MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 3331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019560	TTA	2	6	819723	819728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1504	NC_019560	CATT	2	8	821096	821103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_019560	T	6	6	821118	821123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019560	AAT	2	6	822039	822044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019560	ATT	2	6	822210	822215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019560	A	7	7	822492	822498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1510	NC_019560	A	6	6	822533	822538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1512	NC_019560	A	6	6	822605	822610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1520	NC_019560	A	6	6	826422	826427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019560	A	6	6	827900	827905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_019560	ATT	2	6	827911	827916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_019560	T	6	6	830274	830279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_019560	A	6	6	830297	830302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1604	NC_019560	TAT	3	9	870187	870195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_019560	A	6	6	870246	870251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_019560	A	6	6	871008	871013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1920	NC_019560	TTCAA	2	10	1010023	1010032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1921	NC_019560	GGGA	2	8	1010144	1010151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_019560	TGC	2	6	1010171	1010176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_019560	CTCAT	2	10	1010253	1010262	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1924	NC_019560	GAC	2	6	1010287	1010292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1926	NC_019560	AGCT	2	8	1010442	1010449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1927	NC_019560	C	6	6	1010467	1010472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1928	NC_019560	GAC	2	6	1010565	1010570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1929	NC_019560	CGG	2	6	1010596	1010601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1931	NC_019560	CTTT	2	8	1010800	1010807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1933	NC_019560	CCT	2	6	1010832	1010837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1934	NC_019560	GTT	2	6	1010839	1010844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_019560	CA	3	6	1010853	1010858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1936	NC_019560	GTT	2	6	1010907	1010912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_019560	GATT	2	8	1010924	1010931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_019560	CACC	2	8	1010936	1010943	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1939	NC_019560	AGC	2	6	1011005	1011010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1940	NC_019560	TAT	2	6	1011040	1011045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1941	NC_019560	AT	3	6	1011065	1011070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1942	NC_019560	GTTT	2	8	1011096	1011103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_019560	TCC	2	6	1011161	1011166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1944	NC_019560	GCA	2	6	1011224	1011229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1946	NC_019560	TCGC	2	8	1011674	1011681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1947	NC_019560	ACT	2	6	1011683	1011688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1948	NC_019560	TCACT	2	10	1011733	1011742	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1949	NC_019560	CT	3	6	1011750	1011755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1950	NC_019560	CT	3	6	1011870	1011875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1951	NC_019560	TTC	2	6	1011978	1011983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1952	NC_019560	TACTT	2	10	1012032	1012041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1953	NC_019560	AGA	2	6	1012130	1012135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_019560	T	6	6	1012159	1012164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_019560	TTG	2	6	1012199	1012204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_019560	TAACT	2	10	1012221	1012230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1957	NC_019560	GTT	2	6	1012297	1012302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_019560	GAAA	2	8	1012396	1012403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_019560	G	7	7	1012434	1012440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_019560	TTAAA	2	10	1012482	1012491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1961	NC_019560	TTAAA	2	10	1012499	1012508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1962	NC_019560	TTAAA	2	10	1012516	1012525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1963	NC_019560	TTAAA	2	10	1012533	1012542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_019560	TTAAA	2	10	1012550	1012559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_019560	TTAAA	2	10	1012567	1012576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_019560	TAAA	2	8	1012585	1012592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1967	NC_019560	CAT	2	6	1012624	1012629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1969	NC_019560	T	6	6	1012857	1012862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_019560	C	9	9	1016330	1016338	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1978	NC_019560	CT	3	6	1016350	1016355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1980	NC_019560	T	6	6	1016368	1016373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1981	NC_019560	CT	3	6	1016375	1016380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1982	NC_019560	A	6	6	1023814	1023819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1983	NC_019560	TTTA	2	8	1027000	1027007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1984	NC_019560	TTTA	2	8	1027143	1027150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1985	NC_019560	TTA	2	6	1027164	1027169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1987	NC_019560	A	6	6	1027254	1027259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_019560	GTA	2	6	1027270	1027275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_019560	GCTT	2	8	1033407	1033414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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