MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_019779	ATT	2	6	2541980	2541985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_019779	TGT	2	6	2542015	2542020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_019779	AGG	2	6	2542023	2542028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_019779	A	6	6	2542775	2542780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_019779	ATT	2	6	2545756	2545761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_019779	CCTT	2	8	2545824	2545831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_019779	GTT	3	9	2551329	2551337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_019779	GCT	2	6	2551478	2551483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_019779	TCTT	2	8	2551489	2551496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_019779	GCT	2	6	2551499	2551504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_019779	TCTT	2	8	2551510	2551517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_019779	GCT	2	6	2551520	2551525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_019779	TTTC	2	8	2551529	2551536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8014	NC_019779	CTG	2	6	2551542	2551547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_019779	CCG	2	6	2551567	2551572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_019779	TCT	2	6	2551600	2551605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_019779	TCT	2	6	2551634	2551639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_019779	CTT	4	12	2551643	2551654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_019779	TCT	2	6	2551655	2551660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_019779	CTT	2	6	2551664	2551669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_019779	CCA	2	6	2551743	2551748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_019779	TCA	2	6	2551823	2551828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_019779	GA	3	6	2551885	2551890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_019779	TTA	2	6	2551931	2551936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_019779	TCA	2	6	2551957	2551962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_019779	TGT	2	6	2553118	2553123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_019779	ACG	2	6	2553126	2553131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_019779	CTC	2	6	2553271	2553276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_019779	C	9	9	2553278	2553286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8030	NC_019779	TTG	2	6	2554720	2554725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_019779	GCT	2	6	2556492	2556497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_019779	A	6	6	2556547	2556552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_019779	AGG	2	6	2556633	2556638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_019779	GTG	2	6	2557121	2557126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_019779	A	6	6	2558536	2558541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_019779	GCA	2	6	2559001	2559006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_019779	TTG	2	6	2559016	2559021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_019779	CAGG	2	8	2561248	2561255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8039	NC_019779	TG	3	6	2561316	2561321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_019779	T	8	8	2561391	2561398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_019779	TGT	2	6	2561430	2561435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_019779	CT	3	6	2561453	2561458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_019779	A	6	6	2566420	2566425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_019779	TCC	2	6	2566426	2566431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_019779	CA	3	6	2566434	2566439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_019779	A	6	6	2566446	2566451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_019779	A	7	7	2566516	2566522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_019779	AGA	2	6	2566546	2566551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_019779	T	7	7	2566579	2566585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_019779	TCA	2	6	2567783	2567788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_019779	GAT	2	6	2568494	2568499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_019779	AAG	2	6	2568508	2568513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_019779	TGG	2	6	2568562	2568567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_019779	ATA	2	6	2568601	2568606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_019779	T	6	6	2570595	2570600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_019779	TAT	2	6	2570608	2570613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_019779	ATTT	2	8	2571819	2571826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_019779	GTAA	2	8	2571835	2571842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_019779	T	6	6	2571843	2571848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_019779	AGGG	2	8	2573309	2573316	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_019779	ACG	2	6	2573347	2573352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_019779	TTG	2	6	2573357	2573362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_019779	CAA	2	6	2573363	2573368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_019779	CAA	2	6	2576589	2576594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_019779	CCAC	2	8	2576602	2576609	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8066	NC_019779	TAGA	2	8	2576664	2576671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_019779	A	6	6	2580288	2580293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_019779	GAAA	2	8	2580368	2580375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_019779	A	8	8	2580373	2580380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_019779	TGA	2	6	2581072	2581077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_019779	ATG	2	6	2581088	2581093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_019779	AGA	2	6	2582763	2582768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_019779	ATG	2	6	2582852	2582857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_019779	A	7	7	2582865	2582871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_019779	TGA	2	6	2582948	2582953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_019779	AGC	2	6	2582957	2582962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_019779	ATT	2	6	2583002	2583007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_019779	CAA	2	6	2583069	2583074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_019779	CCAA	2	8	2583101	2583108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8080	NC_019779	TTAT	2	8	2584484	2584491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_019779	CAT	2	6	2584514	2584519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_019779	A	6	6	2584597	2584602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_019779	ATTT	2	8	2584614	2584621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_019779	AAT	2	6	2584634	2584639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_019779	TAC	2	6	2584753	2584758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_019779	GGGT	2	8	2587167	2587174	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_019779	TTG	2	6	2587177	2587182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_019779	TC	3	6	2587190	2587195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_019779	GGA	2	6	2587223	2587228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_019779	AATT	2	8	2591329	2591336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_019779	TTA	2	6	2591402	2591407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_019779	CTT	2	6	2591418	2591423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_019779	A	6	6	2592854	2592859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_019779	TAA	2	6	2594609	2594614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_019779	TGA	2	6	2594621	2594626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_019779	GTTG	2	8	2599420	2599427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_019779	ATTA	2	8	2599471	2599478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_019779	CAAC	2	8	2599480	2599487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_019779	GAA	2	6	2599502	2599507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_019779	T	6	6	2599570	2599575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_019779	G	6	6	2599624	2599629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_019779	G	6	6	2599633	2599638	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_019779	A	6	6	2601013	2601018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_019779	TA	3	6	2601022	2601027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_019779	TTCTA	2	10	2601037	2601046	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8106	NC_019779	CAT	2	6	2601087	2601092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_019779	A	7	7	2601137	2601143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_019779	TG	3	6	2601185	2601190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_019779	ATC	2	6	2601211	2601216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8111	NC_019779	CAA	2	6	2601314	2601319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_019779	TTA	2	6	2601321	2601326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_019779	CCTCA	2	10	2603801	2603810	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8114	NC_019779	CT	3	6	2605559	2605564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_019779	TAG	2	6	2605656	2605661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_019779	T	6	6	2605680	2605685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_019779	TGT	2	6	2605701	2605706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_019779	TAG	2	6	2609430	2609435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_019779	ATT	2	6	2609440	2609445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_019779	T	6	6	2609451	2609456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_019779	GCTT	2	8	2609569	2609576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_019779	AGGT	2	8	2609732	2609739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_019779	CAA	2	6	2609794	2609799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_019779	GAA	3	9	2611736	2611744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_019779	TTA	2	6	2611745	2611750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_019779	GTC	2	6	2611752	2611757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_019779	CCT	2	6	2611760	2611765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_019779	TGAC	2	8	2611804	2611811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8129	NC_019779	T	7	7	2611866	2611872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_019779	GTCA	2	8	2611928	2611935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8131	NC_019779	CAA	2	6	2611981	2611986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8133	NC_019779	TTC	2	6	2612011	2612016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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