MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 3585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	T	7	7	61	67	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021216	A	6	6	141	146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021216	AAT	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021216	T	7	7	176	182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021216	TGGC	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021216	ATT	2	6	306	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021216	TGA	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021216	A	7	7	459	465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021216	T	6	6	468	473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021216	GTTC	2	8	476	483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021216	AAC	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021216	TTTC	2	8	1525	1532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021216	G	6	6	1540	1545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021216	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021216	GTG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021216	ATA	3	9	1627	1635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021216	CGCA	2	8	1659	1666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021216	CATT	2	8	1688	1695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021216	GT	3	6	1811	1816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021216	TAA	2	6	1820	1825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021216	TTC	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021216	ATC	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021216	TAC	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021216	TAG	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021216	T	7	7	1905	1911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021216	TAA	3	9	1939	1947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021216	ATA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021216	AAT	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021216	A	7	7	2041	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021216	GTTT	2	8	2052	2059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021216	TAA	2	6	2081	2086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021216	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021216	GA	4	8	2767	2774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021216	TTA	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021216	TTTC	2	8	6384	6391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021216	GGGT	2	8	8275	8282	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021216	ATT	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021216	A	6	6	8334	8339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021216	AACA	2	8	8345	8352	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021216	A	6	6	14204	14209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021216	CAA	2	6	14221	14226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021216	GA	3	6	19042	19047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021216	TTGA	2	8	19055	19062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021216	ATT	2	6	19075	19080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021216	A	6	6	19086	19091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021216	T	6	6	19104	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021216	CT	3	6	21112	21117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021216	T	6	6	21133	21138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021216	ATT	2	6	21139	21144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021216	GGGA	2	8	21170	21177	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021216	GATTGA	2	12	21198	21209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021216	A	6	6	21211	21216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021216	A	6	6	21274	21279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021216	GGT	2	6	21298	21303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021216	AGG	2	6	22501	22506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021216	CCAA	2	8	22535	22542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021216	ATT	2	6	23541	23546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021216	A	6	6	23661	23666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021216	T	6	6	24822	24827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021216	ATT	2	6	24832	24837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021216	TTA	2	6	27091	27096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021216	A	6	6	27123	27128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021216	TTA	2	6	27161	27166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021216	AGG	2	6	27173	27178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021216	TAAAG	2	10	36240	36249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021216	AAGG	2	8	36250	36257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021216	CTT	2	6	37294	37299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021216	ATT	2	6	37808	37813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021216	AAT	3	9	37818	37826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021216	ATT	3	9	37850	37858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021216	TTAAT	2	10	37859	37868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021216	A	7	7	37870	37876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021216	T	6	6	37883	37888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021216	TCC	2	6	39471	39476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021216	TTA	2	6	40364	40369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021216	TCAA	2	8	40398	40405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021216	CAAT	2	8	41777	41784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021216	TAA	2	6	41801	41806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021216	TCT	2	6	41821	41826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021216	CAAT	2	8	42633	42640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021216	TCTTG	2	10	42671	42680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021216	TAT	2	6	42739	42744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021216	AT	3	6	42750	42755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021216	ATA	2	6	42761	42766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021216	GTT	2	6	42768	42773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021216	TAA	3	9	42775	42783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021216	TCGC	2	8	42826	42833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021216	TTC	2	6	43822	43827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021216	AAC	2	6	45062	45067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021216	A	7	7	46543	46549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021216	CCT	2	6	48001	48006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_021216	AAAATA	2	12	48014	48025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021216	ATAAA	2	10	48044	48053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021216	T	8	8	48058	48065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021216	AAAAT	2	10	48078	48087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021216	A	8	8	48090	48097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021216	T	6	6	48154	48159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021216	CTT	2	6	48175	48180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021216	ATC	2	6	55510	55515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021216	TA	3	6	55559	55564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021216	T	6	6	55587	55592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021216	CACC	2	8	55635	55642	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_021216	GC	3	6	55651	55656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021216	ATT	2	6	55692	55697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021216	T	6	6	60745	60750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021216	GTT	2	6	61595	61600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021216	TAAAAA	2	12	61610	61621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021216	T	6	6	68365	68370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021216	TAACA	2	10	68404	68413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021216	ACA	2	6	68417	68422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021216	AATAA	2	10	69793	69802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021216	TATC	2	8	69803	69810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021216	AT	4	8	69813	69820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021216	TAT	2	6	69829	69834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021216	CTT	2	6	70592	70597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021216	T	6	6	70648	70653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021216	ACC	2	6	70719	70724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021216	TAA	2	6	70788	70793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021216	T	7	7	70844	70850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021216	GCT	3	9	70883	70891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021216	TATTAG	2	12	70957	70968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021216	TTC	2	6	70975	70980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021216	CAG	2	6	71034	71039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021216	A	7	7	71054	71060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021216	ATG	2	6	71064	71069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021216	A	6	6	71070	71075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021216	AGA	2	6	71089	71094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021216	AAAT	2	8	71139	71146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021216	ACTC	2	8	71250	71257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021216	TTGA	2	8	71356	71363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021216	A	7	7	71365	71371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021216	CT	3	6	71381	71386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021216	CAT	2	6	71392	71397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021216	TAA	2	6	71454	71459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021216	T	6	6	71484	71489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021216	ACC	2	6	71614	71619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021216	T	8	8	71642	71649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021216	T	6	6	71655	71660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021216	TCT	2	6	71748	71753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021216	T	6	6	71759	71764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021216	CTT	2	6	71768	71773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021216	T	8	8	71772	71779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021216	T	6	6	71854	71859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021216	CTT	2	6	71912	71917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021216	AAG	2	6	71921	71926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021216	T	7	7	71963	71969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021216	TTG	2	6	71997	72002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021216	GTG	2	6	72048	72053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021216	ATG	2	6	72054	72059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021216	AT	3	6	72070	72075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021216	CCA	2	6	72143	72148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_021216	A	6	6	72210	72215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021216	A	6	6	72248	72253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021216	TTTGA	2	10	72278	72287	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021216	AAG	2	6	72306	72311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021216	A	7	7	72438	72444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021216	T	7	7	72447	72453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021216	CT	3	6	72892	72897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_021216	ATT	2	6	72910	72915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_021216	A	6	6	81663	81668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_021216	A	6	6	131438	131443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_021216	T	6	6	134774	134779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_021216	T	6	6	140149	140154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_021216	T	6	6	160567	160572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_021216	T	6	6	160597	160602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_021216	T	7	7	202953	202959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_021216	TGG	2	6	203052	203057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_021216	GTG	2	6	203078	203083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_021216	AAAGA	2	10	209042	209051	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
437	NC_021216	ATTG	2	8	210503	210510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_021216	TAA	2	6	212914	212919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_021216	A	6	6	221567	221572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_021216	TTA	2	6	222790	222795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_021216	A	7	7	238408	238414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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