MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 8572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021172	TC	3	6	3134301	3134306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7002	NC_021172	CCG	2	6	3134318	3134323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_021172	GCGG	2	8	3134457	3134464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7004	NC_021172	GCC	2	6	3134508	3134513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_021172	TTCA	2	8	3134540	3134547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7006	NC_021172	CGCAT	2	10	3134944	3134953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7007	NC_021172	CG	3	6	3134978	3134983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_021172	GCTC	2	8	3135039	3135046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_021172	GTG	2	6	3136970	3136975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_021172	CG	3	6	3136977	3136982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_021172	TA	3	6	3136984	3136989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021172	GCATTG	2	12	3139104	3139115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7013	NC_021172	GCA	2	6	3139152	3139157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_021172	A	6	6	3139162	3139167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021172	AACG	2	8	3140954	3140961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7016	NC_021172	TCG	2	6	3141621	3141626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_021172	TCT	3	9	3145494	3145502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_021172	G	6	6	3146082	3146087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_021172	TCG	2	6	3146107	3146112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_021172	GAC	2	6	3146166	3146171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_021172	CCG	2	6	3146230	3146235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_021172	ATA	2	6	3146303	3146308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_021172	CGA	2	6	3146357	3146362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_021172	GCG	2	6	3146571	3146576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_021172	TGCC	2	8	3146625	3146632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_021172	CG	3	6	3147194	3147199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_021172	ATG	3	9	3147243	3147251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_021172	TC	3	6	3147290	3147295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7029	NC_021172	TCC	2	6	3147311	3147316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_021172	GTTC	2	8	3147335	3147342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_021172	TCA	2	6	3147485	3147490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_021172	CG	3	6	3147557	3147562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_021172	CGA	2	6	3147629	3147634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_021172	GGCT	2	8	3147662	3147669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7035	NC_021172	GAC	2	6	3147753	3147758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_021172	CGT	2	6	3147790	3147795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_021172	CGT	2	6	3147830	3147835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_021172	GTG	2	6	3147847	3147852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_021172	GCA	2	6	3147908	3147913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_021172	TTC	2	6	3147946	3147951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_021172	TCG	3	9	3147979	3147987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_021172	CG	3	6	3147997	3148002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_021172	CGT	2	6	3148252	3148257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_021172	TTG	2	6	3148273	3148278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_021172	G	6	6	3148346	3148351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021172	G	6	6	3148405	3148410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_021172	TCG	2	6	3148470	3148475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_021172	TTG	2	6	3148550	3148555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_021172	TCG	2	6	3148581	3148586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_021172	CAAT	2	8	3148629	3148636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7051	NC_021172	ATC	2	6	3148673	3148678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_021172	ACG	2	6	3148691	3148696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_021172	GCA	2	6	3148750	3148755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_021172	GCAT	2	8	3148764	3148771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7055	NC_021172	GGC	2	6	3148807	3148812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_021172	TCG	2	6	3148839	3148844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_021172	GCAA	2	8	3148856	3148863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7058	NC_021172	TGC	2	6	3148902	3148907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_021172	CGG	2	6	3148957	3148962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_021172	ACT	2	6	3149024	3149029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_021172	CGC	2	6	3149068	3149073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_021172	CGT	2	6	3149118	3149123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_021172	GCG	2	6	3149126	3149131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_021172	TGA	2	6	3150409	3150414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_021172	CGA	2	6	3150420	3150425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_021172	TCG	2	6	3150769	3150774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_021172	AT	3	6	3150800	3150805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_021172	TG	3	6	3150825	3150830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021172	A	7	7	3150836	3150842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021172	GCTC	2	8	3150875	3150882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7071	NC_021172	AGCG	2	8	3150885	3150892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7072	NC_021172	GT	3	6	3150907	3150912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_021172	CAA	2	6	3151421	3151426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_021172	GGCGT	2	10	3151524	3151533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7075	NC_021172	TGA	2	6	3151547	3151552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_021172	