MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	TC	3	6	3	8	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019561	A	6	6	142	147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019561	ATAA	2	8	159	166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019561	AAT	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019561	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019561	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019561	AAG	2	6	391	396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019561	AGT	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019561	ATG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019561	A	6	6	601	606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019561	AGT	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019561	T	6	6	618	623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019561	GATA	2	8	661	668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019561	GC	3	6	682	687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019561	CAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019561	TGCTTG	2	12	5677	5688	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019561	AAC	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019561	AAT	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019561	ATA	2	6	5753	5758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019561	T	7	7	5815	5821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019561	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019561	T	6	6	5896	5901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019561	TAA	2	6	5919	5924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019561	A	6	6	5939	5944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019561	TAT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019561	ATTAT	2	10	5963	5972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019561	ATG	2	6	5974	5979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019561	T	6	6	6038	6043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019561	TTA	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019561	A	6	6	6134	6139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019561	TAA	2	6	6169	6174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019561	TAT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019561	TGG	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019561	TTA	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019561	A	7	7	6358	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019561	CTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019561	GT	3	6	7122	7127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019561	ATT	2	6	8768	8773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019561	A	6	6	8777	8782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019561	ATA	3	9	8789	8797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019561	TTA	2	6	8839	8844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019561	ACT	2	6	8895	8900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019561	CCT	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019561	CCAC	2	8	8939	8946	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_019561	AC	3	6	8959	8964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019561	TAT	2	6	9037	9042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019561	TTA	2	6	9083	9088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019561	AAG	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019561	TTA	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019561	AAG	2	6	9121	9126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019561	TTA	2	6	9127	9132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019561	AAG	2	6	9143	9148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019561	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019561	AAG	2	6	9165	9170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019561	TTA	2	6	9171	9176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019561	GTT	2	6	9227	9232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019561	GC	3	6	9254	9259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019561	ATGT	2	8	9260	9267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019561	A	6	6	9277	9282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019561	GTT	2	6	9290	9295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019561	AAC	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019561	ATG	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019561	T	6	6	9361	9366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019561	A	6	6	9367	9372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019561	GAA	2	6	9391	9396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019561	A	6	6	9395	9400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019561	TTG	2	6	9422	9427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019561	T	7	7	9526	9532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019561	A	7	7	9577	9583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019561	A	6	6	9609	9614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019561	A	8	8	9640	9647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019561	CAAAA	2	10	9720	9729	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019561	T	6	6	9736	9741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019561	T	8	8	9767	9774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019561	AAG	2	6	9831	9836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019561	TGAG	2	8	9865	9872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019561	TGG	2	6	9968	9973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019561	TGT	2	6	9999	10004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019561	AC	3	6	10014	10019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019561	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019561	TAA	2	6	10046	10051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019561	A	8	8	10096	10103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019561	GTAG	2	8	10105	10112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019561	ATT	2	6	10164	10169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019561	T	6	6	10182	10187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019561	TTG	2	6	10202	10207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019561	T	6	6	16022	16027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019561	CA	3	6	16048	16053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019561	ATT	2	6	16134	16139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019561	CTG	2	6	16708	16713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019561	T	7	7	16759	16765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019561	CT	3	6	16802	16807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019561	A	7	7	16824	16830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019561	A	6	6	16864	16869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019561	A	9	9	16892	16900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019561	A	6	6	16910	16915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019561	AT	3	6	16949	16954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019561	T	6	6	17014	17019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019561	T	6	6	17028	17033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019561	AAATG	2	10	17087	17096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019561	GTA	2	6	17354	17359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.