MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 8572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021172	TAGC	2	8	2420149	2420156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_021172	GAG	2	6	2421801	2421806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_021172	ATTC	2	8	2421846	2421853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_021172	CGG	2	6	2421897	2421902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_021172	TC	3	6	2422314	2422319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_021172	T	6	6	2422321	2422326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021172	GCA	2	6	2422426	2422431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_021172	CG	3	6	2422464	2422469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_021172	GCC	2	6	2422473	2422478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_021172	TCT	2	6	2423332	2423337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_021172	CTG	2	6	2423351	2423356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_021172	ACA	2	6	2423394	2423399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_021172	TCC	2	6	2423400	2423405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_021172	CGG	2	6	2423465	2423470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_021172	GAA	2	6	2423478	2423483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021172	TCC	2	6	2423742	2423747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_021172	A	6	6	2423805	2423810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021172	TCGT	2	8	2424475	2424482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_021172	GC	3	6	2424534	2424539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_021172	GCT	2	6	2424553	2424558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_021172	TGG	2	6	2424584	2424589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_021172	TC	3	6	2424611	2424616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_021172	CATT	2	8	2424657	2424664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_021172	CA	3	6	2426667	2426672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_021172	GC	3	6	2426677	2426682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_021172	CAA	2	6	2426692	2426697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_021172	CAA	2	6	2426707	2426712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_021172	CGA	3	9	2426723	2426731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_021172	CGT	2	6	2426745	2426750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_021172	GCCG	2	8	2426805	2426812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_021172	GCA	2	6	2426946	2426951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_021172	TGT	2	6	2426961	2426966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021172	GGC	2	6	2428055	2428060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021172	CAA	2	6	2428077	2428082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_021172	GAT	2	6	2428134	2428139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021172	AGC	2	6	2428153	2428158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_021172	ATG	2	6	2428180	2428185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021172	AT	3	6	2430658	2430663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021172	CGAT	2	8	2430682	2430689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_021172	GAT	2	6	2430714	2430719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021172	GTT	2	6	2430739	2430744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021172	AAC	2	6	2430782	2430787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_021172	AGAT	2	8	2430841	2430848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021172	AGC	2	6	2430869	2430874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021172	CAA	2	6	2431706	2431711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_021172	TTC	2	6	2431753	2431758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_021172	CTC	2	6	2431821	2431826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_021172	GGAG	2	8	2432054	2432061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021172	CTC	2	6	2432760	2432765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_021172	TCA	2	6	2432789	2432794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_021172	CGG	2	6	2432854	2432859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_021172	TCA	2	6	2432901	2432906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_021172	TCG	2	6	2432952	2432957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_021172	CGG	2	6	2432965	2432970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_021172	TTC	2	6	2433042	2433047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_021172	TGG	3	9	2433063	2433071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021172	CGA	2	6	2433146	2433151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_021172	GCTG	2	8	2433202	2433209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_021172	AGG	2	6	2434029	2434034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021172	GTG	2	6	2434473	2434478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_021172	CGGTC	2	10	2434538	2434547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_021172	CGG	2	6	2434553	2434558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_021172	AGA	2	6	2434662	2434667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021172	ATT	2	6	2434672	2434677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021172	TCT	3	9	2434681	2434689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_021172	TC	3	6	2440368	2440373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_021172	CCG	2	6	2440403	2440408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_021172	CGG	2	6	2440434	2440439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_021172	ACA	2	6	2440441	2440446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_021172	CCG	2	6	2440476	2440481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_021172	GTT	2	6	2440849	2440854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_021172	CCT	2	6	2441199	2441204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_021172	TAGG	2	8	2443126	2443133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_021172	GCT	2	6	2447319	2447324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_021172	GAAT	2	8	2447347	2447354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021172	GCC	2	6	2447359	2447364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_021172	TCG	2	6	2447412	2447417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_021172	GATCA	2	10	2447422	2447431	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5579	NC_021172	GATG	2	8	2447459	2447466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021172	GACA	2	8	2447496	2447503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_021172	CGG	2	6	2447563	2447568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_021172	TGC	2	6	2450309	2450314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_021172	CTG	2	6	2450350	2450355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_021172	CGC	2	6	2450371	2450376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_021172	TAC	2	6	2450406	2450411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_021172	GAT	2	6	2450423	2450428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021172	CGT	2	6	2450453	2450458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_021172	AAAG	2	8	2450461	2450468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021172	CAT	2	6	2450474	2450479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_021172	TGTGAG	2	12	2450502	2450513	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021172	AGT	2	6	2450744	2450749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021172	CAG	2	6	2450753	2450758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_021172	GCC	2	6	2451264	2451269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_021172	ATTG	2	8	2451284	2451291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021172	GCC	2	6	2451304	2451309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_021172	CAG	2	6	2451331	2451336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_021172	ATT	2	6	2452571	2452576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021172	CG	3	6	2452631	2452636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_021172	GCCG	2	8	2452700	2452707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_021172	GC	3	6	2452713	2452718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_021172	GA	3	6	2452736	2452741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021172	A	8	8	2453690	2453697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021172	TGAA	2	8	2453721	2453728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021172	GTT	2	6	2455588	2455593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021172	T	7	7	2458887	2458893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021172	GCC	2	6	2458915	2458920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_021172	GCA	2	6	2458947	2458952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_021172	CGT	2	6	2458986	2458991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_021172	GAC	2	6	2459108	2459113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_021172	T	6	6	2459133	2459138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021172	CGC	2	6	2460748	2460753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_021172	CGA	3	9	2460757	2460765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_021172	CAA	2	6	2460814	2460819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_021172	GGA	2	6	2461057	2461062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021172	CTG	2	6	2461082	2461087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_021172	TAA	2	6	2461139	2461144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021172	CTT	2	6	2461151	2461156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_021172	GGA	2	6	2461192	2461197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021172	TCA	2	6	2461790	2461795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_021172	C	6	6	2461831	2461836	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5621	NC_021172	AC	3	6	2461869	2461874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_021172	CAA	2	6	2462642	2462647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_021172	CTC	2	6	2462650	2462655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_021172	TCG	2	6	2462663	2462668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_021172	ACG	2	6	2463574	2463579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_021172	GCGT	2	8	2463593	2463600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5627	NC_021172	GCT	2	6	2463622	2463627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_021172	CGC	2	6	2463665	2463670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_021172	AC	3	6	2463679	2463684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_021172	AAG	2	6	2463708	2463713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_021172	TGC	2	6	2464848	2464853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_021172	G	6	6	2464898	2464903	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_021172	GCC	2	6	2475381	2475386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5746	NC_021172	T	6	6	2524544	2524549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5747	NC_021172	TCGA	2	8	2524613	2524620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5749	NC_021172	TCGAG	2	10	2527115	2527124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5750	NC_021172	AT	3	6	2527130	2527135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5751	NC_021172	AACTG	2	10	2531047	2531056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5752	NC_021172	TC	3	6	2532552	2532557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5753	NC_021172	CAA	2	6	2532563	2532568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5755	NC_021172	GCC	2	6	2534199	2534204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5756	NC_021172	GGC	2	6	2534211	2534216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5757	NC_021172	CCTTG	2	10	2534222	2534231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5758	NC_021172	AG	3	6	2534256	2534261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5759	NC_021172	CTCGT	2	10	2534386	2534395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5760	NC_021172	CAC	2	6	2534423	2534428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5762	NC_021172	CAA	3	9	2541580	2541588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5763	NC_021172	ACT	2	6	2541648	2541653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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