MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 8572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021172	GCG	2	6	1378208	1378213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021172	CGT	2	6	1378215	1378220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021172	CGC	2	6	1380385	1380390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_021172	GGC	2	6	1380396	1380401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_021172	CT	3	6	1380402	1380407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_021172	GTGG	2	8	1380418	1380425	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021172	CGG	2	6	1380447	1380452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021172	AAGG	2	8	1381818	1381825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021172	CTG	2	6	1381866	1381871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_021172	GCC	2	6	1381877	1381882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_021172	TCC	2	6	1381895	1381900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_021172	ATA	2	6	1381926	1381931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021172	ACC	2	6	1383532	1383537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_021172	CGA	2	6	1383543	1383548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_021172	AAC	2	6	1383595	1383600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021172	ACG	2	6	1383640	1383645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021172	AAAT	2	8	1385162	1385169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021172	CGC	2	6	1388629	1388634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_021172	ATT	2	6	1388657	1388662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021172	AAG	2	6	1391511	1391516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021172	CGT	2	6	1391533	1391538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_021172	GGT	2	6	1391554	1391559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021172	TTG	2	6	1392238	1392243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021172	GGA	2	6	1392269	1392274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021172	CACG	2	8	1392325	1392332	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_021172	GCG	2	6	1392385	1392390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_021172	TCG	2	6	1392398	1392403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_021172	GTT	2	6	1392462	1392467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021172	CTGCGC	2	12	1392469	1392480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_021172	TG	3	6	1392485	1392490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021172	CA	3	6	1394285	1394290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_021172	CAT	2	6	1394319	1394324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_021172	AGG	2	6	1394386	1394391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021172	AGC	2	6	1394439	1394444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_021172	GCT	2	6	1394462	1394467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_021172	TCG	2	6	1394479	1394484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021172	CAG	2	6	1394530	1394535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021172	ATGAT	2	10	1394569	1394578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021172	CGG	2	6	1396006	1396011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_021172	GAT	2	6	1396748	1396753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021172	CA	3	6	1396769	1396774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_021172	TC	3	6	1396805	1396810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_021172	GA	3	6	1396941	1396946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021172	G	6	6	1398147	1398152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021172	GC	3	6	1398162	1398167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_021172	CCG	2	6	1398968	1398973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_021172	TA	3	6	1399006	1399011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021172	CCG	2	6	1399103	1399108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_021172	ATT	2	6	1399134	1399139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_021172	CGCTG	2	10	1399172	1399181	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3051	NC_021172	ACG	2	6	1401403	1401408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_021172	TC	3	6	1401441	1401446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_021172	CA	3	6	1402913	1402918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_021172	CA	3	6	1402971	1402976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_021172	CTG	2	6	1402983	1402988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_021172	TAA	2	6	1403068	1403073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021172	GCA	2	6	1403105	1403110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_021172	TGC	2	6	1403124	1403129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_021172	TAA	2	6	1403131	1403136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021172	TC	3	6	1407390	1407395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_021172	ATT	2	6	1407408	1407413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021172	TGG	2	6	1407663	1407668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021172	GTTG	2	8	1410718	1410725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021172	CGG	2	6	1410751	1410756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021172	GGCC	2	8	1410836	1410843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_021172	T	6	6	1419554	1419559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021172	GTT	2	6	1419582	1419587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021172	CGT	2	6	1419642	1419647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_021172	GTG	2	6	1419656	1419661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021172	CCGTC	2	10	1419715	1419724	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3071	NC_021172	GT	3	6	1419750	1419755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021172	CCTT	2	8	1420568	1420575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_021172	TCA	2	6	1420627	1420632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021172	GCA	2	6	1420654	1420659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_021172	CAG	2	6	1420718	1420723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021172	CCAAT	2	10	1420743	1420752	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3077	NC_021172	AT	3	6	1422089	1422094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021172	CG	4	8	1422102	1422109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_021172	GCC	2	6	1422198	1422203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_021172	GGC	2	6	1422210	1422215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_021172	GGCC	2	8	1422255	1422262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_021172	GCG	2	6	1422285	1422290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_021172	TC	3	6	1423073	1423078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_021172	CCG	2	6	1423130	1423135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_021172	CGA	2	6	1424194	1424199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_021172	GAG	2	6	1424751	1424756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021172	GGCGT	2	10	1424766	1424775	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3088	NC_021172	GCG	2	6	1424808	1424813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_021172	A	6	6	1426348	1426353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021172	CGG	2	6	1427166	1427171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_021172	TTA	2	6	1427179	1427184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021172	GCCG	2	8	1427207	1427214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_021172	AG	3	6	1427253	1427258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021172	GGC	2	6	1428832	1428837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_021172	GCCG	2	8	1428861	1428868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_021172	CGT	2	6	1428877	1428882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_021172	TCC	2	6	1428883	1428888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_021172	CG	3	6	1428908	1428913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_021172	TCAA	