MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019779	TTA	2	6	3300289	3300294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_019779	GAT	2	6	3300305	3300310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_019779	TTA	2	6	3301320	3301325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_019779	AGCG	2	8	3301338	3301345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10005	NC_019779	TTTAG	2	10	3302741	3302750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_019779	TAA	2	6	3302755	3302760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_019779	CGATT	2	10	3304194	3304203	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10008	NC_019779	AAAT	2	8	3304371	3304378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_019779	ATT	2	6	3304380	3304385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_019779	TTA	2	6	3304396	3304401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_019779	GAA	2	6	3306126	3306131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_019779	GCA	2	6	3306144	3306149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_019779	CTAAA	2	10	3306170	3306179	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10014	NC_019779	AGG	2	6	3306214	3306219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_019779	CTC	2	6	3306248	3306253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_019779	GTA	2	6	3306273	3306278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_019779	AGG	2	6	3306289	3306294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_019779	AG	3	6	3307249	3307254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_019779	CCA	2	6	3307403	3307408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_019779	AT	3	6	3307457	3307462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_019779	TTG	2	6	3307480	3307485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_019779	T	6	6	3308251	3308256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_019779	T	6	6	3309220	3309225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_019779	TTC	2	6	3309232	3309237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_019779	A	7	7	3309379	3309385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_019779	A	6	6	3309438	3309443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_019779	GATGT	2	10	3311162	3311171	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_019779	TTGAT	2	10	3311173	3311182	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_019779	CT	3	6	3311185	3311190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_019779	TCA	2	6	3311201	3311206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_019779	TTCAT	2	10	3311211	3311220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10032	NC_019779	GTC	2	6	3311225	3311230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_019779	TC	3	6	3312793	3312798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_019779	CGC	2	6	3312860	3312865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_019779	CTC	2	6	3312910	3312915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_019779	AAG	2	6	3312957	3312962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_019779	A	7	7	3313040	3313046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_019779	GGAC	2	8	3313128	3313135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10039	NC_019779	GAA	2	6	3313209	3313214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_019779	GCGTA	2	10	3313229	3313238	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10041	NC_019779	GA	3	6	3313320	3313325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_019779	AG	4	8	3313340	3313347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_019779	T	7	7	3313644	3313650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_019779	CAT	2	6	3313655	3313660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_019779	AT	3	6	3313672	3313677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_019779	TG	3	6	3313708	3313713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_019779	TTAA	2	8	3313716	3313723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_019779	TCC	2	6	3314337	3314342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_019779	CTT	2	6	3314352	3314357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10051	NC_019779	CAC	2	6	3314398	3314403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_019779	CA	3	6	3314512	3314517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_019779	AGC	3	9	3314518	3314526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_019779	CAG	2	6	3314571	3314576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_019779	CT	3	6	3315711	3315716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_019779	GAT	2	6	3315725	3315730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_019779	TA	3	6	3315745	3315750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_019779	AAG	2	6	3316524	3316529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_019779	GGA	2	6	3316530	3316535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_019779	TTCA	2	8	3317078	3317085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10061	NC_019779	T	7	7	3317824	3317830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_019779	GGGA	2	8	3317861	3317868	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_019779	ATT	2	6	3317891	3317896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_019779	AAG	2	6	3317946	3317951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_019779	TGT	2	6	3317956	3317961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_019779	TGA	2	6	3318017	3318022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_019779	TAA	2	6	3318134	3318139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_019779	CT	3	6	3318188	3318193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_019779	CTAAC	2	10	3320848	3320857	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10070	NC_019779	GTT	2	6	3321106	3321111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10074	NC_019779	TCT	2	6	3321836	3321841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_019779	AGAT	2	8	3321845	3321852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10085	NC_019779	ATTG	2	8	3327351	3327358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_019779	ATG	2	6	3328166	3328171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10102	NC_019779	TATCA	2	10	3330016	3330025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10103	NC_019779	AAATT	2	10	3330519	3330528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_019779	C	6	6	3330585	3330590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10107	NC_019779	T	6	6	3330686	3330691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_019779	AAGA	2	8	3330713	3330720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10111	NC_019779	TC	3	6	3331824	3331829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_019779	A	6	6	3331861	3331866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_019779	AAAT	2	8	3331883	3331890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_019779	ATCA	2	8	3332197	3332204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_019779	CAT	2	6	3332218	3332223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10119	NC_019779	ATCA	2	8	3334545	3334552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10120	NC_019779	TTC	2	6	3336037	3336042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_019779	TCC	2	6	3336292	3336297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_019779	TCAT	2	8	3336312	3336319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10123	NC_019779	TC	3	6	3336331	3336336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_019779	GTA	2	6	3336402	3336407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10126	NC_019779	TTG	2	6	3336504	3336509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_019779	AATCTG	2	12	3338556	3338567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10128	NC_019779	CGAC	2	8	3338569	3338576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_019779	TC	3	6	3338600	3338605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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