MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 9999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019964	CGT	2	6	1651074	1651079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_019964	GACGT	2	10	1651575	1651584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5003	NC_019964	GACA	2	8	1651743	1651750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_019964	ATC	2	6	1651800	1651805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019964	GCC	2	6	1651809	1651814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_019964	GAC	2	6	1652857	1652862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_019964	CGAGA	2	10	1652886	1652895	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5008	NC_019964	TCG	2	6	1652902	1652907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_019964	TGGG	2	8	1652920	1652927	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019964	GCA	2	6	1653009	1653014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_019964	CTCA	2	8	1653018	1653025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_019964	ACG	2	6	1653060	1653065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_019964	CCG	2	6	1653131	1653136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_019964	GAT	2	6	1653209	1653214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019964	GC	3	6	1653263	1653268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_019964	CGA	2	6	1653315	1653320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_019964	CCAC	2	8	1653352	1653359	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5018	NC_019964	CCG	2	6	1653398	1653403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_019964	GCC	2	6	1653423	1653428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_019964	GGC	2	6	1653501	1653506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_019964	T	6	6	1653516	1653521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019964	GAC	2	6	1653564	1653569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_019964	TCGA	2	8	1653600	1653607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_019964	GTC	2	6	1653608	1653613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_019964	CCTC	2	8	1654144	1654151	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5026	NC_019964	GTCC	2	8	1654152	1654159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_019964	GCA	2	6	1654162	1654167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_019964	GAC	2	6	1654329	1654334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_019964	GAT	2	6	1654393	1654398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019964	CGT	2	6	1654419	1654424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_019964	GTTC	2	8	1654459	1654466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_019964	CAAT	2	8	1656230	1656237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_019964	CTCGCG	2	12	1656241	1656252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_019964	ACGGC	2	10	1656271	1656280	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5035	NC_019964	ACG	2	6	1656292	1656297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_019964	CGA	2	6	1656308	1656313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_019964	GCC	2	6	1658769	1658774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_019964	GTCC	2	8	1658817	1658824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_019964	CG	3	6	1658838	1658843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_019964	CATT	2	8	1658992	1658999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_019964	CGC	2	6	1659088	1659093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_019964	CGC	2	6	1659111	1659116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_019964	CGCC	2	8	1659473	1659480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5044	NC_019964	GCC	2	6	1659527	1659532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_019964	CAA	2	6	1659542	1659547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_019964	TCG	2	6	1660611	1660616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_019964	GACG	2	8	1660636	1660643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_019964	TACC	2	8	1661633	1661640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_019964	CGT	2	6	1661669	1661674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_019964	CCG	2	6	1661688	1661693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_019964	GACC	2	8	1661780	1661787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_019964	GTCGA	2	10	1663499	1663508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5053	NC_019964	AG	3	6	1663547	1663552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019964	CCG	2	6	1664954	1664959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_019964	GAG	2	6	1664987	1664992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019964	CCGA	2	8	1665021	1665028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_019964	GTC	2	6	1665107	1665112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_019964	GCC	2	6	1665137	1665142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_019964	TGAC	2	8	1667030	1667037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_019964	CCA	2	6	1667038	1667043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_019964	GTCG	2	8	1667063	1667070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_019964	CGT	2	6	1667097	1667102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_019964	CCCGG	2	10	1667110	1667119	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5064	NC_019964	CGCT	2	8	1667122	1667129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_019964	TCG	2	6	1667150	1667155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_019964	GAGT	3	12	1667177	1667188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_019964	GTCG	2	8	1668226	1668233	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_019964	GCT	2	6	1668262	1668267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_019964	CAC	2	6	1668326	1668331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_019964	CA	3	6	1668404	1668409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_019964	GTA	2	6	1668462	1668467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019964	G	6	6	1671081	1671086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_019964	GCC	2	6	1671108	1671113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_019964	CAC	2	6	1671128	1671133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_019964	GCT	2	6	1671251	1671256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_019964	GTC	2	6	1671285	1671290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_019964	CGG	2	6	1671324	1671329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_019964	CGG	2	6	1672638	1672643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019964	GGC	2	6	1672799	1672804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_019964	CTTCG	2	10	1674469	1674478	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5081	NC_019964	GGACC	2	10	1674552	1674561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5082	NC_019964	GTCG	2	8	1674617	1674624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_019964	TCG	2	6	1675377	1675382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_019964	AC	3	6	1675416	1675421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_019964	CGAT	2	8	1675502	1675509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_019964	GGT	2	6	1675535	1675540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_019964	CGG	2	6	1675543	1675548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_019964	CCGTC	2	10	1675549	1675558	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5089	NC_019964	CGA	2	6	1675564	1675569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_019964	