MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 8819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021921	GTC	2	6	298369	298374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021921	TTC	2	6	302295	302300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021921	GTA	2	6	302301	302306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021921	TCG	2	6	302338	302343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021921	CG	4	8	302398	302405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_021921	ACA	2	6	302414	302419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021921	GTC	2	6	303814	303819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021921	AATG	2	8	303872	303879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021921	TAT	2	6	303901	303906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021921	CGT	2	6	303916	303921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021921	CG	3	6	307417	307422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_021921	GTA	2	6	307464	307469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021921	AGGG	2	8	310856	310863	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021921	GAA	2	6	310868	310873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021921	AGC	2	6	310901	310906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021921	AGGG	2	8	310919	310926	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021921	GAA	2	6	310931	310936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021921	AGC	2	6	310964	310969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021921	AGGG	2	8	310982	310989	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021921	GAA	2	6	310994	310999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021921	AGC	2	6	311027	311032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021921	AG	3	6	311046	311051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021921	AG	3	6	311068	311073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021921	CG	3	6	311187	311192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_021921	AGGT	2	8	312735	312742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021921	GGCA	2	8	315955	315962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_021921	TCT	2	6	315984	315989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021921	GCCC	2	8	316054	316061	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_021921	CCGAT	2	10	317748	317757	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1030	NC_021921	GAG	2	6	319221	319226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021921	GAG	2	6	319261	319266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021921	GAGT	2	8	319295	319302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021921	CGT	2	6	319312	319317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021921	CGG	2	6	319319	319324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021921	G	7	7	319323	319329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021921	TCG	2	6	320569	320574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021921	CCT	2	6	320588	320593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_021921	CGTCAC	2	12	321311	321322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_021921	T	12	12	321423	321434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021921	ATG	2	6	321436	321441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021921	TCGA	2	8	321793	321800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_021921	ACC	2	6	322490	322495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_021921	AGTC	2	8	322840	322847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_021921	CT	3	6	324565	324570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_021921	GGT	2	6	325173	325178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021921	GTC	2	6	325210	325215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021921	TTC	2	6	325705	325710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021921	GTT	2	6	326805	326810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021921	TGT	2	6	326847	326852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021921	CGAA	2	8	326919	326926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_021921	CGC	2	6	326932	326937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_021921	CCG	2	6	326982	326987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_021921	CG	3	6	326990	326995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_021921	TCGCGC	2	12	327030	327041	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_021921	GCCC	2	8	327064	327071	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1056	NC_021921	GGCT	2	8	328024	328031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_021921	GGGC	2	8	328064	328071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_021921	CCA	2	6	328077	328082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_021921	GTC	2	6	328101	328106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021921	GAC	2	6	328111	328116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021921	ACG	2	6	328560	328565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021921	CGC	2	6	331788	331793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_021921	CG	3	6	331810	331815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_021921	TA	3	6	332653	332658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021921	CAC	2	6	332698	332703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_021921	AC	3	6	332750	332755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_021921	GT	3	6	332823	332828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021921	GTG	2	6	332836	332841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021921	CTT	2	6	332924	332929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021921	AGCCA	2	10	332965	332974	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1071	NC_021921	CCG	2	6	333014	333019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_021921	GCG	2	6	333045	333050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_021921	AAC	2	6	333051	333056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_021921	CGT	2	6	333090	333095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021921	AGCGA	2	10	333100	333109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_021921	TCGC	2	8	333148	333155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_021921	GA	3	6	333195	333200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021921	CG	3	6	333204	333209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_021921	AGCGA	2	10	333211	333220	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_021921	CGT	3	9	334522	334530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021921	CTC	2	6	334559	334564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021921	CGC	2	6	334646	334651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_021921	C	6	6	334661	334666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1084	NC_021921	CT	3	6	334718	334723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_021921	AGG	2	6	334801	334806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021921	CAG	2	6	335626	335631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021921	AG	3	6	335651	335656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021921	GCCA	2	8	335753	335760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_021921	CGT	2	6	337056	337061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021921	A	6	6	337502	337507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021921	CGG	2	6	338390	338395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021921	TGT	2	6	338419	338424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021921	AT	3	6	338621	338626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021921	CCG	2	6	340246	340251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_021921	CGA	2	6	340261	340266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021921	ACT	2	6	340282	