MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 9650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021521	AAAT	2	8	1318798	1318805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_021521	CAA	2	6	1318811	1318816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_021521	CTA	2	6	1318863	1318868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_021521	AGA	2	6	1318902	1318907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021521	CTT	2	6	1318918	1318923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_021521	ATAA	2	8	1318928	1318935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021521	AAC	2	6	1320117	1320122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_021521	TAA	2	6	1320157	1320162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021521	AAAT	2	8	1320163	1320170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021521	AAC	2	6	1320176	1320181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_021521	T	6	6	1320183	1320188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021521	A	6	6	1320191	1320196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021521	TAT	2	6	1320205	1320210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021521	T	6	6	1320210	1320215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021521	T	6	6	1320276	1320281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021521	GGA	2	6	1320333	1320338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021521	TAAA	2	8	1322556	1322563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021521	TAG	2	6	1322569	1322574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_021521	ACA	2	6	1322577	1322582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_021521	TCAA	2	8	1322583	1322590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_021521	AC	4	8	1322598	1322605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_021521	CTA	2	6	1322625	1322630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_021521	AC	3	6	1323526	1323531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_021521	GT	3	6	1323535	1323540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021521	CAA	2	6	1323551	1323556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_021521	AC	3	6	1323593	1323598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_021521	GT	3	6	1323602	1323607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021521	ATT	2	6	1323615	1323620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021521	TCG	2	6	1324598	1324603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_021521	ATTA	2	8	1326245	1326252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021521	T	6	6	1326269	1326274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021521	T	6	6	1326278	1326283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021521	T	6	6	1326384	1326389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021521	T	7	7	1326399	1326405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021521	TCCT	2	8	1326966	1326973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_021521	T	7	7	1326973	1326979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021521	GTT	2	6	1327017	1327022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021521	AG	3	6	1327028	1327033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021521	ACA	2	6	1327041	1327046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_021521	ATT	2	6	1327048	1327053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021521	TTG	2	6	1327067	1327072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021521	TTG	2	6	1328807	1328812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021521	CGA	2	6	1328883	1328888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_021521	TCA	2	6	1328910	1328915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021521	ACT	2	6	1328936	1328941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_021521	TTG	2	6	1328948	1328953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021521	CAA	2	6	1329023	1329028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_021521	GAT	2	6	1329031	1329036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021521	TGT	2	6	1329037	1329042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021521	T	7	7	1329151	1329157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_021521	GCTT	2	8	1329189	1329196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_021521	TCA	2	6	1329267	1329272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_021521	T	6	6	1329289	1329294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021521	T	6	6	1329301	1329306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021521	TTG	2	6	1329311	1329316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021521	TTG	2	6	1329353	1329358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021521	GGT	2	6	1329384	1329389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_021521	T	9	9	1329411	1329419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021521	TTG	2	6	1329424	1329429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021521	CACT	2	8	1329495	1329502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_021521	GTT	2	6	1329519	1329524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021521	T	6	6	1329533	1329538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021521	TGT	2	6	1329545	1329550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021521	TGT	2	6	1329568	1329573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021521	GTT	2	6	1329659	1329664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021521	GGTGTA	2	12	1329665	1329676	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_021521	T	6	6	1329778	1329783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021521	TCT	2	6	1329818	1329823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_021521	GA	3	6	1329825	1329830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021521	A	6	6	1329842	1329847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021521	TCT	2	6	1329860	1329865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021521	TGA	2	6	1329866	1329871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021521	CAA	2	6	1329880	1329885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_021521	GTT	2	6	1329933	1329938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_021521	TGA	2	6	1330031	1330036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021521	ACGC	2	8	1330242	1330249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_021521	TTC	2	6	1330339	1330344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_021521	TAA	2	6	1330354	1330359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021521	GA	3	6	1330377	1330382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021521	TCAA	2	8	1330397	1330404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_021521	GGTT	2	8	1330426	1330433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021521	AGC	2	6	1330486	1330491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_021521	CTT	2	6	1330521	1330526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5585	NC_021521	GTT	2	6	1330707	1330712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5587	NC_021521	C	7	7	1330816	1330822	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5588	NC_021521	G	6	6	1330835	1330840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021521	A	6	6	1331472	1331477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_021521	CGGT	2	8	1331487	1331494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5591	NC_021521	AAGAA	2	10	1331530	1331539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021521	TCA	2	6	1331555	1331560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5594	NC_021521	TAT	2	6	1334141	1334146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021521	CAA	2	6	1334249	1334254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_021521	A	6	6	1334253	1334258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021521	T	9	9	1334287	1334295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021521	GTC	2	6	1334306	1334311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_021521	AAAT	2	8	1336211	1336218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_021521	TAA	2	6	1336244	1336249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021521	A	7	7	1336280	1336286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021521	CACT	2	8	1336305	1336312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_021521	GCT	2	6	1336319	1336324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_021521	TAT	2	6	1336340	1336345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021521	TCA	2	6	1336399	1336404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_021521	A	7	7	1336482	1336488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021521	TAT	2	6	1336520	1336525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021521	GAAA	2	8	1336528	1336535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021521	A	6	6	1336533	1336538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_021521	A	7	7	1336551	1336557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021521	GCA	2	6	1336570	1336575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_021521	ATG	2	6	1336619	1336624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021521	GAAA	2	8	1336636	1336643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021521	AGC	2	6	1336659	1336664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_021521	AGA	2	6	1336716	1336721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021521	A	6	6	1336843	1336848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021521	ATA	2	6	1336850	1336855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021521	TATAT	2	10	1336893	1336902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021521	A	6	6	1336943	1336948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_021521	AT	3	6	1336959	1336964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021521	AAG	2	6	1337003	1337008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_021521	GTT	2	6	1337044	1337049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021521	AGA	2	6	1337109	1337114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_021521	TAA	2	6	1337124	1337129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021521	T	7	7	1337162	1337168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021521	AC	3	6	1337326	1337331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_021521	GT	3	6	1337335	1337340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_021521	TTAA	2	8	1337349	1337356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_021521	TTC	2	6	1337367	1337372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_021521	ATT	2	6	1337393	1337398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_021521	TA	3	6	1337422	1337427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_021521	TA	3	6	1337444	1337449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_021521	ATT	2	6	1338172	1338177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_021521	ATTAG	2	10	1340330	1340339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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