MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 4234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018938	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018938	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018938	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018938	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018938	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018938	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018938	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018938	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018938	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018938	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018938	T	8	8	4802	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018938	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018938	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018938	A	6	6	4896	4901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018938	T	7	7	5031	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018938	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018938	A	6	6	5058	5063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018938	TTTTA	2	10	5116	5125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018938	A	6	6	5167	5172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018938	A	7	7	5181	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018938	A	8	8	5198	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018938	A	6	6	7182	7187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018938	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018938	T	7	7	7252	7258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018938	AAATT	2	10	7274	7283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018938	TAAG	2	8	7306	7313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018938	T	14	14	7345	7358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018938	T	6	6	7389	7394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018938	GTTT	2	8	7399	7406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018938	GGT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018938	T	6	6	7475	7480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018938	AGCG	2	8	7497	7504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018938	C	6	6	7525	7530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_018938	A	7	7	7531	7537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018938	G	6	6	7551	7556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018938	GAT	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018938	TAA	3	9	9254	9262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018938	ATAA	2	8	9645	9652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018938	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018938	TAA	2	6	9735	9740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018938	ATT	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018938	TTA	2	6	9818	9823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018938	TATT	2	8	9845	9852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018938	ATTC	2	8	9860	9867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018938	GAA	2	6	9895	9900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018938	AGG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018938	GCTTT	2	10	13576	13585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018938	T	6	6	13583	13588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018938	ACC	2	6	13607	13612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018938	T	7	7	13645	13651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018938	ATA	2	6	13655	13660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018938	TTAA	2	8	13674	13681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018938	AGTT	2	8	16620	16627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018938	CA	3	6	16681	16686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018938	CTG	2	6	16702	16707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018938	A	7	7	16836	16842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018938	CCA	2	6	18284	18289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018938	ATCA	2	8	22732	22739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018938	TTTA	2	8	22777	22784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018938	T	7	7	22798	22804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018938	GGT	2	6	22807	22812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018938	GTTG	2	8	22836	22843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018938	TCA	2	6	22851	22856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018938	A	6	6	23021	23026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018938	T	6	6	23075	23080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018938	GC	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018938	CTTG	2	8	23121	23128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018938	GGT	2	6	23129	23134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018938	T	6	6	23162	23167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018938	A	6	6	23179	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018938	T	6	6	23197	23202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018938	A	6	6	23222	23227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018938	TTTG	2	8	23229	23236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018938	A	6	6	23241	23246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018938	A	7	7	23249	23255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018938	AAAAG	2	10	23259	23268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018938	TTA	2	6	25471	25476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018938	GT	3	6	25516	25521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018938	ATTA	2	8	25583	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018938	A	15	15	25608	25622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018938	GTT	2	6	25684	25689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018938	A	6	6	25707	25712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018938	T	6	6	25732	25737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018938	TTG	2	6	25741	25746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018938	T	7	7	25836	25842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018938	A	7	7	25843	25849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018938	GGT	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018938	A	6	6	25967	25972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018938	CGCT	2	8	25977	25984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018938	A	6	6	27405	27410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018938	T	6	6	27439	27444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018938	A	7	7	27482	27488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018938	TA	3	6	27502	27507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018938	T	6	6	28842	28847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018938	A	7	7	28874	28880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018938	GGTT	2	8	31950	31957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018938	T	8	8	37634	37641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018938	TTA	2	6	37643	37648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018938	T	6	6	37660	37665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018938	A	7	7	37693	37699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018938	TAA	2	6	40609	40614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018938	A	6	6	40619	40624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018938	AG	3	6	40629	40634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018938	TAA	2	6	42075	42080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018938	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018938	GT	3	6	44299	44304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018938	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018938	CTATT	2	10	44351	44360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018938	T	6	6	44359	44364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018938	T	6	6	44400	44405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018938	ACC	2	6	44415	44420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018938	CTT	2	6	44423	44428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018938	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018938	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018938	ATCT	2	8	44481	44488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018938	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018938	CTT	2	6	44621	44626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018938	AAAT	2	8	44643	44650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018938	TTA	2	6	44683	44688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018938	CAT	2	6	44708	44713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018938	GATT	2	8	44732	44739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018938	ATG	2	6	44776	44781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018938	CT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018938	T	6	6	44939	44944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018938	TAG	2	6	44962	44967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018938	ACTTAG	2	12	44968	44979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018938	A	6	6	45025	45030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018938	GTA	2	6	51335	51340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018938	AAAG	2	8	51375	51382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018938	CTT	2	6	51387	51392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018938	ATC	2	6	51407	51412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018938	GCA	2	6	51413	51418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018938	TGA	2	6	51457	51462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018938	CTC	2	6	51482	51487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018938	ATC	2	6	51536	51541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018938	TGT	2	6	51611	51616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018938	TAA	2	6	51636	51641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018938	CAT	2	6	51646	51651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018938	TAAA	2	8	51734	51741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018938	TGAAAT	2	12	51799	51810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018938	A	6	6	51834	51839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018938	AAT	2	6	51847	51852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018938	CAA	2	6	52310	52315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018938	T	6	6	52326	52331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018938	GATAA	2	10	52412	52421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018938	TTTA	2	8	61310	61317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018938	T	6	6	61381	61386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018938	TAAT	2	8	61410	61417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018938	TAA	3	9	61516	61524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018938	AACGA	2	10	61561	61570	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_018938	TTAAA	2	10	61573	61582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018938	A	6	6	61592	61597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_018938	TCT	2	6	194787	194792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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