MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019779	T	6	6	1815722	1815727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_019779	AAG	2	6	1815782	1815787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019779	ACT	2	6	1815792	1815797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_019779	CA	3	6	1815814	1815819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_019779	ATA	2	6	1815828	1815833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019779	GTT	2	6	1815854	1815859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019779	TAA	2	6	1816351	1816356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_019779	ATTG	2	8	1816364	1816371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019779	TTCC	2	8	1816450	1816457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_019779	CAA	2	6	1816470	1816475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_019779	GTTA	2	8	1816571	1816578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_019779	CGAT	2	8	1816622	1816629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_019779	AAC	2	6	1816666	1816671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_019779	T	7	7	1816686	1816692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_019779	CCTA	2	8	1816693	1816700	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_019779	A	7	7	1816706	1816712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019779	TA	3	6	1816757	1816762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019779	T	8	8	1816767	1816774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019779	TCAA	2	8	1816790	1816797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_019779	TCTT	2	8	1816807	1816814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_019779	AG	4	8	1816827	1816834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019779	ATA	2	6	1816877	1816882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019779	A	6	6	1816911	1816916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_019779	A	6	6	1816922	1816927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019779	TCG	2	6	1816938	1816943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_019779	T	6	6	1816967	1816972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019779	TGA	2	6	1817038	1817043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019779	GAA	2	6	1817052	1817057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019779	AGA	2	6	1817078	1817083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019779	AAG	2	6	1817173	1817178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_019779	TC	4	8	1819163	1819170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_019779	ATCG	2	8	1819433	1819440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_019779	ATT	2	6	1820496	1820501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_019779	AAGC	2	8	1820551	1820558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_019779	ATTA	2	8	1820622	1820629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019779	TATT	2	8	1820674	1820681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_019779	AT	3	6	1821667	1821672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_019779	CCT	2	6	1821720	1821725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_019779	CCA	2	6	1821750	1821755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_019779	TTTAT	2	10	1822162	1822171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_019779	CAA	2	6	1822178	1822183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_019779	TAAA	2	8	1822212	1822219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019779	TTA	2	6	1828248	1828253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019779	TGT	2	6	1828271	1828276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6048	NC_019779	AAT	2	6	1829871	1829876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_019779	AG	3	6	1829886	1829891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_019779	TAT	2	6	1837547	1837552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_019779	ATATTT	2	12	1837569	1837580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_019779	ATT	3	9	1837699	1837707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_019779	TGA	2	6	1837708	1837713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_019779	TAA	2	6	1837728	1837733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019779	TCT	2	6	1837995	1838000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6058	NC_019779	CAAG	2	8	1839543	1839550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_019779	AT	3	6	1839552	1839557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_019779	C	6	6	1839580	1839585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6061	NC_019779	C	6	6	1839589	1839594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6062	NC_019779	C	6	6	1839617	1839622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6063	NC_019779	C	6	6	1839626	1839631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6064	NC_019779	G	6	6	1839639	1839644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6067	NC_019779	ATT	2	6	1839951	1839956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_019779	TGCT	2	8	1840470	1840477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6103	NC_019779	T	6	6	1842471	1842476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_019779	CGAAG	2	10	1842549	1842558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6109	NC_019779	T	6	6	1846463	1846468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_019779	A	7	7	1846485	1846491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_019779	T	6	6	1847120	1847125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6113	NC_019779	GGT	2	6	1847195	1847200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_019779	GAGAA	2	10	1847216	1847225	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_019779	AGA	2	6	1848239	1848244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_019779	TTG	2	6	1848958	1848963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_019779	CAGA	2	8	1848980	1848987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_019779	TTAA	2	8	1850191	1850198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_019779	GAT	2	6	1850257	1850262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_019779	AAT	2	6	1851449	1851454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019779	ATA	2	6	1851526	1851531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_019779	CG	3	6	1852482	1852487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_019779	TTC	2	6	1854031	1854036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_019779	T	6	6	1854048	1854053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_019779	GTT	2	6	1854055	1854060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_019779	CAAC	2	8	1854118	1854125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_019779	TTGA	2	8	1854216	1854223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_019779	CTTT	2	8	1856158	1856165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_019779	AT	3	6	1856525	1856530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_019779	ATC	2	6	1856543	1856548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_019779	TTA	2	6	1857863	1857868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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