MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 8572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021172	CCA	2	6	1613469	1613474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_021172	CCT	2	6	1613547	1613552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_021172	TGC	2	6	1613847	1613852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021172	GGT	2	6	1613925	1613930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021172	GA	3	6	1614804	1614809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021172	CGG	2	6	1614823	1614828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021172	GTT	2	6	1614856	1614861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021172	TGCC	2	8	1614866	1614873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_021172	CG	3	6	1614984	1614989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_021172	TGC	2	6	1614990	1614995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021172	CCACG	2	10	1615027	1615036	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3512	NC_021172	CAAAA	2	10	1615093	1615102	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3513	NC_021172	TTG	3	9	1616709	1616717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021172	TAT	2	6	1616767	1616772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021172	C	6	6	1616802	1616807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3516	NC_021172	GTC	2	6	1617218	1617223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021172	GGGAC	2	10	1618659	1618668	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3518	NC_021172	CGA	2	6	1618715	1618720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_021172	ACTTG	2	10	1618740	1618749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_021172	TCC	2	6	1620020	1620025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_021172	AAC	2	6	1620393	1620398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021172	CTTC	2	8	1620423	1620430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_021172	GCA	2	6	1620438	1620443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021172	GCG	2	6	1620455	1620460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021172	CG	3	6	1620506	1620511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_021172	CGT	2	6	1620517	1620522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_021172	TCG	2	6	1620532	1620537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_021172	GCC	2	6	1620546	1620551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_021172	T	6	6	1620580	1620585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021172	AAC	2	6	1620591	1620596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021172	GC	3	6	1620607	1620612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_021172	GAC	2	6	1620618	1620623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021172	TCT	2	6	1620638	1620643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021172	GCTG	2	8	1622207	1622214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_021172	TGC	2	6	1622643	1622648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_021172	CCT	2	6	1622667	1622672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_021172	GCC	2	6	1622673	1622678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_021172	T	6	6	1622690	1622695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021172	GGC	2	6	1622756	1622761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_021172	GAT	2	6	1623419	1623424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021172	GCAC	2	8	1623428	1623435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_021172	GAC	2	6	1624178	1624183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021172	CCT	2	6	1626143	1626148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_021172	CGC	2	6	1626158	1626163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_021172	GCG	2	6	1626172	1626177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021172	G	6	6	1626202	1626207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021172	GGT	2	6	1626239	1626244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021172	ACAA	2	8	1627149	1627156	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_021172	CAA	2	6	1627946	1627951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021172	CG	4	8	1627987	1627994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_021172	GA	3	6	1628085	1628090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021172	CGC	2	6	1628151	1628156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_021172	CGG	2	6	1628178	1628183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021172	TCG	2	6	1628709	1628714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021172	TA	3	6	1628715	1628720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021172	TA	3	6	1628729	1628734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021172	CGG	2	6	1628762	1628767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021172	GTT	2	6	1629922	1629927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021172	GGC	2	6	1630020	1630025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021172	CCCA	2	8	1632412	1632419	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3561	NC_021172	GGC	2	6	1632420	1632425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021172	GT	4	8	1632560	1632567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021172	CG	3	6	1633305	1633310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_021172	GTC	2	6	1633379	1633384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021172	GTTG	2	8	1634090	1634097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021172	TG	3	6	1634096	1634101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021172	TCGC	2	8	1634112	1634119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_021172	TA	3	6	1634150	1634155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021172	AGCG	2	8	1634943	1634950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_021172	ATC	2	6	1634954	1634959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021172	CGG	2	6	1634987	1634992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021172	CGG	2	6	1635010	1635015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021172	TCG	2	6	1635569	1635574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021172	TGA	2	6	1635807	1635812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021172	CGC	2	6	1636681	1636686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_021172	TCC	2	6	1636700	1636705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_021172	TA	3	6	1636771	1636776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021172	TGT	2	6	1636777	1636782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021172	CG	3	6	1636788	1636793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_021172	GCC	2	6	1636799	1636804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_021172	T	6	6	1639370	1639375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021172	TAA	2	6	1639402	1639407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021172	AAT	2	6	1639408	1639413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021172	T	6	6	1639426	1639431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021172	AACGC	2	10	1639572	1639581	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3586	NC_021172	CG	3	6	1639612	1639617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_021172	TC	3	6	1639641	1639646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_021172	T	6	6	1639662	1639667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021172	CGC	2	6	1645760	1645765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021172	TTG	2	6	1646552	1646557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021172	GCGG	2	8	1646585	1646592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_021172	GCA	2	6	1646600	1646605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021172	AG	3	6	1646630	1646635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021172	CCG	2	6	1647270	1647275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_021172	TCG	2	6	1647278	1647283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021172	T	6	6	1647325	1647330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021172	GC	3	6	1647388	1647393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_021172	GGC	2	6	1647405	1647410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_021172	CGT	2	6	1647578	1647583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021172	TCG	2	6	1648334	1648339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_021172	CCGG	2	8	1648342	1648349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_021172	AAGA	2	8	1650041	1650048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021172	GC	3	6	1650064	1650069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_021172	CGC	2	6	1650082	1650087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_021172	AT	3	6	1650099	1650104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021172	CCG	2	6	1650134	1650139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_021172	GAAGCG	2	12	1656330	1656341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3608	NC_021172	TGAT	2	8	1656361	1656368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021172	G	6	6	1656388	1656393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021172	G	8	8	1656413	1656420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021172	AGCGA	2	10	1658569	1658578	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3612	NC_021172	CG	3	6	1659201	1659206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_021172	TCC	2	6	1659214	1659219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_021172	ACG	2	6	1660585	1660590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_021172	CCG	2	6	1660616	1660621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_021172	GAC	2	6	1660686	1660691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_021172	CAG	2	6	1661138	1661143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_021172	CGC	2	6	1661146	1661151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_021172	ACG	2	6	1661244	1661249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_021172	TGCGG	2	10	1663301	1663310	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3621	NC_021172	AAT	2	6	1663330	1663335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021172	CAAA	2	8	1665379	1665386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_021172	TAA	2	6	1665413	1665418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021172	CGA	3	9	1665420	1665428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021172	CG	3	6	1665970	1665975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_021172	ATT	2	6	1666911	1666916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021172	ATT	2	6	1666952	1666957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021172	AGG	2	6	1667015	1667020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021172	A	6	6	1667797	1667802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021172	CCT	3	9	1668169	1668177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_021172	CAGT	2	8	1669214	1669221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3632	NC_021172	T	6	6	1669295	1669300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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