MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 9999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019964	CAC	2	6	1457955	1457960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_019964	CGG	2	6	1457969	1457974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_019964	GTG	3	9	1457984	1457992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_019964	CGTT	2	8	1459616	1459623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_019964	CGGT	2	8	1459648	1459655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_019964	AT	3	6	1459840	1459845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_019964	G	6	6	1461244	1461249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_019964	TCGA	2	8	1462063	1462070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_019964	CCT	2	6	1462094	1462099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_019964	GTA	2	6	1462163	1462168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_019964	GAT	2	6	1462185	1462190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_019964	GTC	2	6	1462832	1462837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_019964	GAT	2	6	1462848	1462853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_019964	TC	3	6	1462889	1462894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_019964	TGG	2	6	1462916	1462921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_019964	CGAG	2	8	1463004	1463011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_019964	CGAG	2	8	1463042	1463049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_019964	CGAG	2	8	1463080	1463087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_019964	ACCGT	2	10	1463116	1463125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4520	NC_019964	TCG	2	6	1463129	1463134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_019964	TAT	2	6	1463145	1463150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_019964	CAG	2	6	1463181	1463186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_019964	ACG	2	6	1463195	1463200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_019964	GAC	2	6	1464295	1464300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_019964	CGAT	2	8	1464342	1464349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_019964	GTTGG	2	10	1464363	1464372	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_019964	TCGG	2	8	1464388	1464395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_019964	TTC	2	6	1464418	1464423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_019964	ACTGA	2	10	1465009	1465018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4530	NC_019964	TCGA	2	8	1465054	1465061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_019964	TCGA	2	8	1465100	1465107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_019964	AAC	2	6	1466481	1466486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_019964	AGC	2	6	1466502	1466507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_019964	GCG	2	6	1467728	1467733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_019964	ACC	2	6	1467780	1467785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_019964	GCG	2	6	1468464	1468469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_019964	CGC	2	6	1468474	1468479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_019964	GAGG	2	8	1470221	1470228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_019964	TCG	2	6	1470275	1470280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_019964	GTC	2	6	1470309	1470314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_019964	GATC	2	8	1471927	1471934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_019964	GAG	2	6	1471961	1471966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019964	GAC	3	9	1471975	1471983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_019964	CAG	2	6	1471988	1471993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_019964	TAC	2	6	1472021	1472026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_019964	ATCG	2	8	1473890	1473897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_019964	GCC	2	6	1475659	1475664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_019964	CT	3	6	1475738	1475743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_019964	CGGT	2	8	1475831	1475838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_019964	CAG	2	6	1477012	1477017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_019964	CAGCG	2	10	1477024	1477033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4552	NC_019964	AAG	2	6	1478739	1478744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_019964	CGGT	2	8	1479921	1479928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_019964	CGGTTC	2	12	1479932	1479943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_019964	CCT	2	6	1479960	1479965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_019964	GTC	2	6	1480807	1480812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_019964	CACC	2	8	1480897	1480904	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4558	NC_019964	TGT	2	6	1480905	1480910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_019964	CGA	2	6	1480923	1480928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_019964	CGAT	2	8	1480947	1480954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_019964	TATTT	2	10	1480994	1481003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_019964	GT	3	6	1481050	1481055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_019964	CGC	2	6	1483968	1483973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_019964	GCG	2	6	1483980	1483985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_019964	TGCGA	2	10	1483989	1483998	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4566	NC_019964	GGGGA	2	10	1483999	1484008	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_019964	CCG	3	9	1484046	1484054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_019964	CGCA	2	8	1484074	1484081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_019964	CTG	2	6	1484121	1484126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_019964	CGC	2	6	1484140	1484145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_019964	TCG	2	6	1484173	1484178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_019964	CGTC	2	8	1484203	1484210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_019964	CTC	2	6	1484215	1484220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_019964	CCCG	2	8	1484245	1484252	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4575	NC_019964	GTT	2	6	1484315	1484320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_019964	CCG	2	6	1485802	1485807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_019964	ACCC	2	8	1485872	1485879	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4578	NC_019964	GAACA	2	10	1485881	1485890	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4579	NC_019964	GAG	2	6	1486793	1486798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_019964	TG	4	8	1486814	1486821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_019964	GTCC	2	8	1486832	1486839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_019964	GCA	2	6	1489952	1489957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_019964	ACG	2	6	1489980	1489985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_019964	TCGCT	2	10	1489997	1490006	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4585	NC_019964	GC	3	6	1490007	1490012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_019964	GCA	2	6	1490063	1490068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_019964	GC	3	6	1490145	1490150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_019964	TAA	2	6	1490188	1490193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_019964	CGTTC	2	10	1490198	1490207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4590	NC_019964	ACG	2	6	1490233	1490238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_019964	TGAG	2	8	1490267	1490274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_019964	GTGAAA	2	12	1495810	1495821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_019964	GAC	2	6	1495854	1495859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_019964	TCC	2	6	1495956	1495961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_019964	GGC	2	6	1496024	1496029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_019964	TCGCGC	2	12	1496034	1496045	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_019964	TAC	2	6	1496063	1496068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_019964	CGTC	2	8	1500722	1500729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_019964	TGC	2	6	1500740	1500745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_019964	