340287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021921	TCCCC	2	10	340301	340310	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1098	NC_021921	CGG	2	6	341966	341971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021921	GA	3	6	346965	346970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021921	ATAC	2	8	346978	346985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_021921	GTC	3	9	347005	347013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021921	CGC	2	6	347025	347030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_021921	TGCG	2	8	347043	347050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_021921	ACG	2	6	347051	347056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021921	GTC	2	6	347065	347070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021921	TCT	2	6	347112	347117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_021921	G	7	7	347153	347159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021921	GGCGA	2	10	347169	347178	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_021921	GTC	2	6	347237	347242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021921	CGG	2	6	347598	347603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021921	TAT	2	6	347621	347626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021921	GTT	2	6	347683	347688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021921	GTA	2	6	347692	347697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021921	TG	3	6	347707	347712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021921	ACG	3	9	347722	347730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021921	GAA	2	6	347734	347739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021921	TGA	2	6	347769	347774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021921	GTCT	2	8	347794	347801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_021921	CGA	2	6	347913	347918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021921	CCG	2	6	348073	348078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_021921	AGT	2	6	348128	348133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021921	CAC	2	6	348168	348173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_021921	CGAC	2	8	348180	348187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_021921	GT	3	6	349266	349271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021921	TCA	2	6	350357	350362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021921	CGG	2	6	350370	350375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021921	CCCA	2	8	350405	350412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1128	NC_021921	CTACTC	2	12	351798	351809	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_021921	GGTCGT	2	12	351858	351869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1130	NC_021921	GCG	2	6	352898	352903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021921	TGGCGT	2	12	352922	352933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1132	NC_021921	TCGCC	2	10	352961	352970	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1133	NC_021921	GAC	2	6	353507	353512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021921	GA	3	6	353519	353524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021921	CGT	2	6	353526	353531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021921	GCG	2	6	353639	353644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021921	AAC	2	6	353674	353679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_021921	TCC	2	6	353734	353739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_021921	AGC	2	6	353741	353746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_021921	ACC	2	6	353749	353754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_021921	GCTT	2	8	353807	353814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1142	NC_021921	AGC	2	6	354184	354189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_021921	GGC	2	6	354190	354195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_021921	GTCC	2	8	354202	354209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1145	NC_021921	ACC	2	6	355035	355040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_021921	GAACG	2	10	355080	355089	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1147	NC_021921	TCG	2	6	355105	355110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1149	NC_021921	GC	3	6	361183	361188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1150	NC_021921	C	6	6	361201	361206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1151	NC_021921	ACC	2	6	361210	361215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1152	NC_021921	GTA	2	6	361881	361886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_021921	GCG	2	6	361902	361907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1154	NC_021921	CTCC	2	8	362029	362036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1155	NC_021921	TCG	2	6	362043	362048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1157	NC_021921	GCTC	2	8	362089	362096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1158	NC_021921	GCCA	2	8	363052	363059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1159	NC_021921	CAC	2	6	363100	363105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1160	NC_021921	GTG	2	6	365313	365318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_021921	CGTGGT	2	12	365320	365331	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1162	NC_021921	GTC	2	6	366709	366714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_021921	TCG	2	6	366725	366730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1164	NC_021921	GGA	2	6	366739	366744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_021921	CCA	2	6	367506	367511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1167	NC_021921	GCT	2	6	370624	370629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1168	NC_021921	TG	3	6	370640	370645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_021921	TTA	2	6	370912	370917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1171	NC_021921	AACGT	2	10	370991	371000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1172	NC_021921	CCG	2	6	371661	371666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1173	NC_021921	GTC	2	6	371681	371686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1174	NC_021921	GTCCG	2	10	371732	371741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1175	NC_021921	GGA	2	6	371755	371760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1176	NC_021921	CGG	2	6	371813	371818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1178	NC_021921	CTT	2	6	373305	373310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1180	NC_021921	CTG	2	6	373452	373457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1181	NC_021921	CCG	2	6	373481	373486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1194	NC_021921	CGG	2	6	381036	381041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1232	NC_021921	TTG	2	6	399885	399890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1237	NC_021921	GAG	2	6	401777	401782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1244	NC_021921	AAGT	2	8	404144	404151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_021921	TCG	2	6	407730	407735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_021921	TCG	2	6	409348	409353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1406	NC_021921	CGG	2	6	453410	453415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_021921	CGAA	2	8	453478	453485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1408	NC_021921	GGA	2	6	453503	453508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_021921	CGA	2	6	453514	453519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_021921	CGC	2	6	453659	453664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1413	NC_021921	GCT	2	6	453730	453735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1431	NC_021921	GCG	2	6	454485	454490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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