MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 9999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019964	CGG	2	6	290171	290176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_019964	GTA	2	6	290207	290212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019964	CAG	2	6	291033	291038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_019964	TCG	2	6	292475	292480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_019964	CCA	2	6	292484	292489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_019964	CCGT	2	8	292560	292567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_019964	GAGAC	2	10	292618	292627	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_019964	TGG	2	6	292641	292646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019964	CGG	2	6	292687	292692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019964	GGGT	2	8	293268	293275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019964	GGT	2	6	295603	295608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019964	ATC	2	6	295661	295666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_019964	TA	3	6	296010	296015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019964	TCAG	2	8	296085	296092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_019964	TA	3	6	296097	296102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019964	ATT	2	6	297274	297279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019964	ACTAT	2	10	297281	297290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_019964	AT	3	6	297321	297326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019964	TCCAT	2	10	297345	297354	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_019964	GTT	2	6	297388	297393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019964	TGG	2	6	298117	298122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019964	TTC	2	6	298201	298206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_019964	TTC	2	6	298224	298229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019964	CTTC	2	8	298251	298258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_019964	TGC	2	6	298299	298304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019964	CGC	2	6	298353	298358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_019964	GTG	2	6	298381	298386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019964	TGG	2	6	298442	298447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019964	AG	3	6	298484	298489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019964	GCTC	2	8	300023	300030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_019964	GGCG	2	8	300039	300046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_019964	TC	3	6	300047	300052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_019964	CGG	2	6	300081	300086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019964	TGCG	2	8	300094	300101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_019964	TTC	2	6	300145	300150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_019964	ACT	2	6	300188	300193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019964	CTACC	2	10	300237	300246	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1038	NC_019964	TAGT	2	8	301965	301972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019964	A	6	6	301987	301992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019964	TCT	2	6	302939	302944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_019964	CCT	2	6	302984	302989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_019964	TATC	2	8	303676	303683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_019964	ACC	2	6	303768	303773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_019964	CGT	2	6	303781	303786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_019964	CCT	2	6	303791	303796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_019964	CGA	2	6	303800	303805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019964	CGAT	2	8	304084	304091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_019964	TTCG	2	8	307217	307224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_019964	TCG	2	6	307242	307247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_019964	TGG	2	6	307297	307302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019964	GGA	2	6	307306	307311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019964	TCACA	2	10	307782	307791	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1053	NC_019964	ATA	2	6	307794	307799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019964	CCG	2	6	307927	307932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_019964	CGG	2	6	307937	307942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_019964	CTG	2	6	308787	308792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019964	TCG	2	6	308793	308798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_019964	ACGAA	2	10	309159	309168	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_019964	GGGA	2	8	309181	309188	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019964	CG	3	6	309240	309245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_019964	TCG	2	6	310194	310199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_019964	GGTG	2	8	310200	310207	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019964	GTC	2	6	310221	310226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019964	ACCGGA	2	12	311038	311049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_019964	GGT	2	6	311058	311063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019964	CTG	2	6	311083	311088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_019964	GTTCG	2	10	311093	311102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_019964	CGG	2	6	311105	311110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019964	ACG	2	6	312524	312529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_019964	CCCA	2	8	312579	312586	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1071	NC_019964	GTC	2	6	313700	313705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_019964	GTG	2	6	313755	313760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019964	CGA	2	6	313811	313816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019964	TGC	2	6	313828	313833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_019964	CCGGA	2	10	313887	313896	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1076	NC_019964	CGT	2	6	313901	313906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019964	CGG	2	6	313934	313939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019964	TCG	2	6	314636	314641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_019964	ACG	2	6	314644	314649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019964	AGTG	2	8	314784	314791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019964	ACG	2	6	314805	314810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019964	TGA	2	6	316002	316007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019964	TGG	2	6	316041	316046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019964	GTG	2	6	316058	316063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019964	AG	4	8	316079	316086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019964	TCGCG	2	10	316529	316538	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_019964	GGC	2	6	316548	316553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_019964	GCT	2	6	316597	316602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019964	GCG	2	6	316610	316615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_019964	CGG	2	6	316626	316631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_019964	ACC	2	6	316645	316650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_019964	GTG	2	6	316663	316668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019964	ACT	2	6	316673	316678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019964	CGC	2	6	317362	317367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_019964	GTC	2	6	317375	317380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_019964	GCCA	2	8	317418	317425	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_019964	TTC	2	6	317464	317469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_019964	GA	3	6	317610	317615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019964	TCC	2	6	318025	318030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_019964	GCG	2	6	318118	