MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 3585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021216	GTT	2	6	460657	460662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021216	TAA	2	6	460663	460668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021216	T	6	6	460729	460734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021216	AGAT	2	8	460753	460760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021216	TC	3	6	460943	460948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_021216	A	7	7	460960	460966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021216	ATT	2	6	461427	461432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021216	ACC	2	6	461454	461459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_021216	CAAA	2	8	461465	461472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_021216	CCA	2	6	461491	461496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_021216	TAT	2	6	461528	461533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021216	ACC	3	9	461563	461571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_021216	T	6	6	461889	461894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021216	T	6	6	461896	461901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021216	TAA	2	6	461952	461957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021216	TTTA	2	8	461997	462004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021216	A	6	6	462148	462153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021216	CA	3	6	462194	462199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_021216	A	6	6	462900	462905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021216	TAAC	2	8	462914	462921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_021216	A	6	6	462966	462971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021216	TACC	2	8	462993	463000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_021216	CT	3	6	463045	463050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_021216	CT	3	6	463068	463073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_021216	TTC	2	6	463078	463083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021216	TTA	2	6	464631	464636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021216	TC	4	8	464643	464650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_021216	TTAAA	2	10	464731	464740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021216	ATTTTT	2	12	464746	464757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021216	TAC	2	6	464773	464778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021216	A	6	6	464809	464814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021216	CAAC	2	8	464829	464836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_021216	T	6	6	467270	467275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021216	TTG	2	6	467284	467289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021216	TG	3	6	478416	478421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021216	TCA	2	6	478479	478484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021216	AAGG	2	8	478553	478560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021216	A	6	6	478576	478581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021216	AAG	2	6	478607	478612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021216	AT	3	6	478617	478622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021216	ATG	2	6	478643	478648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021216	ATT	2	6	478657	478662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021216	TAG	2	6	478677	478682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021216	TTGT	2	8	478699	478706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021216	GTT	2	6	480903	480908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021216	A	6	6	481328	481333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021216	A	6	6	482295	482300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021216	GCAT	2	8	488715	488722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_021216	TAA	2	6	488725	488730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021216	T	7	7	488750	488756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021216	ATCA	2	8	488783	488790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_021216	GGT	2	6	488813	488818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021216	AAT	2	6	490282	490287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021216	A	6	6	490344	490349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021216	T	6	6	490363	490368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021216	T	6	6	490423	490428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021216	T	6	6	490442	490447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021216	AG	3	6	490456	490461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021216	TTTTA	2	10	490692	490701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021216	T	6	6	490705	490710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021216	ATT	2	6	490730	490735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021216	ATT	3	9	490753	490761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021216	TCCAAA	2	12	490803	490814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021216	TAA	2	6	490856	490861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021216	ATTTT	2	10	490882	490891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021216	TTGAA	2	10	490903	490912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021216	TAG	2	6	490916	490921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021216	A	6	6	490997	491002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021216	GTT	2	6	496354	496359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021216	TTA	2	6	496385	496390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021216	AGCCT	2	10	496431	496440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_021216	TGG	2	6	496479	496484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021216	AATC	2	8	496536	496543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_021216	TAT	2	6	496546	496551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021216	AAT	2	6	501798	501803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_021216	A	6	6	505734	505739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021216	AGTTA	2	10	505769	505778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021216	ATT	2	6	505806	505811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021216	TAAG	2	8	505812	505819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021216	A	6	6	508841	508846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021216	AAACT	2	10	510099	510108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_021216	TTA	2	6	510112	510117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021216	ATTT	2	8	510186	510193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021216	TCA	2	6	514274	514279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021216	GCTT	2	8	514339	514346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_021216	TTA	2	6	514358	514363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021216	GTT	2	6	514387	514392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021216	CTT	2	6	514454	514459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021216	CTAAA	2	10	514474	514483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_021216	A	6	6	514481	514486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021216	T	6	6	515053	515058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021216	TATAA	2	10	516932	516941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021216	A	6	6	516949	516954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021216	A	7	7	516968	516974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021216	TAA	2	6	516989	516994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021216	TATT	2	8	519941	519948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021216	TAC	2	6	519986	519991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021216	ACA	2	6	520016	520021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021216	AAG	2	6	520071	520076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021216	GAA	2	6	520081	520086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021216	CT	3	6	526723	526728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_021216	TAT	2	6	526729	526734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021216	AT	3	6	526782	526787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021216	T	6	6	526801	526806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021216	GGT	2	6	527473	527478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021216	T	6	6	528113	528118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021216	GAG	2	6	528194	528199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021216	AAAAAG	2	12	528304	528315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021216	C	6	6	528322	528327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1111	NC_021216	CCA	2	6	528368	528373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_021216	TCA	2	6	528392	528397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021216	AGT	2	6	528438	528443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021216	AAAAAG	2	12	528454	528465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021216	G	6	6	531081	531086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021216	TAA	2	6	531202	531207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021216	CAA	2	6	531288	531293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021216	ACAA	3	12	531290	531301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_021216	ATAAA	2	10	531307	531316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021216	A	6	6	531341	531346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021216	TTA	2	6	532974	532979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021216	CTTT	2	8	533959	533966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_021216	TCGTA	2	10	533975	533984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_021216	TTAA	2	8	533991	533998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021216	T	7	7	534018	534024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021216	A	6	6	534049	534054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021216	TAA	2	6	534110	534115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021216	GAT	3	9	534123	534131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021216	TAA	2	6	534132	534137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021216	AAC	2	6	534174	534179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021216	AAC	2	6	534494	534499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021216	CTA	2	6	534516	534521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_021216	TTTA	2	8	537327	537334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021216	TTAA	2	8	537348	537355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021216	ATA	2	6	539125	539130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021216	TAA	2	6	539140	539145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021216	T	6	6	541952	541957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_021216	TTGT	2	8	545775	545782	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_021216	ATGAT	2	10	545794	545803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_021216	TAA	2	6	545858	545863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1418	NC_021216	TCCAT	2	10	653798	653807	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1419	NC_021216	AAGC	2	8	653861	653868	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1420	NC_021216	ATC	2	6	653886	653891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_021216	ATC	2	6	653970	653975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_021216	T	6	6	654161	654166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_021216	ATC	2	6	654261	654266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1427	NC_021216	TCC	2	6	654302	654307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1428	NC_021216	AAAGCC	2	12	654320	654331	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1430	NC_021216	CTAA	2	8	654363	654370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_021216	A	6	6	654435	654440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_021216	T	6	6	654478	654483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1437	NC_021216	GTA	2	6	654767	654772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_021216	TCC	2	6	654828	654833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1443	NC_021216	C	6	6	654973	654978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1444	NC_021216	A	7	7	654991	654997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_021216	AAG	2	6	655183	655188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_021216	CTA	2	6	655216	655221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_021216	CAT	2	6	655254	655259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_021216	ATA	2	6	655288	655293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_021216	AT	3	6	655502	655507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_021216	TAA	2	6	655524	655529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_021216	ACC	2	6	657504	657509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1456	NC_021216	A	7	7	663333	663339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_021216	A	6	6	663376	663381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_021216	TATT	2	8	663407	663414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_021216	T	6	6	674613	674618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_021216	CTT	2	6	674636	674641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_021216	ATA	2	6	675372	675377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1472	NC_021216	A	6	6	675413	675418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_021216	T	6	6	694467	694472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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