MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 9650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021521	GCT	2	6	1551726	1551731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_021521	GTT	2	6	1551816	1551821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021521	CACC	2	8	1551845	1551852	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6504	NC_021521	GT	3	6	1551853	1551858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021521	TCGGT	2	10	1552061	1552070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6506	NC_021521	GCC	2	6	1552147	1552152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6507	NC_021521	GTAC	2	8	1552269	1552276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_021521	GGA	2	6	1552375	1552380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021521	C	6	6	1552385	1552390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6510	NC_021521	TTG	2	6	1552425	1552430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_021521	TTC	2	6	1552501	1552506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_021521	TGC	2	6	1552513	1552518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_021521	CTTTCG	2	12	1552534	1552545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_021521	CGC	2	6	1552548	1552553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_021521	TAG	2	6	1552649	1552654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_021521	TTC	2	6	1552656	1552661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_021521	CTT	2	6	1552702	1552707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_021521	CTT	2	6	1552744	1552749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_021521	ACT	2	6	1552835	1552840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_021521	TAC	2	6	1552878	1552883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_021521	TC	3	6	1552931	1552936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_021521	ATC	2	6	1552994	1552999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_021521	CTT	2	6	1553023	1553028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_021521	ATG	2	6	1553074	1553079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_021521	TGG	2	6	1553082	1553087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_021521	CCT	2	6	1553112	1553117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_021521	AGGC	2	8	1553125	1553132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_021521	TCA	2	6	1553164	1553169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_021521	TTC	2	6	1553177	1553182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_021521	TCAC	2	8	1553186	1553193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_021521	GTG	2	6	1553226	1553231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_021521	ACC	2	6	1553249	1553254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6533	NC_021521	ACC	2	6	1553284	1553289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_021521	TCTT	2	8	1553321	1553328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_021521	TG	3	6	1553350	1553355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_021521	AGG	2	6	1553384	1553389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_021521	GT	3	6	1553524	1553529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_021521	TCG	2	6	1553661	1553666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_021521	GT	3	6	1553692	1553697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_021521	ATG	2	6	1553717	1553722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_021521	TCC	2	6	1553743	1553748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_021521	CAA	2	6	1553795	1553800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_021521	GAC	2	6	1553856	1553861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_021521	GCA	2	6	1553868	1553873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_021521	CTT	2	6	1553916	1553921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_021521	TTC	2	6	1553944	1553949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_021521	GCCTTC	2	12	1554188	1554199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_021521	TCC	2	6	1554205	1554210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_021521	CCCT	2	8	1554250	1554257	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6550	NC_021521	GCT	2	6	1554395	1554400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_021521	CTT	2	6	1554420	1554425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_021521	TCA	2	6	1554472	1554477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_021521	CTT	2	6	1554504	1554509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_021521	C	6	6	1554539	1554544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6555	NC_021521	CTG	2	6	1554563	1554568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_021521	TCG	2	6	1554638	1554643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_021521	CCA	2	6	1554662	1554667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_021521	TAC	2	6	1554736	1554741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_021521	AAGC	2	8	1554831	1554838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6560	NC_021521	TTC	2	6	1554839	1554844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_021521	GCC	2	6	1554877	1554882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_021521	A	7	7	1554953	1554959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021521	A	7	7	1555024	1555030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_021521	TCAA	2	8	1555046	1555053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_021521	CA	3	6	1555062	1555067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_021521	GTT	2	6	1555081	1555086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_021521	A	6	6	1555094	1555099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_021521	ACG	2	6	1555102	1555107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_021521	ACT	2	6	1555122	1555127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_021521	CGT	2	6	1555139	1555144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_021521	TG	3	6	1555145	1555150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_021521	T	6	6	1555189	1555194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_021521	A	6	6	1555197	1555202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_021521	A	7	7	1555207	1555213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_021521	ATG	2	6	1555238	1555243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_021521	GTT	2	6	1555262	1555267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_021521	ACTT	2	8	1555393	1555400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6578	NC_021521	ACA	2	6	1556732	1556737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_021521	AAGTG	2	10	1558430	1558439	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_021521	T	7	7	1558520	1558526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_021521	CTT	2	6	1558549	1558554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_021521	CAAA	2	8	1558556	1558563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6583	NC_021521	CAAA	2	8	1558575	1558582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_021521	TGA	2	6	1558620	1558625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_021521	GAA	2	6	1558638	1558643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_021521	CTT	2	6	1558647	1558652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_021521	T	6	6	1558651	1558656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_021521	ACG	2	6	1558712	1558717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_021521	T	6	6	1558724	1558729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_021521	AC	3	6	1558745	1558750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_021521	AT	3	6	1562146	1562151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_021521	TA	3	6	1562155	1562160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_021521	TAT	2	6	1562209	1562214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_021521	CTA	2	6	1562223	1562228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_021521	CTA	2	6	1562235	1562240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_021521	GTTCA	2	10	1562251	1562260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6597	NC_021521	A	6	6	1562278	1562283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_021521	ATT	2	6	1562302	1562307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_021521	T	6	6	1562310	1562315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_021521	ATG	2	6	1562320	1562325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_021521	TAA	2	6	1562326	1562331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_021521	TAA	2	6	1562360	1562365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_021521	AATT	2	8	1562379	1562386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021521	AGA	2	6	1562438	1562443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021521	ATCT	2	8	1562475	1562482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6606	NC_021521	ATA	2	6	1563486	1563491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_021521	A	7	7	1563506	1563512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_021521	TTAT	2	8	1563582	1563589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_021521	A	7	7	1563618	1563624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_021521	TTG	2	6	1565342	1565347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021521	A	6	6	1566004	1566009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021521	TAAA	2	8	1566016	1566023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_021521	AC	3	6	1567435	1567440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_021521	A	7	7	1567444	1567450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_021521	A	7	7	1569426	1569432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_021521	CAA	2	6	1569442	1569447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_021521	AT	3	6	1569497	1569502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021521	GATT	2	8	1569512	1569519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_021521	ACAAA	2	10	1569545	1569554	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6620	NC_021521	ATT	2	6	1569582	1569587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_021521	TCT	2	6	1569613	1569618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_021521	T	7	7	1572041	1572047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_021521	AT	3	6	1572076	1572081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_021521	TATGT	2	10	1572093	1572102	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021521	T	6	6	1572146	1572151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021521	A	6	6	1573431	1573436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_021521	AT	3	6	1573468	1573473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021521	TAGA	2	8	1573479	1573486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021521	AATA	2	8	1573504	1573511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_021521	TCA	2	6	1573523	1573528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_021521	T	6	6	1573586	1573591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_021521	AT	3	6	1574940	1574945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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