2	8	1430361	1430368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_021172	GTTCCA	2	12	1430387	1430398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021172	GT	3	6	1430533	1430538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021172	CCG	2	6	1430556	1430561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_021172	GCC	2	6	1430565	1430570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_021172	GT	3	6	1430630	1430635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021172	CCG	2	6	1430695	1430700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_021172	GCT	2	6	1430703	1430708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_021172	A	7	7	1432189	1432195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021172	ATA	2	6	1432215	1432220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021172	TGC	2	6	1435185	1435190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021172	GCCT	2	8	1435305	1435312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_021172	ATA	2	6	1436086	1436091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021172	GC	4	8	1440218	1440225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_021172	CG	3	6	1440295	1440300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_021172	GTT	2	6	1440335	1440340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021172	CGC	2	6	1441357	1441362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_021172	CAA	2	6	1442322	1442327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021172	GCTC	2	8	1442335	1442342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_021172	GGC	2	6	1442347	1442352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_021172	CGAT	2	8	1442372	1442379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_021172	GCC	2	6	1442403	1442408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_021172	CGT	2	6	1442409	1442414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_021172	CT	3	6	1442424	1442429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_021172	ATG	2	6	1443562	1443567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021172	CGG	2	6	1445956	1445961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_021172	CCAG	2	8	1447338	1447345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_021172	A	7	7	1447367	1447373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021172	CAA	2	6	1447384	1447389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_021172	GT	3	6	1447406	1447411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021172	A	7	7	1447431	1447437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021172	GCC	2	6	1447745	1447750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_021172	TTG	2	6	1447846	1447851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021172	CGA	2	6	1447857	1447862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021172	AAT	2	6	1448042	1448047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_021172	A	6	6	1448057	1448062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021172	GACTTG	2	12	1448118	1448129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3136	NC_021172	G	6	6	1448129	1448134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_021172	GAC	3	9	1508213	1508221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_021172	GCCG	2	8	1508222	1508229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3265	NC_021172	ACC	2	6	1508238	1508243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3266	NC_021172	GAAT	2	8	1508269	1508276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_021172	CTC	2	6	1508293	1508298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3268	NC_021172	AAG	2	6	1508317	1508322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_021172	GAAC	2	8	1508344	1508351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3270	NC_021172	GAG	2	6	1508399	1508404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_021172	AGG	2	6	1510457	1510462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_021172	GAAG	2	8	1510466	1510473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_021172	GCT	2	6	1510547	1510552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3280	NC_021172	GTC	2	6	1516303	1516308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3282	NC_021172	ACGG	2	8	1520753	1520760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3283	NC_021172	GGC	2	6	1520769	1520774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3286	NC_021172	CGG	2	6	1528166	1528171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3287	NC_021172	CTG	2	6	1528202	1528207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3292	NC_021172	TC	3	6	1529218	1529223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3293	NC_021172	AGCA	2	8	1529226	1529233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3294	NC_021172	TG	3	6	1529605	1529610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3295	NC_021172	AGCA	2	8	1530764	1530771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3296	NC_021172	AAG	2	6	1532609	1532614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3300	NC_021172	GTT	2	6	1534186	1534191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3304	NC_021172	GC	3	6	1534327	1534332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3377	NC_021172	ATACG	2	10	1564018	1564027	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3378	NC_021172	GAC	2	6	1564058	1564063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3380	NC_021172	CGC	2	6	1565703	1565708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3383	NC_021172	CCTG	2	8	1575669	1575676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3384	NC_021172	GC	3	6	1575689	1575694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3385	NC_021172	CCGT	2	8	1575739	1575746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3386	NC_021172	GAA	2	6	1577197	1577202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_021172	AGCG	2	8	1577208	1577215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3388	NC_021172	CGC	2	6	1577235	1577240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3389	NC_021172	TCA	2	6	1577242	1577247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3390	NC_021172	TCT	2	6	1578574	1578579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3391	NC_021172	TAT	2	6	1578973	1578978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3392	NC_021172	TCTTT	2	10	1579101	1579110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3393	NC_021172	GTG	2	6	1579221	1579226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3394	NC_021172	AC	3	6	1579233	1579238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3395	NC_021172	GAA	2	6	1579304	1579309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3396	NC_021172	CGA	2	6	1581243	1581248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3397	NC_021172	GCG	2	6	1581282	1581287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3398	NC_021172	CAAT	2	8	1581306	1581313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3399	NC_021172	TGGCGA	2	12	1581328	1581339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3400	NC_021172	CGC	2	6	1581353	1581358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3401	NC_021172	GGC	2	6	1581368	1581373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3402	NC_021172	ATC	2	6	1581387	1581392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3416	NC_021172	CG	3	6	1591949	1591954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3417	NC_021172	GTA	2	6	1592457	1592462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3429	NC_021172	GCAGC	2	10	1600064	1600073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3432	NC_021172	CCGT	2	8	1600284	1600291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3433	NC_021172	GAAA	2	8	1600300	1600307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_021172	GTTG	2	8	1601987	1601994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3490	NC_021172	GC	3	6	1610119	1610124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3494	NC_021172	GAC	2	6	1610673	1610678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_021172	CG	3	6	1610684	1610689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3496	NC_021172	GGC	2	6	1610730	1610735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_021172	ATGA	2	8	1610749	1610756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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