MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 8572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021172	CG	3	6	724633	724638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_021172	CG	3	6	724697	724702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_021172	GAC	2	6	726151	726156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021172	GTTGAA	2	12	726188	726199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021172	GCAG	2	8	726229	726236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_021172	GCT	2	6	726243	726248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021172	CCCG	2	8	726286	726293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1508	NC_021172	CAC	2	6	726396	726401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_021172	TATT	2	8	726593	726600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021172	ATG	2	6	727229	727234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021172	GCC	2	6	727348	727353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_021172	ATC	2	6	727700	727705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021172	TCG	2	6	727723	727728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_021172	AAG	2	6	727766	727771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021172	GCT	2	6	727802	727807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_021172	GGCAGC	2	12	730148	730159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021172	GC	3	6	730657	730662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_021172	ACT	2	6	730680	730685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_021172	CGAT	2	8	730758	730765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021172	TGG	2	6	730821	730826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021172	CTCC	2	8	731767	731774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1522	NC_021172	GTTG	2	8	733570	733577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021172	GCG	2	6	734033	734038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021172	CCAG	2	8	734076	734083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_021172	T	6	6	734084	734089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021172	CG	3	6	734131	734136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_021172	CG	4	8	734178	734185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_021172	TTG	2	6	734194	734199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021172	CTAC	2	8	734248	734255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_021172	TC	3	6	734272	734277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_021172	TGC	2	6	734307	734312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_021172	CGTC	2	8	734319	734326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_021172	ATG	2	6	734334	734339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021172	ATT	2	6	734356	734361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021172	CAG	3	9	734411	734419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021172	TCA	2	6	734443	734448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_021172	GCATG	2	10	734476	734485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1538	NC_021172	GCTC	2	8	734581	734588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_021172	TGCG	2	8	734598	734605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_021172	GCT	2	6	734680	734685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_021172	GGA	2	6	734760	734765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021172	TTGG	2	8	734968	734975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021172	CCCG	2	8	734987	734994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1544	NC_021172	TAT	2	6	735333	735338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021172	AGC	2	6	735343	735348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021172	GGC	2	6	735377	735382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_021172	CAG	2	6	735453	735458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_021172	GGT	2	6	735473	735478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021172	CCG	2	6	736205	736210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_021172	CATC	2	8	736669	736676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_021172	TCA	2	6	736746	736751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021172	CAG	2	6	736805	736810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021172	CGT	2	6	736917	736922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021172	GA	3	6	736975	736980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021172	TCGA	2	8	736996	737003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_021172	TGG	2	6	737080	737085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021172	AGT	2	6	737164	737169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_021172	CGC	2	6	737858	737863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_021172	GCT	2	6	740629	740634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021172	TCG	2	6	751407	751412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_021172	GATC	2	8	751416	751423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_021172	CGG	2	6	751492	751497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021172	GGCT	2	8	751505	751512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_021172	CTT	2	6	751519	751524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021172	TC	3	6	751554	751559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1570	NC_021172	GA	3	6	751790	751795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_021172	GTT	2	6	754040	754045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_021172	GAT	2	6	757641	757646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021172	CTTGG	2	10	757647	757656	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1602	NC_021172	GC	3	6	761886	761891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_021172	CG	3	6	761892	761897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_021172	ACA	2	6	761906	761911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021172	CG	3	6	761937	761942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1608	NC_021172	TGC	2	6	762066	762071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1610	NC_021172	TGCC	2	8	765615	765622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1624	NC_021172	GA	3	6	767100	767105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021172	A	7	7	767134	767140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021172	GGA	2	6	767146	767151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021172	GCA	2	6	767267	767272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021172	CGCA	2	8	767315	767322	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_021172	GGCGCA	2	12	768914	768925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1907	NC_021172	GCG	2	6	821851	821856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_021172	T	6	6	822457	822462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1909	NC_021172	AGG	2	6	822515	822520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_021172	A	7	7	822569	822575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_021172	TGC	2	6	822588	822593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1912	NC_021172	CAT	2	6	824004	824009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1913	NC_021172	CCA	2	6	824276	824281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1914	NC_021172	CTG	2	6	824284	824289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1916	NC_021172	CCG	2	6	824726	824731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1917	NC_021172	AGT	2	6	824766	824771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1919	NC_021172	AC	4	8	824788	824795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1920	NC_021172	AGC	2	6	824828	824833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1922	NC_021172	CTG	2	6	825251	825256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_021172	GCTG	2	8	825331	825338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1924	NC_021172	CAGAGT	2	12	825366	825377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1925	NC_021172	AT	3	6	825425	825430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1926	NC_021172	ACG	2	6	825474	825479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1927	NC_021172	CTT	2	6	825507	825512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1928	NC_021172	AGGC	2	8	825545	825552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1929	NC_021172	CGC	2	6	826820	826825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1930	NC_021172	CAT	2	6	826899	826904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1932	NC_021172	GAG	2	6	827994	827999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_021172	A	6	6	828761	828766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_021172	CGA	2	6	828816	828821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1935	NC_021172	CGC	2	6	828894	828899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1936	NC_021172	ATGTG	2	10	828915	828924	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_021172	GTCTC	2	10	831411	831420	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1938	NC_021172	ACG	2	6	831427	831432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1940	NC_021172	CTG	2	6	831521	831526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_021172	CGA	2	6	832114	832119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_021172	GCG	2	6	832225	832230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_021172	G	6	6	832252	832257	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_021172	ATC	2	6	840878	840883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1946	NC_021172	GCT	2	6	840905	840910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1947	NC_021172	AGA	2	6	840913	840918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_021172	GTC	2	6	843685	843690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1949	NC_021172	GAG	2	6	843811	843816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_021172	GTG	2	6	843830	843835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_021172	AGCG	2	8	843842	843849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1952	NC_021172	GATG	2	8	843867	843874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_021172	CGA	2	6	843887	843892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1954	NC_021172	AGGCG	2	10	846363	846372	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1955	NC_021172	CCT	2	6	847053	847058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1956	NC_021172	TG	3	6	847062	847067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_021172	CGT	2	6	847069	847074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1958	NC_021172	CT	3	6	847075	847080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1959	NC_021172	GC	3	6	847177	847182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1960	NC_021172	GC	3	6	847214	847219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1961	NC_021172	CGC	2	6	847226	847231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1964	NC_021172	A	6	6	848232	848237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_021172	CGAT	2	8	848258	848265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1967	NC_021172	GGC	2	6	849803	849808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1968	NC_021172	GCC	2	6	849830	849835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1969	NC_021172	CGG	2	6	849848	849853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1972	NC_021172	CTTG	2	8	853177	853184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1973	NC_021172	GGC	2	6	853226	853231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1974	NC_021172	ACG	2	6	853233	853238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1979	NC_021172	CG	3	6	853314	853319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1980	NC_021172	AAG	2	6	853340	853345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1983	NC_021172	GTT	2	6	853907	853912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1986	NC_021172	GC	3	6	857976	857981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1988	NC_021172	GAC	2	6	858050	858055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1992	NC_021172	TCCC	2	8	859045	859052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1993	NC_021172	ACA	2	6	859065	859070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1994	NC_021172	CTC	2	6	859865	859870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1995	NC_021172	GTG	2	6	859898	859903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1996	NC_021172	TCGC	2	8	859943	859950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1997	NC_021172	AAG	2	6	859964	859969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_021172	ATTA	2	8	860013	860020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_021172	GAC	2	6	860155	860160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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