MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 9650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021521	AAT	2	6	277337	277342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021521	CGTG	2	8	277379	277386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_021521	GGA	2	6	277418	277423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021521	TTA	2	6	277509	277514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021521	TAT	2	6	277526	277531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021521	G	7	7	277532	277538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021521	GGT	2	6	277565	277570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021521	TGG	2	6	277571	277576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021521	T	7	7	277598	277604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021521	A	6	6	277613	277618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021521	CTT	2	6	277712	277717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021521	TA	3	6	277740	277745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021521	GA	3	6	277769	277774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021521	CTTT	2	8	278549	278556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_021521	T	6	6	278554	278559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021521	A	6	6	278560	278565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021521	TTTA	2	8	278587	278594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021521	T	7	7	278615	278621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021521	TAATT	2	10	278667	278676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021521	AAT	2	6	279458	279463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021521	T	6	6	281025	281030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021521	TAA	2	6	282117	282122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021521	ATT	3	9	282125	282133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021521	ATGCT	2	10	282146	282155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_021521	ACT	2	6	282163	282168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021521	TGA	2	6	282225	282230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1028	NC_021521	CTT	2	6	282288	282293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021521	GTTT	2	8	282573	282580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021521	T	6	6	282578	282583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021521	ATTT	2	8	282623	282630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021521	T	6	6	282628	282633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021521	CAT	2	6	282670	282675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021521	AAC	2	6	282702	282707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021521	CAAA	2	8	282721	282728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_021521	CT	3	6	282755	282760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_021521	T	6	6	282767	282772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021521	A	7	7	282808	282814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021521	GCCAGT	2	12	282834	282845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_021521	TGGT	2	8	282901	282908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021521	TGG	2	6	282960	282965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021521	CCG	2	6	283080	283085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_021521	TAT	2	6	283100	283105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021521	ATT	2	6	283129	283134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021521	TGA	2	6	283137	283142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021521	ACA	2	6	283149	283154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021521	GTT	2	6	283183	283188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021521	CGT	2	6	283201	283206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021521	GA	3	6	283242	283247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021521	ATC	2	6	283387	283392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021521	T	6	6	283433	283438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021521	ATG	2	6	283439	283444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021521	AAAG	2	8	283469	283476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021521	ATC	2	6	283491	283496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021521	CAT	2	6	283513	283518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1059	NC_021521	TTA	2	6	284841	284846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021521	GTG	2	6	285648	285653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1063	NC_021521	GGTT	2	8	287236	287243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021521	CAA	2	6	290135	290140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021521	T	6	6	290169	290174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021521	TAA	2	6	290181	290186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_021521	TGT	2	6	292171	292176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_021521	TAG	2	6	292232	292237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_021521	CTA	2	6	292267	292272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_021521	GGAAT	2	10	293958	293967	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021521	TGATA	2	10	294639	294648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021521	TAG	2	6	294653	294658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_021521	GTG	2	6	295530	295535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_021521	A	6	6	295630	295635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021521	TTG	2	6	295665	295670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_021521	TAT	2	6	295873	295878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021521	CAA	2	6	295892	295897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021521	TTA	3	9	298281	298289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_021521	TAT	2	6	299529	299534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021521	TGT	2	6	299556	299561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_021521	GT	3	6	304834	304839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021521	TAT	2	6	304854	304859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021521	AC	3	6	304871	304876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_021521	GT	3	6	304880	304885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021521	A	6	6	305425	305430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021521	GTT	2	6	306246	306251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021521	TAA	2	6	308084	308089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021521	AGTA	2	8	308109	308116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021521	A	6	6	308140	308145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021521	GGTT	2	8	309114	309121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021521	CAAA	2	8	309147	309154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_021521	A	6	6	309196	309201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021521	TCT	2	6	309210	309215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021521	T	6	6	309230	309235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021521	AAT	2	6	309310	309315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021521	AAT	2	6	310634	310639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021521	ATC	2	6	310640	310645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021521	CT	4	8	310651	310658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_021521	T	6	6	312155	312160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021521	TCG	2	6	312193	312198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021521	TTA	2	6	312200	312205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021521	AAT	2	6	312914	312919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021521	AGTT	2	8	312942	312949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021521	AGAT	2	8	314672	314679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021521	TTA	2	6	314768	314773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021521	GAT	2	6	315823	315828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021521	ATTA	2	8	315855	315862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021521	T	6	6	315913	315918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021521	T	7	7	315925	315931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021521	AAAG	2	8	317018	317025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021521	TA	3	6	317159	317164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021521	AAG	2	6	317212	317217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021521	ACA	2	6	317222	317227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021521	CAA	2	6	317983	317988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021521	AACA	2	8	318011	318018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_021521	C	7	7	319041	319047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1413	NC_021521	AAAG	2	8	371189	371196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_021521	A	6	6	371787	371792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021521	A	7	7	371804	371810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_021521	CTT	2	6	372609	372614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_021521	TAT	2	6	372615	372620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_021521	AATG	2	8	373351	373358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_021521	T	7	7	373424	373430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_021521	CTTAT	2	10	373461	373470	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1434	NC_021521	CT	3	6	375259	375264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1448	NC_021521	AGT	2	6	378208	378213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_021521	TTGA	2	8	378295	378302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_021521	CAT	2	6	378503	378508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1486	NC_021521	A	6	6	383292	383297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_021521	TCAA	2	8	383400	383407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1500	NC_021521	AC	3	6	384130	384135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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