MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019779	CGA	2	6	3656722	3656727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_019779	TCT	2	6	3656761	3656766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_019779	AAC	2	6	3656843	3656848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_019779	AGT	2	6	3657225	3657230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_019779	AGC	2	6	3657260	3657265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_019779	C	6	6	3657265	3657270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11007	NC_019779	TCC	2	6	3657307	3657312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_019779	TTA	2	6	3657339	3657344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_019779	CGA	2	6	3657350	3657355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_019779	TAT	2	6	3657357	3657362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_019779	AGG	2	6	3657371	3657376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_019779	CTG	2	6	3657382	3657387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_019779	GAA	2	6	3657474	3657479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_019779	GGT	2	6	3657503	3657508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_019779	ATG	2	6	3657595	3657600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_019779	TATG	2	8	3657626	3657633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_019779	TCT	2	6	3657653	3657658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_019779	TGA	2	6	3657659	3657664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_019779	AGA	2	6	3657683	3657688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_019779	CAA	2	6	3657738	3657743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_019779	AAT	2	6	3657756	3657761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_019779	AGA	2	6	3657821	3657826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_019779	GA	3	6	3657825	3657830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_019779	GTT	2	6	3657849	3657854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_019779	CGA	2	6	3657889	3657894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_019779	TTAAC	2	10	3657953	3657962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11027	NC_019779	TCT	2	6	3657976	3657981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_019779	ATA	2	6	3658036	3658041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_019779	ATCA	2	8	3658060	3658067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11030	NC_019779	ATG	2	6	3658098	3658103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_019779	GT	4	8	3658106	3658113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_019779	GTGAA	3	15	3658117	3658131	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_019779	C	6	6	3658930	3658935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11034	NC_019779	ATA	2	6	3658971	3658976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_019779	TGT	2	6	3661185	3661190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_019779	AAAC	2	8	3661216	3661223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_019779	GGT	2	6	3662644	3662649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_019779	ACA	2	6	3662658	3662663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_019779	TTG	2	6	3662673	3662678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_019779	ATG	2	6	3662841	3662846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_019779	CG	3	6	3662872	3662877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11042	NC_019779	GAG	2	6	3662881	3662886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_019779	TTC	2	6	3665688	3665693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_019779	GCT	2	6	3667194	3667199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_019779	ATA	2	6	3667273	3667278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_019779	CT	3	6	3667542	3667547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_019779	AGT	2	6	3667684	3667689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11049	NC_019779	GTT	2	6	3668856	3668861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_019779	T	6	6	3668930	3668935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_019779	ACAAT	2	10	3668945	3668954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11052	NC_019779	T	7	7	3668954	3668960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_019779	GAG	2	6	3668967	3668972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_019779	TGA	2	6	3668976	3668981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_019779	CT	3	6	3669032	3669037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11056	NC_019779	CAA	2	6	3670969	3670974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11058	NC_019779	TTC	2	6	3671005	3671010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_019779	TTC	2	6	3671019	3671024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_019779	GTTG	2	8	3671032	3671039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_019779	GTTG	2	8	3671067	3671074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_019779	CAAC	2	8	3671134	3671141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_019779	CTC	2	6	3671170	3671175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11065	NC_019779	TGA	2	6	3671208	3671213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_019779	ATT	2	6	3671228	3671233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_019779	TCT	2	6	3671248	3671253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_019779	T	6	6	3671337	3671342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_019779	TTTTC	2	10	3671376	3671385	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11070	NC_019779	TAGCA	2	10	3671413	3671422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11077	NC_019779	G	6	6	3673793	3673798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_019779	GATA	2	8	3673825	3673832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_019779	TAAGT	2	10	3673845	3673854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_019779	ATT	2	6	3673877	3673882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_019779	AACA	2	8	3673922	3673929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11091	NC_019779	G	6	6	3677863	3677868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_019779	G	6	6	3677874	3677879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_019779	C	6	6	3677890	3677895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11099	NC_019779	GAGG	2	8	3679424	3679431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_019779	ATG	2	6	3679439	3679444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11111	NC_019779	C	6	6	3681439	3681444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11112	NC_019779	C	6	6	3681447	3681452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11113	NC_019779	C	6	6	3681469	3681474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11114	NC_019779	C	6	6	3681477	3681482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11121	NC_019779	G	6	6	3683956	3683961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_019779	C	6	6	3683971	3683976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11123	NC_019779	G	6	6	3683992	3683997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11126	NC_019779	C	6	6	3684051	3684056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11127	NC_019779	G	6	6	3684064	3684069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_019779	GT	3	6	3684083	3684088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11130	NC_019779	C	6	6	3684180	3684185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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