TCC	2	6	1500782	1500787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_019964	GT	3	6	1500806	1500811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_019964	GCA	2	6	1501433	1501438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_019964	GCG	2	6	1501488	1501493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_019964	ACT	2	6	1501495	1501500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_019964	CTCG	2	8	1501525	1501532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_019964	CTGT	2	8	1501630	1501637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_019964	GTC	2	6	1502359	1502364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_019964	ATCG	2	8	1502381	1502388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_019964	GCCG	2	8	1502391	1502398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_019964	GCCA	2	8	1502407	1502414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_019964	CAG	2	6	1502417	1502422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_019964	CGT	2	6	1503377	1503382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_019964	GTGA	2	8	1503431	1503438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_019964	CA	3	6	1503443	1503448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_019964	TTTCT	2	10	1504680	1504689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4616	NC_019964	GGT	2	6	1504708	1504713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_019964	CAC	2	6	1505373	1505378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_019964	CG	3	6	1505472	1505477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_019964	GCC	2	6	1506850	1506855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_019964	TCG	2	6	1506892	1506897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_019964	TCC	2	6	1511348	1511353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_019964	ATC	2	6	1511454	1511459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_019964	CGT	2	6	1513131	1513136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_019964	TC	4	8	1515600	1515607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_019964	TCG	2	6	1515682	1515687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_019964	GGT	2	6	1515691	1515696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_019964	GGA	2	6	1515738	1515743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_019964	CGA	2	6	1518035	1518040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_019964	ACT	2	6	1518507	1518512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_019964	GTC	2	6	1518568	1518573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_019964	TCGT	2	8	1518603	1518610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4632	NC_019964	GTC	2	6	1518617	1518622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_019964	TCC	2	6	1518639	1518644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4634	NC_019964	CCGT	2	8	1518663	1518670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4635	NC_019964	CCG	2	6	1518675	1518680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4636	NC_019964	GTC	2	6	1519686	1519691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4637	NC_019964	TGTC	2	8	1519713	1519720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4638	NC_019964	GCC	2	6	1519750	1519755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4639	NC_019964	TG	3	6	1520248	1520253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_019964	GTCG	2	8	1520304	1520311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4641	NC_019964	GAA	2	6	1520316	1520321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4643	NC_019964	CGCC	2	8	1521043	1521050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4644	NC_019964	CGG	2	6	1521066	1521071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4645	NC_019964	GTAC	2	8	1521105	1521112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4646	NC_019964	TGA	2	6	1521213	1521218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4647	NC_019964	TCAG	2	8	1521233	1521240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4651	NC_019964	TGAA	2	8	1521374	1521381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4652	NC_019964	ACTC	2	8	1521390	1521397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4653	NC_019964	TGC	2	6	1521465	1521470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4659	NC_019964	AGTC	2	8	1521639	1521646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4663	NC_019964	CCAG	2	8	1522811	1522818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4664	NC_019964	GA	3	6	1522891	1522896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_019964	ACCG	2	8	1522919	1522926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4668	NC_019964	CGA	2	6	1524502	1524507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4670	NC_019964	AGC	2	6	1525049	1525054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4671	NC_019964	TCAAT	2	10	1526814	1526823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4672	NC_019964	CCGAT	2	10	1526900	1526909	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4673	NC_019964	GTCG	2	8	1527353	1527360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4674	NC_019964	GTCG	2	8	1527367	1527374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4675	NC_019964	CCGT	2	8	1527414	1527421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4676	NC_019964	TCG	2	6	1527428	1527433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4692	NC_019964	GGAT	2	8	1532116	1532123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4743	NC_019964	GTG	2	6	1544075	1544080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4744	NC_019964	CTCGT	2	10	1544090	1544099	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4745	NC_019964	CG	3	6	1545303	1545308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4746	NC_019964	CGGA	2	8	1546343	1546350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4747	NC_019964	AAT	2	6	1546381	1546386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_019964	CCG	2	6	1548869	1548874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4750	NC_019964	TACCA	2	10	1550126	1550135	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4751	NC_019964	CCGG	2	8	1550738	1550745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4752	NC_019964	CAG	2	6	1551776	1551781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_019964	GTCG	2	8	1552791	1552798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4754	NC_019964	CGTT	2	8	1552810	1552817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4755	NC_019964	CAC	2	6	1553867	1553872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4756	NC_019964	GCA	2	6	1554344	1554349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4757	NC_019964	CGG	2	6	1554354	1554359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_019964	AAGC	2	8	1554429	1554436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4759	NC_019964	CGTT	2	8	1555043	1555050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4893	NC_019964	CGA	2	6	1602260	1602265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4894	NC_019964	TCG	2	6	1602319	1602324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4895	NC_019964	TGG	3	9	1602383	1602391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4896	NC_019964	AC	3	6	1603266	1603271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4897	NC_019964	ATC	2	6	1603276	1603281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4898	NC_019964	GA	3	6	1603282	1603287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4899	NC_019964	AGC	2	6	1603312	1603317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4900	NC_019964	T	6	6	1603320	1603325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4901	NC_019964	CGG	2	6	1603370	1603375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4914	NC_019964	CGTA	2	8	1613861	1613868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4915	NC_019964	TTG	2	6	1613872	1613877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4932	NC_019964	ACGG	2	8	1622391	1622398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4945	NC_019964	TCGA	2	8	1628713	1628720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4952	NC_019964	CGAT	2	8	1631300	1631307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4953	NC_019964	TCCG	2	8	1631406	1631413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4954	NC_019964	ACC	2	6	1631429	1631434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5000	NC_019964	GAAC	2	8	1651046	1651053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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