GCC	2	6	3151584	3151589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_021172	AGA	3	9	3151641	3151649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_021172	TGAA	2	8	3151675	3151682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_021172	TGC	2	6	3151739	3151744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_021172	TCC	2	6	3153113	3153118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7081	NC_021172	T	7	7	3156613	3156619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_021172	T	8	8	3158868	3158875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_021172	CGC	2	6	3158878	3158883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_021172	TGT	2	6	3158887	3158892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_021172	GCT	2	6	3164392	3164397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_021172	AAG	2	6	3164412	3164417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_021172	TGC	2	6	3164429	3164434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_021172	TCGA	2	8	3167666	3167673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7089	NC_021172	CGC	2	6	3167685	3167690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7090	NC_021172	GCT	2	6	3167729	3167734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_021172	TGCT	2	8	3167764	3167771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7092	NC_021172	TGA	2	6	3167812	3167817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_021172	GCG	2	6	3167941	3167946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_021172	AAT	2	6	3167988	3167993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021172	ATG	2	6	3168028	3168033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021172	T	6	6	3168034	3168039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021172	TTC	2	6	3168069	3168074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_021172	ATC	2	6	3168148	3168153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_021172	TGAT	2	8	3168166	3168173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_021172	TGT	2	6	3168572	3168577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_021172	TCGGT	2	10	3168722	3168731	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7102	NC_021172	ATC	2	6	3168736	3168741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_021172	TGG	2	6	3168744	3168749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_021172	TTC	2	6	3171859	3171864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_021172	ATTT	2	8	3171874	3171881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_021172	T	6	6	3173028	3173033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_021172	TCA	2	6	3173081	3173086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_021172	GCT	2	6	3173130	3173135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_021172	ATC	2	6	3173177	3173182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_021172	GTC	2	6	3173193	3173198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_021172	TAT	2	6	3179387	3179392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_021172	CCG	2	6	3179395	3179400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_021172	TTA	2	6	3179448	3179453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021172	ATT	2	6	3179457	3179462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_021172	AC	3	6	3179487	3179492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_021172	CCG	2	6	3179514	3179519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_021172	GCCGC	2	10	3179572	3179581	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7118	NC_021172	GCTT	2	8	3179594	3179601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7119	NC_021172	TC	3	6	3179621	3179626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7120	NC_021172	TCGA	2	8	3179630	3179637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7121	NC_021172	GGCG	2	8	3180198	3180205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7122	NC_021172	CTA	2	6	3180208	3180213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_021172	AG	3	6	3187779	3187784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021172	CCG	2	6	3187853	3187858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_021172	CAAT	2	8	3188989	3188996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_021172	TAC	2	6	3189022	3189027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_021172	CCG	2	6	3189056	3189061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_021172	TCT	2	6	3189087	3189092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_021172	GCC	2	6	3198274	3198279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7130	NC_021172	TGC	2	6	3198323	3198328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7132	NC_021172	CGC	2	6	3199364	3199369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7133	NC_021172	ACT	2	6	3199376	3199381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_021172	TGC	2	6	3199401	3199406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7139	NC_021172	CGGC	2	8	3204056	3204063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7142	NC_021172	GCCC	2	8	3211760	3211767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7143	NC_021172	T	6	6	3212505	3212510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7255	NC_021172	TTCGT	2	10	3265796	3265805	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7256	NC_021172	TTC	2	6	3265837	3265842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7257	NC_021172	CGT	2	6	3267557	3267562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7258	NC_021172	CAAT	2	8	3267604	3267611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7259	NC_021172	CGAG	2	8	3269340	3269347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7260	NC_021172	CAT	2	6	3269387	3269392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7261	NC_021172	GC	3	6	3269395	3269400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7262	NC_021172	AGC	2	6	3269449	3269454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7263	NC_021172	GC	3	6	3269461	3269466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7264	NC_021172	GA	3	6	3269509	3269514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7267	NC_021172	A	6	6	3272600	3272605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7282	NC_021172	GCCG	2	8	3280494	3280501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7492	NC_021172	A	6	6	3374825	3374830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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