MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019779	C	6	6	890216	890221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3002	NC_019779	G	7	7	890229	890235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019779	G	6	6	890239	890244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019779	GCA	2	6	890253	890258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_019779	TTG	2	6	890262	890267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_019779	AGTG	2	8	890290	890297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_019779	TAA	2	6	892264	892269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019779	TTA	2	6	892937	892942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_019779	TGAC	2	8	892973	892980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_019779	ATCG	2	8	893015	893022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_019779	ACT	2	6	893031	893036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_019779	CGA	2	6	893068	893073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_019779	TCCT	2	8	893080	893087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_019779	CGA	2	6	893089	893094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_019779	G	7	7	893108	893114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_019779	TCT	2	6	893128	893133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_019779	GGAT	2	8	893137	893144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_019779	GCA	2	6	893188	893193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_019779	T	6	6	893790	893795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_019779	T	7	7	893837	893843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_019779	ATT	2	6	893858	893863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019779	TA	3	6	893882	893887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_019779	C	6	6	893915	893920	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3024	NC_019779	C	6	6	893924	893929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3025	NC_019779	CTA	2	6	893992	893997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_019779	TCTGT	2	10	894026	894035	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_019779	AAT	2	6	894089	894094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019779	CAA	2	6	894423	894428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_019779	TTC	2	6	897323	897328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019779	TTTCCT	2	12	898004	898015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_019779	TTAT	2	8	898103	898110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019779	ATTA	2	8	898143	898150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_019779	ATCA	2	8	898202	898209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_019779	GTC	2	6	898218	898223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_019779	TGC	2	6	898246	898251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_019779	TC	3	6	898284	898289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_019779	CA	3	6	903682	903687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_019779	AGG	2	6	903758	903763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_019779	CAG	2	6	903789	903794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_019779	ATTC	2	8	903800	903807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_019779	TAGT	2	8	903885	903892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019779	TAT	2	6	905713	905718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019779	A	6	6	905791	905796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019779	GTT	2	6	905817	905822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019779	AGG	2	6	905847	905852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019779	AGT	2	6	905870	905875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_019779	CTC	2	6	905944	905949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_019779	GAG	2	6	905956	905961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019779	TTCA	2	8	906040	906047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_019779	T	6	6	906069	906074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019779	GTT	2	6	906118	906123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019779	TCTTA	2	10	907741	907750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3054	NC_019779	GTTT	2	8	907754	907761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019779	CCA	2	6	907763	907768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_019779	CA	3	6	907767	907772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_019779	AC	3	6	907904	907909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_019779	TAAA	2	8	907930	907937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019779	GAT	2	6	907976	907981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019779	C	6	6	908019	908024	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3061	NC_019779	GAC	2	6	908030	908035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_019779	AAC	2	6	908054	908059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_019779	ATG	2	6	908207	908212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019779	ATC	2	6	911361	911366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_019779	CAAG	2	8	911400	911407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_019779	A	6	6	912062	912067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_019779	TAT	2	6	912081	912086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3070	NC_019779	TTC	2	6	914875	914880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_019779	TTC	2	6	915152	915157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_019779	AACC	2	8	915182	915189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_019779	ACTGC	2	10	915201	915210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3074	NC_019779	TAAC	2	8	915265	915272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_019779	TAA	2	6	915967	915972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_019779	TAT	2	6	917822	917827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019779	CAT	2	6	917891	917896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_019779	ATT	2	6	917900	917905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_019779	TAGAT	2	10	921286	921295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019779	TTGC	2	8	921352	921359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_019779	A	6	6	921386	921391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019779	GATCA	2	10	921393	921402	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3091	NC_019779	AGT	2	6	922825	922830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_019779	TGA	2	6	922835	922840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3102	NC_019779	ACG	2	6	923766	923771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3104	NC_019779	CTT	2	6	924226	924231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_019779	GTAG	2	8	924315	924322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019779	TC	4	8	924357	924364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_019779	GCC	2	6	924454	924459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3109	NC_019779	AG	4	8	924674	924681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019779	CGGGTA	2	12	924730	924741	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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3112	NC_019779	ACT	2	6	924775	924780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_019779	CTCC	2	8	924803	924810	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3114	NC_019779	AGT	2	6	924864	924869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3119	NC_019779	CCT	2	6	925230	925235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_019779	TCA	2	6	925247	925252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_019779	TGG	2	6	925268	925273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_019779	GCT	2	6	925420	925425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_019779	TAC	2	6	925542	925547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_019779	TCGCTT	2	12	925622	925633	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_019779	GCT	2	6	925641	925646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_019779	TTC	2	6	925689	925694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_019779	TCC	2	6	925723	925728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_019779	CA	3	6	925822	925827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_019779	GGT	2	6	925847	925852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_019779	CT	3	6	925910	925915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_019779	TCGC	2	8	926044	926051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_019779	TTTTC	2	10	926075	926084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3134	NC_019779	TCG	2	6	926215	926220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_019779	CTT	2	6	926232	926237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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