MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 DNA

Total Repeats: 4253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020555	GTTT	2	8	1333	1340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020555	TTTAA	2	10	1363	1372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020555	GT	3	6	1378	1383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020555	ATT	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020555	GTAGT	2	10	1410	1419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020555	ATG	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020555	T	6	6	8559	8564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020555	AAT	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020555	T	6	6	8572	8577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020555	GTT	2	6	10049	10054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020555	GAG	2	6	10076	10081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020555	TG	3	6	10104	10109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020555	ATAA	2	8	10119	10126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020555	AAG	2	6	10180	10185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020555	TCT	2	6	10439	10444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020555	CA	3	6	10445	10450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020555	TTC	2	6	10456	10461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020555	ATT	2	6	10470	10475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020555	AGG	2	6	17105	17110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020555	GTG	2	6	21370	21375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020555	ACC	2	6	21393	21398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020555	A	6	6	21451	21456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020555	T	6	6	21540	21545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020555	TAG	2	6	21566	21571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020555	TTG	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020555	T	6	6	21677	21682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020555	TA	3	6	21685	21690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020555	ATT	2	6	21725	21730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020555	AAG	2	6	22010	22015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020555	A	6	6	22522	22527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020555	GT	3	6	22533	22538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020555	CTC	2	6	22560	22565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020555	CGA	2	6	22570	22575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020555	GAA	2	6	22581	22586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020555	GTT	2	6	22631	22636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020555	T	8	8	22635	22642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020555	GTT	2	6	22646	22651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020555	TCAGAT	2	12	23431	23442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020555	CA	3	6	23597	23602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020555	T	6	6	23612	23617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020555	TCT	2	6	23622	23627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020555	CT	3	6	23626	23631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020555	TAC	2	6	23746	23751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020555	CAA	2	6	25070	25075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020555	AGCAT	2	10	29278	29287	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020555	TGT	2	6	29330	29335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020555	A	6	6	29394	29399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020555	TCAAA	2	10	29433	29442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020555	ATTTG	2	10	32660	32669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020555	TCAA	2	8	32711	32718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020555	TA	3	6	34256	34261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020555	TACAA	2	10	34354	34363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020555	A	6	6	36242	36247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020555	TCC	2	6	39163	39168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_020555	TTA	2	6	41396	41401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020555	ACAA	2	8	41407	41414	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020555	TTA	2	6	41418	41423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020555	A	6	6	41427	41432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020555	TG	3	6	41436	41441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020555	TAAA	2	8	41465	41472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020555	TAA	2	6	41519	41524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020555	A	6	6	41523	41528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020555	TGT	2	6	47102	47107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020555	GT	3	6	47106	47111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020555	TAT	2	6	47235	47240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020555	T	6	6	47256	47261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020555	TA	3	6	47268	47273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020555	CA	3	6	47302	47307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020555	TGG	2	6	48539	48544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020555	GTTG	2	8	48594	48601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020555	TTA	2	6	48624	48629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020555	GAAT	2	8	50380	50387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020555	GAAT	2	8	55378	55385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020555	ATTTG	2	10	55390	55399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020555	TAAAA	2	10	55426	55435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020555	T	6	6	55464	55469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020555	A	6	6	55472	55477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020555	A	7	7	55559	55565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020555	GTT	2	6	55861	55866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020555	CTTGT	2	10	58614	58623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020555	TG	3	6	58640	58645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020555	TAT	2	6	58655	58660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020555	TCAC	2	8	58669	58676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020555	AAGATT	2	12	58696	58707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020555	T	7	7	58713	58719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020555	TTGCT	2	10	58741	58750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020555	AG	3	6	58858	58863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020555	T	6	6	60257	60262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020555	A	6	6	60274	60279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020555	TGAA	2	8	61375	61382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020555	AAAT	2	8	63311	63318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020555	GT	3	6	72210	72215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020555	A	6	6	75378	75383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020555	T	6	6	75401	75406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020555	CTT	2	6	75408	75413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020555	ACA	2	6	77898	77903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020555	GT	3	6	77922	77927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020555	TTTA	2	8	79129	79136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020555	TTTTGC	2	12	79145	79156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020555	T	6	6	80234	80239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020555	CTTA	2	8	82081	82088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020555	TTG	2	6	85013	85018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020555	T	6	6	85596	85601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020555	GA	3	6	85620	85625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020555	TTGGA	2	10	89496	89505	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020555	GA	4	8	89529	89536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020555	GAATCT	2	12	90208	90219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020555	