MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 3331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019560	TTA	2	6	210200	210205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019560	AATG	2	8	212154	212161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019560	T	7	7	212431	212437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019560	A	6	6	217298	217303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019560	TAA	2	6	219214	219219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019560	TAG	2	6	219231	219236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019560	TTTTA	2	10	219239	219248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019560	T	6	6	221002	221007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019560	TATT	2	8	221087	221094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019560	ATT	2	6	223936	223941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019560	GAT	3	9	223989	223997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019560	AAAAC	2	10	224290	224299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
513	NC_019560	TG	3	6	224329	224334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019560	A	6	6	224340	224345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019560	T	6	6	225736	225741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019560	ATT	2	6	225759	225764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019560	TAT	2	6	225790	225795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019560	T	6	6	225808	225813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019560	CTA	2	6	225822	225827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_019560	TGG	2	6	226901	226906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019560	CGCT	2	8	226941	226948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_019560	ATTT	2	8	226950	226957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019560	AAC	2	6	226978	226983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_019560	GTA	2	6	227035	227040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019560	AAG	2	6	227168	227173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019560	AAAT	2	8	227214	227221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019560	T	6	6	227237	227242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019560	TGAT	2	8	227279	227286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019560	A	6	6	228187	228192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019560	TCTT	2	8	228213	228220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_019560	CCT	2	6	228324	228329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_019560	T	6	6	228343	228348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019560	TTC	2	6	230470	230475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_019560	CTTAA	2	10	230534	230543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
535	NC_019560	A	16	16	230557	230572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019560	T	6	6	230585	230590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019560	AAG	2	6	230685	230690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019560	A	7	7	231862	231868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019560	GCC	2	6	231928	231933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_019560	GT	3	6	231989	231994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019560	T	6	6	231994	231999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019560	ATG	2	6	232017	232022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019560	TAA	2	6	232064	232069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019560	TTTA	2	8	233591	233598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019560	TAA	2	6	233637	233642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019560	T	9	9	233670	233678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_019560	TAT	2	6	234497	234502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019560	T	6	6	237896	237901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019560	A	6	6	237902	237907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019560	AAG	2	6	237911	237916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019560	CAT	2	6	238046	238051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_019560	TCA	2	6	238108	238113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_019560	T	7	7	238134	238140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019560	GGT	2	6	238146	238151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019560	CTT	2	6	239230	239235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_019560	CTT	2	6	239255	239260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_019560	CAAAA	2	10	239265	239274	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
558	NC_019560	A	6	6	239271	239276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_019560	CTT	2	6	245314	245319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_019560	T	6	6	245773	245778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_019560	T	7	7	245850	245856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019560	ATA	2	6	245880	245885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019560	ATT	2	6	248434	248439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019560	ATTTTA	2	12	248527	248538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019560	TTA	2	6	248544	248549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019560	AAATT	2	10	248567	248576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019560	TAAA	2	8	251792	251799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019560	TGA	2	6	254393	254398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019560	TAAT	2	8	254418	254425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019560	AAAG	2	8	254463	254470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019560	ATG	2	6	254483	254488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019560	T	6	6	254630	254635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_019560	T	8	8	257646	257653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019560	CAATC	2	10	257676	257685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
576	NC_019560	ATA	2	6	257701	257706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_019560	CTCTT	2	10	262432	262441	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
581	NC_019560	A	6	6	262483	262488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019560	TAT	2	6	262495	262500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019560	TGAT	2	8	262505	262512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019560	TTG	2	6	262515	262520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019560	AGA	2	6	263206	263211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019560	TAG	2	6	264024	264029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_019560	A	6	6	266667	266672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019560	AAG	2	6	269815	269820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019560	TAA	2	6	271388	271393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019560	A	6	6	274549	274554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019560	AAATA	2	10	274557	274566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019560	T	6	6	276442	276447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019560	GTTTT	2	10	280177	280186	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_019560	GAA	2	6	280212	280217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_019560	AG	3	6	299627	299632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019560	T	6	6	302221	302226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019560	CTA	2	6	302236	302241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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602	NC_019560	AAT	2	6	302272	302277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_019560	ATA	2	6	302279	302284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019560	TCA	2	6	302362	302367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_019560	AGG	2	6	303414	303419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019560	G	6	6	303418	303423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019560	ACC	2	6	303472	303477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_019560	T	6	6	305988	305993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019560	AACA	2	8	305994	306001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_019560	TAA	2	6	306026	306031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_019560	AAT	2	6	306057	306062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019560	A	7	7	306090	306096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_019560	TAA	2	6	306154	306159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019560	TGT	2	6	306894	306899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019560	GTT	2	6	308567	308572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_019560	T	6	6	314247	314252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019560	TCAG	2	8	314326	314333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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621	NC_019560	TTATA	2	10	321456	321465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019560	TAT	2	6	321538	321543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019560	A	7	7	321565	321571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019560	TTA	2	6	321578	321583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_019560	TCA	2	6	321613	321618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_019560	T	6	6	321722	321727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019560	T	7	7	321752	321758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_019560	TG	3	6	321768	321773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019560	T	6	6	321802	321807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_019560	A	7	7	322689	322695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019560	TTGG	2	8	324594	324601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019560	T	6	6	324602	324607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_019560	T	6	6	324621	324626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_019560	A	6	6	324627	324632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019560	AAGTT	2	10	328032	328041	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
637	NC_019560	ACA	2	6	328064	328069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_019560	AG	3	6	328102	328107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_019560	A	6	6	332632	332637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_019560	ATC	2	6	332676	332681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_019560	CTT	2	6	332688	332693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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