MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 3331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019560	TTG	2	6	1483581	1483586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019560	TGA	2	6	1483702	1483707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019560	ATA	2	6	1483788	1483793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019560	ATT	2	6	1483836	1483841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019560	T	6	6	1483871	1483876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_019560	TGA	2	6	1483930	1483935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_019560	TGAA	2	8	1483956	1483963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019560	CAAG	2	8	1483993	1484000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_019560	CAA	2	6	1484017	1484022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_019560	T	6	6	1484041	1484046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019560	TAA	2	6	1484056	1484061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_019560	ACA	2	6	1484101	1484106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_019560	GAT	2	6	1484144	1484149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019560	TAA	2	6	1484179	1484184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_019560	TA	3	6	1484222	1484227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_019560	ATG	3	9	1484361	1484369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_019560	AT	3	6	1484412	1484417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_019560	A	6	6	1484444	1484449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_019560	T	6	6	1485744	1485749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_019560	ATT	2	6	1485751	1485756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_019560	TTA	2	6	1485757	1485762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019560	ACC	2	6	1485795	1485800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_019560	ATA	2	6	1485813	1485818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_019560	GTA	2	6	1485847	1485852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_019560	TGA	2	6	1488708	1488713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_019560	TTA	2	6	1491684	1491689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_019560	TTA	2	6	1491702	1491707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019560	TAATA	2	10	1491708	1491717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019560	C	6	6	1491718	1491723	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3030	NC_019560	TTAG	2	8	1491737	1491744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019560	AAC	2	6	1494381	1494386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_019560	TATTT	2	10	1494428	1494437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_019560	T	6	6	1495784	1495789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019560	TAT	2	6	1495837	1495842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019560	AAT	2	6	1495850	1495855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019560	TAA	3	9	1495857	1495865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019560	A	6	6	1495898	1495903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_019560	GAA	2	6	1498620	1498625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_019560	A	7	7	1498704	1498710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019560	AGTTT	2	10	1498733	1498742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019560	TAA	2	6	1499965	1499970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019560	A	6	6	1501250	1501255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019560	A	6	6	1501396	1501401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019560	T	6	6	1501444	1501449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019560	TTTG	2	8	1501455	1501462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019560	T	7	7	1501501	1501507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_019560	CAT	2	6	1502765	1502770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_019560	T	6	6	1502776	1502781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019560	CTT	2	6	1502820	1502825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_019560	ATC	2	6	1502893	1502898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_019560	T	6	6	1502917	1502922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019560	TTG	2	6	1503011	1503016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019560	TTTA	2	8	1503028	1503035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019560	AG	3	6	1503042	1503047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019560	T	7	7	1503093	1503099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019560	TTAATA	2	12	1503167	1503178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019560	ATA	2	6	1503235	1503240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019560	ATG	2	6	1503329	1503334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019560	T	6	6	1503337	1503342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019560	TGG	3	9	1503368	1503376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019560	ATG	2	6	1503437	1503442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019560	GA	3	6	1503463	1503468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019560	TAA	2	6	1503486	1503491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019560	AT	3	6	1503502	1503507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019560	CCG	2	6	1503558	1503563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_019560	GAA	2	6	1503585	1503590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_019560	CT	3	6	1503716	1503721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_019560	GTG	3	9	1503866	1503874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019560	T	6	6	1503949	1503954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_019560	CAAA	2	8	1504038	1504045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_019560	TCT	2	6	1504082	1504087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_019560	A	6	6	1504129	1504134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_019560	A	6	6	1504178	1504183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019560	TTC	2	6	1504186	1504191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_019560	GAAA	2	8	1504201	1504208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_019560	CTT	2	6	1504275	1504280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_019560	TTC	2	6	1504402	1504407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_019560	CTT	2	6	1504614	1504619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_019560	GTT	2	6	1504641	1504646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_019560	TTC	2	6	1504654	1504659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_019560	AAT	2	6	1504714	1504719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019560	T	7	7	1504739	1504745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_019560	A	6	6	1504757	1504762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_019560	A	6	6	1504764	1504769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019560	TTCT	2	8	1504819	1504826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_019560	CA	3	6	1504855	1504860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_019560	TCCA	2	8	1504867	1504874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_019560	T	6	6	1504894	1504899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_019560	A	6	6	1504934	1504939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_019560	T	7	7	1504952	1504958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_019560	TCA	2	6	1504967	1504972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_019560	TAA	2	6	1504993	1504998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019560	CTAT	2	8	1505000	1505007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_019560	T	6	6	1505011	1505016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_019560	T	6	6	1505059	1505064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_019560	TAAA	2	8	1505157	1505164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019560	GATAA	2	10	1508494	1508503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_019560	TAAA	2	8	1509535	1509542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_019560	CA	3	6	1509658	1509663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_019560	TAC	2	6	1509729	1509734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_019560	CATT	2	8	1509745	1509752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_019560	T	6	6	1510576	1510581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_019560	T	6	6	1510587	1510592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_019560	T	6	6	1510615	1510620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019560	TAA	2	6	1510624	1510629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019560	GCTTG	2	10	1510639	1510648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_019560	AGA	2	6	1510668	1510673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_019560	GGT	2	6	1510691	1510696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_019560	CCA	2	6	1510713	1510718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_019560	A	6	6	1512180	1512185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_019560	TAA	2	6	1512191	1512196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019560	TAA	3	9	1512234	1512242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_019560	AGT	2	6	1512251	1512256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019560	TGAA	2	8	1512264	1512271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019560	CG	3	6	1512301	1512306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_019560	A	7	7	1512331	1512337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_019560	TGAA	2	8	1512339	1512346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019560	TTA	2	6	1513741	1513746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_019560	TGAA	2	8	1513763	1513770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_019560	TGAA	2	8	1513785	1513792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_019560	TGAA	2	8	1513796	1513803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_019560	ATA	2	6	1513854	1513859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_019560	A	8	8	1513873	1513880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_019560	A	6	6	1517152	1517157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_019560	TAA	2	6	1517165	1517170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_019560	TGT	2	6	1517233	1517238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_019560	TCA	2	6	1517245	1517250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_019560	CAT	2	6	1524880	1524885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_019560	TCA	2	6	1524921	1524926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_019560	TAA	2	6	1524932	1524937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_019560	CCT	2	6	1524942	1524947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_019560	GA	3	6	1527504	1527509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_019560	A	6	6	1527512	1527517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_019560	T	6	6	1527527	1527532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_019560	TAA	2	6	1527545	1527550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3306	NC_019560	ATAAA	2	10	1610625	1610634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3313	NC_019560	CTTG	2	8	1610801	1610808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3324	NC_019560	TTA	2	6	1613232	1613237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.