MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 9650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021521	ATT	2	6	143787	143792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021521	GGGT	2	8	143809	143816	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021521	CCA	2	6	143823	143828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_021521	TGG	2	6	143854	143859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021521	ACCC	2	8	143866	143873	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
506	NC_021521	AT	3	6	143894	143899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021521	T	6	6	144903	144908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021521	CAA	2	6	144918	144923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021521	A	6	6	144922	144927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021521	TTA	2	6	144948	144953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021521	ATG	2	6	144980	144985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021521	CT	3	6	144993	144998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_021521	AAT	2	6	145295	145300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021521	A	7	7	146902	146908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021521	TAA	2	6	146936	146941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021521	TTTTA	2	10	148148	148157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021521	ACAG	2	8	148955	148962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_021521	T	7	7	149017	149023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021521	GTA	2	6	149029	149034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021521	CCA	2	6	149066	149071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_021521	ATC	2	6	149082	149087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021521	TGA	2	6	149096	149101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021521	TTA	2	6	150855	150860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021521	ATT	2	6	150882	150887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021521	GTT	2	6	150888	150893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021521	T	6	6	150892	150897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021521	T	6	6	150943	150948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021521	A	6	6	150950	150955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021521	ATA	2	6	150984	150989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021521	CCA	2	6	151092	151097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_021521	GT	3	6	151154	151159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021521	AGTT	2	8	151314	151321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021521	T	6	6	151320	151325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021521	TCT	2	6	151405	151410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021521	AAT	2	6	151426	151431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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538	NC_021521	TAG	2	6	153497	153502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_021521	TAG	2	6	156439	156444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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542	NC_021521	T	6	6	156549	156554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021521	TCTT	2	8	156594	156601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_021521	T	6	6	156622	156627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021521	TTA	2	6	156637	156642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021521	T	7	7	156668	156674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021521	AAT	2	6	156683	156688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021521	TTA	2	6	158519	158524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021521	ATT	2	6	158534	158539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021521	ATCA	2	8	158576	158583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_021521	ATA	2	6	158587	158592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021521	TAG	2	6	158673	158678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021521	A	6	6	159741	159746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021521	TA	3	6	159757	159762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021521	T	6	6	159795	159800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021521	TA	3	6	159893	159898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021521	A	7	7	162090	162096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021521	CTTTT	2	10	162127	162136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
559	NC_021521	TCAC	2	8	162155	162162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021521	ACT	2	6	162202	162207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021521	TA	3	6	162252	162257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021521	ATT	2	6	165082	165087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021521	ATA	2	6	165110	165115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021521	GTT	2	6	165563	165568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021521	TTGAG	2	10	165601	165610	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021521	TTG	2	6	165619	165624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021521	ACC	3	9	165695	165703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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569	NC_021521	A	7	7	167763	167769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021521	ATTG	2	8	167832	167839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021521	TAT	2	6	169139	169144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021521	GTAA	2	8	171128	171135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021521	GTCACG	2	12	171869	171880	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021521	TCA	2	6	171906	171911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021521	GTT	2	6	172010	172015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021521	ATA	2	6	172024	172029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021521	TAT	2	6	172049	172054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_021521	ATT	2	6	172110	172115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021521	T	6	6	172114	172119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021521	T	6	6	172136	172141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021521	CCATT	2	10	172155	172164	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
583	NC_021521	TCA	2	6	172359	172364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021521	ATA	2	6	172417	172422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021521	CTA	2	6	172436	172441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021521	ACT	2	6	172445	172450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_021521	GTA	2	6	176172	176177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021521	T	7	7	176199	176205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021521	TA	3	6	176239	176244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021521	ACA	2	6	176293	176298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021521	GAAA	2	8	176311	176318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021521	TAAG	2	8	176322	176329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021521	ACA	2	6	178004	178009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021521	CA	3	6	178008	178013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_021521	AAC	2	6	178017	178022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021521	A	6	6	178078	178083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021521	AT	3	6	178123	178128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021521	AAT	2	6	178176	178181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_021521	ATCA	2	8	179530	179537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_021521	A	7	7	179539	179545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021521	TAT	2	6	180040	180045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021521	AAT	2	6	180049	180054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021521	TTA	2	6	180086	180091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021521	TAA	2	6	180100	180105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021521	TCC	2	6	180154	180159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_021521	TTC	2	6	180177	180182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021521	GAA	2	6	180256	180261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021521	TTGG	2	8	180306	180313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021521	TTCCC	2	10	180398	180407	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
612	NC_021521	TCA	2	6	180421	180426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021521	AAGT	2	8	180428	180435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021521	TCTT	2	8	180451	180458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_021521	TTATT	2	10	180470	180479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021521	TTTA	2	8	182089	182096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021521	T	6	6	182121	182126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021521	ATC	2	6	185733	185738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021521	AAT	2	6	185741	185746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021521	A	6	6	188476	188481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021521	GAA	2	6	188499	188504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021521	AAATT	2	10	188513	188522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021521	ATTA	2	8	188623	188630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021521	ATC	2	6	188643	188648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021521	TCA	2	6	188659	188664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021521	TCT	2	6	188701	188706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021521	AATT	2	8	188838	188845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021521	GT	3	6	188904	188909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021521	TCA	2	6	188968	188973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021521	GTA	3	9	188988	188996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021521	CTT	2	6	189026	189031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021521	TTC	2	6	189116	189121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021521	GCA	2	6	189141	189146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021521	AG	3	6	189148	189153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021521	GAAC	2	8	189177	189184	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_021521	CTAAAT	2	12	189214	189225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
637	NC_021521	CAG	2	6	189235	189240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021521	AGCCA	2	10	189371	189380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
639	NC_021521	CTT	2	6	189448	189453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021521	TGTT	2	8	189509	189516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_021521	TTA	2	6	252198	252203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
923	NC_021521	AGAT	2	8	252212	252219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
924	NC_021521	ATAA	2	8	252220	252227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
925	NC_021521	ATGT	2	8	252231	252238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
926	NC_021521	GAAT	2	8	252253	252260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
927	NC_021521	TTTG	2	8	252283	252290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
928	NC_021521	A	7	7	252291	252297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
929	NC_021521	TC	3	6	252349	252354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
930	NC_021521	TGAT	2	8	252369	252376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
931	NC_021521	TCT	2	6	252379	252384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
932	NC_021521	GCCT	2	8	252416	252423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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939	NC_021521	ATGA	2	8	260947	260954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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942	NC_021521	AGTTT	2	10	261033	261042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
943	NC_021521	AAC	2	6	261646	261651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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946	NC_021521	TGT	2	6	261807	261812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_021521	TCT	2	6	261991	261996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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950	NC_021521	ACT	2	6	262089	262094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
951	NC_021521	AC	3	6	262146	262151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
952	NC_021521	TCC	2	6	262180	262185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
953	NC_021521	TCAC	2	8	262201	262208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
954	NC_021521	GTA	2	6	262221	262226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_021521	TTA	2	6	262291	262296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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963	NC_021521	GAA	2	6	262596	262601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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967	NC_021521	A	7	7	265687	265693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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972	NC_021521	T	6	6	265865	265870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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976	NC_021521	ATT	2	6	269723	269728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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984	NC_021521	AT	3	6	275265	275270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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