GGAG	2	8	1675593	1675600	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019964	GTC	2	6	1675658	1675663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_019964	GC	3	6	1675780	1675785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_019964	GTG	2	6	1675817	1675822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_019964	TCGG	2	8	1675908	1675915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_019964	CAC	2	6	1675956	1675961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_019964	CCG	2	6	1675992	1675997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_019964	CTGA	2	8	1676074	1676081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_019964	AGC	2	6	1676166	1676171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_019964	CCGG	2	8	1676192	1676199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_019964	AGTA	2	8	1676253	1676260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019964	AGTG	2	8	1676294	1676301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019964	CAC	2	6	1677287	1677292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_019964	CGA	2	6	1677337	1677342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_019964	CAT	2	6	1677350	1677355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_019964	CATC	2	8	1677402	1677409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_019964	CGGG	2	8	1677435	1677442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_019964	CCA	2	6	1677674	1677679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_019964	CCTG	2	8	1677722	1677729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_019964	AGC	2	6	1677739	1677744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_019964	CGG	2	6	1679780	1679785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_019964	GAT	2	6	1680938	1680943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019964	TCGA	2	8	1680954	1680961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_019964	TCGA	2	8	1680980	1680987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_019964	CCCG	2	8	1681002	1681009	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5115	NC_019964	GGCT	2	8	1681107	1681114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_019964	TCG	2	6	1681138	1681143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_019964	CGT	2	6	1683927	1683932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_019964	CGC	2	6	1683946	1683951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_019964	ACG	2	6	1684220	1684225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_019964	TG	3	6	1684238	1684243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019964	TCT	2	6	1684274	1684279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_019964	GGT	2	6	1684302	1684307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019964	ACG	2	6	1686292	1686297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_019964	TCGG	2	8	1686311	1686318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_019964	GGCA	2	8	1686393	1686400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_019964	CGT	2	6	1686448	1686453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_019964	CGA	2	6	1686482	1686487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_019964	TCGC	2	8	1686539	1686546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_019964	CGCC	2	8	1686596	1686603	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5130	NC_019964	CACG	2	8	1686620	1686627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_019964	ACC	2	6	1686628	1686633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5256	NC_019964	TCG	2	6	1704834	1704839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_019964	G	6	6	1704853	1704858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_019964	CGCC	2	8	1704864	1704871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5259	NC_019964	TCCG	2	8	1705146	1705153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5262	NC_019964	TCC	2	6	1705409	1705414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_019964	ACC	2	6	1705431	1705436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_019964	ATC	2	6	1705527	1705532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5266	NC_019964	AG	3	6	1706074	1706079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5270	NC_019964	GACC	2	8	1706270	1706277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5271	NC_019964	TGG	2	6	1706308	1706313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5273	NC_019964	C	6	6	1708264	1708269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5282	NC_019964	TCG	2	6	1711892	1711897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5283	NC_019964	CG	3	6	1711927	1711932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5284	NC_019964	CGT	2	6	1711947	1711952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5288	NC_019964	CGG	2	6	1712406	1712411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5300	NC_019964	GT	3	6	1718575	1718580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_019964	CGT	2	6	1718664	1718669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5325	NC_019964	TCG	2	6	1725853	1725858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5327	NC_019964	GA	3	6	1727972	1727977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5340	NC_019964	GAGT	2	8	1736606	1736613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5344	NC_019964	GTCGG	2	10	1737613	1737622	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5358	NC_019964	GACG	2	8	1740505	1740512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5359	NC_019964	CGA	2	6	1740546	1740551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5362	NC_019964	CGGAG	2	10	1742916	1742925	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5363	NC_019964	TCG	2	6	1742926	1742931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5364	NC_019964	GTC	2	6	1742953	1742958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5365	NC_019964	AGCCG	2	10	1742989	1742998	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5367	NC_019964	TCG	2	6	1746621	1746626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5372	NC_019964	CCG	2	6	1749713	1749718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5373	NC_019964	CTG	2	6	1749726	1749731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NC_019964	GCC	2	6	1749757	1749762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5375	NC_019964	ATCG	2	8	1750451	1750458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5376	NC_019964	GAC	2	6	1750499	1750504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5378	NC_019964	CGT	2	6	1750605	1750610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5379	NC_019964	CGA	2	6	1751256	1751261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5380	NC_019964	AT	3	6	1751996	1752001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_019964	CCGG	2	8	1752021	1752028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5382	NC_019964	CGAG	2	8	1752058	1752065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5383	NC_019964	ACTG	2	8	1752572	1752579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5384	NC_019964	GTA	2	6	1752753	1752758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_019964	TCAC	2	8	1753009	1753016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5386	NC_019964	AGC	2	6	1753052	1753057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5387	NC_019964	TCG	2	6	1753068	1753073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5388	NC_019964	GTTGT	2	10	1755990	1755999	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_019964	GTCGA	2	10	1756015	1756024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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