MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 1933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017944	GCG	2	6	111366	111371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017944	ACCA	2	8	111537	111544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_017944	CAA	2	6	111582	111587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017944	TTC	2	6	111643	111648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017944	GAC	2	6	111727	111732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017944	TCG	2	6	111832	111837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017944	TCG	2	6	111841	111846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017944	GTG	2	6	111884	111889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017944	CG	3	6	111893	111898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_017944	TCG	2	6	112222	112227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017944	TGT	2	6	112603	112608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017944	TC	3	6	112656	112661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017944	GA	3	6	112859	112864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017944	GAC	2	6	113786	113791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017944	GCT	2	6	113799	113804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017944	A	6	6	115257	115262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017944	CT	3	6	115303	115308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017944	GCC	2	6	115316	115321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017944	GTC	2	6	115344	115349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017944	CGG	2	6	115392	115397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017944	CA	3	6	115423	115428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_017944	ACG	2	6	115487	115492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017944	CGC	2	6	115505	115510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017944	CGT	2	6	115533	115538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017944	TAA	2	6	115562	115567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017944	AGT	2	6	117175	117180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017944	GTT	2	6	117221	117226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017944	CGT	2	6	117366	117371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017944	TCGC	2	8	117386	117393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
530	NC_017944	CGA	2	6	117413	117418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017944	AAT	2	6	117456	117461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017944	GC	3	6	117558	117563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_017944	CAG	2	6	117604	117609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017944	CG	3	6	117620	117625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_017944	CCT	3	9	117669	117677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_017944	CGA	2	6	117783	117788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017944	GGC	2	6	117790	117795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017944	CGGCT	2	10	117801	117810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
539	NC_017944	GCC	2	6	117840	117845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_017944	GCT	2	6	117848	117853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017944	CAA	2	6	117870	117875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017944	AATC	2	8	117926	117933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_017944	TCTG	2	8	117936	117943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_017944	GACG	2	8	117980	117987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_017944	AGA	2	6	119715	119720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017944	AAT	2	6	119792	119797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017944	ACC	2	6	119813	119818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_017944	CGAC	2	8	119840	119847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017944	CTA	2	6	119886	119891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017944	GGC	2	6	119908	119913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017944	CGT	2	6	119934	119939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017944	TGAC	2	8	119968	119975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017944	GTG	3	9	123786	123794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017944	GAC	2	6	123803	123808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017944	CTAT	2	8	123839	123846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017944	TGA	2	6	123934	123939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017944	AGC	2	6	123948	123953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017944	AGT	2	6	124955	124960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017944	TCC	2	6	126673	126678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_017944	CGACC	2	10	126794	126803	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
561	NC_017944	CTAC	2	8	126832	126839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_017944	CGA	2	6	127487	127492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017944	GCG	2	6	127497	127502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017944	GAA	2	6	127518	127523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017944	CCT	2	6	127535	127540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017944	CGA	2	6	127541	127546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017944	ATT	2	6	127619	127624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017944	CCT	2	6	127657	127662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_017944	TGA	2	6	127671	127676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017944	GA	3	6	127675	127680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017944	ACTC	2	8	127721	127728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017944	ACAG	2	8	127771	127778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_017944	GT	3	6	127782	127787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017944	GT	3	6	127804	127809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017944	GA	3	6	127861	127866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017944	AGTT	2	8	127895	127902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017944	CTA	2	6	128703	128708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017944	CG	3	6	128731	128736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_017944	CCA	2	6	128800	128805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_017944	GAG	2	6	128809	128814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017944	CAAA	2	8	128815	128822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_017944	TATG	2	8	128841	128848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017944	AGG	2	6	128904	128909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017944	AAAC	2	8	128958	128965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_017944	TGA	2	6	128997	129002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017944	ATG	2	6	129035	129040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017944	TTG	2	6	129152	129157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017944	CTCA	2	8	129194	129201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_017944	TACG	2	8	129306	129313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017944	CGT	2	6	129342	129347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017944	AAT	2	6	129358	129363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017944	AAG	2	6	129368	129373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017944	CAAA	2	8	129379	129386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_017944	CTTG	2	8	129423	129430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_017944	CGG	2	6	129434	129439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017944	GGTC	2	8	129786	129793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
597	NC_017944	GACA	2	8	129808	129815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_017944	CCA	3	9	129836	129844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017944	CA	3	6	129843	129848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_017944	C	6	6	129849	129854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
601	NC_017944	TACT	2	8	129865	129872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_017944	GGT	2	6	129901	129906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017944	GTG	2	6	129937	129942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017944	AGC	2	6	129990	129995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017944	AAT	2	6	130835	130840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017944	GTT	2	6	130850	130855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017944	ATA	2	6	130862	130867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017944	GT	3	6	130945	130950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017944	CCT	2	6	130984	130989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017944	AGGT	2	8	131081	131088	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017944	TCG	2	6	131102	131107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017944	GC	4	8	131139	131146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_017944	TA	3	6	131160	131165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017944	ATTCA	2	10	131171	131180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
615	NC_017944	A	6	6	131311	131316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017944	CCA	2	6	131347	131352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017944	CGA	2	6	131395	131400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017944	TTC	2	6	131441	131446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017944	GTC	2	6	135249	135254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017944	AGTC	2	8	136330	136337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_017944	TAAT	2	8	136369	136376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017944	TCA	2	6	136383	136388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017944	AGG	2	6	136391	136396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017944	GA	3	6	136704	136709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017944	CTC	2	6	136750	136755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017944	TC	3	6	136784	136789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_017944	AAC	2	6	136800	136805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017944	ATA	2	6	136839	136844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017944	GCC	2	6	136854	136859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_017944	GACG	2	8	136877	136884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_017944	CGG	2	6	136896	136901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017944	CTTT	2	8	136972	136979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_017944	CCA	2	6	136985	136990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017944	GGC	2	6	137065	137070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017944	CGACA	2	10	137129	137138	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
636	NC_017944	TAATT	2	10	137178	137187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_017944	TCCCC	2	10	137207	137216	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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915	NC_017944	GA	3	6	219135	219140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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