GTTT	2	8	90268	90275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020555	AAT	2	6	90825	90830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020555	ATG	2	6	92635	92640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020555	ATTT	2	8	92643	92650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020555	T	6	6	92721	92726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020555	AAT	2	6	95748	95753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020555	AAG	2	6	95762	95767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020555	GCT	2	6	95810	95815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020555	TA	3	6	96481	96486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020555	T	7	7	96525	96531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020555	AT	4	8	97269	97276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020555	TAT	3	9	97283	97291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020555	TAA	2	6	98003	98008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020555	TA	3	6	98041	98046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020555	TGCAA	2	10	98054	98063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020555	GTT	2	6	98154	98159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020555	CA	3	6	98227	98232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020555	A	7	7	98232	98238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020555	A	6	6	98241	98246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020555	ACA	2	6	102302	102307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020555	CAA	2	6	102581	102586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020555	CTA	2	6	102598	102603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020555	GAT	2	6	102644	102649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020555	TG	3	6	102968	102973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020555	ATAG	2	8	103069	103076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020555	TCAC	2	8	103128	103135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020555	A	6	6	104112	104117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020555	AGAT	2	8	109015	109022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020555	TGA	2	6	109046	109051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020555	TG	3	6	110768	110773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020555	CTTTTA	2	12	110774	110785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020555	CA	3	6	110815	110820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_020555	GGA	2	6	110880	110885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020555	T	7	7	112818	112824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020555	T	6	6	116051	116056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020555	TTA	2	6	116087	116092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020555	AAG	2	6	116125	116130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020555	CAAT	2	8	119552	119559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020555	GTG	2	6	119599	119604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020555	AGT	2	6	119629	119634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020555	CCG	2	6	119640	119645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_020555	A	6	6	119691	119696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020555	GCTTT	2	10	119708	119717	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_020555	T	6	6	119715	119720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020555	T	6	6	119751	119756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020555	GGT	2	6	119764	119769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020555	AGT	2	6	119779	119784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020555	TTC	2	6	119845	119850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_020555	TTG	2	6	119893	119898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_020555	T	6	6	121906	121911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_020555	A	6	6	125755	125760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020555	ATTT	2	8	125778	125785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020555	GGT	2	6	125814	125819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020555	T	6	6	125825	125830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020555	ATAC	2	8	125841	125848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_020555	TG	3	6	125927	125932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020555	AC	3	6	128011	128016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_020555	ACA	2	6	132525	132530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_020555	T	6	6	134724	134729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020555	AAC	2	6	138163	138168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_020555	T	6	6	138218	138223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_020555	A	7	7	142970	142976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_020555	A	6	6	143019	143024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_020555	AATC	2	8	152623	152630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
290	NC_020555	AAC	2	6	152642	152647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_020555	GA	3	6	153148	153153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_020555	TCCC	2	8	153406	153413	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
304	NC_020555	TTGAA	2	10	153525	153534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_020555	ATT	2	6	154570	154575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_020555	TA	3	6	154613	154618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_020555	T	6	6	214847	214852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_020555	AT	3	6	214857	214862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_020555	T	7	7	214887	214893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_020555	AAAC	2	8	214928	214935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
434	NC_020555	ACAAT	2	10	214943	214952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_020555	CAAA	2	8	214967	214974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
436	NC_020555	AGG	3	9	216400	216408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_020555	ATG	2	6	216713	216718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_020555	ATG	2	6	216742	216747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_020555	AATTT	2	10	216768	216777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_020555	AGG	2	6	218744	218749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
442	NC_020555	T	6	6	219918	219923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_020555	TAT	2	6	219985	219990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_020555	TG	3	6	220089	220094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
447	NC_020555	T	6	6	220100	220105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_020555	A	6	6	221339	221344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_020555	A	6	6	221365	221370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_020555	A	6	6	221376	221381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020555	AAT	2	6	221393	221398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_020555	T	6	6	221414	221419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_020555	AT	4	8	221425	221432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_020555	AAG	2	6	223527	223532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_020555	AGT	2	6	224742	224747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_020555	TTG	2	6	225408	225413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_020555	CAA	2	6	225470	225475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_020555	TTA	2	6	225543	225548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_020555	TA	3	6	225643	225648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_020555	ATG	2	6	225963	225968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_020555	CTA	2	6	226738	226743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_020555	ATT	2	6	226746	226751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_020555	AG	3	6	226805	226810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_020555	TAC	2	6	227316	227321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_020555	TTCT	2	8	228119	228126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_020555	ATC	2	6	228233	228238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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