022356	ATAG	2	8	221095	221102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022356	GTA	2	6	221125	221130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022356	TCAT	2	8	221133	221140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_022356	TAT	2	6	221926	221931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022356	AAT	2	6	223677	223682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022356	AT	3	6	223698	223703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022356	A	6	6	223709	223714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_022356	CTTTT	2	10	223735	223744	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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782	NC_022356	TCC	2	6	239962	239967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_022356	CCCT	2	8	240007	240014	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
784	NC_022356	GCT	2	6	240152	240157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_022356	CTT	2	6	240177	240182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_022356	CTT	2	6	240261	240266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
787	NC_022356	C	6	6	240296	240301	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
788	NC_022356	CTG	2	6	240320	240325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_022356	CCA	2	6	240419	240424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
790	NC_022356	TC	3	6	240484	240489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
791	NC_022356	CGT	2	6	240519	240524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
792	NC_022356	TCC	2	6	240596	240601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
793	NC_022356	GCC	2	6	240633	240638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
794	NC_022356	TTCAA	2	10	240668	240677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
795	NC_022356	TAAA	2	8	240707	240714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
796	NC_022356	ACT	2	6	240716	240721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
797	NC_022356	A	6	6	240723	240728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
798	NC_022356	A	6	6	240774	240779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
799	NC_022356	TCAA	2	8	240795	240802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
800	NC_022356	CA	3	6	240811	240816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
801	NC_022356	AT	3	6	240826	240831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
802	NC_022356	A	6	6	240843	240848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
803	NC_022356	ACG	2	6	240851	240856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
804	NC_022356	CGT	2	6	240888	240893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
805	NC_022356	TG	3	6	240894	240899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
806	NC_022356	ATTT	2	8	240949	240956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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813	NC_022356	TA	4	8	241778	241785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
814	NC_022356	T	7	7	241805	241811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
815	NC_022356	ATT	2	6	241842	241847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
816	NC_022356	AATTTT	2	12	241855	241866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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818	NC_022356	T	6	6	241907	241912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
819	NC_022356	A	6	6	241963	241968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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821	NC_022356	TCT	2	6	243171	243176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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823	NC_022356	TATCA	2	10	244825	244834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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826	NC_022356	AAT	2	6	244937	244942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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829	NC_022356	GAAT	2	8	245025	245032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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832	NC_022356	AAC	2	6	245143	245148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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844	NC_022356	T	6	6	252842	252847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
845	NC_022356	TCG	2	6	253250	253255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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854	NC_022356	T	7	7	257210	257216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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862	NC_022356	AG	3	6	257426	257431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
863	NC_022356	AAC	2	6	257432	257437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
864	NC_022356	AG	3	6	257445	257450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
865	NC_022356	GCGAT	2	10	257503	257512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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874	NC_022356	TA	3	6	257760	257765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
875	NC_022356	AAT	2	6	257972	257977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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880	NC_022356	AT	3	6	258123	258128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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902	NC_022356	T	7	7	260919	260925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
903	NC_022356	T	6	6	260961	260966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
904	NC_022356	AATA	2	8	260973	260980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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906	NC_022356	A	6	6	262891	262896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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919	NC_022356	TAAA	2	8	264144	264151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
920	NC_022356	CTT	2	6	266312	266317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
921	NC_022356	A	6	6	267554	267559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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