318123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_019964	ACG	2	6	318150	318155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019964	GAT	2	6	318221	318226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019964	TAA	2	6	318361	318366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019964	TGAG	2	8	318379	318386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019964	TCA	2	6	318441	318446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_019964	C	6	6	319199	319204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1107	NC_019964	CAG	2	6	319231	319236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019964	GTGTA	2	10	319417	319426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019964	GA	3	6	319457	319462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019964	GT	3	6	319525	319530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019964	TCGT	2	8	319971	319978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_019964	CCTG	2	8	320000	320007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_019964	CTG	2	6	320017	320022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_019964	GT	3	6	320044	320049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019964	CCTGC	2	10	320335	320344	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1116	NC_019964	GGC	2	6	320353	320358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019964	TC	4	8	320413	320420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_019964	CTGA	2	8	320484	320491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_019964	GAC	2	6	320535	320540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019964	CCG	2	6	321493	321498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_019964	CG	3	6	321572	321577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_019964	CGG	2	6	321585	321590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019964	CGT	2	6	323264	323269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_019964	CCGCT	2	10	323288	323297	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1125	NC_019964	CGG	2	6	324392	324397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_019964	CCAG	2	8	324408	324415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_019964	CCG	2	6	324468	324473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_019964	CCG	2	6	324494	324499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_019964	CCGCC	2	10	324525	324534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1130	NC_019964	GACGG	2	10	324589	324598	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_019964	CGC	2	6	324599	324604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_019964	TTCG	2	8	325984	325991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_019964	TCC	2	6	326463	326468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_019964	CGT	2	6	326523	326528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_019964	GGC	2	6	326594	326599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_019964	CGT	2	6	327445	327450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_019964	CGA	2	6	327484	327489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_019964	CACT	2	8	327557	327564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_019964	AGG	2	6	327568	327573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_019964	GAC	2	6	327625	327630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_019964	CGA	2	6	327631	327636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_019964	CGA	2	6	327653	327658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_019964	TCTA	2	8	327671	327678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1144	NC_019964	CTGTCG	2	12	327691	327702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_019964	CCA	2	6	328715	328720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_019964	CCGCC	2	10	328736	328745	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1147	NC_019964	TCGA	2	8	328793	328800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1148	NC_019964	CG	3	6	328838	328843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1149	NC_019964	TG	3	6	328845	328850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_019964	CTT	2	6	328865	328870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1151	NC_019964	GC	3	6	328874	328879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1152	NC_019964	CCA	2	6	328883	328888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1153	NC_019964	TCGG	2	8	329916	329923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_019964	TCG	2	6	330014	330019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_019964	CGTCT	2	10	330034	330043	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1156	NC_019964	TCG	2	6	330044	330049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1157	NC_019964	TCG	2	6	330077	330082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_019964	TCG	2	6	330095	330100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1159	NC_019964	ACG	2	6	330101	330106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1160	NC_019964	GTC	2	6	330148	330153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_019964	GC	3	6	330258	330263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1165	NC_019964	CTT	2	6	330292	330297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_019964	CGA	2	6	330298	330303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_019964	GGC	2	6	330322	330327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1169	NC_019964	GAG	2	6	330383	330388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_019964	CAC	2	6	330442	330447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1174	NC_019964	CGGTG	2	10	330733	330742	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1214	NC_019964	CTG	2	6	332294	332299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1223	NC_019964	CGA	2	6	334644	334649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1230	NC_019964	CT	3	6	334793	334798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1245	NC_019964	GGT	2	6	346950	346955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1248	NC_019964	ACTG	2	8	348991	348998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1249	NC_019964	CGT	2	6	349008	349013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_019964	CGA	2	6	349489	349494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_019964	GCC	2	6	349542	349547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_019964	TGGC	2	8	349587	349594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1253	NC_019964	TCG	2	6	349600	349605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_019964	CGA	2	6	349606	349611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_019964	GA	3	6	349610	349615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_019964	GTT	2	6	349622	349627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_019964	GTC	2	6	349975	349980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_019964	GCG	2	6	350007	350012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_019964	GTC	2	6	350134	350139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_019964	CGAG	2	8	351352	351359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1261	NC_019964	CAGC	2	8	351376	351383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1262	NC_019964	ACGA	2	8	351407	351414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1263	NC_019964	CTGA	2	8	351415	351422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1264	NC_019964	TC	3	6	352643	352648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_019964	CGGC	2	8	352678	352685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_019964	CGC	2	6	353666	353671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1404	NC_019964	TAC	2	6	394628	394633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_019964	GTG	2	6	394635	394640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_019964	GCT	2	6	394666	394671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_019964	TCG	2	6	394702	394707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_019964	G	6	6	395133	395138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_019964	CT	3	6	397176	397181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1450	NC_019964	TA	3	6	405381	405386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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